Quando una nuova minaccia emerge su National City, Kara/Supergirl si unisce a suo cugino, Clark Kent/Superman, per fermarla. Kara è entusiasta di avere la sua famiglia in città, ma questo lascia che Alex si senta un po' abbandonato. Nel frattempo, Hank e Supergirl sono storditi dal contenitore che si è schiantato sulla Terra.

Kara viene ferita da un villain creato da CAdmus con la kryptonite e Superman da' la colpa a Hank visto che la kryptonite è stata rubata dalla DEO. Nel frattempo il primo giorno di lavoro di Kara come reporter non va come previsto perchè il suo capo è un tipo molto burbero. Alex e sua sorella hanno un chiarimento perchè la prima si sente messa in disparte dall'arrivo del cugino di Kara, Clark.

Supergirl e il DEO sono assegnati alla protezione dei Presidente in seguitgo a un attacco che prova delle tensioni in National City per i diritti degli alieni. Alex indaga sul caso insieme a Maggie Sawyer mentre Kara teme che Mon-El possa essere il responsabile della faccenda.

Kara e gli altri cercano di fermare un ring clandestino di lotta tra alieni; Kara capisce che Mon-El ha bisogno di una famiglia con cui imparare a vivere sulla Terra e si offre di ospitarlo a casa sua. Intanto J'onn vorrebbe instaurare un collegamento mentale con M'gann, ma si scopre che lei non è chi dice di essere...

Supergirl sta affrontando una banda di criminali in possesso di armi che possono ferire gli alieni. Kara si ritrova a lavorare con LEna Luthor per fermare i criminali. Intanto Alex scopre qualcosa su se' stessa e cerca di affrontare questa nuova realtà mentre James decide di voler combattere il crimine per conto proprio.

Alex parla con Kara dei suoi sentimenti per Maggie, ma inizialmente Kara reagisce male. In seguito si scopre che la sua reazione è dovuta a sensi di colpa nei confronti di Alex. Kara è furiosa con Mon-El perchè sta usando i suoi poteri per scopi personali e non per aiutare il prossimo, intanto Supergirl deve vedersela con un parassita alieno che si nutre di energia.

Lillian ricatta Kara richiedendo la sua presenza minacciando di fare del male a Mon-El. Una volta arrivata, Supergirl viene catturata dal vero Hank, che ora è dotato di poteri. Intanto in città c'è un nuovo vigilante che sta uccidendo i criminali che James ha catturata e che non sono stati condannati. Si scopre il motivo per cui Lillian vuole il sangue di Kara. Alex finalmente riesce ad accettare che tra lei e Maggie c'è solo amicizia.

Superman Cyborg sprigiona un virus in un bar uccidendo tutti gli alieni eccetto Mon-El che viene messo in quarantena al DEO. Eliza, che si trova in visita in città, capisce che il virus è kriptoniano mentre Kara scopre che Henshaw voleva impossessarsi di Medusa, un virus creato da Zor-El. Kara si rivolge a Lena Luthor per avere aiuto e le dice che Lillian è il leader di Cadmus ma Lena decide di non collaborare. Alex e Maggie si baciano per la prima volta e Kara riceve la visita di Barry e Cisco dalla dimensione parallela...

Note: Prima parte del mega-crossover della CW che comprende, in ordine cronologico, Supergirl, The Flash, Arrow e Legends of Tomorrow.

Mentre sono alla ricerca di una donna scomparsa, Supergirl e Mon-El finiscono su un altro pianeta - non molto ospitale - dove Roulette ha organizzato un traffico di schiavi. Per fortuna Alex e Winn riusciranno a salvarli.

Quando Livewire riesce, apparentemente, a scappare di prigione, Supergirl si mette a lavoro per rintracciarla e catturarla di nuovo.

Un marziano bianco di nome Armek arriva a National City intenzionato a catturare M'gann e riportarla sul loro pianeta per essere affrontare le accuse di tradimento.

Metallo libera Lillian dalla prigione e le prove indicano che Lena Luthor è responsabile di tutto, così Lena viene arrestata dalla polizia e tocca a Kara scoprire la verità.

