Na palubě Air Force 1 dojde k záhadnému úmrtí důstojníka, který měl na starosti atomový kufřík. Mezi různými složkami státních ozbrojených institucí (CIA, FBI, NCIS) začne růst řevnivost, kdo bude případ vyšetřovat. Agentovi NCIS Gibbsovi se podaří díky chytrosti získat pro svůj úřad tělo, aby společně s agentkou tajné služby Caitlin Toddovou zjistili, že na prezidenta se chystá teroristický útok. A právě tomuto útoku se jim podaří na poslední chvíli zabránit. Odhalí totiž falešného novináře. Agentka Toddová poté, co nesouhlasí s chováním svých nadřízených, odchází do NCIS.

NCIS vyšetřuje smrt muže, důstojníka námořní pěchoty, při seskoku padákem. Brzy zjistí, že se nejednalo o nehodu, nýbrž o úkladnou vraždu. Někdo důstojníkovi naleptal šňůry hlavního padáku. Zjistí také, že se muži nepodařilo při seskoku otevřít ani záložní padák, protože i on byl poškozený. Při testech v laboratoři jsou objeveny stopy drog v pouzdře jednoho z padáků. Agenti díky tomuto zjištění odhalí překupníka drog a vraha v jedné osobě. Jeho nadřízený začal mít podezření, a proto musel zemřít.

Parta mladých lidí, kteří mají na pláži večírek, zaslechne střelbu. Následně z moře vyjede na pláž rozstřílený člun. Ráno na to pak moře vyplaví mrtvolu zastřeleného námořního důstojníka. Důstojníci NCIS jsou zprvu přesvědčeni, že by se mohlo jednat o spojení tohoto případu s nálezem dvou mrtvých drogových dealerů o pár kilometrů dál. Další vyšetřování však ukáže, že od jednoho z lídrů místní drogové scény si někdo vypůjčil rychlý člun. Skupina, která si půjčila člun, jak se ukáže, připravuje teroristický útok na elektrickou síť na celém pobřeží. Muž je při jedné přípravné akci překvapil, a proto musel zemřít. NCIS na poslední chvíli plánovanému útoku zabrání.

Vyšetřovací tým pracuje na záhadném utonutí poddůstojníka na křižníku. Muž byl nalezen v moři se závažími kolem nohou a šavlí u boku. Překvapením pro vyšetřovatelé je zjištění, že mladíka natolik pohltila počítačová online hra, že začal věřit ve svou nesmrtelnost. Na důkaz toho, že je skutečně nesmrtelný, skočil se závažími a šavlí do moře. Dojít na pobřeží se mu však skutečně nepodařilo.

Poručík vojenského námořnictva je pohřešován již takřka deset let. Nikdo už nedoufal, že by se mohl vynořit, nebo že by se alespoň podařilo najít jeho ostatky, když přijde zpráva o jistém "lovci jelenů", u něhož se voják našel. Tým NCIS se okamžité vydává na místo za záhadným lovcem. K jejich úděsu najdou už jen mumifikovanou mrtvolu hledaného poručíka. Před vyšetřovateli stojí těžký úkol. Musí zrekonstruovat celý příběh, který se možná udál už před desíti lety a především musí zjistit, co se stalo s jedním milionem dolarů, které měl pohřešovaný na své lodi.

Stan Berly, bývalý vyšetřovatel NCIS požádá o pomoc svého bývalého nadřízeného Gibbse. Námořníci z obsluhy záchytného zařízení letadel na letadlové lodi byli na vycházce. Jednomu z nich, desátníku Wilksovi, přeskočilo a našli ho nahého v ledničce - pravděpodobně byl pod vlivem drog, protože podobnými záchvaty trpí i narkomani. Gibbs přijíždí se svým týmem na letadlovou loď. Zjišťuje, že poslední rozbor Wilksovy moči před třemi týdny byl negativní a nelze ho obejít, protože systém kontrol je podrobný. Gibbs navštíví na ošetřovně Wilkse a vyslýchá ho. Wilks tvrdí Gibbsovi, že nikdy žádné drogy nebral, ten je však přesvědčený o opaku. Na přistávací ploše mezitím dostane záchvat další námořník z té samé jednotky. Stejně jako Wilks vypovídá, že s drogami neměl nikdy nic společné. Wilks je v zápětí zavražděn. Gibbs zjistí, že v jednotce záchytného zařízení panovaly velmi napjaté vztahy. Velitel Reyes se snažil plnit úkoly na více než 100% a to samé požadoval od svých podřízených, kteří často nebyli schopni jeho nároky splnit. Nakonec se prokáže, že Reyes dodával svým podřízeným drogy, aby splnili všechny jeho náročné pracovní požadavky. Jak však obešel vyšetření moči? Musel mít komplice a Gibbs už ví, kdo jím je...

Specialisté na nebezpečný odpad objeví v jednom ze sudů rozleptané lidské tělo. Po příchodu Dr. Mallarda z NCIS se ukáže, že někdo tělo rozleptal kyselinou fluorovodíkovou, která se používá na různé účely. V námořnictvu je nejčastěji využívají na čistění kovových povrchů. Má silné leptavé účinky, rychle proniká lidskou kůží, rozkládá měkké tkáně a dekalcifikuje kosti. Mallard odhaduje, že oběť byla v sudu méně než 24 hodin. Podle zbytků oděvů patřil znetvořený muž k námořnictvu. Podrobnou expertízou těla dospěje Dr. Mallard k závěru, že smrt způsobil tupý úder. Podle zbytku tetování na těle mrtvoly se ukáže, že neznámy mladík musel působit na některé z nedaleko kotvících ponorek. Gibbs dá rozkaz svým lidem, aby důkladně prohlédli ponorky a on sám se vybere s Kate na ponorku Philadelphia, která vyplula na cvičnou plavbu.

Jeden námořník je sice mrtvý, ale na žádné ponorce nikomu nechybí. Gibbs má podezření, že ho nahradil někdo jiný, nepovolaný s nekalým plánem.

Poddůstojník druhé třídy Chalil Said působil jako tlumočník na Kubě. Zemřel v autě cestou do Fredersburgu, když skoro zajel dva cyklisty. Dr. Mallard v jeho těle najde smaragdy, které spolykal, aby je mohl propašovat do USA. Uvízly mu v trávicím traktu, dostal vnitřní krvácení a zemřel. Gibbs se svým týmem vycestuje na Kubu. Said působil v táboře Delta v Guantanámu a v jeho autě bylo nalezeno pět neodeslaných listů zvláštní agentce Paule Cassidiové. Gibbs se snaží Paule pravý důvod návštěvy zatajit, protože je podezřelá. Všechny důkazy nasvědčují tomu, že byla Saidovou milenkou. NCIS vyslechne i vězně Nassera, o kterém si myslí, že dal Saidovi smaragdy a je do celé záležitosti též zapletený.

Mladá vdova, Sára Kidwellová, je při pohřbu manžela vyrušena telefonátem, který ji vyděsí. V telefonu se jí ozve hlas Jima, který jí tvrdí, aby nevěřila nikomu, protože on stále žije. Po tomto neobvyklém incidentu, na první pohled působícím jako žert, začne pátrat Námořní vyšetřovací úřad.

Major Jim Kidwell a jeho přítel major Peary byli vycvičení pro speciální a tajné mise. Při poslední akci oba zemřeli za záhadných okolností a jejich manželky chtějí zjistit skutečnou příčinu jejich smrti. Tým exhumuje nalezené Kidwellovo tělo a přijdou na to, že major zemřel hroznou smrtí za velmi podezřelých okolností, ale určitě později než byl oficiální pohřeb. Gibbs nechá odposlouchávat Sářin telefon. Jeho lidé se nemohou dostat k potřebným informacím o mrtvých vojácích. Navštíví velícího důstojníka "mariňáků", protože zablokoval celý systém. Ten jim prozradí, že jejich smrt drží v tajnosti záměrně, ne kvůli zahraniční cestě, které se zúčastnili, ale kvůli tomu, že svou úlohu splynout s davem vzali velmi vážně. Nyní se musí Gibbs snažit zjistit, zda druhý major žije a jestli je způsob jak ho zachránit.

Vystrašené ženě se podaří vyhrabat z hrobu a zastaví na lesní cestě okolo jedoucí auto. Jeho řidiče požádá o pomoc. Nepamatuje si nic ze své minulosti, jen to, že se jí někdo pokusil zavraždit a nedaleko v lese pohřbít. Je přesvědčená o tom, že do jedné z vojenských lodí někdo nastražil bombu.

Případem je pověřen Gibbs a jeho tým. Agentka Kate Toddová navštíví oběť v nemocnici - vezme její otisky prstů a šatstvo, které pošle na důkladnou expertízu. Na oblečení se najdou chemikálie, které se používají k výrobě nebezpečných trhavin. Agenti nenajdou u hrobu oběti žádné podezřelé stopy - jen klíč. Ten je od hotelového apartmánu, který si na delší dobu pronajal jistý Richter, majitel německé společnosti. Vyšetřovatelé však zjistí, že Richtera někdo zavraždil. V apartmánu se najdou otisky prstů ženy se ztrátou paměti. Kate ji přivede do márnice a doufá, že když uvidí Richterovu tvář, tak si vybaví nějaké souvislosti. Tvrdí, že ho určitě nezná, ale Kate má pocit, že nemluví pravdu...

Na vojenskou základnu ve Virginii zavolá anonym a oznámí vraždu muže. Jde o důstojníka Thomase Egana, případu se ujímá Námořní vyšetřovací úřad. Oběť působila jako technický poradce a civilní dodavatel pro základnu. Podle výpovědí kolegů odešel Egan brzy ráno provést testy jednoho jejich podvodního zařízení. Měl u sebe speciální ruční zbraň, která využívá ozvěny zvuků na vytvoření vizuálních obrazů - jako sonogram. Jejich novou verzi však unese i potápěč. Vynalezli tento koncept a předali jeho jediný prototyp armádě. Egan byl odborník na radarové ozvěny a přístroj testoval.

NCIS zjistí, že anonymní hovor byl z budovy CIA. Gibbs navštíví šéfa CIA a žádá ho o spolupráci, protože někdo z jeho lidí je podezřelý ze satelitní špionáže americké základny. Žádá o nahrávky satelitních přenosů, ovšem neúspěšně. Gibbs však ví jak obejít "úředního šimla" a požádá Abby, aby zatelefonovala svému dávnému příteli z NASA, který má na starosti kontrolu vojenských satelitů a neoficiální cestou ho požádala o zjištění, který satelit se v inkriminované době nacházel nad místem zločinu a kdo ze CIA jej obsluhoval. Poté co Gibbs, takto nestandardně, zjistí dotyčnou osobu - mladého technika Wortha, tak ho spolu s Kate vyslechne a přinutí mluvit. Zjistí, že nešlo o špionáž americké základny, ale Worth pouze obešel interní předpisy CIA a sledoval z vojenského satelitu nahou ženu opalující se na pláži. Při té příležitosti se mimo jiné stal svědkem vraždy a byl to právě on, kdo telefonoval na vojenskou základnu. Gibbs zatelefonuje řediteli CIA a opět žádá o spolupráci, jinak vše zveřejní. Dotyčné záběry získává, ale vraha se mu přesto nepodaří identifikovat.

Jeho tým se tedy zaměří na hledání oné tajemné a neznámé nahé ženy ze záběrů. Jedná se o zaměstnankyni vojenské základny Ginu. Ta sice z dálky viděla nějakou hádku, ale odešla z pláže dříve, než k vraždě došlo. Jediným vodítkem pro Gibbse je to, že Gina si je jistá tím, že s Eganem na místě činu byla žena a hodně nahlas se spolu hádali.

Podezřelými se stávají Eganova nadřízená Lauren Tylerová a trochu překvapivě jeho manželka. První je podezřelá, protože měla s mrtvým intimní poměr a druhá z toho, že na to pravděpodobně přišla a manžela zabila. Gibbs nastraží na Eganovu manželku past tím, že jí sdělí, že Eganova nadřízená je podezřelá z vraždy a prvořadým úkolem vyšetřovatelů je nalézt ztracenou ruční zbraň, která by Lauren usvědčila. Past zabere a Eganovu manželku usvědčí. Gibbs jí se svým týmem přichytí přímo při tom, když si dojede na tajné místo pro dotyčnou ruční zbraň.

Bezdomovec najde v kontejneru lidskou nohu. Svůj šokující objev nahlásí na policii. Případem je pověren Námořní vyšetřovací úřad a agent Gibbs vycestuje se svým týmem na místo činu do Západní Virginie. Noha patří vojákovi. Podle odhadu lékaře Mallarda byla končetina oddělená od těla až po smrti. Mallard rentgenem zjistí, že muž musel podstoupit náročnou operaci členkového kloubu. Na základě výrobního čísla umělého kloubu se jim podaří zkontaktovat s ošetřujícím lékařem. 22-ti letý voják Námořní pěchoty Thomas Dorn sice podstoupil náročný zákrok ve vojenské nemocnici, ale před dvěma lety zemřel na nečekaný infarkt. Pitva nebyla provedena a jeho tělo bylo po podepsání úmrtního listu okamžitě zpopelněné. Gibbs zjistí, že Dorn podepsal těsně před smrtí vysokou životní pojistku.

NCIS je povolána vyšetřit vraždu náboráře námořní pěchoty přímo v jeho kanceláři. Agenti zjistí, že střelec postupuje jako velmi zkušený a inteligentní odstřelovač. Ve chvíli, kdy agenti zjistí, že to musí být někdo, koho Námořní pěchota odmítla, dojde k další vraždě. Gibbs s Kate se rozhodnou vlákat střelce do pasti. Návnadou je sám Gibbs a Kate.

NCIS vyšetřuje vraždy mužů ze základny letectva. Všechny oběti vykazují znaky vražd sériového vraha. Oběť zastaví u silnice, aby někomu pomohla, následně je zastřelena, svlečena a spoutána. Na stopě těchto vražd NCIS spolupracuje s místní šerifkou, ta však věnuje mnohem větší pozornost Gibbsovi než případu. Postupně se zjistí, že vraždit by mohla manželka jedné z obětí. Ostatní vraždy mohla spáchat proto, aby od sebe odpoutala pozornost. NCIS však naráží na problém. Žena má skálopevné alibi, které vyvracejí nález DNA na místě jednoho z činů. Její alibi však padnou ve chvíli, kdy agenti zjistí, že žena má sestru dvojče.

Na NCIS se obrátí FBI s prosbou o vyhledání zběhlého plukovníka z Iráku. Gibbs ho ze svého předchozího působení důvěrně zná, a proto nevěří, že muž zběhl a ukradl při tom dva miliony dolarů. Plukovník ovšem sám Gibbse vyhledá a začne mu vykládat o podivném spiknutí a vykrádání armádních peněz. Gibbs, který riskuje svou kariéru, aby starému příteli pomohl, sice spiknutí a vykrádání peněz odhalí, ale také pochopí, že jeho přítel trpí schizofrenií.

Do pitevny NCIS vnikne neznámý vetřelec a vezme si za rukojmí patologa i s jeho asistentem. Později se mu díky Katyině neopatrnosti podaří získat jako rukojmí i jí. Gibbs sice zjistí, co se v pitevně děje i jaký je důvod nezvané návštěvy, není však schopen útočníka zneškodnit. Díky malé lsti útočník unikne.

Na panských záchodech nočního klubu bylo nalezeno tělo mrtvého vojenského skladníka. NCIS má zprvu podezření, že mladíka někdo srazil autem a schoval na záchodky a že důvodem této vraždy byly úplatky. Všechny stopy však selžou a tým musí své pátrání začít znovu od začátku. Správná stopa se nakonec konečně najde. Tým zjistí, že jeden z údajných kamarádů zavražděného připravil jeho vraždu poté, co ho oběť vydírala, když přišla na jeho peněžní podvod. Vraždu vrah ovšem nastražil tak, aby vypadala jako smrt v důsledku nehody.

Agenti vyšetřují útěk vězně z vojenského vězení. Zjistí při tom, že voják byl zavřený za vraždu své manželky, kterou nespáchal. Při hledání skutečného vraha zjistí, že za vším je vojákův nadřízený, který na vojákovu manželku žárlil z toho důvodu, že měla milostný poměr s jeho ženou. Jako vrah se však v závěru ukáže být právě jeho žena.

