Preview to the new stargate series called Stargate Atlantis. Includes cast interviews and behind the scene footage.

The Sci-Fi Channel debuted the behind-the-scenes special "From Stargate to Atlantis: A Sci-Fi Lowdown" on July 5, 2004. With great anticipation for the July 9 premiere of of Stargate SG-1's eighth season and the July 16 world premiere of Stargate Atlantis, GateWorld presents these Atlantis preview shots from the special! The images include the first good look at the "puddle jumper" ship, an outer space Stargate in orbit of a planet, a Pegasus galaxy D.H.D., the male Wraith, and more.

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百万年前，在南极洲（还没有被冰层覆盖）坐落着古人的城市 Atlantis，可能是为了避开瘟疫的威胁，整个城市飞离了银河系，到达了飞马座（Pegasus）。后来 SG-1 找到了他们留下的前哨站，ONeill 使用古人的武器摧毁了 Anubis 的舰队（SG-1, 7.22, Lost City）。现在 Daniel 终于找到了第 8 个地址，利用前哨站的 ZPM 为星门提供能源（长途拨号消耗比较大），由 Dr.Elizabeth Weir 率领的由十多个国家的队员组成的探险队顺利抵达了 Atlantis。

McKay 根据 Ford 记下的符号找出了幽灵所在的星球，发送过去的 MALP 显示那里的星门是悬浮在星球的轨道中的。随后他们找到了古人留下的可以穿过星门的小型飞船“Jumper”（SG-1 也曾遇到过一个，带有时间机器的，用它回到古埃及弄到了 ZPM），Sheppard 的古人基因可以完全控制它（Jumper 能够隐形，且拥有生命探测装置，还有便携式的 X_|||）。鉴于现在已经有了战略优势，Weir 同意 Sheppard 带队前往营救 Sumner 上校。通过生命探测仪 Sheppard 等人很快就找到了被关押的 Teyla 等人。

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Dr. Carson Beckett 的研究表明古人使用基因作为装置启动密码（ATA：古代技术激活），为了使成员具有使用古人技术的能力，需要修改基因序列（用鼠类逆转录病毒，副作用是口干舌燥、头晕、向轮子冲过去的冲动，呵呵）。McKay 是第一个实验者，他成功地激活了一个古人个人防护罩，这个小东西可以保护他免受任何伤害（金钟罩，从楼上摔下来都没事）。不过没想到的是，他自己的手也没办法伸进去把他取下来，吃饭喝水都成了问题。Carson 认为可以用意识把它取下来，但是 McKay 坚称没有作用，Weir 等人则认为是他不想取下来（炫耀、胆小、没有安全感等），古人不可能造这么一个可能会危及自己生命的东西。

Jumper One（Sheppard、McKay、Teyla、Ford）侦查幽灵的星球时发现，当时看到的整个小山就是一艘幽灵母舰，现在他们离开了那里，准备去屠戮世界。然后他们遭遇到幽灵的伏击，混乱中一只外星虫子紧紧地抓到了 Sheppard 的脖子上（Ford 少尉对着虫子开枪都弄不死它，它跟幽灵一样，吸食了食物就会自动复原），穿过星门时，由于 Jumper 的发动机受损没有及时收回，结果被卡住了。星门只能接受传送和还原完整的东西，所以38分钟后，飞船的前半段和里面的驾驶员就会消失，后半段则被切断，Sheppard 等人将被扔到太空。

Shepppard 等人刚出去几小时就灰溜溜地被打回来了（McKay 中了一枪，幸好幽灵的武器只是是麻痹神经，还要留着活人吸食生命，所以 McKay 只是暂时嘴巴不能动），这是他们第9次刚出任务就遭遇幽灵了，Weir 认为基地里有内奸，Teyla 和 Athos 人成了怀疑对象，McKay 和 Sheppard 认为不可能，因为那样的话幽灵会直接攻击 Atlantis。 Weir 开始逐个询问 Athos 人，调查期间星门任务暂停。与此同时 McKay 发现城市的屋顶可以打开，Sheppard 和 Ford 驾驶着 Jumper 兜风时发现了陆地，Athos 人决定搬往陆地（省得天天又被限制又被怀疑），Teyla 则留下来加入 Sheppard 的小队。