E' la festa di San Valentino ed Alex è su di giri per il suo primo Valentino con Maggie, quest'ultima però non è molto entusiasta delle festività e questo le porta a litigare. Tuttavia Maggie decide di farsi perdonare organizzando una serata speciale per Alex. Intanto Kara ha dei problemi con una creatura magica che arriva sulla Terra e semina il caos quando lei non ricambia i suoi sentimenti.

Quando Jeremiah Danvers viene salvato da Cadmus, Ales e Kara sono felici di riaverlo finalmente con loro, ma Mon-El è sospettoso e non smette di chiedersi il perchè di questo tempestivo ritorno.

Per mandare all'aria l'ultimo piano di Cadmus, Kara e Alex si rendono conto di dover rompere le regole per raggiungere il loro obiettivo.

Supergirl è alle prese con un nuovo villain in città, la nuova ragazza di Winn, Lyra finisce per metterlo nei guai con la legge. Supergirl combatte contro il Music Meister.

Un gruppo di alieni prende di mira National city perchè intende raccogliere la taglia che pende sulla testa di Supergirl.

L'ex ragazzo di Lena, Jack Spheer, arriva in città per annunciare una scoperta eccezionale nel campo della nanotecnologia che potrebbe eliminare tutte le malattie.

Alex viene rapita e Supergirl e Maggie lavorano fianco a fianco per salvarla prima che sia troppo tardi.

National City viene attaccata dai Phorian, una razza aliena in genere pacifica che possiede abilità telecinetiche.

Supergirl è in preda ai dubbi e non sa se obbedire agli ordini presidenziali in merito alle azioni compiute da Rhea. Intanto Cat Grant fa ritorno a National City.

Supergirl sfida Rhea a una battaglia uno contro uno per salvare National City, ma dovrà fare i conti con la sua scorrettezza. Superman ritorna, ma finisce sotto l'effetto di una sostanza che lo metterà contro Kara e i due finiranno per scontrarsi. Alla fine Supergirl è costretta a prendere una decisione drastica che le costerà un caro prezzo.

Kara affronta la perdita di Mon-El concentrandosi sulla sua missione di paladina della giustizia e lottando contro una nuova minaccia. Alex confessa un segreto a Maggie. Un cittadino di National City ha un misterioso collegamento con Kara mentre Lena fa una mossa azzardata.

Un ladro con poteri mentali attacca National City e prova essere un avversario formidabile per Supergirl.

Maggie si rivolge a suo padre quando Eliza organizza una festa per l'imminente matrimonio di Alex. Supergirl intanto si unisce a J'onn per una missione personale.

Kara indaga su un gruppo segreto il cui leader, Thomas Covill, ha una misteriosa connessione con Supergirl. Nel frattempo Samantha teme di aver deluso Ruby, mentre J'onn confessa un vecchio segreto.

When multiple children get sick from lead poisoning, Morgan Edge points the finger at Lena and blames her creation of the lead bomb she made to save National City from the Daxamites. While Lena knows she never intended any harm, she fears there may have been a flaw in her design, leaving her responsible. Kara teams up with Samantha to clear Lena’s name, but it turns out to be harder than they thought. Meanwhile, Alex and Maggie make a crucial decision about the future of their relationship.

Kara and Alex head home to Midvale for a little R&R. While there, Kara recalls a painful memory of a childhood friend's death and how that traumatic experience brought the Danver sisters closer together.

When Winn and the team discover an alien ship has crash landed deep underwater beneath National City, Kara/Supergirl is called in to investigate. Meanwhile, Hank attempts to bond with his father, Myr'nn. Samantha, eager for some understanding of the changes she has been experiencing, looks to her estranged mother, Patricia Arias, for answers.

Barry and Iris’s wedding brings the gang together, but things go awry when villains from Earth-X attack the ceremony. All of the superheroes band together with help from their super friends like Citizen Cold, The Ray, Felicity Smoak, Iris West and Alex Danvers to take on their most formidable villains yet. Earth’s mightiest heroes – Green Arrow, Supergirl, The Flash and White Canary – lead their teams into battle to save the world.

