Poslední mise v Paraguayi skončila záchranou pohřešovaných dětí, nicméně vrtulník se musel vznést ve chvíli, kdy akci ze země ještě kryl Gibbs. Ten dal pokyn, aby stroj vzlétl bez něj. McGee se rozhodl s Gibbsem v Paraguayi zůstat. Oba padnou do zajetí. Bishopová přebírá vedení týmu v NCIS a ministerstvo obrany zakládá senátní výbor, který má prozkoumat pochybení ředitele NCIS Vance v souvislosti s nedodržením předpisů při nařízení zásahu v Paraguayi. Tým se zatím snaží najít jakoukoli stopu po Gibbsovi a McGeem. Ti se nacházejí na palubě lodi rebelů, jejichž šéf se je chystá začít mučit, aby z nich dostal prodejné informace. Gibbs a McGee ale pracují na důmyslném plánu útěku.

Gibbs s McGeem chystají návrat do práce. Po zdravotní stránce jsou oba v pořádku, nicméně je čeká ještě pohovor s psycholožkou. Zatímco Gibbs projde na výbornou, McGee má obavy, že testy nezvládne. Trpí totiž úzkostnými stavy a neví si s nimi rady. Tým se ujímá případu, kdy při převozu rakví na hřbitově z jedné z nich vypadli dva mrtví - sedmaosmdesátiletá Edna Stoneová, která zemřela přirozenou smrtí před dvěma roky, a Richard Coyne, nahlášený jako nezvěstný před rokem a půl. Coyne před dvěma lety zasáhl při ozbrojené loupeži a měl předstoupit před soud jako klíčový svědek. Prokáže se, že pachatel loupeže neměl s jeho vraždou nic společného. Když Palmer během pitvy nečekaně omdlí, Abby zjistí, že poručík byl otráven.

NCIS se v rámci společného vyšetřování podílí na rutinním sledování. Pak ale Torresův parĎták Higgins záhadně zmizí. Případu se ujímá jeho nadřízený, detektiv Sportelli. Je přesvědčen, že se jedná o únos. Díky zajištěnému záznamu se vyšetřování přesouvá k Michelle Laneové, vyšetřovatelce městské policie. Právě její otisk byl nalezen na místě zmizení Higginse. Sportelli ale tvrdí, že Laneová je již deset let mrtvá. Zemřela při akci zamířené proti obchodníkovi se zbraněmi, Benjaminovi Sitanovi, když pracovala v utajení. Její tělo se nikdy nenašlo.

Gibbsův tým vyšetřuje pobodání důstojníka během detektivní hry. Muž naštěstí přežije, ale vzápětí se ukáže, že někdo unesl jeho ženu Helen, bohatou dědičku průmyslového impéria. A protože Helen pracovala na letadlové lodi, vydávají se Bishopová a Torres na palubu, aby našli nějaké stopy. Bishopová se tam však ke svému překvapení setkává s bývalým spolužákem, který ji kdysi šikanoval.

Clayton chodí na sezení alkoholiků. Tam se seznámí s Melissou, kterou týrá její přítel. V den, kdy se od přítele konečně odstěhuje, je krátce po sezení unesena. Když se ukáže, že přítelem je technik pracující pro námořní rozvědku, případ přepírá Gibbs. Jenomže Melissa není takový svatoušek, za jakého se vydávala, a v sázce je prodej citlivých informací za nejvyšší nabídku.

Na golfovém hřišti je nalezen rotmistr Miller, který si přivydělával jako správce hřiště. Byl také nadšeným radioamatérem. McGee je přesvědčený, že někdo z jeho kontaktů by mohl vědět, co se stalo, a tak pátrá po jeho radioamatérském příteli Ricochetovi. Když ho najde, zaujme ho mužův pes. Je to totiž bývalý pes na vyhledávání drog a den předtím reagoval velmi podivně. To McGeeho přivede na stopu velkého množství kokainu, nalezeného v bunkru na golfovém hřišti. Zdá se, že stopa vede do Mexika k drogovému kartelu. A Gibbs je odhodlaný dostat hlavu drogového bosse.