Sheppard 等人在侦查一个星球时，Jumper 受到奇怪的电磁脉冲干扰迫降到地面，然后他们被一群拿着弓箭的十多岁的孩子包围，要带他们去见“长者”。这个所谓的“长者”，Keras，也只有24岁，他说500年前这里是幽灵的食物场，他们的祖先相信幽灵只抓成年人，所以定下规矩，25岁之后必须自杀。他邀请 Sheppard 等人参加他的自杀仪式。

Hoff 这个国家在研究一种可以免疫幽灵的药品，Carson 医生参与了该项目，对方是一个漂亮的女医生 Perna。曾经有一个 Hoff 人拥有一种特殊的蛋白质，可以抵抗幽灵释放的药物（幽灵吸食生命的原理大概是释放一种药物，吸收和分解人类的抑制衰老的蛋白质。人类进入中年后，这种蛋白质开始减少，同时也就逐渐衰老），药品的原型就来自这个人。Carson 利用原型和之前捕获的幽灵（Sheppard 把他命名为 Steve）的血液制出了血清。

Teyla 介绍 Weir 和 Genii 的农民交易，用药品换取粮食供给。他们的首领 Cowen 看到 Sheppard 用 C4 炸掉树桩后（只是为了帮助居民垦荒，牛 X_|||），希望用粮食换取 C4 和药品。Sheppard 请示了 Weir 之后返回 Genii 途中，McKay 接收到一个奇怪的放射信号，跟踪着信号找到了一个地道，一个地下的城市，然后遇到了全副武装的 Cowen。

M5S-224 星球弥漫着浓雾，但是 McKay 发现那些其实都是生命体或能量体，而且星门可以用空气中吸取能量。这意味着修改一下该星球的 DHD，就可以从这里拨号回地球。问题是回去了地球，就没办法回来了（地球 ZPM 已经耗光了），不过 Asgard 已经修改了普罗米修斯（Prometheus）的引擎，有望一个月就能抵达飞马座。

一场“完美风暴”即将袭击 Atlantis，Atlantis 的人员必须紧急撤离。Sheppard 请求 Manara 的首领 Smeadon 允许 Atlantis 暂时撤离到他们的星球，Smeadon 暗地里却通知了 Genii 的首领 Cowen（他们刚刚和 Atlantis 结下梁子）。Cowen 派遣指挥官 Kolya 集结了一个突击小队准备袭击 Atlantis。

McKay 警告 Kolya 要得到 Atlantis，必须留下他们两个，Kolya 骗 Sheppard 说 Weir 已经死了，Sheppard 发誓要取他性命。此时留在陆地的 Teyla 等人进入了暴风眼（飓风的中心，阳光明媚、风平浪静），Teyla 等人趁此机会，驾驶 Jumper 赶回 Atlantis 协助 Sheppard，Kolya 通知 Genii 要求增派援手。

Jumper-1 在一次飞行训练中，发现了一颗携带古人武器的人造卫星（大小如同一个 Goauld 母舰），可惜卫星已经报废。他们同时发现了一艘坠毁的幽灵飞船，猜测它可能是在一万年前进攻 Atlantis 时被古人卫星摧毁的。在下面的星球上，他们发现了许多像萤火虫一样的“space bug，太空虫子”（Sheppard 这个家伙有命名的嗜好），这些虫子有强烈的生命信号，对他们携带的食品（巧克力？）很感兴趣。

科学家们在搜索 Atlantis 城区的时候，在一个病毒实验室发现了一些破碎的容器，然后队员们相继开始出现鬼魂的幻觉，6个小时后导致脑动脉破裂而死。一个病人由于过度的惊吓在城区四处乱窜，Atlantis 全面戒严。