Lidé s NCIS tentokrát musí vyšetřit vraždu svého kolegy. Někdo ho zastřelil a poté doslova vykuchal. Gibbs a jeho tým zjistí, že jejich kolega rozkryl podivné okolnosti tři roky starého případu zpronevěry dvaceti milionů dolarů. Díky paměťové kartě, kterou oběť spolkla, zjistí, že se jejich kolega zajímal o jakousi ženu. Když podezřelou začnou sledovat, objeví, že žena je předělaný muž, pachatel oné zpronevěry a ke všemu teď už i vrah.

Největší ostudu si vysloužil nenapravitelný DiNozzo, který v rámci sledování podezřelé(ho) s ní(m) navázal intimnější vztah (vášnivě se líbali v restauraci) aniž by tušil, že ona je on.

NCIS je přivolána k pátrání po zmizelém specialistovi na výbušniny. Po tomto absolutně ztraceném vojákovi pátrá celý tým včetně agenta DiNozza. A právě ten se dostane do ohrožení svého vlastního život, když ho kdosi také unese. DiNozzo se probudí přivázán v kanalizaci za nohu k jakýmsi řetězům. K jeho překvapení se vedle něj nachází přivázaný ztracený voják. DiNozzo se však nevzdává a oba dokáže osvobodit.

Tím také zjistí, že za vším je tři roky starý případ smrti tří mladých žen v nákladním prostoru vojenské lodi. Vojáci dívky chtěli propašovat z jejich vlasti do Států, ony však nešťastnou náhodou v podpalubí zemřely až na jednu. A ta se teď mstí.

NCIS vyšetřuje vraždu podivného zbrojíře, seržanta Thomase Grimma. Muž byl nalezený s prostřelenou hrudí protitankovou střelou. Zprvu vše vypadá na to, že se tento muž stal obětí nějaké militantní skupiny, se kterou se nepohodl, když se jim pokoušel načerno prodávat zbraně z vojenských zásob. Byl skvělým boxerem, v námořnictvu byl od svých 17 let a vypracoval se na špičku.

Agenti NCIS však narazí na agentku jiné tajné služby, která byla do kšeftů se zbraněmi přímo zapletena a za smrt muže je přímo odpovědná. Grimm jí chtěl před smrtí předat zbraně, domluvil si s ní schůzku, na kterou však nepřišel.

Při nočním cvičení speciální jednotky SEALS dojde k úmrtí. Slaňujícímu poručíkovi se přetrhne skoba. Muž se na místě zabije. NCIS jsou v časovém presu, protože jednotka má odjet na utajenou misi. Vojáci jsou smrtí svého velitele otřeseni a jejich mise je ohrožena v situaci, kdy se zjistí, že skoba byla vyměněna za jinou, nekvalitní...

Kate ve městě zahlédne Gibbsem hledaného teroristu, který v minulosti vnikl na pitevnu NCIS, bohužel ve snaze tohoto muže dopadnout naskočí do auta, kde jedou jeho komplicové. Ti ji zajmou a Kate musí přihlížet, jak se teroristi připravují zaútočit na presidentský vrtulník. Mezi tím se podaří MacGeemu konečně pro Gibbse zjistit teroristovu totožnost. Ke svému zděšení zjistí, že muž je agent Mosadu vyslaný infiltrovat buňku palestinské skupiny Hammas. V té chvíli i Kate zjistí, že muž není teroristou a že jen rafinovaně likviduje arabské teroristy. Gibbs si však vymíní na svých nadřízených setkání s tímto mužem. Mezi čtyřma očima si vyjasní své postoje. Gibbs se s ním však rozloučí sobě vlastním způsobem. Oplatí mu zranění, které tento muž způsobil pomocníkovi patologa. Střelí ho do ramene.

Do NCIS se dostaví sekretářka vyššího důstojníka s tím, že její šéf je vydírán. Údajně došlo k únosu jeho rodiny, manželky a slepé dcerky a on je teď vydírán skrze počítačové spojení. Únosce po něm požaduje převést dva miliony dolarů na zahraniční konto. Tým se dokáže nejen napojit na kapitánův počítač, ale i vypátrat místo, kde je rodina držena. Zprvu se podaří osvobodit dcerku a na základě informací od ní si agenti už dojdou i pro ženu. Co je však překvapí, je zjištění, že samotný únos měl být zástěrkou pro finanční podvod, jehož pachatelem je sám vydíraný důstojník.

Při stavebních pracích na jedné ze základen námořnictva objeví dělníci mumifikovanou mrtvolu ženy. Z dalšího vyšetřování vyplývá, že ten, kdo nechal ženu zemřít v podivném krytu - vězení, určitě v současnosti týrá tímto způsobem další oběť. Díky drobnému hmyzu policisté objeví, že vrah se mohl přesunout pouze na čtyři další možné základny. Policisté zjistí, že pouze na jedné z nich je pohřešována mladá žena. Je jen otázkou času ženu najít.

Na poli, kdesi v západní Virginii, je nalezen opuštěný vrtulník Kobra. Piloti jsou pohřešováni a místní venkované tvrdí, že je unesli mimozemšťané. Gibbsovi lidé však brzy najdou mrtvolu a předpokládají, že se jedná o jednoho z pilotů. Druhý pilot se mezitím najde živý. Evidentně neví nic o tom, proč jeho kolega odletěl s vrtulníkem sám. Vzorky DNA z těla mrtvého však odhalí, že mrtvý byl bratrem pohřešovaného pilota. Když ještě Gibbs zjistí, že v údolí, kde se vrtulník našel, panuje letitý spor, pochopí, že pilot se přišel pomstít. Skládačku doplní Kate, když zjistí, že mrtvý čekal s místní dívkou dítě. Její otec se nemohl smířit s tím, že ona otěhotněla z člověkem z druhé strany údolí. Problém vyřešil tím, že ho upálil. Gibbs naštěstí pomstychtivého pilota včas odhalí, a tak zabrání další tragédii.

Dva námořníci najdou na námořní základně v Norfolku tělo mrtvé a znásilněné dívky. Gibbs spolu s ostatními vyšetřovateli jsou překvapeni informací lékaře Mallarda, který jim sdělí, že zavražděná byla zabita stejným způsobem jako jedna žena před deseti lety. Další zkoumání potvrdí, že sperma nalezené u oběti se také shoduje. Mallard, který u sebe stále nosí urnu první mrtvé, celou záležitost velmi těžce prožívá. Agentům se naštěstí podaří zjistit totožnost druhé mrtvé a i Abby v laboratoři odvede dobrou práci, podaří se jí dokázat, že DNA ze spermatu se shoduje s DNA vlasů možného podezřelého. Jenže ten je už několik měsíců mrtev. Sperma mohl podstrčit pouze ten, kdo měl přístup do laboratoře.

Na námořní základně v prostoru pro zkušební bombové útoky najdou tělo civilisty. Zjistí se, že takto se mafie zbavuje svých svědků a nepohodlných lidí již léta. Gibbs se dozví, že mrtvý muž byl agent FBI a pracoval v utajení. Agent FBI Fornell je obviněn ze spolupráce s mafií a uvězněn. Svou vinu popírá, Gibbs i přesto, že má s agentem Fornellem časté pracovní neshody, mu věří a pokusí se udělat vše pro jeho záchranu. Prvním krokem je odhalení skutečného informátora mafie, který pracuje uvnitř samotné FBI. Gibbs s Fornellem proto nastraží originální malou past. Gibbs k tomu musí jen předstírat, že jeho přítel Fornell se v cele oběsil.

Agenti vyšetřují pumový útok na bývalou elitní pilotku, které už dlouhou dobu vyhrožuje Al Kajda za její údajné zabití deseti civilistů v Afghánistánu. Gibbs se svým týmem je však v poněkud nevýhodné situaci. Je rozhodnuto, že vyšetřování případu povede hlavně FBI a oni mají ženě zajistit bezpečnost. Spolupráce je poněkud problematická, a tak Gibbs musí vyšetřovatelku FBI výhrůžkou o předání informací tisku donutit k vydání podezřelého. Poté už není problém zadržet ostatní členy teroristické skupiny. Jenomže teprve pak Gibbs pochopí, že ženu se vedle profesionálních vrahů snažil zabít i nějaký amatér.

Do budovy NCIS se dostaví starý muž, válečný veterán z druhé světové války, nositel nejvyššího vyznamenání za chrabrost. Tento muž žádá Gibbse, aby byl zatčen za to, že zabil svého přítele. Údajně ho měl utlouct svou pistolí. Gibbsovi se celá situace a mužovo přiznání nezdá, považuje ho za výplod staré mysli. Naneštěstí se o situaci dozví vyšetřovatelka z JAGU a trvá na vyšetření událostí. Gibbs musí vytvořit imaginární rekonstrukci za použití starých dokumentárních filmů, aby dokázal, že muž svého přítele sice zabil, ale jednalo se o ránu z milosti.

V nemocnici námořnictva dojde ke vznícení pacienta po operaci srdeční chlopně. NCIS je k případu přivolána, aby vyšetřila, zda se jednalo o nešťastnou náhodu nebo o mnohem závažnější situaci. Díky pitvě se zjistí, že šlo o vraždu. Z této vraždy je podezřelý námořník, který měl s obětí, jež byla jeho velitelem, spory. Tento námořník se také ze svého pracoviště ztratí a když ho lidé z NCIS najdou, pokouší se před nimi spáchat sebevraždu. Caitlin ho v domění, že při manipulaci se zbraní v ruce chce ohrozit Gibbse, zastřelí. Další vyšetřování však odhalí, že pacient byl už v době vznícení mrtvý a námořník nebyl jeho vrahem.

Žena námořního důstojníka postřelí neznámého útočníka, který jí vnikl do domu. Při dalším vyšetřování se zjistí, že útočník se s ní seznámil na internetu a ve chvíli, kdy se pokusil jejich internetový flirt skutečně realizovat, vše se poněkud vymklo kontrole. Abby však zjistí, že žena žádné e-maily nepsala. Tým se pustí do dalšího vyšetřování, při kterém zjistí, že žena, která se vydává za sestru postřeleného, je známá násilnice a muž je její komplic. Se svými oběťmi se seznamuje právě skrze internet.

Gibbs a jeho tým pracuje na krádeži velkého množství starožitností z Iráku. Jelikož má podezřelého, ale nemá ony starožitnosti, nechá onoho muže v doprovodu DiNozza utéci z vězeňského převozu. Gibbs doufá, že uprchlík dovede DiNozzu ke svému komplici. Tato část plánu sice vyjde, ale Gibbs s Kate zjistí, že uprchlík je mnohem nebezpečnější, než vypadá. Má za sebou několik podříznutých obětí. Gibbs s Kate se snaží co nejrychleji vystopovat uprchlíky, bojí se o DiNozza. Ten nejenom že objeví starožitnosti, ale ochrání i sebe.

Známý soukromý detektiv najde v jezeře auto pohřešovaného poručíka námořní pěchoty, dědice mnohamilionové firmy. Právě v tuto chvíli se do vyšetřování zapojí NCIS. První důkazy naznačují, že muž byl zastřelen a poté auto s mrtvolou spadlo do jezera. Slavný detektiv se už vidí jako majitel milionové odměny za dopadení vraha. Tím má být bratr oběti. Gibbsovi se však důkazy nezdají a tak vše znovu důkladně prověří. Z vraždy se náhle dle nových důkazů stane autonehoda a slavný detektiv čelí žalobě z manipulace s důkazy...

NCIS začíná vyšetřovat údajnou vraždu poddůstojníka, počítačového experta. Telefonní operátor byl svědkem údajné vraždy ve chvíli, kdy muži telefonoval. Lidé z NCIS však zjistí, že vražda byla fingovaná. Muž právě pracoval na počítačovém programu pro námořní zdravotní službu a skrze tento program dokázal ukrást velké množství léků.

Gibbsovu týmu pomáhá s vyšetřováním poručík Cheney se svým policejním týmem, který jako by z oka vypadl Gibbsovu týmu, nikoliv však podobou, ale chováním. Kate Toddová je nejvíce zmatená z toho jak se Cheney neuvěřitelně ve všem podobá Gibbsovi.

Vyšetřovatelé a policisté se pustí muži po stopě, muže však najdou skutečně zavražděného. Jeho údajný komplic a spolubydlící však tvrdí, že muže zabil nějaký kolega oběti z práce. Gibbs dalším šetřením postupně vyloučí podezřelé a zbývá mu pouze atraktivní Karen Wilkersonová, která byla nadřízenou zavražděného experta. Problém je v tom, že se Gibbsovi velmi líbila a dokonce s ní úspěšně flirtoval...

Patolog Mallard konečně zjistí, kdo byl jedním z oněch tří rozkouskovaných těl, které měl dlouho na pitevně. Zjistil, že se i v případě ostatních dvou těl jedná o soudní úředníky z případu, kde i on figuroval. Jednalo se o muže, který znásilnil a zavraždil příslušnici Námořní pěchoty. Gibbs brzy pochopí, že je třeba hlídat i patologa, protože ten je další možnou obětí. Bohužel pachatel Kate Toddovou ošálí a patologa unese. Začíná honba s časem, úkolem je patologa zachránit živého. Stopy vedou do pohřebního ústavu, který vlastní matka onoho pachatele. Gibbs a jeho lidé přijdou v poslední chvíli.

Náhodná svědkyně nahlásí na policii vraždu námořníka, kterou viděla v okně vedlejšího domu. Policisté nic na místě údajného napadení nenajdou a vzdávají se vyšetřování. Na základě tohoto hlášení pošle Gibbs McGeeho vyslechnout svědkyni. Problém je v tom, že v době údajného činu byla svědkyně opilá a natočený záznam údajné vraždy je bezcenný, protože začala nahrávat až poté co v okně vedlejšího domu nebyl už nikdo vidět. McGee však i přesto svědkyni věří a povolá Gibbse a jeho tým na místo činu. Na základě její výpovědi a důkladného prozkoumání místa agenti zjistí, že muž měl dvojí identitu. V posteli objeví důkladně ukryté dva kufříky. V jednom byla zbraň a ve druhém pravděpodobně větší obnos peněz. Když se zanedlouho najde i tělo námořníka, je výpověď svědkyně potvrzena. McGee je pověřen, aby hlídal byt oběti pro případ, že by se vrah vrátil na místo činu. Když telefonuje se svědkyní stane se svědkem jejího napadení, ale na pomoc jí přiběhne pozdě a její vrah mu uniká. McGee se rozpomene, že vrah nosí hodinky na pravé ruce...

Na výletě v horách zemře poddůstojník námořní pěchoty. Někdo mu rozbil hlavu basebalovou pálkou a shodil ho ze svahu ve chvíli, kdy filmoval ráno v horách. NCIS zjistí, že muž měl večer před svou smrtí spor s tulákem, který bydlel v přívěsu ve stejném kempu. Jenže pozornosti vyšetřovatelů neujdou ani manželka a kamarád. Nahrávka z kamery dokazuje, že měli mezi sebou o hodně bližší vztah, než se snaží, aby to vypadalo. Abby však dokáže s nahrávkou dále pracovat a tím usvědčí tuláka.

NCIS je přivolána k vraždě mladé poručice. Zprvu vše vypadá, že mladík, který se ženou spal, ji ubodal. Další vyšetřování však ukáže, že muž říká pravdu, že žena, se kterou se probudil, není ženou, se kterou do postele šel spát. Jako další možná varianta vyšetřování přichází v úvahu podivný konkurenční boj mezi nočními kluby, muž totiž v jednom z nich pracuje. Gibbs též pochopí, že majitel druhého klubu považuje své zaměstnankyně za osobní majetek. Mrtvá byla sestrou jedné jeho zaměstnankyně a chtěla jí pomoci se z tohoto podivného zaměstnání dostat.

Poddůstojníkovi ze zpravodajského oddělení přijdou poštou v balíčku vyříznuté lidské oči. Omylem balíček otevře sousedka a je to pro ni šok. NCIS zjistí, že poddůstojník, který mezitím spáchal sebevraždu, byl napojen na zpravodajského lektora z vojenské fakulty. Tento muž, dle zjištění NCIS, má další "kšeftíky" právě v jižní Americe, v místě, odkud oči byly odeslány.

Gibbs na místo vyšle DiNozza a Kate. Ti zjistí, že lektor je pedofil a oči patřily zřejmě jeho "přestárlé" sedmnáctileté ženě. Ve chvíli, kdy Gibbs naléhá na své nadřízené, aby mohl lektora nechat zatknout, neznámý muž z velení nechá lektora zastřelit.