The crossover continues on Arrow S06E08 Crisis on Earth-X (II), The Flash S04E08 Crisis on Earth-X (III) and DC's Legends of Tomorrow S03E08 Crisis on Earth-X (IV).

Supergirl investigates a mysterious symbol popping up all over National City, tracing its origins back to an ancient prophecy and the mark of the World Killer, Reign. Meanwhile, the tension between Lena and Morgan Edge continues to build, causing James to step in and offer up some protection, and possibly igniting a spark in the process.

Struggling to heal from her injuries inflicted by Reign, Supergirl remains in a dreamlike state, unable to be reached. Mon-El recruits one of the Legion members, Brainiac-5, to try to bring her back. Meanwhile, Reign continues her rampage on the city so the DEO teams up with the Legion of Superheroes to try to stop her.

As Reign continues to terrorize the city, Supergirl teams up with Saturn Girl, and the two recruit Supergirl’s former enemies, Livewire and Psi, to form a team for a mission to Fort Rozz to recover a prisoner who has information on how to defeat Reign once and for all. Meanwhile, Alex babysits Ruby.

Someone tries to kill Morgan Edge and he barely survives. He accuses Lena of being behind the attempt and vows to destroy her. When Lena fears her hatred for Morgan will take her to the Luthor dark side, Kara steps in to help her friend. Meanwhile, after Sam realizes she’s losing time, she confides in Alex who decides to run some medical tests to see if she can find out what’s going on with her new friend.

The DEO captures a second Worldkiller, Purity. Supergirl and Alex use very different methods of interrogation with Purity in the hopes of finding out how to defeat Reign. However, Purity escapes and attacks the city’s subway tunnels. Meanwhile, J’onn, Winn and Mon-El band together to fix the Legion ship.

When Winn’s father dies, his estranged mother, Mary, reappears trying to reconnect and to explain why she abandoned him all those years ago. Winn is too embittered from his rough childhood to forgive her but when a copycat Toyman attacks, the two must work together to stop him. Mon-El tells Kara something important about the Worldkillers, and Alex becomes suspicious of Myr'nn’s recent behavior.

Myr'nn inadvertently causes psychic disturbances at the DEO; Supergirl must work with J'onn to contain the chaos; Mon-El begins training Kara in fighting techniques he's learned in the future.

Supergirl and Imra have different ideas on how to stop the third Worldkiller, Pestilence. However, when both Alex and Winn are seriously injured by Pestilence, Supergirl and Imra team up to stop the destruction.

Still reeling after learning about Lena’s secret, Supergirl asks Guardian for a favor that could alter his relationship with Lena forever. Meanwhile, with all three Worldkillers united, Supergirl and the team brace for an epic battle.

When Reign starts hunting Ruby, Supergirl and Alex work together to keep her safe. Supergirl and J'onn look to Sam’s mother for advice on how to stop Reign and come away with some shocking news.

When Tanya, a disciple of Coville's, escapes from what's left of his cult, she gives Kara and James a journal that could hold the key to saving Sam. Someone learns Guardian's identity and threatens to expose James if he doesn't do what they ask. James contemplates what it means to be a black vigilante without a mask in America.

Supergirl is stunned to discover that a part of Krypton survived. Meanwhile, Alex is attacked while out with Ruby, and Lena considers how far she will go to keep Reign contained.

Kara makes a major life decision. Meanwhile, J'onn finds out that special DEO-caliber guns have hit the streets of National City.

Supergirl learns the true depth of Serena's nefarious plans for Earth. Supergirl, Mon-El and Alura must devise a plan to stop her before Serena gets to Earth. J'onn prepares to say goodbye to his father.

Supergirl and team take on Selena in an epic battle for Earth.

Kara sembra avere tutto sotto controllo, impegnata nel doppio ruolo di eroina e reporter. Nel frattempo, Alex, nuovo direttore del DEO, si dimostra all'altezza del ruolo.