Jumper-1 被一群幽灵战机追赶，突然下面的星球上发出一束亮光，亮光摧毁了幽灵战机，Jumper 却安然无恙。McKay 认为只有 ZPM 才能为这样强大的武器提供能源，建议下去调查一下。 一个叫做 Zarah 的修道士代表 Proculus 人欢迎了他们，他们从未遇到过幽灵，Athar 神一直在保护他们。McKay 认为有一个他们不知道的古人武器在保护这个星球，不过这里倒是 Atlantis 的最佳避难所。Zarah 带他们去见女祭司 Chaya 以征求神的意志，Chaya 很遗憾地说 Athar 神不能让非子民在此居住，不过她很希望去参观一下神奇的 Atlantis。

Sheppard、Teyla、Ford 等人搜索城区时发现了一个冷冻着的老人（和 ONeill 当年冷冻自己一样的装置），根据资料记载，她已被冰冻了将近一万年，Carson 将其解冻后，她居然认识所有的队员，并声称她自己是 Dr.Elizabeth Weir。她带领探险队抵达 Atlantis 时，找到了一个时间旅行装置，通过它找到了原来居住在 Atlantis 的古人。 在她的时空中，Atlantis 的能量被耗光后并没有浮起来，而是被海水淹没，只有她和 Sheppard、Zelenaka 躲在一个 Jumper 内得以幸存（我竟然死了，McKay 一脸不情愿），然后 Jumper 被幽灵摧毁，只有她通过 Jumper 上的时间机器找到了一万年前 Atlantis 的古人。

McKay 在五个前哨站之一的 Dagan 星球的考古学家 Allina 的协助下寻找 ZPM 的下落。历史记载说，当年一个叫 Lantian 的古人把一个 ZPM 交给 Sudarian 的由 15 个僧侣组成的兄弟 会 The Quindosim 保管，并声称将来取回时会酬谢他们，但是后来幽灵几乎灭绝了 Sudarian 人，兄弟会把 ZPM 的保存地点分刻在九块石头上，McKay 根据 Allina 找到的三块石头很快就发现了其他五块，并找 到可能保存着 ZPM 的密室。然而他们却被死对头 Kolya 指挥官抓住了。

Atlantis 现在已经到了千钧一发的地步，McKay 认为虽然没有办法建立一个回到地球的虫洞，但是可以建立一个1.3秒的连接。利用这段时间，他可以用高压缩比的数据格式把研究数据、行动报告甚至所有队员的私人视频信息传送回去，同时向地球发送关于幽灵的警告。

很久以前，有一个幽灵捉了一批人做基因改造试验，想让人类吃起来“更可口”。后来发现在被改造的同时，这些人也拥有了“能感应到幽灵的到来”、甚至可以“探测幽灵意识”的能力。后来这个幽灵中止了实验，这批人被放了回去（他原以为与普通人类杂种繁殖后这种能力就会消失），Teyla 的祖先曾是被实验者之一，她的基因里含有部分幽灵的 DNA。Teyla 从实验室带回的数据还表明，幽灵是在古人抵达飞马座后才开始进化的；幽灵的语言其实是一种古人的方言。Carson 认为幽灵是曾经抓住 Sheppard 脖子的那 种虫子混合了人类的 DNA 后的产物，是古人无意间造出了幽灵。

McKay、Grodin 和 Miller 乘 Jumper 去尝试修复古人的攻击卫星，从 Teyla 得到的路线图看，幽灵舰队正好经过那里。Sheppard 和 Teyla 则要继续搜索合适的 Alpha 基地。为了防止古人的数据库落入幽灵之手（上次传回去不过只是 8%-9%），Zelenka 精心设计了自毁计划（包括一个清除数据的病毒）。 Shepperd 等人又遇到了袭击，Bates 中士不分青红皂白就指责 Teyla，实际上攻击他们的只是一种像恐龙的怪兽。Teyla 与 Bates 的摩擦升级，随后 Bates 离奇死亡，Teyla 成了怀疑对象。Carson 从 Bates 衣服上 DNA 测试得知，基地里有一个幽灵，应该是前几天的侦查机自毁后隐藏在城内的。Teyla 和 Ford 很快就逮住了他，不过这家伙（Sheppard 把他命名为 Bob）除了说些威胁的话外没透 露任何信息。