Při soutěži krásy v plavkách je nalezena mrtvá poručice námořnictva. Vyšetřování ukazuje, že dívka vedla dvojí život. Nejenom, že sloužila v námořnictvu, ale také usilovala o kariéru modelky a fotila slušné, avšak přesto lechtivé fotky do různých časopisů. První stopa vede k vězni, který se snažil ženě psát milostné dopisy z vězení a byl na ni velmi fixován. A to i v situaci, kdy ona na dopisy neodpovídala. Záznam televizní společnosti ze soutěže však dokáže, že propuštěný vězeň ženu nezabil, že mluví pravdu. Gibbsovi lidé však dokáží, že vrahem byla ženina přítelkyně. Ta ji zavraždila ve chvíli, kdy zjistila, že oběť čeká s jejím přítelem dítě.

Gibbs a jeho lidé jsou povoláni k případu poddůstojnice, která tvrdí, že ji někdo v noci přepadl v domě a vyhrožoval jí smrtí. Ve chvíli, kdy se dostaví na místo činu, ženu si vyzvedne její vojenský psychiatr a odveze ji do nemocnice. Gibbsovi se však jeho vysvětlení poněkud nezdá a tak se pustí do vyšetřování. Jeho podezření o to více zesílí v situaci, kdy zjistí, že žena měla vazbu na svého bývalého velitele, v současnosti vyšetřovaného FBI pro podezření z korupce. Ve chvíli, kdy NCIS objeví v domě poddůstojnice, kterou mezitím někdo v nemocnici uškrtil, odposlouchávací zařízení, není už tak těžké dopadnout pachatele, protože se na jednom čipu našlo trochu krve. A to je něco pro Abby...

NCIS je přivolána k mrtvole námořníka, veterána, tentokrát přímo na civilní školu. Agenti zjistí, že skupina námořníků zde studuje vyšší matematiku. Zprvu vše vypadá tak, že na škole mariňáci vytvořili tajný klub, jehož hlavním cílem jsou podivné adrenalinové zábavy typu paintball. Dva přátelé se měli mezi sebou pohádat a jeden veterán měl zabít druhého. Ve chvíli, kdy je objeven podezřelý, který je také zavražděný, Gibbs pochopí, že za vším není jen hloupá hra. Mezitím McGee dokáže vystopovat podivného hackera, který prozradí, že za vším byla žena. Přítelkyně jednoho ze zavražděných - Ashley Simmonsová podle výpovědi hackera začala chodit s druhým zavražděným.

Ducky zjistil, že oba námořníci byli zavražděni holýma rukama. Někdo zkušený a silný jim zlomil vaz. Ashley, pro kterou si mezitím přijede Gibbs s týmem na školu je však menší postavy a hubená...

Při zatýkání Ashley je přítomen i velitel zavražděných mariňáků, seržant Leeka. Je to silný a zkušený mariňák, který prošel tvrdým výcvikem a zúčastnil se mnoha bojových akcí. Kate s DiNozzem odvádí Ashley z místnosti, kde zůstává Gibbs se seržantem Leekou. Gibbs začíná tušit, že Leeka je přesně ten typ, který mohl oba námořníky zabít, ale jaký mohl mít motiv?

Když navíc uplakaná Ashley sdělí Kate a DiNozzovi své podezření, že oba námořníky pravděpodobně zabil seržant Leeka, protože se jim svěřila, že se jí Leeka pokusil znásilnit, je jim jasné, že Gibbsovi hrozí nebezpečí...

Po té, co zdravotník jednotky námořnictva padne v palbě nepřítele v Iráku, jeho kamarádka otevře jeho pronajatý sklad. V jeho dodávce se najde kostra dívky, mužovy bývalé kamarádky, která před dlouho dobou zmizela. Muži, který je posmrtně navržen na vyznamenání za statečnost, hrozí označení vraha. To Gibbs nechce připustit a dokáže, že vrahem dívky byl její nevlastní otec. Když zdravotník padl, vrah si myslel, že svůj čin hodí na mrtvého.

Do NCIS přijde dopis s otiskem rtů na obálce. Právě DiNozzo ho díky své povaze otevře. Z dopisu se vysype bílý prášek. Agenti z doprovodného textu zjistí, že se skutečně jednalo o biologický útok. Gibbsovi lidé jsou v izolaci a lékaři s Abby hledají pachatele a látku, která byla v dopise obsažena. Zjistí, že se jednalo o spóry plicního moru.

Další vyšetření ukáže, že nakažený je pouze DiNozzo. Mezitím se objeví první stopy po pachateli. Tím je matka údajně znásilněné dívky. Dívka tvrdila, že ji znásilnili nějací námořníci. Matka je ředitelkou laboratoře, která právě pracuje s nebezpečnými viry a bakteriemi. Gibbs však dokáže, že údajné znásilnění si dívka vymyslela. Naštěstí i DiNozzo se začíná uzdravovat.

Agent Gibbs z NCIS a jeho tým mají opět plné ruce práce. Tentokrát jde o práci profesionálů, kteří se vydávali za dopravní policisty a zavraždili dva námořníky poté co je zastavili za překročení rychlosti. Jednomu z námořníků byly useknuty ruce.

Agent DiNozzo přišel nedávno skoro o život a měl by ještě pár dnů ležet v domácím ošetření. Gibbsovi však oznámí, že se už cítí lépe a chce nastoupit zpět do práce.

Právě DiNozzo objeví při obhlídce místa činu nastraženou bombu, která se aktivuje otevřením kufru na automobilu, a tím zachrání život svým kolegům. Gibbsovi je jasné, že šlo o past. Někdo chtěl, aby se do případu zapojili jeho lidé. Použil vojenské výbušniny extra třídy z dobře utajeného zdroje, aby je zlikvidoval.

NCIS také zjistí, že z letecké základny byl ukraden speciální letoun. Letoun je sice pro dnešní potřeby námořnictva zastaralý, pro teroristický útok je však dostatečný. Vzápětí NCIS získá informaci, že Ari Haswari je ve městě a chystá se nejen na teroristický útok, ale též zavraždit Gibbse. Gibbs zjistí, že útok je namířen na vracející se námořníky z Iráku.

Útoku se sice podaří zabránit, při akci je však zastřelena Kate kulkou, která patřila Gibbsovi...

Při ochraně Gibbsova života byla neznámým útočníkem zastřelena Caitlin Toddová. Gibbs je přesvědčen, že vrahem je Ari Haswari, i když nemá důkazy. Při dalším vyšetřování se zjistí, že šlo o život i McGeemu a zachránil se jen náhodou. Všechny velmi zasáhne Caitlinina smrt. Nejhůře to bere Dr. Mallard, který musí provést její pitvu. Všem členům týmu se vrací v představách a vzpomínkách...

Agenti si povšimli nepřítomnosti Ariho a snaží se ho vypátrat. Ztratil se i Dr. Mallard. Stává se Ariho rukojmím. Tony sledujte Zivu do městských lázní, kde se setkala s neznámou ženou a obě si vyměnily župany. Když DiNozzo prohledá vyměněný župan, najde v něm falešný pas a peníze. Vše je připraveno pro Ariho. Na čí straně vlastně stojí Ziva?

Hlavním předmětem vyšetřování NCIS se tentokrát stane obávaný vězeň, masový vrah a psychopat Kyle Boone. Guvernér Virginie přikáže Gibbsovi, aby se s mužem setkal tři dny před jeho popravou. Gibbs musí do tří dnů zjistit místa, kde pohřbil vrah své oběti, jinak si vezme tajemství do hrobu. Někdo však v jeho stylu vraždí dál...

V antropologickém laboratoři otevře Dr. Burnsová před zraky kamer rakev z Občanské války a v ní najde mrtvolu muže v uniformě Unie. Vedle muže leží mobil a je zřejmé, že muž zemřel poměrně nedávno. Ziva přichází do NCIS jako nový člen týmu. Samotného Gibbse tato zpráva překvapí a dochází k ostré výměně názorů s ředitelkou Shepardovou.

Při hádce po telefonu s manželkou sjede Jerry Smith ze silnice a je nalezen mrtev. Vyšetřovatele k nehodě zavolá samotná manželka, která navíc slyšela střelbu zřejmě z vedle jedoucího vozu. Jaké je však překvapení vyšetřovatelů, když pohřešovaného Jerryho Smithe naleznou živého v práci. Otisky prstů však dokáží, že se nejedná o skutečného Jerryho Smithe, nýbrž Johna Kirbyho. Otázka je, proč si oba muži vyměnili svou identitu.

Tým pátrá po pohřešované manželce jednoho z vojáků sloužících v Iráku, Leane Robertsové. McGee si při prohlídce domu uvědomí, že jeden z pokojů již někdy viděl, a to ve videoklipu zaslaném e-mailem. Na něm byla žena předvádějící striptýz, kterou někdo zezadu napadl a podřezal jí hrdlo. McGee se domníval, že jde o jakýsi vtip. Ukazuje se, že žena v domácnosti si skutečně přivydělávala na internetu a dokonce měla i své webové stránky. Na nich byla i její sousedka Janice Carrová. Vyšetřovatelé ji chtějí vyslechnout, ale dům je prázdný, je tam však nalezena krev. Abby dostává nového asistenta Charlese, ale odmítá s ním pracovat. Posléze je nalezeno tělo Janice Carrové a zdá se, že brzy bude nalezena i Leanne. Mezitím manžel Leanne zažádal o neodkladnou dovolenou a vrací se z Iráku domů.

NCIS kontaktuje šestiletý chlapec Zach, že byl jeho otec Alex Tanner unesen v zábavním parku. Ukazuje se, že otec pracuje pro námořnictvo na tajném projektu Honor a je jediný, kdo má k projektu kód. Chlapec dokáže přesně vylíčit, co se stalo, a popsat oba muže, se kterými otec odešel. Bohužel jeho matka již nežije a není ani nikdo z příbuzných, kdo by si ho vzal k sobě, musejí si ho tedy převzít sociální pracovníci. V úřadě, kde Tanner pracoval, zavládl zmatek, neboť neustále padá počítačová síť, ztrácejí se informace a někdo se do počítače nabourává. Vše je v rukou jednoho člověka - a to Tannera. Je ohrožena bezpečnost všech dalších složek. Vyvstává otázka, zda je Tanner obětí únosu, nebo zrádcem.

Agenti DiNozzo a Davidová vystupují jako manželský pár v utajení místo skutečných nájemných vrahů, jejichž těla leží na patologii NCIS. Mezitím Gibbs zjistí, že NCIS nemusí být jediná agentura angažovaná do případu.

Vojenská jednotka objeví při zásahu v lese dvě odřezané lidské nohy. Neobyčejného případu se ujme NCIS. Na místě činu je nalezen i kousek gumové rukavice s otisky prstů. Mezitím co doktor Mallard a jeho asistent pan Palmer zkoumají, komu patří chybějící končetiny, Abby se pokouší zjistit, komu patří otisky prstů na rukavici. Počítač je opakovaně přiřadí Anthonymu DiNozzovi. Jeho nadřízený Gibbs však tento názor ani na chvíli nesdílí a rovněž tak Tonyho kolegové. Do vyšetřování se zapojuje FBI, která vyslýchá podezřelého agenta NCIS. Gibbs tuší, že jde o past a jeho tým se snaží získat nové důkazy, které by DiNozza očistily.

Tým NCIS má zajistit bezpečnost důležitého člověka z námořnictva, který je právě na odchodu z budovy. McGee se ujišťuje, že je vše v pořádku, a u vchodu vidí muže, jak se hádá s někým v autě. McGee se identifikuje, muž se otočí a McGee zahlédne v jeho ruce zbraň a slyší výstřel, zároveň sám vystřelí. Kolegové najdou McGeeho a mrtvé tělo muže. Auto je pryč. Začíná vyšetřování, avšak nenalezne se ani zbraň, ani kulka, které by potvrdily verzi McGeeho. Naopak se zjistí, že obětí je detektiv metropolitní policie Benedict, který pracoval v utajení na protidrogovém oddělení. McGee je v šoku, protože poprvé v životě někoho zabil. Situaci komplikuje fakt, že se na místě činu nenašla nábojnice ani zbraň, ze které měl policista Benedict vystřelit jako první.

Na námořní základně se natáčí reality show, ve které tři známé modelky cvičí stejně jako vojáci. Absolvují všechny tréninky a žijí ve stejných těžkých podmínkách. Při prohlídce je jedna z nich nalezena v ostnatém drátě mrtvá. Na místě činu se pohybuje množství novinářů, z čehož nemá Gibbs velkou radost. Ducky zjistí, že modelka je mrtvá nejméně 5 hodin a drát nebyl příčinou smrti. Ředitelku Shepardovou opět rozladilo Gibbsovo chování, když se odmítl zúčastnit slavnostního předávání cen...

Při vyšetřování v loděnici, při hledání pašovaných zbraní, zmizí Tony a Ziva. Je na týmu NCIS, aby je našel. Abby se je snaží lokalizovat přes GPS čipy v jejich telefonech, ale ty ukazují, že jsou mimo dosah. Tony se Zivou se mezitím schovají před střelbou do kontejneru, kde nachází důkazy, které by jim mohly pomoci vyřešit případ.

Na centrále NCIS je zaznamenán telefonát ženy, která tvrdí, že byla unesena. Agenti prověří její totožnost. Jde o poručíka Amandu Wilkersonovou, která působí na ministerstvu námořnictva ve Washingtonu. Nehlásí se ani v práci, ani na mobilním telefonu. Gibbs se se svými kolegy pouští do pátrání. Snaží se najít důvod, proč byla unesena. Zjistí, že Wilkersonová je příslušnicí ochrany. Měla na starosti tajný převoz nukleárního odpadu a konkrétně plánovala trasy, kudy vlak pojede. Na jejím oddělení nastala mimořádná situace. V noci odjel z elektrárny v Ohiu náklad jaderných palivových článků. Cíl cesty je přísně tajný, jen pár lidí ví přesnou trasu, kudy vlak pojede a poručík Wilkersonová je zřejmě jednou z nich. NCIS se rozhodla po tomto zjištění vlak zastavit až do doby, než se podaří ženu najít.

Tým NCIS vyšetřuje vraždu dvou námořních manželek a musí najít vrahy dříve, než zaútočí na další cíl, další ženu.

NCIS odhalí nelegální obchod s náhradními díly, který provozují mariňáci. V kufru jednoho auta najdou lidskou hlavu. Hlava patřila námořníkovi, jenž byl již delší dobu po smrti. Gibbsův tým se tak dostane na stopu překupníků s částmi lidských těl.

Tým NCIS je, po explozi sanitky přepravující ostatky námořního důstojníka zabitého při autonehodě, povolán k prověření, co se skutečně stalo. Vyšetřování je vede k několika zajímavým objevům - DNA oběti, nalezená v sanitce, neodpovídá DNA mariňáka; sanitka byla na explozi nastavena; a rodina mrtvého skrývá velmi důležité tajemství.

Roztrhané tělo mariňáka je nalezeno v národním parku. Vše nasvědčuje tomu, že šlo o útok medvěda. V průběhu vyšetřování vyjde najevo, že námořník nebyl v parku sám. NCIS rozjede pátrání po ženě, která byla s ním a je možná ještě naživu. Původní teorie útoku medvěda vezme za své, když se zjistí, že v parku se událo několik podobných případů a možná jde o útoky sériového vraha.

Na základní škole v Quanticu musí tým NCIS zabránit dospívajícímu studentovi, který si vzal ostatní studenty jako rukojmí, v odpálení bomby, připevněné k jeho tělu. Gibbs se ho pokouší zastavit a vstoupí do třídy, kde si uvědomí, že to může být někdo zvnějšku, kdo dospívajícího studenta ovládá.

Dvě děti naleznou pod ledem mrtvolu muže, který je posléze identifikován jako Ryan Downing, člen vojenské mise v Iráku, pohřešovaný od své dovolené. Vzápětí se v rybníku najdou další tři těla s tetováním patřícím pouličnímu gangu. Všichni byli zastřeleni Downingovou zbraní. Vyšetřovatelé zvažují dvě možnosti, buď Downing použil zbraň v sebeobraně, nebo se dopustil trojnásobné vraždy. Na vyšetřování je vyvíjen extrémní tlak, neboť ostatní vojáci z Downingovy roty se právě mají vracet domů a vládnou obavy z toho, že by někdo z nich chtěl smrt kamaráda pomstít...

Ve svém bytě je nalezena zastřelená kryptoložka. Protože armádní velení má informace, že právě z tohoto oddělení unikají informace, má vedení NCIS za to, že žena byla špionem. Jenže pitva odhalí, že žena byla zastřelena ve chvíli, kdy byla v bezvědomí. Stopy vedou k zaměstnanci venezuelské ambasády a NCIS ho dlouho považuje za vraha. Problém je jak ho zadržet. Gibbs však na poslední chvíli přijde na to, že skutečným vrahem a zároveň skrytým špionem je někdo úplně jiný.