La tensione fra umani e alieni è alle stelle; la Presidentessa si dimette per evitare di peggiorare la situazione. Marcy disattiva i dispositivi che consentono agli alieni di camuffarsi.

L'esplosione dell'ordigno azionato da Mercy Graves ha riempito l'atmosfera terrestre di frammenti di kryptonite. Kara, colpita in volo, precipita verso morte certa.

Dopo essere stata ad un passo dalla morte, Supergirl è sopravvissuta. È in una speciale tuta di contenimento, in attesa che l'atmosfera terrestre sia ripulita dalla kryptonite.

Con il Parassita in corpo, Jensen è ora assetato dell'energia e dei poteri degli alieni di National City, trascinando l'intera città nel caos. Supergirl è impotente di fronte a lui.

I Figli della Liberta' stanno organizzando, per la notte del Ringraziamento, delle ronde notturne in tutta National City con cani addestrati a scovare gli alieni.

Supergirl e Manchester fanno squadra per far fronte ai Figli della Libertà che sono intenzionati a far esplodere un ordigno. Kara non è d'accordo con i modi usati dal suo nuovo alleato e non sa se fidarsi o meno di lui ma J'onn la invita a non dubitare del suo amico perché crede di capire come si sente. Purtroppo però, l'uomo ha un piano tutto suo, e pur di mettere le mani sul mandante dell'omicidio di Fiona, non esita a tradire chiunque prova a fidarsi di lui.

I sogni di Nia sono sempre più reali e lei, non avendone il controllo, è spaventata da questi episodi, finché non rivela a Kara di essere un'aliena in grado di prevedere il futuro.

Tornato in possesso del Libro del Destino, il dottor Deegan ha nuovamente riscritto la realtà. Ora, Barry e Oliver sono due criminali noti come i Gemelli Trigger, lo stesso Deegan è il nuovo Superman di un mondo completamente assoggettato al suo volere e Kara è sua prigioniera. Tutti gli amici dei tre supereroi sono ora loro nemici, al servizio del malvagio kryptoniano. Flash, Green Arrow e Supergirl devono trovare il modo di riportare tutto alla normalità.

In Russia, Red Daughter continua il suo addestramento. Supergirl, dopo essersi rifiutata di rivelare al Governo la sua identità segreta, è stata congedata dal D.E.O.

Per proteggere sua sorella, Alex ha scelto come altri agenti del D.E.O., di farsi cancellare l'identità segreta di Supergirl dalla mente, sfruttando i poteri di J'onn.

Due ladri di gioielli si imbattono in una specie di asteroide, da cui esce una forma aliena simbiotica, che si impossessa del corpo della donna, facendola diventare Menagerie.

Manchester, con l'aiuto di Hat e Menagerie, evade di prigione. Con loro ed il Morae rimasto, fonda l'Elite. Tra Supergirl e Manchester non trovando un giusto accordo, si incombe in una guerra.

Diventato Direttore degli Affari Alieni, Lockwood è ancora di più nel mirino di Manchester. Menagerie viene catturata da Kara, Hank e Nia.

Lex Luthor, dopo essere stato arrestato quattro anni prima, torna ora da Lena perché è malato di cancro. Sa che sua sorella è l'unica persona in grado di salvarlo.

Tre anni prima degli eventi del presente, Lex Luthor viene condannato per diversi crimini. Fuori dal tribunale lo aspettano Otis Graves e Eve Tessmacher.

J'onn, caduto in una profonda crisi interiore dopo aver ucciso Manchester, sente di aver fallito come uomo di pace e custode spirituale dei simboli che racchiudono le memorie marziane e chiede consiglio al padre; lo spirito di M'yrnn riesce a fargli capire che l'unica cosa importante è che J'onn accetti la sua vera natura, ossia quella di un guerriero, e J'onn, finalmente in pace con se stesso, decide di riportare i simboli su Marte in attesa di trovare un custode.

James accetta di entrare in terapia e scopre che le sensazioni che sperimenta durante gli attacchi di panico sono provocate dal siero dell'Harun-El, che gli ha conferito abilità sovrumane.