突然间星门接通，ONeill 将军派来了援军，因为 SG-1 在一次时空混乱中弄到了一个 ZPM （SG-1, 8.20, Moebius）。Everett 上校一进来就解除了 Weir 的指挥权，中止了自毁程序，并开始积极备战。地球建造的 Daedalus 号飞船即将在四天内带着 ZPM 抵达，现在要做的就是要坚持到飞船抵达。 Everett 上校计划使用 Jumper 把六枚 Naquadah 加强核弹作为太空雷布置在幽灵舰队航线 上，士兵们开始在城区布置重机枪防御网，他们同时还带来了 Naquadah II 型发电机为控制椅提供能源—— 看起来 Atlantis 守卫战已经万无一失。

Daedalus带来ZPM启动Atlantis的护盾抵御Wraith的进攻但 他们发现实在不够抵抗如此多的舰队。紧急关头他们利用一个核 爆诡计领Wraith相信城市已经被毁灭。Atlantis在未来一段时 间将获得安全。

当探险队计划回到地球时发现Daedalus感染了一种Wraith电脑病毒，该病毒把Daedalus引向Wraith领地并发送地球的坐标。 McKay要清除船上电脑内存并重启以消除病毒.

Sheppard小队试图寻找Ford中尉他们去到一个星球发现Ford 正以杀死Wraith夺取酶为生。同时他们发现一个被Wraith追逐 的人Ronon Dex。

Cadman和McKay被吸入Dart的内存里当Zelenka把其中一个 释放出来时发现是McKay的身体但却是Cadman的意识然后好不容易才解决了这个问题。与此同时Sheppard开始帮助Ronon 适应Atlantis的生活。

Atlantis发现一个星球Olesia和Wraith有着安稳的关系原来他们提供一群“有罪的人”在岛上给Wraith喂食以换取和平。 Jumper在回城途中被岛中居民俘虏并驱使他们打开星门以逃离 这个星球。最后众人平安回到Atlantis而和Wraith交易的 Olesia高官Marin看见一部Cruiser正缓慢朝他飞来。

Atlantis造访了一个和古人有着良好关系的行星Doranda并发现 一个古人前哨站McKay说服Weir让他们回去研究这种武器装置。 另一边Ronon和Teyla去Belka行星做农作物贸易Ronon发 现他并不是唯一被Wraith追逐的人同时他杀死了一个仇人。 McKay的研究过了火武器不受控制地发射而毁灭了星球所在子星系他们依靠Daedalus逃回了Atlantis。

探险小队发现一名Wraith小孩Ellia被一个人类所抚养还藏在一个小村庄中。Beckett医 生打算利用这次机会测试Wraith逆转录酶病毒的效果。村庄的人想杀死Ellia而居然发现原来该人类自愿给她吸食。她尽管偷服了一瓶逆转录酶病毒样本但仍脱离不了Wraith 的本性。最后Ellia逃离了村庄但最终被Ronon击倒。

Sheppard由于被Ellia咬了一口身体渐渐往Wraith方向转化Caldwell暂时代替他的职务。科学家们认为只有用iratus虫子为本源制造的药物才有可能使Sheppard复Beckett 组织小队前往iratus的星球取所需材料但无功而返。最后Sheppard在使用抑制剂的情况下自己独闯虫洞取得所需从而治好了自己。

小队发现一艘古人的大舰Aurora漂泊在星系的边缘而船员全部生存处于冬眠状态。 Sheppard加入了他们的虚拟世界和他们交流以学习打败Wraith的方法却发现他们对自己的情况一无所知。同时Teyla发现一个Wraith也混入其中。