Veřejná obhájkyně Jessica Schafferová se ujímá případu Gabriela Hickse, který byl před 11 lety odsouzen k trestu smrti za brutální vraždu námořního poručíka. Gabriel však trvá na své nevině a Jessice se podaří dosáhnout obnoveného líčení. Gibbs je požádán, aby případ znovu prošel a případně našel skutečného vraha. Když Bishopová spojí zločin s dalšími čtyřmi vraždami, zdá se, že se jedná o práci narušeného sériového vraha. Jediná osoba, která do toho může vnést světlo, je jedna svědkyně, která před jedenácti lety vypovídala před agentem Fornellem a ten její výpověď zatajil, protože byl přesvědčený o Hicksově vině...

Počítačovou specialistku Amber, která si šla zaběhat do lesa, přivedou hlasy k jakési boudě. Žena tam objeví tělo mrtvého muže. Tím je Victor King, vlastník velké nadnárodní ocelářské společnosti a přední dodavatel pro námořnictvo. King byl uplynulé dva roky vyšetřován kvůli zpronevěře, krádežím a dodávkám vadného materiálu, ale nikdy mu nebylo nic prokázáno. V únoru pak zmizel.

Přestože Amber vykazuje všechny znaky senzibila, Gibbs tomu odmítá uvěřit. Do případu vnese světlo až Sloanová, která zjistí, že ženě před nedávnem zemřela dcera. Její podivné chování tedy není dílem mimosmyslového vnímání, ale hluboce narušené osobnosti. McGee s Delilah prožívají těžké období. Nemohou se shodnout, zda chtějí znát pohlaví dítěte, a nejsou schopni se domluvit ani na jménech.

Sloaneové se ozve její přítel z MI5, Nigel Ford. Podle všeho se dostal do přestřelky. Ve chvíli, kdy tým na místo dorazí, je již mrtvý. Ford se se Sloaneovou spojil minulý týden s tím, že sleduje mezinárodního dealera se zbraněmi, Andre Yorku, kterého před svou smrtí postřelil. Když na něj McGee náhodou narazí na pohotovosti, pokusí se ho zadržet. Bohužel marně. Yorka si bere rukojmí a domáhá se, aby ho někdo ošetřil. Torres a Clayton zatím zjišťují, že Yorka plánuje bombový útok. Aby ale mohli bombu zneškodnit, musí nejprve zjistit, kde je.

Děj se odehrává v Afghánistánu, v provincii Helmand. Americké vojáky na základně o vánočních svátcích navštívil bavič Chet Goodman a senátor a námořní generál Phillips, kterému dělají doprovod Sloaneová a Torres. Senátor se ale musí urychleně vrátit do Ameriky, protože jeho syn Chandler utrpěl těžké zranění a je to s ním hodně zlé. Cestou auto najede na minu a senátor i s Torresem a Sloanovou zůstanou v horách, kde řádí bandy Talibanu. Bishopová a McGee zatím vyšetřují Chandlerův pád a brzy zjistí, že nešlo o nešťastnou náhodu. Stopa vede k hráčskému podvodu, na kterém se Chandler podílel se svými dvěma kumpány.

Tým vyšetřuje smrt mladé důstojnice JAGu, Melissy Newhallové. Oběšenou ženu našli její rodiče. Smrt Newhallové se zprvu jeví jako velká záhada. Žena úspěšnou kariéru, oddaného snoubence, se kterým plánovala svatbu, a podle její kamarádky z dětství Kelly se snažila žít příkladný život. Vyšetřování je sice vedeno jako šetření sebevraždy, okolnosti případu však vedou k úvahám o rafinované vraždě. Jenže velmi brzy vyjde najevo, že žena žila ve skutečnosti dva životy...

Vedle silnice je v potoce nalezena mrtvola námořníka, který zemřel na následky srážky s autem. Abby se rychle podaří zjistit, jaký to byl vůz. Jelikož se jedná o velmi drahé auto, není problém najít majitele. Jak se ukáže, majitel námořníka nemohl srazit, protože byl v době činu opilý a auto má blokovací přístroj pro opilé osoby. Je tedy zřejmé, že mu v noci auto někdo ukradl, aby se v něm projel. Stopa vede ke dvěma studentkám z nedaleké střední školy. Když se Gibbs vydá za rodiči jedné z nich, zcela nečekaně se dají na útěk. Abby potvrdí, že to nejsou dívčini rodiče.