James non riesce a controllare i suoi poteri a causa degli attacchi di panico; Brainy s'inserisce nella mente dell'amico e scopre che la vera origine di tutto, riemersa in seguito all'attentato, è una triste esperienza che impedì a James, da bambino, di partecipare al funerale del padre.

James mette alla prova i suoi poteri alla Fortezza della Solitudine; Alex, intanto, ottiene finalmente la possibilità di adottare un bambino, frutto di una gravidanza indesiderata, ma all'ultimo istante la madre biologica sceglie di non dare il piccolo in affidamento. Alex ha il cuore a pezzi e vorrebbe rinunciare al suo sogno di avere dei figli, sentendo di non poter sopportare altre delusioni, ma Kelly la esorta a non perdersi d'animo.

Kara, catturata dagli uomini di Baker, scopre che il presidente è in combutta con Lex e ha cancellato tutte le prove contro di lui. Red Daughter viene mandata a finirla, ma Kara, sfruttando la propria maggiore resistenza alla kryptonite, riesce a liberarsi e a fuggire.

La puntata si apre con un flashback: in una base segreta, Lex e Eve creano un'armatura potenziata con l'energia dei prigionieri alieni, dopodiché la Kaznia, al segnale di Lex, sferra il proprio attacco all'America proprio nel momento in cui Red Daughter sconfigge Supergirl.

Kara is surprised to find that CatCo has a new owner who has brought in a star reporter. New couples emerge and explore their budding relationships while J’onn J’onzz receives an unexpected visitor.

Supergirl, Alex, and Brainiac thwart an alien attack while William investigates Kara. J'onn J'onzz and Kelly use Obsidian tech to solve a problem.

Kara attempts to mend her relationship with Lena. J’onn J’onzz takes a deep dive into his memories while Kelly tries to help an old friend.

Kara's investigation into William Dey's "criminal" activities results in the shocking revelation he is not who she thinks. Meanwhile, the conflict between Malefic and J'onn J'onzz reaches a boiling point.

On the eve of the worldwide launch of Andrea Rojas's VR contact lenses, Kara and William team up on an investigation that exposes a terrorist plot. Kelly and Alex celebrate an anniversary, but Alex's safety is in jeopardy.

While a new villain is under arrest at the DEO, Supergirl uses him to try and understand who is responsible for the recent attacks. Meanwhile, Andrea and Lena think back on their tumultuous past.

Supergirl finally learns the truth about Lena while tangling with Leviathan. J'onn J'onn makes a discovery about his brother's whereabouts.

Supergirl's struggle against Leviathan reaches a boiling point as she faces off against Rama Khan. Meanwhile, as Lena and Hope work to launch Project Non Nocere, Hope proves to be an invaluable asset to Lena.

The Monitor sends Harbinger to gather the worlds’ greatest heroes - Supergirl, The Flash, Green Arrow, Batwoman, White Canary, The Atom and Superman - in preparation for the impending Crisis. With their worlds in imminent danger, the superheroes suit up for battle while J’onn and Alex recruit Lena to help them find a way to save the people of Earth-38.

This crossover continues on Batwoman S1E09, The Flash S6E09, Arrow S8E08, and Legends of Tomorrow S05E01.

The subsequent complications from the Crisis leave Supergirl to face a chaotic threat.

As Supergirl tries to thwart a Toyman copycat, Winn Schott returns from the future.

Supergirl helps Winn face his greatest fear. After Alex sets out to find evidence against Lex, Brainy must decide between helping his friend or continuing to secretly work for Lex.

Mxyzptlk returns with a proposition for Kara – what if she could go back in time and tell Lena her secret before Lex did, would things turn out different? Looking back over key moments throughout the series, Kara must decide if she wants to change history to become friends with Lena again.

Lex tasks Supergirl with protecting Andrea from an anti-tech extremist, but his nefarious purpose goes beyond merely keeping Andrea alive. Meanwhile, Lena moves forward with Non Nocere, with Lex’s help.

Yvette, una trans di colore, viene aggredita da Gregory Bauer, alias Angus, un uomo facente parte di un gruppo che perseguita i transgender.