小队被Ford俘虏他现在正带领着一群同样服用酶的人对抗Wraith还建议小队服用酶以 获得更强的能力。他们要McKay修好Dart然后留下他而拉上Sheppard一行去一艘Hive 执行死亡任务。但很不幸被Wraith捕获了。

Sheppard和Ford一行被Wraith困在Hive里寻求逃脱办法而McKay冒险使用酶从而得以回到Atlantis。在一次逃离行动中他们 救了一个人类女子Neera想不到竟是崇拜Wraith一族为了刺 探情报而已。正好这时出现了第二艘HiveSheppard利用离间计使两艘Hive互相攻击而毁灭而Ford再次逃离。

小队在一个星球发现古人遗迹的一个怪洞由一种能化结界隔离里面的时间比外界快约第倍。Sheppard被困在里面其他人回到AtlantisMcKay推测有个ZPM存在。原来里面是一个村村民们都是准备升天的人类。

Atlantis被告知被Turst放置了一个炸弹原来Goauld已经有 一个奸细插入Atlantis中。Weir等人对此展开调查甚至动用非常手段。最后才发现被Goauld侵入的Caldwell。在紧急 关头他们关闭了被超载的ZPM避免了被Wraith船只发现。

McKay和Daedalus上的成员Griffin试飞一部修复的Jumper美想到出了故障掉下深海Griffin为此牺牲McKay困在后舱。 他在心理压力越来越大的情况下出现幻觉——Carter出现了并且和他一起寻求解决方法渡过难关最终等到了求援。

小队发现一个行星上有一座类似Atlantis城的古人装置并被一群人占据着统治其他居民。他们前去调查果然发现了不少古人的东西还有武器。Sheppard莫名其妙成为了争夺国王宝座的继承人McKay用尽了ZPM的能量阻止了一场大祸，不过他们补充了不少Drone和Jumper。

小队发现两具人体舱里面分别有一个外星人。他们不慎激活了装置两个外星人的意识侵入了Weir和Sheppard开始了他们相互的战争。幸好这种占据是有期限的。在未发生重大变故前 Weir两人恢复了自己的意识。

Atlantis又和Genii较上了劲，这次还掺入Genii的政变中。Genii使诡计骗取Atlantis的Jumper来对付Wraith，但其最高指挥官自食其果被自己研制的核弹所毁灭。Genii从此步入新的时代。

一名失忆的年轻中尉Michael经常被恶梦所困扰。终于他发现自己并不是人类而是被Beckett医生发明的药物从Wraith转变而来。他用尽办法逃走了并扬言要报告Atlantis未消失的消息给所有Wraith知道。

小队发现一个文明在研究古人的装置却发现这个装置下面是一 座即将爆发的大型火山。同时他们也发现了一艘古人大舰Orion。 最后在Daedalus等帮助下众人逃出升Orion留在了Atlantis。

由Michael带领的一群Wraith联系Atlantis意图合作，他们提供Wraith的资料换取Beckett的转化药物，把其他意见相左的 Wraith转成人类以吸食。Atlantis轻信了他们并帮助他们投放药物。想不到他们在资料中设置了病毒，该病毒不仅消除了Wraith资料还获得了地球的坐标。Wraith抓住Sheppard小队并使母舰向地球驶去。

Apollo舰的突袭不但没有制止复制人的侵略野心，他们反而弄了个带星门有超空间发动机的卫星来到了Atlantis，直接攻击A城迫使A城只有逃命的份了。而A城舰起飞后却飞到了一个不知晓的区域。Weir博士被复制人光束击中以后生命垂危，Rodney把她身上残余的复制人纳米细胞激活后得以生存。

Rodney和Sheppard驾驶 Jumper经过几次跳跃来到复制人星球偷ZPM。利用Weir身上的纳米复制人细胞连接到复制人的系统并修改了底层代码，计划让复制人去对付幽灵。

SAM接任Atlantis的主管，Ronon和Teyla在一个星球上找到Ronon的几个故友，他们想去Atlantis但被SAM拒绝，但SAM同意Sheppard小组协同他们去破坏幽灵的试验基地。