Policisté chytí na silnici zloděje s kradeným autem. V nákladovém prostoru vozu je nalezen velký barel a v něm je nacpána mrtvola pohřešovaného námořního důstojníka Willise. A jelikož oběť před časem působila u ostře sledovaného soudního procesu jako člen poroty, vyšetřování se stáčí tímto směrem. Gibbs se dílem náhody znovu setkává s Tobiasem Fornellem, kterého kvůli případu Gabriela Hickse vyhodili z FBI.

Tým ihned začne vyšetřovat vraždu Hicksovy právničky. Od Sloaneové se vyšetřovatelé dozvídají, že právnička vypověděla Hicksovi zastupování. Začnou tedy pátrat, co ji donutilo změnit názor na klienta. Brzy zjistí, že Jessica před svou smrtí navštívila ve vězení Hicksova spoluvězně Triffa. Také Abby najde v telefonu mrtvé odposlouchávací zařízení. McGee společně se Sloaneovou Triffa ve vězení navštíví a chtějí zjistit, co vlastně od něho Jessica chtěla vědět. Triff jim oznámí, že jim dá důkazy proti Hicksovi, pokud mu zařídí jakousi dovolenou mimo vězení. Jeho podmínkou je strávit dva dny ve svém bývalém bytě. Jedná se o byt, ve kterém teď žije McGee s rodinou.

Tým musí vyšetřit podivné úmrtí mladého mariňáka, který byl otráven. Jed byl podle Abby v sušenkách, které v rámci armádního programu podpory vojáků dobrovolníci posílají jednotkám v zahraničí. Vyšetřovatelé velmi brzy vystopují, že balíček poslal bývalý příslušník námořnictva John Ross. Ross byl v minulosti sám dlouhá léta v íránském zajetí a dnes je známý svou podporou vojákům na zahraničních misích. Ross však tvrdí, že s jedem nemá nic společného. Vyšetřovatelé objeví stopu, která vede k známému moderátorovi Whitovi, který ve svém bulvárním pořadu Rosse napadl. Když se ho jdou vyšetřovatelé zeptat na okolnosti setkání s Rossem, jsou sami Whitem na sociálních sítích nařčeni, že ho zastrašují a cíleně obtěžují. O několik hodin později Whit odvysílá zprávu, že Ross je vrahem, který vojáka otrávil sušenkami?

Ve vysílání televizní show se objeví stará historická válečná palice. Gibbs a Ducky v ní poznají vražedný předmět z dávno neobjasněného případu vraždy mrtvého námořníka. Námořník Finn měl rozbitou hlavu a v ráně Ducky našel hřeb z vikingské válečné palice. Gibbs a Ducky jsou přesvědčeni, že předmět, který se objevil v televizi, je právě oním vražedným předmětem z Finnova případu. Je to ale už šestnáct let a najít nové forenzní důkazy nebude jednoduché. Naštěstí Ducky přiváží z univerzity velmi cennou pomocnici Kasie, která se s Abby vrhá do práce.

Tým nemá žádný případ, a tak se zdá, že všichni budou mít čas přečíst si materiály k Duckyho připravované knize. Náhle se ozve výbuch a na střešní okno dopadne mrtvola. Zprvu se zdá, že se jedná o nešťastnou nehodu při opravě transformátoru. Brzy však lidé z NCIS zjistí, že ve skutečnosti do budovy pronikli tři teroristé převlečení za opraváře. Výbuch transformátoru byl způsoben špatně zapojenou trubkovou bombou. V budově se tedy toho času pohybují dva zbývající teroristé. Místo je kvůli výbuchu bomby ihned evakuováno. Jenže nastávají komplikace. Systém postupně zablokovává všechny vstupy do budovy a Gibbsův tým, který dostal od Vance povolení teroristy v budově hledat, je rozdělen.