Una volta entrati nella Realta' Virtuale, molti non sono piu' in grado di uscirne e scambiano per reale cio' che e' finzione.

Lex, dopo la crisi sulle Terra Infinite, usa la nuova Terra per architettare un piano per uccidere Supergirl.

Gemma Cooper, alias Gamemnae, incarica Rama Khan di procurare la Kryptonite custodita nel DEO.

Ora che Rama Khan e' in possesso della Kryptonite, Supergirl non puo' combattere ne' lui ne gli altri dominatori degli elementi.

Lex ottiene i poteri combinati dei membri di Leviathan e progetta ciò che l'Anti-Monitor non poteva fare: distruggere tutta la vita sulla Terra.

Il team di Supergirl convince Silas, un alieno, a costruire un portale per entrare nella Zona Fantasma e salvare Supergirl.

Zor-El viene catturato da Scar e dai suoi amici nella Zona Fantasma. Kara conosce Nyxly, un folletto che crede di aver perso i suoi poteri.

M'gann in parte è ancora un Fantasma, quindi ha il potere di percepire le forze vitali. Lena entra a far parte del team. Crea la Proto-Trappola, un'arma per catturare i Fantasmi

Nia e Brainy cercano di salvare Supergirl viaggiando nel tempo e tornando nel 2009, al liceo di Midvale.

Nia continua a sognare la gabbia dove c'era il coguaro. CJ trova l'astronave di Naxim e viene catturata. Kara e Kenny vanno al ballo studentesco.

Mentre il team cerca di arrivare nella Zona Fantasma per salvare Supergirl e riportarla a casa, il Fantasma attacca tutti i membri sulle loro paure profonde.

Kara è tornata a National City insieme a suo padre Zor-El e ha ripreso il suo posto alla CatCo Media ma è ancora perseguitata dalla traumatica esperienza nella Zona Fantasma.

Il lavoro nei servizi sociali porta Kelly a incontrare Joey, un orfano alieno problematico che subisce l'influenza negativa del fratello Orlando, detenuto in carcere.

Nia ha liberato Nyxly dal mondo dei sogni e il folletto è ora libero di portare distruzione sulla Terra. Nyxly vuole riottenere i suoi poteri e intrappolare Supergirl.

Supergirl e il suo team devono impedire a Nyxly di catturare Mister Mxyzptlk. Per combatterla però devono prima creare un dispositivo che la privi di tutti i poteri.

L'edificio Ormfell implode ferendo molti dei residenti delle Heights e i presenti nella zona; tra questi anche la consigliera Rankin.

Il Team Supergirl deve anticipare le mosse di Nyxly; il Totem del Coraggio da lei bramato ha le fattezze di un'antica fionda ed è in un museo di National City.

William chiede di rimanere in contatto con i super eroi di National City, accettando di mantenere segreti alcuni dettagli nei suoi articoli. Nyxly trova e prende il Totem dell'Umanità e lo attiva, portando tutti nel raggio d'azione a unirsi ad una rissa causata dalla folla.

La piccola Esme è stata adottata da Kelly e Alex che la vogliono abituare da subito ad esplorare i suoi poteri, ma la bambina si sente sotto pressione.

Kara organizza uno storico incontro tra i leader di nazioni in guerra, ma l'intervista dei suoi sogni viene interrotta dall'arrivo di un mostro dal Regno dei Sogni.

Con l'avvicinarsi del loro anniversario, Alex intende preparare a Kelly una festa molto speciale, ma una serie di imprevisti si mettono di mezzo.

Braniac riceve l'ordine di ritornare nel futuro per fondersi con il Grande Intelletto una volta sconfitti Nyxly e Lex Luthor.

Lex Luthor chiede ai Super-amici un riscatto: tutti i Totem, incluso quello del Destino ancora da trovare, in cambio di Esmé.

Lo scontro tra Lex e Nyxly indebolisce sempre più gli abitanti di tutto il mondo e Supergirl farà loro un discorso che entrerà nei libri di storia.