Sheppard在一个星球上接触了一种有思维的水晶体，回来以后好几个人都在梦中梦见另一个Sheppard，原来是那水晶生命附体。

Sheppard单独驾驶 Jumper穿越星门执行任务时被不明武器击中并被俘虏。对手是一个飞马星系的另一支未知人类队伍。他们正在寻找可供他们息存的古人飞 船，但因没有古人基因而无法试用就强迫Sheppard为其开启古人战舰。

一场致命的传染病使得亚特兰蒂斯的关键成员失去了记忆，要靠Teyla和Rodney来寻找治疗的方法。但一群士兵在到处追赶所有人，却没人记得原因。要一起团结合作治愈所有人难上加难。

在拜访New Athos的期间, Teyla和Keller发现自己被一个原始武士部落通缉，之后Teyla有了一个惊人的发现。

SGA小队遇到一个有非凡的预言能力的人，他预测亚特兰蒂斯的未来很不妙。同时他们和一个幽灵一起想要修复一种能停止复制者的病毒。

Jeanie、McKay、Miller和Rodney McKay博士被Henry Wallace绑架，Wallace认定只有McKay用外星纳米技术才能拯救他女儿的命。

当一个神秘的探测器闯入亚特兰蒂斯城时，SGA小队确信复制者已经找到了他们。

复制者为了消灭幽灵对飞马星系人类居住的星球进行毁灭性的攻击，亚特兰蒂斯方面同他们所俘虏的幽灵科学家开始合作，和幽灵以及飞马系的流浪部落结成同盟，共同致力于消灭共同的敌人复制者。

探险队获得了一艘幽灵母舰，在定位装置上发现了幽灵的一个基地，该基地是幽灵得到ZMP后运行起来的‘幽灵复制系统’。一旦复制成功，飞马系将出现不可设想的后果。

亚特兰蒂斯城被严密地隔离封闭起来，这严重考验着A城里人与人之间的关系。Rodney发现自己和他女友Katie Brown困在了植物学实验室里。

Sheppard和McKay总是热衷于帮助他们的盟友，他们接受了由Harmony的姐姐提出的一个要求，陪她进行一次苦行，进入森林去寻找启示以代她的已逝母亲来成为女王。

Sheppard回到地球参加他父亲的葬礼并帮助Ava Granger追捕一个由某地球实验室制造出来的人形复制者。

在一次外星球任务中，McKay, Carter和Keller掉进了一个没有出口的地下室。当地的小孩发现了又怕大人骂不敢救他们，都是顶级科学家的两女一男想尽办法都没法出来。

Carter上校邀请Tealc来到亚特兰蒂斯来帮助Ronon，他将受到I.O.A的复审，当他们到中转太空站等待检疫时幽灵发现已完全运作的中途太空站并破解了登陆密码，大批幽灵通过中转站到了地球，SGC里的人全被弄晕了。

幽灵麦克研究了一种病毒使部分人类能变为一个新人种，但另一部分因不适应会死掉。SAM为此而发愁。Teyla 产生了一个幻象使得她坚信她孩子的父亲在尝试与她联系，但之后发现确是麦克捣的鬼 他想让泰勒的孩子生下来给他作变种人的试验。

前医生卡松也被麦克克隆了帮他作试验，Sheppard在寻找泰勒族人的时候才知道麦克的这个秘密。麦克设计抓到了泰勒Sheppard和。

在完成了一次任务之後，Sheppard返回亚特兰蒂斯城时因太阳耀斑被送到48000年后的亚城。这时的亚城已被遗弃了，所有系统全部失效而且所在的地方不是海洋，泛眼望去全是漫漫荒沙。只有Rodney的虚拟电脑人在这里向Sheppard讲述当时的故事。泰勒生完孩子后被幽灵麦克杀死，Ronan为炸掉幽灵的复制基地和幽灵同归于尽，SAM驾驶D舰和幽灵母舰打游击时干掉三艘幽灵舰后牺牲。