V motelu blízko námořní základny je objeven pokoj plný krve a cárů lidské kůže. K případu je povolána NCIS. Následně dojde v laboratoři, kde Abby právě pracuje, k útoku kyanidem. NCIS předpokládá, že oba útoky spolu souvisejí a spojovacím článkem by mohl být Abbyin bývalý duševně narušený přítel. NCIS mladíka sice dopadne, ale na poslední chvíli zjistí, že skutečným útočníkem je někdo úplně jiný.

Agentům NCIS se povede husarský kousek. Podaří se jim zadržet velkou dodávku heroinu i s mladším bratrem šéfa dealerské organizace. Bohužel mladík při převozu záhadně zemře. Je podezření, že za jeho smrt může agentka Ziva. Mezitím však drogový mafián unese ředitelku NCIS a žádá výměnu. Gibbs je postaven před nelehký úkol – najít místo, kde jejich šéfku drží a osvobodit ji.

Gibbs na své misi sehraje scénku s falešným pasem, aby se setkal se svým informátorem Galibem. Ten mu poté v prádelně lodi sdělí, že radista Pinpin Pula je ve skutečnosti terorista Abu Saif a chce vyhodit muniční základnu námořnictva do povětří. Dříve než Gibbs stačí upozornit NCIS, je prádelna vyhozena do vzduchu, Galib je mrtev a Gibbs těžce zraněn, Filipínec Pinpin Pula se pohřešuje. Gibbsův stav je kritický, ale stabilizovaný. Mozek je v pořádku, nicméně Gibbs se neprobouzí a lékař naznačuje, že je zřejmě existuje důvod, proč se nechce probrat z komatu. NCIS začíná pátrat v jeho minulosti, o které Gibbs nikdy příliš nemluvil.

Gibbs v komatu znovu prožívá tragické události z minulosti - těžké zranění z války v zálivu, smrt první manželky a dcerky. Když se konečně vzbudí, myslí si, že je rok 1991 a na své působení v NCIS si nevzpomíná...

Ukazuje se, že Gibbsova ztráta paměti pokrývá celých předchozích patnáct let, pro něho se právě píše rok 1990 a je v Kuvajtu. Vůbec netuší, že je agentem NCIS a nepoznává lidi ze svého týmu. Všichni doufají, že se jedná pouze o dočasný stav a NCIS se nyní snaží soustředit veškeré své síly na to, aby dopadla teroristu Abu Saifa. Vyšetřovatelé odhalují skutečnosti, které před nimi Gibbs tajil, že měl se svou první ženou dceru a obě byly zavražděny, když se on účastnil operace Pouštní bouře. Zároveň vycházejí najevo další skutečnosti ohledně výbuchu, při němž Gibbs ztratil paměť. Je zřejmé, že teroristé připravují velkou akci a Gibbs je jediný, kdo ví o celé záležitosti víc.

Ziva je svědkyní exploze a na místě činu zahlédne starého známého Ariho. Poté se dozvídá, že má být vydána FBI, neboť je obviněna z vraždy íránského vězně a dvou agentů FBI. Pokusí se skrýt, zatímco NCIS pod vedením Tony dělá vše pro to, aby dokázala, že je nevinná. Když se situace zkomplikuje, je Ziva nucena vyhledat pomoc jediného člověka, který jí vždy důvěřoval - Gibbse. Ten si mezitím užívá bezstarostného důchodu, Zivinu žádost ale neodmítne a je dočasně jmenován zpět do funkce.

Gibbs je donucen vrátit se do práce, poté co ho Fornell požádá o pomoc. Utekl Paulsen, obviněný z vraždy, a Fornell byl jedním z lidí, kteří ho do vězení dostali. Paulsen ho žádá, aby znovu otevřel případ, a vyhrožuje jemu i jeho dcerce Emily. Gibbs s NCIS vyslýchají Mickeyho, který jediný byl s Paulsenem v kontaktu, poté co byl poslán do vězení. Záhy tým zaznamená vzkaz pro Gibbse, v němž Paulsen přivádí detektivy k fotografiím, které dokazují nesrovnalosti v důkazech. Nakonec se zdá, že jeho tetování bylo jediným jednoznačným důkazem, který ho označil za vraha. Tým se snaží zjistit, jak je možné, že Paulsen ví o všem, co se u NCIS děje. Gibbs se podle všeho vrací k NCIS nastálo.

Jenny nabídne vlastní tým Tonymu, jenž však váhá a nakonec odmítne životní šanci. Náhle přichází zpráva, že bylo nalezeno opuštěné auto, potřísněné krví, které je registrováno na programátorku námořnictva Anne Sullivanovou. Postupně se daří získávat podrobnosti o jejím životě. Je samotářka a v jejím bytě jsou nalezeny informace o řadě lidí. Z údajů v jejím počítači je zřejmé, že měla v úmyslu zúčastnit se rychlého seznamovacího večírku v místním hotelu. Ziva se jako jedna z účastnic snaží se skenerem otisků prstů najít hledaného muže. Nakonec NCIS zasáhne právě včas, když se expřítel Anne a zároveň jeden ze zlodějů chystá ženy zbavit.

Krátce poté, co policejní hlídka zastaví řidiče a chystá se ho zatknout za neoprávněné držení zbraně, vrazí do jejího auta další vůz s mrtvým mužem za volantem. Je identifikován jako Jack T. Vale a zdá se, že v autě ujel se zraněním pěknou dálku. Dokonce volal o pomoc s tím, že identifikoval teroristu a že ho sleduje. Postupně se prokáže totožnost zatčeného. Je to Rus, který figuroval v operaci Sunburst právě tak jako Vale. O případu ale nelze zjisti další podrobnosti, protože se spis ztratil.

Poté co agentka realitní kanceláře přivede nové zájemce o dům, s hrůzou zjistí, že v křesle v obýváku sedí mrtvý muž. Podle otisků prstů i zubů se jedná o svobodníka Jamese Finna, kterému nešla střelba a ani neuspěl v teste plavání, a tak působil coby zásobovač. Krátce nato se na oddělení objeví dvě ženy a tvrdí, že jsou Finnovy snoubenky. Od obou si Finn půjčil velkou částku peněz a ženy je chtějí zpět. Nalezená předplacená telefonní karta přivede vyšetřovatele do skladových prostor, kde objeví tašku, plnou zlatých mincí. Vzorky DNA prokážou, že Finn měl poměr ještě s třetí ženou. Z peněz, které se našly, Gibbs vrátí dluh oběma ženám, a vzápětí se objeví další Finnova snoubenka. U NCIS se vyvíjí vztah mezi Palmerem a Lee.

O Halloweenu je unesena dcerka Erika Nilese z námořnictva, poté co únosce napadl Nilese u něj doma. Na místě zůstal mrtvý jeden z útočníků. Postupně vyšetřovatelé vyslýchají manželku Lauru a její sestru Rebeccu a zdá se, že Laura něco tají. Telefonát s ní přivede detektivy na Nilesovu současnou adresu, kde před domem stojí auto, odcizené na místě únosu. Nalezený lístek stejně jako fakt, že Laura musela mrtvého znát z práce, jasně svědčí proti ní. Abby šokuje kolegy halloweenským kostýmem, neboť nikdo nečekal, že se před nimi objeví krásná Marilyn Monroe.

Na golfovém hřišti vojenského námořnického klubu zahyne při explozi před zraky svého dospívajícího syna Joshe plukovník Cooper. NCIS prochází záznamy z klubu, ale nic podezřelého nenajde. Případ posouvá dál až informace CIA o podezřelé teroristické buňce, takže pátrání vede do skladiště, na které CIA dostala tip od svého informátora. Je to však past, ale Zivě se na poslední chvíli podaří zlikvidovat nastraženou výbušninu, aniž by zničila možné důkazy. CIA odmítá prozradit svého informátora, nicméně díky McGeeovi se NCIS dostává k tajným vládním dokumentům a získává jméno Mamouna Sharifa pocházejícího z Bejrútu a spolupracujícího s Interpolem. Sharif zprvu nechce mluvit, po slíbené odměně nakonec jisté informace poskytne.

Tony a Ziva slouží jako ochranka ředitelky na jedné akci v hotelu, který se stal na přechodnou dobu jednou z nejlépe hlídaných budov v zemi. Zivě se v poslední chvíli podařilo ředitelku strhnout stranou, když z výšky padal muž, a skončil mrtvý na stole s pohoštěním. Tajemník kongresmana Andy Nelson oznámil, že ho tento muž napadl v 6. patře a pak utekl. Vyvstává otázka, zda skočil sám, nebo mu někdo pomohl. Mrtvý identifikován jako Brian Wright, bývalý příslušník námořnictva, válečný veterán oceněný dvěma vyznamenáními znamenajícími, že byl v bojích třikrát zraněn. Nyní žije jako bezdomovec, rodina se mu rozpadla. Vyšetřování se zkomplikuje ve chvíli, kdy je v jednom z hotelových pokojů nalezena další mrtvola, tentokrát znásilněné nezletilé dívky...

McGee pracuje v noci na své nové knize, když se před dveřmi objeví jeho sestra, dezorientovaná a celá od krve. Nedokáže říct, co se stalo, a McGee se obává, že vzhledem k jejím problémům s alkoholem to mohlo být cokoliv. Sarah se vybavují pouze útržky a nedokáže říct, zda někoho zabila. Posléze vychází najevo, že mrtvý je její bývalý přítel, který ji opustil kvůli její kamarádce roztleskávačce. Sarah nesla rozchod těžce, a dokonce i v mailu napsala, že Jeffa zabije. Navíc si na svém blogu vybíjela nenávist vůči roztleskávačkám a zesměšňovala je. Důkazy jasně svědčí proti ní a McGee se rozhodne informovat NCIS.

Při instalaci nového kotle na jedné škole vypadne z komína vyuzené tělo. NCIS procházejí seznamy pohřešovaných a jsou zaskočeni špatným odhadem doby úmrtí. Při snaze identifikovat mrtvého zjistí, že přístup k údajům zablokovala FBI. Fornell z FBI počítá s tím, že případ je jeho, ale NCIS se ho nehodlá vzdát. Nalezený je identifikován jako Charles Bright a detektivové se vydají za jeho ženou Karen. Na dvoře jejího domu jsou však nalezeny další oběti. Členové týmu žijí knihou, kterou bez jejich vědomí napsal McGee a ve které se najdou.

Poručík Seabrooková je nalezena ve vozidle, fungujícím na bázi robota, otrávená oxidem uhelnatým. "Otto" je součástí unikátního projektu ministerstva obrany a na jeho úspěšnosti závisí další osud firmy. Šéf firmy Eagler, kterýdívku našel, je přesvědčen, že spáchala sebevraždu, a snaží se vysvětlit NCIS, že vyšetřování projekt ohrožuje. Jeho kolega Pike si je ale jistý, že by se Seabrooková nikdy nezabila. V úvahu připadá tedy i sabotáž. Navíc když se Abby snaží s vozem seznámit, ocitá se ve smrtelném nebezpečí. Ziva má starost o Tonyho zdraví, zatímco ten si prožívá románek s doktorkou Jeanne.

Ve venkovském motelu je nalezena zavražděná tlumočnice Rana Shaheenová, pracující pro zpravodajskou službu námořnictva. NCIS přebírá případ, když je žena už tři dny mrtvá a místní úřady případ "vyřešily". Místo činu je uklizeno a pitva provedena. Naštěstí je díky mladé aktivní Ruby řada věcí zachycena v její zprávě. Tony se Zivou stejně jako další kolegové mají McGeeovi stále za zlé, že bez jejich vědomí vydal knihu, v níž mu posloužili jako předloha. Ziva se bojí o Tonyho, zatímco on zřejmě prožívá s Jeanne opravdovou lásku.

Nefungující semafory a následná identifikace blikajících světel jako volání SOS vedou k nálezu mrtvého Johna Maguira. Patřil k námořnictvu a měl na starosti protichemickou a protibiologickou obranu. Zemřel v důsledku přehřátí a na jeho těle nejsou objeveny stopy násilí, až na chybějící oko. Toxická zpráva Abby hovoří o použití chemické zbraně. Stopy vedou k Mamounu Sharifovi, známému z bombového útoku. Mannová z federální policie a Gibbs jsou nuceni znovu spolupracovat. Sharif žádá propuštění skupiny čečenských separatistů a zároveň se hlásí k záhadnému onemocnění šesti lidí, hospitalizovaných v místní nemocnici. Abby řeší své tetování, Tony milostný vztah k Jeanne, který dostává první ránu. Vztah Gibbse a Mannové se mění z pracovního v ryze soukromý.

Když Ziva a DiNozzo dopadnou izraelského obchodníka se zbraněmi Goliatha, dostanou z něho lstí informace o prodeji tajného zbrojního systému Ares. Při probírání Goliathovými e-maily DiNozzo objeví fotografii muže, kterého sledoval před osmi týdny při tajné operaci, řízené ředitelkou NCIS Jennifer Shepardovou. Ziva a McGee pronásledují prodejce Charlese Harrowa. Avšak teprve e-mail přivede vyšetřovatele ke kupci a Ziva s DiNozzem ho mají při předání zastřelit. Nakonec vyjde najevo, že je v akci zainteresována CIA.

V opuštěné restauraci je objeveno tělo mladého muže. Abby dochází k závěru, že šlo o vraždu, neboť byl otráven jedem z oleandrovníku. Jednou z mála stop, kterou tým má, je laminátová kartička, již měl u sebe. Abby přichází s dalšími šokujícími zjištěními. Při zásahu je zraněn kolega Jake, který na následky zranění umírá. Tonyho vztah s Jeanne se zdá ohrožen, neboť Jeanne vyhledal bývalý přítel, neustále jí telefonuje, a dokonce jí poslal stejný valentýnský dárek jako Tony.

Poručík Sanders žádá Gibbse, aby vyřešil jeho vraždu - byl zasažen radiací. Ziva se od prvního okamžiku snaží přijít na to, proč je jí tak povědomý. NCIS dochází k závěru, že otravu způsobilo thalium a došlo k ní zhruba před 72 hodinami. Ziva má tedy za úkol zmapovat 72 hodin života poručíka Sanderse, a tak si vzápětí oba uvědomují, že se potkávají každé ráno při kondičním běhu, a začínají k sobě pociťovat náklonnost. Vyšetřovatelé nakonec objeví zdroj thalia a dopadnou pachatele, právě když se chystá k útěku.

V mauzoleu národního hřbitova došlo k explozi, experti však usoudí, že se nejednalo o výbušninu. Navíc nalezené ostatky nepatří do žádné z hrobek. Při pitvě začíná být jasné, že mrtvých "navíc" musí být více a že vyšetřovatelé mají co do činění s masovým vrahem. Gibbs opět musí spolupracovat s Mannovou. Podaří se určit totožnost jedné z obětí, která vyšetřovatele zavede k jednomu z přihlížejících na místě exploze. Abby se vyrovnává s osobním problémem a jediným člověkem, s nímž je ochotna mluvit, je Gibbs. Zamilovala se totiž do mladíka, který jí půjčil laboratorní vybavení a jehož jedinou vadou je příliš malý vzrůst.

Duckymu na pitevně obživne údajně zmrzlý muž a NCIS se pokouší zmapovat jeho poslední dny. Postižený O´Neill a nemá příbuzné, a tak Gibbse zarazí, když se dozví, že za ním přišel do nemocnice jakýsi příbuzný. Gibbsův bývalý šéf a učitel Mike Franks tvrdí, že O´Neill je jeho ztracený syn. Chvíli padá podezření z pokusu o vraždu i na Frankse. Gibbsův tým se zaměří na leteckou nákladní přepravu a odhalí pašování lidí. DiNozzo si domlouvá schůzku s Jeanne na horolezecké zdi, ale vyhne se jejímu přání, aby jí vyznal lásku. Ke všemu se zdá, že jsou oba sledováni jakousi ženou. Abby se snaží Gibbse přesvědčit o jeho schopnosti předvídat budoucnost.

Víkendový anonymní telefonát upozorní na možné teroristické nebezpečí, avšak posléze se ukáže, že se jednalo o past, která připravila o život dva agenty. Všechny překvapí pitevní zpráva, podle níž byl údajný atentátník mrtvý ještě před explozí. Analýza zvukového záznamu, kterou provedla Abby, totiž potvrdí, že hlas atentátníka je totožný s hlasem mrtvého. McGee a Abby se pokoušejí najít komplice a vzápětí varují Gibbse, který jednoho z atentátníků zatýká, zatímco sebevražedný atentátník utíká tajnými dveřmi. Cassidy se na něho vrhá a obětuje se, aby zachránila ostatní. Gibbs s Mannovou navazují bližší vztah při výuce baseballu, zatímco Tony se snaží získat zpět Jeanne.