Tým je přivolán k nálezu dvou těl mužů v obchodě se starými deskami. Jeden z mrtvých mužů byl podle dokumentů, které byly u něj nalezeny, příslušníkem námořnictva. Vyšetřovatelé však velmi brzy zjistí, že dokumenty jsou padělány a že takovéto dokumenty druhý z obou mrtvých ve svém obchodě vyráběl. Abby z nalezených přístrojů pro padělání dokáže obnovit poslední tištěný průkaz. Ten zněl na jméno Ruiz, a jak vyšetřovatelé zjistí, tentýž Ruiz s padělaným dokladem se před malým okamžikem nacházel na jedné ze základen námořnictva. McGee vypátrá, že muž na základně sledoval desetiletou dívku. Gibbs se rozhodne ji vzít do ochranné vazby. Otázkou ale zůstává motiv.

Tým NCIS se zapojí do hledání námořníka, který zmizel po autonehodě policejního auta, které ho převáželo do vězení. Šerif převážející námořníka Billingse tvrdí, že cestou na silnici uviděl opilého řidiče a snažil se ho pronásledovat. Při zběsilé honičce šerif nezvládl řízení a se svým autem skončil v jezeře. Šerif vyplaval, ale po Billingsovi není žádná stopa. Vyšetřovatelé brzy pochopí, že se šerifovým vyprávěním není něco v pořádku. Náhodná svědkyně autonehody, slepá žena, vypráví, že podle toho, co slyšela, policejní auto určitě žádné jiné vozidlo nepronásledovalo. Vyšetřovatelé se tedy zaměří na osobu šerifa...

Bývalá členka námořnictva Sara Carterová se obrátí na Gibbse s prosbou. Před rokem zloděj zastřelil její matku a policii se nepodařilo najít vraha. Protože matka byla také členka armády, a navíc se zúčastnila operace Pouštní bouře, Gibbs souhlasí. Týmu se společnými silami podaří najít vraha. Byl jím člověk, který nezákonně prodával léky na předpis. Zbývá ještě vypátrat jeho dodavatele. Abby a Reevese přepadne neznámý muž, vytáhne zbraň a začne střílet?

Reeves je mrtvý a Abby vážně zraněna. Tým rozjíždí pátrání. Zjistí, že šlo o nájemného vraha. Otázka je, kdo ho najal. Bishopová a Torres projdou Abbyiny případy za šestnáct let a na základě profilu agentky Sloanové vytipují jednoho muže: Roberta Kinga, samozvaného patriota, který před lety přinutil Abby vytvořit biologickou zbraň. Abby se rozhodne k riskantnímu kroku a Kinga konfrontuje. S pomocí lsti se jí podaří z něj dostat doznání. Jakmile je případ uzavřen, Abby oznámí celému týmu, že odchází z NCIS a odjíždí do Londýna, aby tam za Reevese založila nadaci na počest jeho matky.

Gibbs přijede na pohřeb svého přítele, kapitána Phila Brookse. Jaké je ale jeho překvapení, když ho ve sklepě jeho vlastního domu najde živého a zdravého. Phil se Gibbsovi svěří, že někdo napadl jeho loď a pokusil se ho zastřelit. Skočil přes palubu a zachránil si život. Domluví se tedy s Gibbsem, že nechají vraha v domnění, že mu prošla vražda, než případ vyšetří. Má to ale jednu podmínku. Nesmí o tom říct ani své ženě Marcy.

Agentka Sloanová si vyrazí na rande. Večer probíhá v příjemném duchu, než do baru vstoupí jistý muž. Jakmile promluví, Sloanová vyskočí a napadne ho. Policie ji zatkne a zavolá Vance. Jemu Sloanová svěří, že muž, kterého v baru potkala, je terorista, který ji a její tým před lety mučil v Afganistánu. Sloanové se vrátí bolestivé vzpomínky a je odhodlaná muže za každou cenu dostat. Jenomže Hakim nyní pracuje pro britské velvyslanectví a je chráněn diplomatickou imunitou.