Hasiči přijíždějí k nahlášenému kouři, vycházejícímu z oken. Zprvu se zdá, že majitel bytu Cove nechal zapnutou troubu, avšak v kuchyni je velký nepořádek, na zemi krvavá skvrna a vedle ní leží vzkaz. Buď je Cove mrtvý, nebo utekl poté, co spáchal vraždu. Posléze je nalezeno jeho auto a kolem velké množství krve. McGee je v šoku, neboť situace odpovídá jedné scéně v jeho knize. Seznamuje kolegy se svou novou knihou, připouští, že jeho postavy jsou zpravidla založeny na skutečných lidech. Jediný rukopis má jeho vydavatelka, která se stává hlavní podezřelou.

Ředitelka Shepardová udělá chybu, když se v honbě za La Grenouillem pokusí setkat s informátorem. Vyšetřovatelé se zprvu domnívají, že útok naplánoval La Grenouille, ale agent CIA, který ho sleduje, tvrdí že to není jeho styl. Díky detailnímu rozboru rozbitého skla a stříkance krve lokalizuje Abby místo jednoho ze střelců. Shephardová ví ještě o dalším svědkovi, který může doložit spojitost útoku s La Grenouillem, a musí ho najít, jinak jí La Grenouille opět unikne.

Poté, co slepý fotograf zjistí, že vyfotografoval mrtvého, a ohlásí to policii, jsou jeho paměť a pořízené snímky jedinými vodítky NCIS. Vyšetřovatelé se postupně dostávají ke kolegovi oběti, který byl vyšetřován kvůli zpronevěře. Ale když je i on nalezen mrtvý s dopisem na rozloučenou a přiznáním, pochopí Gibbs, že dopis byl vynucený. Nečekané schopnosti slepého fotografa i skrytý vzkaz v dopisu na rozloučenou přivedou detektivy ke skutečnému vrahovi.

Do areálu NCIS přiváží taxikář zákazníka, při vstupní kontrole se však ukáže, že je mrtvý. Podle řidiče Joea Kellyho působil pasažér při nastupování dojmem, že ho kdosi honí. V jeho peněžence je nalezen seznam sedmi lidí nichž pět je již mrtvých. Jemenská ambasáda posílá svého atašé, aby identifikoval mrtvého. Shepardová získá v Evropě informace o muži, známém jako La Grenouille. Schází se s Borovovem a chce, aby podepsal, že si u něho La Grenouille objednal zbraně. Borov ji však upozorní, že za zbraně dostal zaplaceno i její otec. Shepardová je v šoku, protože se domnívá, že je její otec mrtvý, zatímco Borov tvrdí, že ho před třemi týdny navštívil v nemocnici.

Shepardová se vrací z Evropy a na letišti ji čeká asistentka Cynthia. Zároveň celnicí prochází i Devin, a protože nedává pozor, srazí ho auto. Událost pozorně sleduje malá holčička. Jenn se po příjezdu domů diví, kde jsou některé její věci, a ptá se služebné, zda v jednom z pokojů někdo nebyl. Abby připravuje McGeea na povinný test na detektoru lži. Za Devinem do nemocnice přijde sestra Bernie s přítelem Nickem, který Devina napadne. Abby přichází v nezvyklý čas do laboratoře, neboť ji ředitelka požádala o prověření otisků na lahvi a skleničkách. Gibbs žádá McGeea, aby se naboural do databáze CIA a vyhledal informace týkající se Shepardové. McGee s Gibbsem naleznou informace o Jasperu Shepardovi. Tonyho čeká velké překvapení.

Gibbs s kolegy mají malý problém, nemohou najít Tonyho Dinozzu. Brzy však pochopí, že ředitelka Shepardová ví víc. Ta se ostatně brzy přizná, že Tony na její příkaz pronikl do blízkosti překupníka se zbraněmi La Grenouillea. Jenže teď se ředitelce ozval signálem, který měli domluvený v případě prozrazení jeho identity. Tým se naštěstí dokáže přes sledovací zařízení napojit na městské zabezpečovací kamery, k jejich úžasu jeho auto vybuchne. Naštěstí v něm neseděl, zahynul jeden z lidí Grenouilla. Tony informuje ředitelku, že se chce Grenouille vzdát. Jejich setkání nedopadne dobře a ředitelka mu odmítne poskytnout ochranu. Když jdou LaGrenouliho zatknout na jeho loď, netuší, že jeho mrtvé tělo plave kousek dál v řece.

Tým je přivolán k vraždě mladého námořníka, byl zastřelen ve svém autě. Jenže o kus dál najdou policisté tělo mrtvé dívky. Pitva prokáže, že dívka krátce před svou smrtí porodila. Protože hrozí, že je dítě v ohrožení života, musí pátrání urychlit. Stopa vede do místního autoservisu, kde se dozvědí, že dívka byla známou podvodnicí, která obírala muže o peníze. Výpis z jejího konta je přivádí k jistému manželskému páru, přiznají se k tomu, že zavražděná dívka byla náhradní matkou, která měla donosit jejich dítě. Teď ji někdo zabil a manžele vydírá...

Jill Reynoldsová se vrací domů z konference a nachází svého manžela kapitána Rejnoldse probodnutého šípem z kuše. NCIS zabavuje jeho laptop a dává ho k dispozici Abby. Ale protože kapitán pracoval u tajné služby ministerstva obrany, je možné, že laptop obsahuje citlivé materiály, proto oddělení vysílá počítačového technika Freda, aby na Abby dohlédl. Vyšetřování je svěřeno plukovnici Manové a hned s prvním podezřelým přichází nové překvapení...

Patolog při vyučování nových studentů objeví, že mrtvý zemřel po té, co mu kdosi vpíchl do mozku rtuť. Při vyšetřování se střetnou s agentkou FBI, která mrtvého muže zná. Měl informace o takzvaném likvidátorovi, který na objednávku zařídil novou identitu a starou zlikvidoval. Gibbs se svým týmem brzy narazí na velmi závažné informace...

Na střeše výškové budovy stojí mladý mariňák a chystá se spáchat sebevraždu. V okamžiku, kdy mu to Gibbs rozmluví, muže někdo zastřelí. Ukáže se, že trpěl hlubokými depresemi, které byly způsobené podáváním špatné kombinace léků. Do pátrání se plete i Vojenská tajná služba, jelikož oběť pracovala jako arabský překladatel na Středním východě a většina materiálů týkající se jeho osoby, je tudíž tajná. McGee je přesvědčený, že vrahem je mariňákův lékař. Ziva sází na jeho velitele, Tony na truchlící manželku. Gibbs je znechucený nejednotností týmu. Nakonec do případu vnáší světlo Abby.

Na výzkumné lodi dojde k záhadnému úmrtí jednoho z členů posádky. Když Gibbsův tým dorazí na loď, aby smrt vyšetřili, posádka je pryč a loď vypadá jako Loď duchů. Ziva je přesvědčená, že je na palubě ještě někdo další. Velitel Skinner, který je za loď zodpovědný, odmítá ředitelce Shepardové sdělit, co bylo cílem mise. Ducky provede předběžné ohledání a zjistí, že mrtvý námořník zemřel na hemoragickou horečku. Je tedy důvodné podezření kontaminaci. Když ale Ducky potvrdí, že virus byl do těla oběti dopraven injekční stříkačkou, je jasné, že nešlo o náhodnou nákazu, ale promyšlenou vraždu.

Gibbse navštíví mladá dívka Maddie, aby ho požádala o pomoc před dotěrným ctitelem. Jako dítě bývala nejlepší kamarádkou Gibbsovy mrtvé dcery Kelly. Když je ale Maddie unesena a Gibbs začne vyšetřovat minulost jejího údajného ctitele, zjistí, že se před pár dny vrátil z Iráku, kde pracoval v oddělení logistiky. Krátce nato najdou jeho tělo a do hry vstupuje organizace pro obnovu Iráku, která prováděla finanční audit a zjistila ztrátu značné částky peněz...

Admirál jede taxíkem na důležitou schůzku, když vtom taxík dožene motorka a posádka začne střílet. K případu je povolán tým NCIS. Zjišťují, že obětí nebyl admirál, ale taxikář, který svým profilem odpovídá povstalci, kterému se podařilo z Burundi utéct a získat ve Státech statut politického uprchlíka. Když přijede manželka, aby identifikovala tělo, zjistí, že to není její muž. Vrazi se snaží zabíjet lidi, kteří jsou mu podobní, aby se nemohl vrátit a vyburcovat burundský lid k povstání.

McGee jako instruktor skautů přivede svou skupinu na exkurzi do NCIS. Když procházejí laboratoří, chtějí vidět práci s databází AFIS. Abby namátkou vybere chlapce, sejme mu otisk a zjistí, že chlapec je vedený jako unesený svým vlastním otcem. Tým začne otce prošetřovat, a ukáže se, že je hledaný pro vraždu majitele obchodu. Otec se ale cítí nevinný a Gibb mu věří. Nastraží tedy na skutečného pachatele po letech past.

Z psychiatrického oddělení v nemocnici v Bethesdě uteče mariňák, který se před dvěma týdny vrátil z mise v Iráku a musel být hospitalizován kvůli post traumatickému šoku. Myslí si, že je stále na misi, žije v představách, že jede za svým bývalý kolegou u Iráku, aby ho zachránil. Gibsův tým ho najde a vrátí zpět na psychiatrické oddělení. Ale krevní rozbor ukáže, že byla určena špatná diagnóza. Nešlo o post traumatický šok, ale o stres způsobený vysokými dávkami steroidu v kombinaci s maskovacími látkami. Gibbs a jeho tým pátrají, kdo se snažil vytvořit super vojáka a použil desátníka muže jako pokusné morče.

V uličce dva bloky od mešity se najde tělo námořníka. Ukáže se, že jde o muslima Abdula, který byl několikrát na misi v Iráku a dostal stříbrnou hvězdu a purpurové srdce za chrabrost. Otec vojáka poprosí Duckyho, aby z náboženských důvodů nedělal pitvu. On z osobních pohnutek souhlasí. Místo toho odveze tělo na magnetickou rezonanci, kde objeví kus ulomené jehly v Abudově těle. Až dosud se domníval, že ho vrah zastřelil, teď ale zjišťuje, že zemřel po vpíchnutí prudkého jedu dřív, než ho zasáhla kulka. Gibbs se vrací do mešity a stopa ho zavede k německému náboráři nových stoupenců Al Kajdy.

Někdo ukradne přísně tajný právě vyvíjený radarový systém, určený pro americký námořní torpédoborec. Dostanou tip, že je radar ukrytý v pochybné čtvrti. Když se jedna z kamer ohlásí, že má slabé baterie, jde je McGee vyměnit a zjišťuje, že pachatel během jejich sledování radar odnesl. Vzápětí se na ulici strhne zdánlivě nevinná hádka, která končí smrtí neznámého muže. Do hry vstupuje policie. Když se ale ukáže, že mrtvý byl oním tajemným informátorem, musí Gibbs spojit síly s policií a kromě radaru začít hledat i vraha.

Gibbs a jeho tým přijíždí zajistit muže podezřelého z pašování drog přes základnu. Námořníka však najdou mrtvého a McGeeho napadne jeho pes. Zdá se, že se voják stal obětí svého vlastního vlčáka. McGee zvíře zraní, ale Palmer a Ducky ho ošetří a odvezou k Abby, aby z něj sejmula důkazy. Ta si zvíře oblíbí a je přesvědčená o jeho nevinně. Když se psův zdravotní stav rapidně zhorší, Ducky a Jimmy ho operují a vyjmou mu z žaludku hrot z nože. Je tedy jasné, že námořníka někdo zabil a pak se to snažil zamaskovat jako napadení psem...

FBI začne vyslýchat celý tým NCIS. Vyšetřují vraždu překupníka drog La Grennouliho. Hlavní podezřelou je ředitelka Shepardová, která na jeho případu měla tak velký zájem, že kvůli němu poslala do utajení agenta Dynozu. Celý tým začne případ vyšetřovat na vlastní pěst. Z Afriky se vrací překupníkova dcera Jeanne a agentu FBI Fornelovi řekne, že viděla střílet Tonyho. Nakonec jsou Shepardová a Tony očištěni a podezření padá na agenta CIA Korta, který pracoval v utajení jako La Grennouliho pravá ruka. I přesto se nad případem dál vznáší otazník a Gibbs má své pochybnosti.

V Bagdádu je při útoku minometu zabit námořník. Jeho žena zatahá za nitky, aby jeho pitvu prováděl Ducky. Ten zjistí, že voják byl zastřelen a minomet posloužil jen jako zástěrka. Zastupující ředitel Vance posílá do Bagdádu Tonyho a Nikki. Ti zjistí, kdo střílel, ale než muže najdou, někdo mu vyřízne jazyk a zabije ho. Gibbs a McGee zjistí, že se mrtvý chystal koupit se svým obchodním partnerem velký pozemek, ale pak si to v poslední chvíli rozmyslel...

Ziva pracuje v utajení, aby byl dopaden brutální vrah nevěrných manželek námořníků, Hoffman. Ten po své páté vraždě odjíždí se Zivou autem. Akce se ale nepovede, Hoffman se dovtípí a chce ji zabít. Ziva ho v sebeobranně zastřelí. Případ je zdánlivě vyřešený, dokud Abby na vražedné zbrani nenajde otisk prstu, který nepatřil vrahovi ani jeho obětem. Zdá se, že Hoffman má napodobitele. Podezření padá na jednoho z hostů baru, kde si vrah vybíral oběti, ale Ziva je přesvědčená o jeho nevině.

NCIS je přivolána na staveniště rekonstruovaného domu, kde byla na střeše výtahové klece objevena mrtvola muže. Při ohledání místa činu Palmer zahlédne u mrtvého cizího muže, který mu sebral pas a při pronásledování na něj vytáhne zbraň a vystřelí. Otisky mrtvého nejsou nalezeny v žádném ze systémů a zdá se, že ani jeho mobil nepomůže odhalit více informací. Identifikace bílého prášku z obličeje mrtvého vede vyšetřovatele k přesvědčení, že dotyčný v místě vrtal a na základě toho nalézají další lidské tělo, tentokrát zalité v betonu...

Ředitelka Shepardová jede do L.A. na pohřeb svému kolegovi, který náhle zemřel na infarkt. Tony a Ziva ji doprovázejí jako ochranka. Na pohřbu se objeví záhadný muž a ptá se po panu Ošimaidovi. To byl krycí kód pro deset let starou operaci, které se ředitelka Shepardová zúčastnila spolu s Gibsem a agentem Deckerem v Moskvě. Jenny je jasné, že Deckerova smrt není náhoda a že bude zřejmě další na řadě. Požádá o pomoc Mika, Gibbsova bývalého šéfa a přítele, a vydává se tajemného muže hledat. Ziva a Tony zjistí, že něco není v pořádku a začnou ředitelku hledat. Bohužel přijíždějí pozdě. Ve starém bistru v poušti došlo ke konfrontaci mezi ředitelkou a členy ruského komanda a ředitelka podle všeho přestřelku nepřežila.

Ředitel Vance nechá převézt těla střelců a ředitelky Shepardové do Washingtonu, aby Ducky mohl provést pitvu. Gibbs oznamuje zprávu o ředitelčině smrti svému týmu. Všichni se snaží najít vraha. Ředitelčiným zástupcem byl prozatím jmenován Leon Vance, který se kormidla ujímá s velkou vervou. Gibbs se vrací zpět do minulosti, aby zapátral, kde se stala chyba. Mike je přesvědčený, že když jsou dva agenti starého případu mrtví, je teď řada na Gibsovi. A McGeemu se podaří zjistit totožnost tajemné ženy ve voze ruského střelce Viga.

Po smrti Shepardové se novým ředitelem NCIS stává Leon Vance. Nový tým se zabývá nálezem mrtvoly pracovníka strategického plánování, který měl jednu z nejvyšších bezpečnostních prověrek. Je pohřešován již čtyři měsíce a našel se u něho poměrně vysoký obnos peněz...

McGee a Ziva jsou pověřeni informovat manželku Chada Evanse o tragické události jejího manžela. Ten zřejmě spáchal sebevraždu skokem z lodi, na které sloužil. Když však za Lyndi Evansovou dorazí, naleznou ji mrtvou...

Projížďka mladého páru na horských kolech končí nečekaně ve chvíli, kdy mladík padá i s kolem do rybníka. Když se vynoří, vedle něho na hladině plave mrtvola mladší ženy. Brzy se zjistí, že mrtvá pracovala pro Pentagon...

Před barem dojde ke rvačce, která končí jedním mrtvým a jedním zraněným návštěvníkem. Třetí z nich se zřejmě zachránil, když se vracel zpět do baru pro kartu. Záznam z kamery však vyloučí rvačku a vše klasifikuje jako přepadení...

Liz Adlerové kdosi vypustil pneumatiky a proto zamíří za sousedem s prosbou o pomoc. K jejímu velkému zděšení nalezne jeho tělo visící za ruce v dílně se zjevnými stopami po mučení. Sejmuté otisky na bedně s nářadím upozorní na jeho velitele, který byl před třemi týdny poslán do důchodu kvůli nemoci krve...

NCIS je přivolána k případu, kdy se ze sprchy valí potoky lidské krve. V jedné z místních vodních nádrží je objeveno tělo muže a v jeho ústech se najde odkaz na webové stránky se záznamem právě spáchané vraždy. Je jasné, že jde o první oběť a mrtvých může být daleko více...

Banka, která se nachází přímo na základně v Quantiku a dosud nikdy nebyla přepadena, se tentokrát stala terčem zlodějů a při loupeži byl zastřelen jeden ze strážců. Zločin musel plánovat někdo, kdo tamní poměry velmi dobře znal...

Gibbs a jeho tým se musí pokusit uvnitř informačního systému spojeného pouze s Bílým domem a Pentagonem odcizit jisté informace, aniž by za sebou zanechali jakékoliv stopy. Jenže akce selže a je patrné, že v NCIS došlo k úniku informací. Gibbs musí přiznat, že uvnitř NCIS je zrádce...

Vance s Gibbsem řeší rozsah úniku informací a fakt, že vedení chce co nejdříve dopadnout únosce. Lee kontaktuje neznámý muž, ale když se ho vyšetřovatelé chystají sledovat, Lee jim v tom nepřímo zabrání, aby nebyla prozrazena...

Na pláži, kde právě probíhá večírek, se náhle objeví zraněný muž a padá mrtvý k zemi. Na první pohled se jedná o oběť automobilové nehody, ale posléze se na jeho těle najdou vážnější zranění staršího data a navíc začíná být zřejmé, že se na auto mrtvého muže střílelo...

Detektiva metropolitní policie Justina Kempa, který vyšetřuje dvojnásobnou vraždu staršího manželského páru, přivedou do NCIS otisky nalezené na místě činu. Ty patří bývalému poddůstojníkovi a veteránovi z Vietnamu. Ale podle záznamů by měl být již nějakou dobu mrtvý...

Tým speciálních agentů pod vedením zkušeného vyšetřovatele Leroye Jethro Gibbse, musí řešit jakýkoliv zločin týkající se zaměstnanců vojenských námořních sil…

Tým speciálních agentů pod vedením zkušeného vyšetřovatele Leroye Jethro Gibbse, musí řešit jakýkoliv zločin týkající se zaměstnanců vojenských námořních sil...

Dcera námořního kapitána přijede spolu s bývalým snoubencem nahlásit otcovo zmizení. Ve stejnou chvíli vyšetřovatelé získávají informaci o nalezeném těle, jehož popis odpovídá zmizelému. Podle všeho byl dotyčný otráven oxidem uhelnatým a následně došlo k vyvržení vnitřností...

Při prodeji a zkoušce zbraní ve skladišti se zřítí část střechy a spolu s ní i mrtvola mladého muže, který před čtyřmi měsíci nastoupil k námořnictvu a chystal se odjet na misi. Zarážející je skutečnost, že se podle všeho střílelo celkem nedávno, ale nalezená krev je již dávno zaschlá.

Mezi špinavým prádlem se v jednom hotelu najde mrtvola pracovníka ministerstva obrany. Podezření padá na muže, který se vydával za agenta DiNozzu a byl mu i podobný. Vše začíná být jasnější ve chvíli, kdy DiNozzu vyhledá muž, kterého agent dříve obvinil z krádeže peněz...

Přímo na ulici je z jedoucího auta zastřelen agent Jack Patterson. Vzápětí přichází Abby s přiznáním, že se s ní dotyčný měl sejít a chtěl jí něco ukázat...

Ducky na základě žádosti Vance provádí pitvu muže vyloveného z Michiganského jezera, jehož mrtvolu mu poslal chicagský patolog. Gibbsovi Vance pouze vysvětlí, že mrtvý byl jeho přítel, ale příslušností k námořnictvu spadá do jejich jurisdikce. Gibbs má o tom ale značné pochyby...

V domě na námořní základně se pod postelí malého hocha najde nabitá zbraň, ze které se nedávno střílelo a na jejíž hlavni se našly zbytky mozku. Chlapec tvrdí, že ji našel na hřišti v kanálu. Vyšetřování ukáže, že stejnou zbraní byl před čtyřmi roky zabit zaměstnanec pošty svým sousedem...

Gibbs se má dostavit na domluvenou schůzku. Když ale na místo dorazí, najde zde dva mrtvé muže. Postupně se dozví, že se jedná o muže pracující pro hledaného zločince. Ten by se podle všeho měl na místě činu ještě ukázat. Gibbs proto přivolává svůj tým...

Hlas zachycený dětskou chůvičkou přivede NCIS k mrtvému bosému vojínovi Marcovi Riggsovi. Mrtvý měl u sebe vojenský scanner, který však chybně použil a skončil tak na úzkopásmové frekvenci. Podle všeho muž trpěl nedostatkem kyslíku, ale žádné známky po škrcení či dušení se nenašly...

V nedostavěné budově se najde přivázaný a popálený vojín Nick Francis Chandler. Záhy se ukáže, že po muži pátrá NCIS v Los Angeles. Údajně se právě vrátil z Kuvajtu, kde mu někdo dal čtvrt miliónu dolarů, které měl předat na jedné adrese v Los Angeles...

Gibbs a McGee pokračují ve vyšetřování vraždy člena místní sekce NCIS. DiNozzo musí prověřit Zivinu loajalitu, zvláštní agent v utajení se snaží odhalit teroristickou buňku a psycholog zjišťuje pravdu o Gibbsově vztahu k agentce Macyové...

Během partičky pokru šéfů tajných služeb někdo odstraní jednoho z agentů úřadu, který zajišťoval bezpečnost celé akce. Brzy je objevena štěnice přilepená na skle a podle karetní partie, která zůstala na stole, lze soudit, že zúčastnění hru vůbec neuměli hrát...

Zivin byt vyletí do povětří. Na místě výbuchu se najdou tři zářezy v plynové trubce, pozůstatek spouštěče, právě tak jako zbytky laptopu, jenž byl podle všeho schovaný pod skříní. Ziva chce věřit tomu, že výbuch byla pouhá nehoda, ale Gibbs jí dá jasně najevo, co si o věci myslí...

Tým pracuje na případu vraždy seržanta Kevina Wingata, ale zároveň řeší nepřítomnost Zivy.Tony s McGeem se domnívají, že se k NCIS již nevrátí a naznačí Gibbsovi, aby si sehnal náhradu. Jednotlivé členy týmu ale zneklidňuje fakt, že se Ziva dosud nikomu z nich neozvala a postupně po ní začínají pátrat...

NCIS řeší případ tří zavražděných, jejichž těla našla v motelovém pokoji objednaná striptérka. Jednou z obětí je seržant Jeff Ross, který se svými dvěma přáteli připravoval v motelu večírek, na kterém měla žena vystoupit. Zarážející je, že podle jejích slov Ross odpoledne při domlouvání celé akce ještě neměl vyholenou hlavu...

Matt Burns dopadne z mostu přímo na staveniště, kde zůstane ležet mrtvý. Krátce před svou smrtí se měl setkat se svým zdrojem a chystal se na blogu uveřejnit nová fakta. Obviňoval NCIS a zmiňoval řadu pochybení významných a vlivných lidí, jejichž prokázání by pro ně mohla mít fatální následky...

V síti rybářské lodi v Indickém oceánu jsou vyloveny ostatky Daniela Cryera. Podle všeho se infiltroval mezi teroristy a naposledy byl spatřen na palubě ztroskotané nákladní lodi, na které cestovala i Ziva. Zarážející je, že mrtvola byla zabalena v igelitu...

V ulicích se slaví Halloween a skupinka dětí připravuje žertík na místního šprýmaře, který se právě vrátil z Afghánistánu. Pak si ale všimnou, že z jeho auta vede jakási hadice. Když auto otevřou, najdou uvnitř muže mrtvého. Ačkoliv se smrt na první pohled jeví jako sebevražda, zabarvení kůže ukazuje na vraždu...

K lodi námořnictva připluje plachetnice se dvěma mrtvými těly. Vzápětí se zjistí, že se jedná o Gibbsovu plachetnici, kterou daroval svému příteli a podle všeho připlula z Mexika. Oběťmi jsou dva z armády propuštění muži, v jejichž tělech se našlo několik střel...

Při kondičním běhu lesem narazí dva muži uprostřed lesa na opuštěné auto a uvnitř mrtvé tělo. Jedná se o lékaře a v kufru jeho vozu se nalezne i chirurgické náčiní. Zdá se, že se jeho pacient snažil skrývat. Oběť byla zastřelena tak, aby umírala dlouho a vykrvácela...

V centrální trafostanici dojde k potyčce mezi ochrankou a maskovanými útočníky a celé DC se zahaluje do tmy. Potyčka má za následek smrt příslušnice námořnictva. NCIS nezbývá, než se při řešení případu vrátit k metodám, které byly běžné před zavedením počítačů...

Dva chlapci narazí v obilném poli na strašáka, z kterého teče krev. Když mu sundají hlavu, zjistí, že na kůlu visí lidské tělo. Mrtvý je identifikován jako svobodník Lazada. Podle všeho byl zabit někde jinde a navíc mu bylo obnoveno jeho tetování patřící jednomu z gangů...

Dvojice mladých lidí na cestě do lesa najde v závějích sněhu tělo mrtvého muže oblečeného pouze v košili a s krvavou ránou na hlavě. Zjistí se, že jde o Thomase Ellise, jehož otec působí jako reverend, a dotyčný muž přešel před osmi měsíci z křesťanské na muslimskou víru...

Strážci parku v Apalačském pohoří naleznou při zjišťování následků lesního požáru ohořelé tělo mrtvého pilota. Všechny zaráží, že nikde není stopa po padáku. Brzy vychází najevo, že muž patřil do skupiny, která se věnovala experimentálním způsobům létání...

Při jedné hodině kurzu pro piloty exploduje vůz saúdského prince a zabit je princův řidič, který měl k autu právě namířeno. Vyšetřování ukáže, že se nejednalo o teroristický čin a bomba byla podomácku vyrobena...

Uklízečka najde ve vaně jednoho bytu mrtvého muže zasypaného posypem pro kočky. Podle stop se nejedná o krádež, vyšetřovatelé v sejfu objeví drahé hodinky a složku s novinovými výstřižky k nevyřešenému případu. Zdá se, že se mrtvý muž nechával najímat coby zabiják...

Auto pronásledované policií exploduje. Je registrováno na muže, který se právě vrátil z druhé mise z Iráku. V blízkosti vozu je zjištěna radiace a potvrdí se přítomnost kobaltu 60 využitelného pro výrobu špinavých bomb...

Veterán z Iráku Damon Werth se obrátí na Gibbse se žádostí o pomoc. Jeho společník pracující pro přepravní společnost Aarona Szweda byl totiž zavražděn...

Mladý pár se na mole ve dvě hodiny ráno snaží uspat dítě, když se ozvou výstřely a oni uvidí ženu, jak se sklání nad mužem v námořnické uniformě. Bezpečnostní kamery nic nezachytily, což znamená, že pachatel musel oblast dobře znát...

Hlídač parku si zajede do nejbližšího lesíku na svačinu, když ho tam vyruší střelba. Posléze se z lesa vynoří zraněný muž a zkolabuje. Jedná se o muže, který se podle služebních záznamů ztratil před šesti lety v Afghánistánu a jeho žena byla přesvědčena, že je dávno mrtvý...

Při kondičním běhu po pláži si jeden z mužů všimne mrtvého těla v neoprénu. Mrtvý zemřel zhruba před třemi dny a po smrti přišel o část levé ruky, kterou mu uřízl lodní šroub. Ukáže se, že případ může mít souvislost s úmrtím kapitána záchranné lodi, který vyšetřuje Pobřežní vyšetřovatelská služba...

Do kapoty jedoucího auta plného nepozorných teenagerů narazí muž a sesune se přímo před ním. Ukáže se, že ho někdo bodl několikrát do zad. Místem činu byl hotelový pokoj, kde se podle manželky zavražděný stýkal s prostitutkou, protože o její práci připravoval článek...

Při večerním kondičním běhu zaslechne muž volání o pomoc. Když se snaží zjistit, co se stalo, zasáhne ho střelba přímo do hrudníku. Ve vodě je poté nalezeno další mrtvé tělo. Ukáže se, že se jedná o kriminálníka Stefana Delmara, který měl svědčit v jednom z případů...

Před nemocnicí téměř narazí do sanitky i s pacientem přijíždějící vůz. Řidič je již mrtvý a ukáže se, že sestrou oběti je televizní reportérka. Od jejího producenta se vyšetřovatelé dozvídají, že jí před dvěma týdny při dopravní nehodě zahynul přítel a ona se stala vykonavatelkou jeho závěti zahrnující i staré knihkupectví...

V kufru auta, které se právě začalo na vrakovišti šrotovat, byla nalezena mrtvola muže. NCIS zjistí, že mužem je Ray Collins, který během působení v Afghánistánu čelil řadě obvinění...

Gibbs povolává tým k řešení dalšího případu v Annapolis, kde se na ohništi objevilo ohořelé lidské tělo. Výsledek identifikace všechny otřese...

Vance posílá Zivu s Tonym do Mexika pro mrtvé tělo patřící zřejmě Bellovi. Ukáže se, že kulky nalezené v jeho těle pocházejí z Gibbsovy zbraně a vypadá to, že se někdo pokouší na Gibbse nalíčit past...

Několik měsíců po neúspěšném vražedném pokusu drogové baronky Palomy Reynosové na Gibbsova otce se Gibbs a tým stávají potencionálními cíli, když je vyšetřování vraždy pilota helikoptéry zavede opět k pomstychtivé Palomě, jejíhož otce Gibbs zastřelil. Vzhledem k tomu, že je Paloma stále na svobodě, musí Gibbs udělat vše pro to, aby ochránil ty, které miluje. Pomocnou ruku mu poskytne starý přítel Mike Franks.

Ve škole na vojenské základně Quantyko někdo vypustí uspávací plyn. Když jsou přepočítáni studenti, ukáže se, že zmizela dívka jménem Rebeka. Rebečini rodiče jsou momentálně na misi na letadlové lodi v Zálivu a o dívku se stará její dědeček Mason. Když ale Gibs začne prověřovat jeho minulost, ukáže se, že Mason má vykonstruovanou minulost. Zdá se, že je bývalý tajný agent, ale žádná agentura se k němu nehlásí. A když kolem Masona začnou umírat lidé spojení s jeho minulostí, Gibsovi dojde, že nejde o únos, ale o jakousi vendetu z dávné minulosti.

Do domu seržantky Heather Dempseyové se někdo vloupá. Zdá se, že jde o zloděje. Heather neváhá a zastřelí ho. Spolu s ní je v domě její milenec, vysoce postavený člen FBI Gary Tolin. Když ale Abby určí totožnost mrtvého, zjistí, že nešlo o zloděje, ale o nájemného vraha. A tak Gibbs přizve k vyšetřování agenta FBI Fornella. Jenomže se ukáže, že cílem zabijáka nebyl Tolin, jak se všichni domnívali, ale seržantka Dempseyová. Vraha na ni najal člen drogového gangu Gene Abbot, který měl na svědomí zdraví jejího bratra. To si ale Heather nenechá líbit a rozhodne se pomstít.

V nepoužívané vířivce je nalezeno tělo mrtvého rotmistra Edwarda Bicka. Manželka Tonymu prozradí, že pracoval na nějakém tajném projektu CIA a že ho někdo krátce před smrtí sledoval. Gibbs se dozví, že Bick měl hlídat tři miliony v označených bankovkách, které měly být předány drogovým dealerům v Afganistánu. Do hry však vstupuje styčný důstojník Malloy, člen britského námořnictva, který odmítá Gibse pustit na letadlovou loď, která byla zřejmě místem činu. Stopy na lodi nakonec najdou, ale peníze jsou pryč. Podezření padá na Malloye, ale ten se na Gibse soukromě obrátí, aby se mu svěřil, že na něj někdo v CIA nastražil past.

Do jedné rozhlasové stanice vrazí muž s puškou a zastřelí moderátora, technika a hosta, námořního poručíka Danielse. Ukáže se, že muselo jít o nějakého extrémistu, kterému se nelíbí, že Spojené státy vynakládají prostředky na vojenské akce v zahraničí. Stopa vede do separované luxusní čtvrti washingtonské smetánky...

Autobus na ulici srazí námořní důstojnici Cleu Thorsnovou. Svědci vypovědí, že se chovala velmi paranoidně. Ale Ducky při pitvě zjistí, že Clea byla otrávena. Stopa vede do biotechnologické společnosti, kde donedávna pracovala na projektu pro Americké námořnictvo. Hledala nové zdroje zelené energie a byla ve svém oboru génius. Její osud ale velmi zasáhne Abby, která se ze všech sil snaží vypátrat, co znamenají tajemné vzorce v Cleině bytě. A jak se zdá právě onen tajemný vzorec bude klíčem k vraždě a k odhalení Cleina vraha.

Před budovou akademie je nalezeno tělo bývalého člena armády a současného zaměstnance nadnárodní hlubinné důlní společnosti Woodyho Iversona. Byl letitým přítelem člena generálního štábu v Pentagonu admirála Chase a chtěl se s ním sejít před akademií. Gibbs a jeho tým se dovídají, že se admirálovi chtěl svěřit s tím, že jeho společnost našla ve Středozemním moři vrak havarovaného letadla, který na své palubě před padesáti lety nesl vodíkovou bombu MK 15.

Ředitel Vance organizuje ve Washingtonu konferenci, na které se mají provádět revize starých případů. Přizváni jsou všichni bývalí ředitelé a agenti NCIS. Mimo jiné i ředitel Mosadu a otec Zivy Eli David. Jenomže kdesi v Mexickém zálivu se objeví tři mrtvá těla údajných pašeráků. Gibbs zjistí, že pašeráci přivezli do Spojených států tři teroristy, kteří se už léta snaží Eliho Davida zabít. Gibbs zorganizuje prvotřídní ochranku, ale dojde k přestřelce. Následuje převoz ředitele Davida zpět do zabezpečeného domu. Cestou ale dojde k nehodě.

Po výbuchu v chráněném domě NCIS je Hadar mrtvý, Vance těžce raněný a Eli beze stopy zmizí. Gibs zjišťuje, že celá věc by mohla souviset s dvacet let starým případem, který se odehrál v Amsterodamu. Vancovi byl jako mladíkovi svěřen úkol vyhledat jistého Rusa. Gibbs věří, že právě Amsterodamský případ je klíčem k řešení. Myslí si, že cílem útoku neměl být Eli David, ač to tak mělo vypadat, ale Leon Vance.

Okresní žalobkyně Walshová se na Gibse obrátí o pomoc při hledání po nezvěstném rotmistrovi. Ten má být klíčovým svědkem v případu vraždy. Gibs a jeho tým se případu ujímají a svědka Jerryho brzy najdou. Ten jim prozradí, že se raději ztratil, jelikož mu někdo předal DVD, na kterém Jerry spí a někdo mu pod krkem drží lovecký nůž. Autor záhadné nahrávky je však krátce na to nalezen mrtvý a do hry vstupuje drogový dealer Smitty, kterému by velmi uškodilo, kdyby byl vrah odsouzen. Mohl by totiž výměnou za nižší trest začít mluvit.

Na palubě restaurační lodi je zastřelen mariňák Jeremy Nolan. Vyšetřování případu se účastní také agentka Abygail Borinová. Jednak proto, že v době vraždy na lodi byla a jednak proto, že je členkou kriminálky Pobřežní hlídky. Abby nejprve zjišťuje, že Jeremy musel být zastřelen z nějaké jiné lodi a když je krátce na to nalezeno v řece Potomac další mrtvé tělo, začíná být zřejmé, že šlo o práci nájemného vraha, kterého poté jeho klient zabil, aby se tak zbavil jediného svědka. Gibbs dochází k závěru, že motivem k vraždě bude nejspíš poslední vůle Jeremyho otce Jacka Nolana.

Na střední škole je nalezen mrtvý námořní náborář Simon Craig. Někdo ho shodil ze schodů a poté mu pracovní botou rozšlápl hlavu. Gibsův tým zjistí, že byl gay, podezření tedy padá na manželku jeho milence. Tato stopa se ovšem ukáže být klamná. Tony a Ziva ale na škole potkají studenta Paula Simonse, který je zaujme podivným chováním. Ukáže se, že měl v minulosti kázeňské potíže a že byl navíc jedním z pěti dětí, které se Craig snažil přitáhnout do armády.

Dívka, která sousedům venčí psy, najde na zahradě jednoho z domů mrtvého námořníka. Rotného Wootena někdo ubil k smrti a jeho žena Georgia se synem zmizela. Když ji státní policie objeví na hranici s Marylandem. Ukáže se, že byla obětí domácího násilí. Georgia to však odmítá přiznat, protože by stala podezřelou z manželovy vraždy. Do hry vstupuje také Wootenova divoká milenka Jancey, je s ním těhotná. A protože se s ní rozešel, má motiv k vraždě i ona...

Tým vyšetřuje vraždu Vincenta Reynoldse zastřeleného na palubě námořnické lodi. Vincent se nikdy neoženil a neměl děti, brzy se chystal odejít do důchodu. Podle bratra měl ale dlouhodobější vztah se ženou, manželkou jeho nejlepšího přítele admirála Wayna Hargrovea, se kterou se scházel více než dvacet let. Po prověřování všech podezřelých definitivně docházejí k závěru, že Reynolds skutečně spáchal sebevraždu. Nedokázal se smířit s koncem kariéry a ani s tím, že ho doma nikdo nečeká. Podřízení, kteří oznámili jeho smrt, si ho natolik vážili, že vše zinscenovali jako vraždu, aby zachránili velitelovu čest.

Ve fiktivním Evropském státě Belgrávie dojde k atentátu na ministra obrany. Důvodem je zřejmě dohoda se Spojenými státy o vojenských základnách, kterou ministr prosazuje. Ministryně zahraničí USA tedy navrhne, aby se dohoda podepsala na území Spojených států. Gibbsovi a jeho týmu je přidělena ochrana ministrovy dcery Adriany. Jenomže ta je za dohledu McGeeho a Tonyho unesena. Celému týmu hrozí, že přijde o místo. Gibbs tedy nařizuje vyšetřování na vlastní pěst.

Kapsář ukradne kabelku a v té najde prsty a zuby. Tělo se najde v okresní márnici. Jedná se o desátníka Armstronga. Mc Gee objeví jeho přítelkyni, vášnivou hráčku počítačových her. Ta mu prozradí, že se jí na jedné hře objevil velmi nezvyklý úkaz. Analýza prokáže, že ve hře je ukrytý jakýsi zašifrovaný soubor. Stopa vede k autorovi hry. Abby zjistí, že zašifrovaný soubor je hackrovací program, který má pomoci svému uživateli proniknout do Pentagonu. Autor hry a zároveň programu je vzápětí nalezen mrtvý a pojistka ukrytá v programu spustí odpočítávání, během něhož má dojít ke zrušení ochrany Pentagonu.

V garážích NCIS je nalezen mrtvý asistent z oddělení zpronevěr. Nedávno byl propuštěn. Podle dostupných důkazů prodával informace o majetku a důkazech nacházejících se ve skladu. Pracoval také na velkém případu zabaveného majetku Leony Phelpsové, která ho zpronevěřila mnoha lidem a v současné chvíli je ve vězení, kde čeká na soud. Je ochotna uzavřít dohodu s NCIS a výměnou za domácí vězení prozradit jméno vraha. Gibbs a jeho tým se domnívají, že se někdo chystá vykrást sklad, kam byly zabavené věci Phelpsové převezeny...

Na žádost ředitele Vance převezme Gibbsův tým od policie dva týdny starý případ brutální vraždy námořního plukovníka ve výslužbě. Obviněn je plukovníkův syn, osmnáctiletý Nick. Obžaloba má ale k dispozici jen nepřímé důkazy. Aby byl výsledek jistý, je třeba dostat z Nicka také ústní doznání. Gibbsovi se ale jeho vina od samého začátku nezdá.

Mladý pár najde v lese zastřeleného námořníka. Blízko těla objeví nápis: Ptačí píseň. Oběť ho napsala vlastní krví těsně před smrtí. Tato stopa dovede Gibse k citlivému rukopisu s názvem Operace Ptačí píseň, která má údajně pojednávat o něčem, co ministerstvo považuje za hrozbu národní bezpečnosti. Když je krátce na to nalezeno tělo agentky, která se s mrtvým mužem znala, začíná Gibse záhadný rukopis a jeho autor vážně zajímat.

Kousek od Washingtonu je nalezeno tělo námořníka. Gibs a Tony se vydají do jeho bytu. Setkají se tam se zvláštní agentkou Barretovou. Jak se ukáže, vražda je dílem sériového vraha, tzv. Přístavního vraha. Na jeho případu od začátku pracovala právě Barretová. kterou Vance do Washingtonu povolal ze španělské Roty, kde došlo k jedné z vražd. Když Gibbs konečně odhalí možného vraha a vydá se do jeho domu, najde ho v mrazicím boxu zavražděného. Pitva ukáže, že je mrtvý už šest týdnů a vyšetřování se tak dostává do slepé uličky. Ziva a Tony se večer sejdou v baru. Neznámý muž Tonymu pošle drink s podivnou kostkou ledu. Je v ní zamražené lidské oko.

V Pentagonu je nalezeno tělo poručíka Rosové. Ze záznamu kamery je patrné, že vrahem je rotný Donner. Jenomže ten je pár dní na to nalezen mrtvý a Doug při ohledání zjistí, že byl mrtvý už dva dny předtím, než měl v Pentagonu zavraždit poručíka Rosovou. Záhadu rozluští Abby, která zjistí, že mu někdo sejmul posmrtně masku, aby mohl vytvořit silikonovou kopii jeho tváře. Na záznamu kamery je tedy někdo v Donnerově masce.

Agentka Barretová odjíždí se svým týmem na Havaj pátrat po Přístavním vrahovi. Mezitím je v Baltimoru nalezeno tělo zabalené v igelitu. Zdá se, že jde o jeho další oběť. Jenomže jak se ukáže, Tony mrtvého zná. Je to jeho bývalý parťák z baltimorského oddělení vražd. Během vyšetřování vyjde najevo, že vražda není dílem Přístavního vraha, ale někoho, kdo ho dokonale napodobuje. A stopa Tonyho vrací ke starému případu, na kterém spolu s Pricem pracoval krátce předtím, než odešel k NCIS.

Pátrání po Přístavním vrahovi pokračuje. Tentokrát je jeho obětí agent NCIS Stark. Ovšem způsob činu je jiný. Vyšetřování stále vede agentka Barretová. Gibbs povolává svého bývalého šéfa Mika Frankse. Do hry vstupuje také agent CIA Kort. Ten Barretové a Gibbsovi prozradí pravé jméno Přístavního vraha. Je jím bývalý voják Cobb, který v programu CIA prodělal výcvik na zabijáka a pak se jim vymknul z ruky. Zdá se ovšem, že ho přestali zajímat mariňáci a soustředil svou pozornost na větší hráče. Na NCIS. Když při konfrontaci zabije Mika Frankse, Gibbs pochopí, že musí začít jednat. Než se stačí do něčeho pustit, Cobb vláká do pasti agentku Barretovou.

Pátrání po Přístavním vrahovi se uzavírá. Gibbs nachází agentku Barretovou spoutanou, ale živou v kufru auta. Krátce nato je unesena Ziva. Ducky vypracovává nový psychologický profil. Je přesvědčený, že Cobb se chce pomstít lidem, kteří ho zapojili do výcviku, jenž z něho v rámci tajné operace námořnictva a CIA udělal bezohledného vraha. Na světlo vychází fakt, že agentka Barretová je neteří ministra námořnictva Davenporta. Když je Cobb převážen do vazby, podaří se mu unést Palmera a znovu agentku Barretovou. Chce tím upoutat ministrovu pozornost, protože to on je podle něj klíčovým mužem v operaci Frankenstein.

Za Gibbsem do nemocnice přichází psycholožka Dr. Rachel Cranstonová, aby si promluvila s Tonym DiNozzou coby pacientem. Stal se obětí střelby, život mu ale naštěstí zachránila vesta. Nicméně si DiNozzo celou záležitost vůbec nepamatuje a právě Dr. Cranstonová mu má pomoci oživit jeho paměť. Při střelbě byl totiž zastřelen jiný agent NCIS a on je podezřelý z jeho zabití. Tonymu se postupně vracejí vzpomínky na tajnou misi, kterou byl pověřen samotným vrchním šéfem námořnictva, Claytonem Jarvisem, o které neměl vědět ani nikdo z Tonyho kolegů, ani s amotný Gibbs. Podle všeho měl kohosi zlikvidovat, ale nedokázal si vzpomenout, kdo měl být terčem. Stopy je zavedou k agentce Barrettové a jejímu kolegovi Cadymu.

Za Gibbsem do nemocnice přichází psycholožka Dr. Rachel Cranstonová, aby si promluvila s Tonym DiNozzou coby pacientem. Stal se obětí střelby, život mu ale naštěstí zachránila vesta. Nicméně si DiNozzo celou záležitost vůbec nepamatuje a právě Dr. Cranstonová mu má pomoci oživit jeho paměť. Při střelbě byl totiž zastřelen jiný agent NCIS a on je podezřelý z jeho zabití. Tonymu se postupně vracejí vzpomínky na tajnou misi, kterou byl pověřen samotným vrchním šéfem námořnictva, Claytonem Jarvisem, o které neměl vědět ani nikdo z Tonyho kolegů, ani samotný Gibbs. Podle všeho měl kohosi zlikvidovat, ale nedokázal si vzpomenout, kdo měl být terčem.

Gibbs vyšetřuje smrt zastřeleného námořního poručíka Paula Boothe. Při ohledání se u něj najde osm let stará McGeeho vizitka z NCIS. Muž pracoval na univerzitě jako profesor matematiky, ale v poslední době si nechal zkrátit úvazek, neboť byl zapojen do tajného projektu pro Telis Research. Jeho manželka, na jejíž účet Paul krátce před svou smrtí převedl veškeré peníze, o projektu vůbec nevěděla. Manžela spíše podezírala z nevěry, ale v poslední době si všimla, že ho kdosi sleduje. Paulův nadřízený nechce vyšetřovatelům prozradit, na čem pracoval. McGee zažije šok, když zjistí, že jedním z posledních hovorů oběti byl telefonát jeho rebelské babičce Penelope. Ta před lety pracovala na tajném vojenském projektu, a jak se zdá, poručíkova smrt by s tím mohla souviset.

Reportérka oslovuje náhodné chodce na ulici a pokládá jim otázky. Jeden z dotazovaných mužů se ale rychle od kamery odvrátí a prchá z místa pryč. Při útěku ho srazí auto a muž v nemocnici umírá. Detektiv Sporteli zjistí jeho totožnost, je to hledaný nájemný vrah. Podle všeho měl být jeho další obětí oceněný hrdina z Afghánistánu, poručík Brett. Ten už rok pracuje v Kongresu jako zákonodárný poradce ve věci dotací na stavbu vojenské letadlové lodi. Ochrany Bretta se i přes jeho počáteční nesouhlas ujímá Ziva. U nájemného vraha v domě Tony nalézá skrýš plnou zbraní, kde je i laptop. Z dalšího zjištění vyplývá, že zabiják dostal nemalou částku od jistého George Kaplana.

Když pobřežní stráž v noci připluje k nedaleko kotvící lodi, na palubě objeví pašované zboží, jinak se ale loď zdá být opuštěná. Náhle se však ozve výstřel a jeden z členů pobřežní stráže padá mrtvý k zemi. Na případu pracuje Gibbs společně s Borinovou. Zatímco probíhá ohledání mrtvoly na palubě lodi, vyšetřovatelé pátrají po členech posádky. Zprvu se zdá, že posádka ze strachu před pobřežní stráží loď opustila, když se najednou ozve vyťukávání morseovky. V podpalubí naleznou libanonskou rodinu, která chce zažádat v USA o azyl. Členové rodiny tvrdí, že je posádka na lodi zamkla a zmizela. Nicméně důkazy je usvědčí ze lži. Na lodi museli být přítomní pouze tito čtyři členové rodiny. Objeví se i další závažné skutečnosti. Rodina měla ještě dceru, která byla zabita při americkém bombardování, a po Faridovi je vyhlášeno pátrání kvůli bombovému útoku před 27 lety. Než Abby s McGeem stačí varovat své kolegy přímo na lodi, dojde ke konfliktu mezi Tonym a Faridem, který končí zatčením a potřísněním Tonyho šatů. Abby si bere Tonyho oblečení k rozboru. Identifikuje čistý glycerín a dojde jí, že se schyluje k teroristickému činu neskutečných rozměrů...

Gibbsův tým řeší vraždu muže, který se předávkoval extází a následkem strašlivé žízně se upil k smrti. Zpočátku to vypadá na vyřizování účtů, ale když je nalezena druhá oběť, zdá se, že jde o práci sériového vraha. Ducky zatím prožívá románek s velmi půvabnou dámou jménem Mary. Ale jak se ukáže, s Mary není něco v pořádku.

Bývalá Gibsova manželka Diane se na něj a na svého druhého ex-manžela Tobiase Fornella obrátí o pomoc. Tvrdí, že její současný manžel Victor byl unesen. Gibbs a Fornell neochotně souhlasí, ale brzy přijdou na to, že obavy Diane byly odůvodněné. Stopa vede k formuli na výrobu syntetického smrtícího viru a v sázce jsou životy celého vojenského velení.

Nedaleko letecké základny v Doveru se zřítí letadlo, které převáželo z Afghánistánu šest mrtvých vojáků. Mezi nimi i nadporučíka Gabrielu Floresovou. Gibbse, kterému se zdálo o jeho dávno zesnulé manželce Shannon, náhle probudí telefon a Vance ho povolává na místo tragédie. Podle všeho bylo na palubě letadla šest rakví a pět členů posádky, z nichž jeden přežil. Abby musí provést testy DNA, aby určila totožnost všech obětí leteckého neštěstí i padlých vojáků. Jenomže DNA nadporučíka Floresové mezi ostatky chybí. Oddíl v Afghánistánu po ní ale v oblasti marně pátrá. Gibbs je odhodlaný stůj co stůj Gabrielu najít a přivést ji zpátky domů.

Gibbs se se Zivou vydává do Afghánistánu. Podaří se jim nadporučíka Floresovou zachránit. Při akci padne kapitán Quincy, ale Gibbs zajistí teroristku, kterou převeze do USA. Při výslechu ale zjistí, že ona a její sourozenci plánují útok na školní autobus.

Na molu se najde rolls royce s opilým spícím otcem agenta DiNozza a mrtvým námořním poručíkem, ale též bohatým podnikatelem Masseym v kufru. Pro DiNozza seniora to nevypadá vůbec dobře, důkazy svědčí proti němu, ale on trpí ztrátou paměti. Tony je přesvědčený, že jeho otec nikoho nezabil a přes výslovný zákaz Gibbse i Vance se zapojí do pátrání a významnou měrou přispěje k odhalení pravého pachatele.

Kapitán námořnictva, Jake Marsden, je nalezen mrtvý v hotelovém pokoji. Díky záznamu z kamer se NCIS podaří nalézt Emmu Reynoldsovou, ženu v devátém měsíci těhotenství. Ta jim tvrdí, že cílem útoku nebyl Jake, ale ona. Netuší ovšem, kdo po ní jde. Sama působila na základně nedaleko Kábulu a otěhotněla s tamním mužem Amirem. Minulý týden si všimla, že ji odděleně sledují tři auta, registrovaná na ministerstvo obrany. Jake Marsden byl její dávný přítel, který ji měl dovézt k rodičům v Ohiu. Když se domnívali, že unikli svým pronásledovatelům, Marsden šel zarezervovat pokoj, zatímco ona na něho čekala v autě. NCIS postupně zjišťuje, že Amir zemřel před měsícem při explozi. Otec Emmina dítěte pocházel z extrémně bohaté afghánské rodiny a byl jediným dědicem rozsáhlých pozemků. V případě mužského potomka by vše dědil ten. Navíc o tyto pozemky v Afghánistánu mají rovněž zájem i jiní, neboť jsou pro ně klíčové pro další působení v oblasti. To vysvětluje jak zájem o Emmu, tak o její dítě. Mezitím Palmer provádí svého budoucího tchána Eda po NCIS. Ten zpočátku odsuzuje Palmerovu nevýdělečnou a časově náročnou práci, nakonec pochopí, proč k ní Palmer cítí takovou lásku.

Děti hrající si na ulici objeví v havarovaném autě tělo mrtvého muže. Je zjevné, že byl zastřelen z dálky profesionálním odstřelovačem. Svědkyně zahlédla, jak z místa činu utíká jakási žena s blonďatými vlasy. Prostřednictvím GPS ve voze oběti Abby určí místo, kde záhadná žena do auta nastoupila. Posléze se ukáže, že onou ženou není nikdo jiný než jejich pohřešovaná kolegyně E. J. Barrettová. Ta identifikuje střelce, ale než se k němu tým dostane, je i on zavražděn. Za těmito vraždami stojí agent FBI Stratton, který má v plánu zabít i Barrettovou. Ta odchází s Tonym do úkrytu...

V opuštěném bytě je nalezeno tělo Mayi Burrisové, která pracovala jako námořní atašé. Její manžel detektivům příliš nevěří a je rozhodnut vraha za každou cenu vypátrat. Na první pohled je zřejmé, že vraždu musel spáchat člověk znalý policejních postupů. Abby přichází se zjištěním, že náboje, které prošly tělem, neodpovídají otvorům ve zdi. Vyšetřování potvrdí, že s tělem bylo manipulováno a vrah střílel ze střechy protějšího domu. Zavražděná žena se zajímala o teroristickou skupinu v Pákistánu a Ziva se dozvídá, že mezi spolupracovníky oběti byl i její přítel, pracovník CIA, Ray Cruz.

Gibbs sedí v bistru, když v tom se tam objeví muž v kapuci, vytáhne pistoli a pokusí se Gibbse zastřelit. V tom okamžiku se Gibbsovi před očima začne odvíjet jeho život. Potkává všechny své mrtvé známé, svou ženu, dceru a bilancuje svůj život a svá rozhodnutí.

Gibsův tým vyšetřuje smrt dvou mužů, kteří pomáhali jako sousedská hlídka v převleku za superhrdiny. Do případu se také zapojuje redaktorka Wendy. Ta je, jak se ukáže, Tonyho bývalá snoubenka, která ho opustila den před svatbou. Vysvětluje mu, že ho kdysi opustila, protože se ještě na takový vztah necítila, zatímco nyní je situace jiná.

V domě, který vykrádají dva vykutálení lupiči, se ve stejném okamžiku oběsí muž. Jedná se o psychologa, který spolupracoval s armádou na vývoji nových psychologických technik v speciálním útvaru MISO. Doktorka, která byla jeho psychoterapeutkou, ale nevěří, že by byl schopen si sáhnout na život. Vance k případu povolává svou bývalou spolužačku z vysoké doktorku Ryanovou. Ta se přes počáteční rozbroje postupně sbližuje s Gibbsem.

Na Gibbse čeká právník se svým klientem Wileyem, kterému hrozí stíhání kvůli drogám. Navrhuje zrušení trestu výměnou za informaci týkající se národní bezpečnosti. Gibbs má o informace zájem, ale když se s Wileym setká, ten se chytne za srdce a zkolabuje. Podle všeho selhal jeho kardiostimulátor. Pak Abby přichází s překvapivým zjištěním, že Wiley byl zavražděn...

Gibbs a Tony mají chránit tajemníka námořnictva Claytona Jarvise, který se rozhodl pro stavbu lodí z moderních a lehčích materiálů než je ocel. Tím ocelářská společnost přišla o svůj nejvýznamnější kontrakt pro námořnictvo. Před týdnem se na internetu objevila jedna strana utajovaného dokumentu a tentýž den dostal Jarvis požadavek, aby námořnictvo změnilo své rozhodnutí, jinak budou zveřejněny další stránky, které poukazují na slabiny všech přístavů na východním pobřeží. Gibbsův tým tajně vyšetřuje, kdo je za vydíráním a komu se podařilo získat tajný dokument.

Muž, který vleče svého velmi opilého společníka k autu, si všimne mrtvého muže. Někdo ho brutálně ubodal. Policie brzy zjistí, že obětí je Caleb Adams. McGee se spojí s velitelem lodi, se kterou Caleb připlul, a zjišťuje, že další, kdo se na loď nevrátil, je Brian Smith...

Dva mladí lidé hledají v parku místo na piknik. Vyberou si místo pod stromem, když najednou vedle nich spadne mrtvola mladého muže. Někdo vyhodil z letadla námořního nadporučíka Larabeeho. Během pátrání se ukáže, že nadporučík působil jako člen humanitárního oddílu v Jižní Americe. Prováděl tam očkování horského obyvatelstva. Spolu s ním tam byla i kaplanka Wadeová. Ta je však nezvěstná, a tak se Gibbs rozhodne vyslat Zivu a Tonyho do Cartageny, aby se po pohřešované podívali.

Ve skladu elektronické firmy United Equinox zuří požár, který se nakonec podaří dostat pod kontrolu. Na místě se však najde ohořelé lidské tělo a tajný spis. Firma vlastnící sklad vyrábí modemy a toustovače, ale také přísně utajované zbraně. Z bezpečnostních záznamů začíná být zřejmé, že obětí je Carter Plimpton, systémový analytik, jenž vešel do budovy jako poslední...

Na lodi U.S.S. Brewer dojde k výbuchu, při kterém dva lidé zahynou. Admirál Theodore Tully informuje o neštěstí na lodi a je rád, že obětí nebylo víc. U mrtvého žháře Bruce Johnsona NCIS nenalezla zatím žádnou pořádnou stopu. Abby prochází Johnsonovu skartovačku a objevuje v ní dokument napsaný korejsky...

Nováček Ned Dorneget si nechává vytáhnout zubní implantát. Zubař zjišťuje, že to není obyčejný implantát, ale odposlouchávací zařízení. Abby prověřuje, čí je to patent a ukáže se, že žádost o registraci podal před osmnácti měsíci právě Harper Dearing. Tentýž Dearing, kterého NCIS hledá kvůli závadné elektroinstalaci. Dearing se napíchne na zabezpečenou linku, aby Gibbsovi sdělil, že právě on je příčinou jeho pomsty, a slibuje další akci. Gibbs s Ryanovou si vytvoří teorii, že by mohlo jít o výrobu vadných dělostřeleckých granátů. Gibbs je o této teorii skálopevně přesvědčen. O to větší je jeho překvapení, když zjistí, že to byla jen past a že hrozba přijde odjinud. A skutečně. Za záhadných okolností mizí ředitel Vance.

Tým je přesvědčený, že za výbuchy a únosem ředitele Vance stojí Harper Dearing. On viní námořnictvo ze smrti svého syna. Gibbs dostane z vězení Jonathana Colea, potenciálního Dearingova spojence, aby ho s jeho pomocí vlákal do pasti. Tým ale nedokáže včas odvrátit poslední útok, bombu vloženou do auta ředitele Vance stojícího před budovou NCIS.

Vyšetřovatelé se po explozi v jejich prostorách vrací do práce. Zatímco Gibbs, Abby, Palmer a Vance vyvázli bez zranění, Ducky s McGeem jsou v nemocnici. Tony se Zivou jsou ještě pohřešováni, protože uvízli ve výtahu a záchrana přichází až za nějakou dobu. Na pomoc je přivolána FBI, aby pomohla s dopadením Harpera Dearinga, neboť právě on stojí za výbuchem, jenž měl za následek životy čtyř agentů. Dearing finguje svoji smrt, aby se vyhnul dopadení. Gibbse však nepřesvědčí. Jediný způsob, jak ho může dostat, je setkat se s ním sám.

Zatímco v budově NCIS probíhají rekonstrukce, tým se musí podrobit psychologickému vyšetření. Zpět do služby jsou povoláni ve chvíli, kdy je zaměstnankyně zbrojního skladu nalezena mrtvá v řece. Záhy se ukáže, že dívka byla zavražděna a vrahem je jeden z lidí pracujících na rekonstrukci objektu. Abby pronásledují zlé sny, kdy se jí zdá, že leží mrtvá na pitevně. Gibbs požádá psychologa, aby se na ni zaměřil. Abby vysvětluje, že její sny má na svědomí strach z toho, že je sama. Gibbs jí proto navrhuje, aby kontaktovala svého biologického bratra. Setkání se vydaří a Abby může zase klidně usínat. Povolaný psycholog pochopí, že i Vance má problém. Chce co nejrychleji vše vrátit do původního stavu, aby mu nic nepřipomínalo explozi, neboť se cítí za celé neštěstí zodpovědný.

Ducky se domnívá, že se v minulosti při pitvě poručíka Robertse dopustil chyby. Protože mu vzhledem k prodělanému infarktu není zatím povolena aktivní služba, exhumuje tělo bez povolení. Příčinu smrti tenkrát posoudil jako následek otravy alkoholem. Ve světle nových skutečností se však ukáže, že byl Robert zavražděn. Ve stejné době je Gibbs povolán k případu rotného Hila, který se otrávil oxidem uhličitým. Když ale Abby v jeho počítači najde Duckův příkaz k exhumaci poručíka Robertse, celý případ nabírá zcela nový směr. Vypadá to, že Roberts a Hil měli spolu jakési nelegální obchody.

Během cvičení dojde nad mořem k havárii vojenského vrtulníku. Do akce jsou vyslány veškeré záchranné složky. Tři členové posádky se zachrání, ale chybí pilot. Krátce nato je nalezeno i tělo velitele Hopa s prostřelenou hlavou. Gibbs zapojuje do vyšetřování celý svůj tým. Ziva se s Tonym a McGeem vsadí, že pozvou na rande první ženu, kterou potkají. Shodou okolností je to šéfka záchranných operací Abbygail Borinová.

Gibbs vyšetřuje vraždu mladíka nalezeného v luxusním sportovním autě. Na místě se najde vražedná zbraň, která vyšetřovatele zavede do místní zastavárny. Tam si Gibbs povšimne vystavené čestné medaile. Ačkoliv zákon nedovoluje medaile prodávat, majitelka obchodu přijde s vysvětlením, že ji koupila od staršího válečného veterána, jenž nutně potřeboval peníze. Gibbs se dozvídá, že medaile patřila Leroyi Jethro Moorovi, blízkému příteli jeho otce, po kterém byl Gibbs pojmenován. Otec se však s ním před lety nepohodl a od té doby se ti dva přestali stýkat. Gibbs se tedy rozhodne dát staré přátele dohromady.

Gibbs řeší případ zabití bývalého mariňáka. Jeho kamarád kapitán Westcott tvrdí, že ho usmrtilo pět nebo šest útočníků, kteří je večer sledovali, když se vraceli domů. Gibbs tuší, že s kapitánem Westcottem není něco v pořádku. Trpí posttraumatickým stresem a měl utkvělou představu, že muž, kterého potkali v obchodě, proti nim bojoval v Afghánistánu. Zpočátku to celé vypadá jako blud, ale z vojenské zprávy vyplyne, že onen muž je členem teroristické skupiny, která na půdě Spojených států chystá nějaký velký útok.

Gibbs a jeho tým se pokoušejí dopadnout Kerseyho a zabránit mu v útoku. Bohužel ani prohlídka jeho domu ani výpověď jeho přítelkyně nové informace nepřinesou. Gibbsovi nezbývá než znovu poprosit o pomoc kapitána Westcotta. Ten si postupně vzpomíná na podrobnosti z přepadení v Afghánistánu a začíná rozplétat teroristický plán. Zdá se, že Kersey má v plánu odpálit na den díkuvzdání dům senátora, který zde zrovna hostí velkou část Kongresu. A co víc, zdá se, že mu v tom jeho přítelkyně zdatně pomáhá.

Gibbs řeší případ unesené dívky Rosie. Zpočátku se zdá, že únosci budou žádat výkupné, ale když je v přívěsu nalezeno mrtvé tělo jednoho z pachatelů a v jeho telefonu se najdou vyzývavé fotky unesené dívky, Gibbs rázem pochopí, že se jedná o obchod s bílým masem. Stopa vede do bowlingové herny, kam její otec chodil se svým nejlepším kamarádem hrát ligu.