Carter为一场巨大的世界外爆炸的受害者展开了一次营救行动； 但是救援队必须与迈克尔和他的军队作战，他们也希望能够挽救幸存者。

Carson Beckett的克隆人从淤滞中移出，可能得到治愈，而这又是唯一可以为严重的医学问题找到治愈方法的人，但对他的最亲密的朋友来说为时已晚。 Keller博士被用来种植一艘占领了亚特兰蒂斯部分地区的幽灵船。

Ronon与Tyre团聚，而Tyre是前Satedan战士，后来变成了“幽灵崇拜者”（来自第4季的“ Reunion”）。提尔希望重建与罗农和亚特兰蒂斯之间被破坏的关系。但当Ronon被被幽灵折磨的幽灵绑架时，情况变得很糟。

一艘宇宙飞船在亚特兰蒂斯上空出现。Sheppard和他的团队发现这艘船是Daedalus号，这很奇怪，因为星际之门司令部证实Daedalus号实际上离地球两天了。Sheppard的团队登上了新的Daedalus，发现它显然已被遗弃，并带有战伤迹象。Teyla查看了Daedalus指挥官Sobel上校的日志条目，该团队从未听说过。突然之间，出现了功率峰值的Daedalus从亚特兰蒂斯上方消失，而从Sheppard团队的角度来看，亚特兰蒂斯消失了。麦凯发现，通过他所说的“替代现实驱动”，它们已经被推进到平行宇宙中，因此Daedalus实际上是来自多重现实。

Weir博士以“数字提升”的身份回到亚特兰蒂斯，她希望利用亚特兰蒂斯来为自己的意识以及其他八位同样希望提升的复制者构建人体。 Weir说服团队允许其他复制者在重建自己的FRAN后召唤他们的身体，这是复制者McKay先前创建的，目的是让他们自己居住的人体。但是，其中一个复制者 ，Koracen不喜欢它，因此逃离了实验室，以保留复制器并寻求提升。 当他试图杀死Sheppard时，Weir摧毁了他，并意识到她和其他复制者构成了太大的威胁，牺牲了自己，以诱使其他复制者通过一个太空门，在那儿，它们因空间的寒冷而永远被冻结并被停用。

McKay的姐姐Jeannie得知亚特兰蒂斯的弟弟已感染了一种被称为“第二孩童时期”的神秘疾病，这种疾病相当于快速发作的阿尔茨海默氏病。Rodney已经退回到孩子般的状态，所有医疗干预尝试均以失败告终。

Sheppard、Beckett和Teldy少校来到了一个星球，该星球的迈克尔研究设施之一是隐藏在洞穴系统中的早期人类-人类杂交种。 团队与混合动力战斗并杀死了它们。

Teyla冒充Todd的幽灵皇后，让他有权与另一个蜂巢及其女王进行对话，以使幽灵使用一种新的基因疗法来消除他们的进食需求。 不久之后，Todd杀死了另一位女王，他们必须共同努力维持自己的阴谋。 Teyla最终用女王的蜂巢与竞争对手的蜂巢进行战斗，以杀死尽可能多的幽灵。

SGA小队援助了一个受到幽灵威胁的村庄，但是当Keller博士被另一名奔跑者绑架时，Ronon和McKay必须解救他们中的一个。

Daniel Jackson返回亚特兰蒂斯，对兰坦科学家Janus进行研究。 但是，在找到了Janus的秘密实验室之一之后，McKay和Jackson在亚特兰蒂斯出现一艘外星人飞船后失踪，第一次接触的进展不佳。

Sheppard和Zelenka在星际之门爆炸中幸存下来，但这座城市遭到严重破坏。 Todd迫使Sheppard放弃了阿特罗装置（Atero Device）的位置，前往Daedalus。

Sheppard和他的团队遇到了一男一女名叫Sefaris和Novo，巴拉拉行星的两个幸存者，他们在霍芬瘟疫中幸存下来，与Beckett博士一起帮助其他人。 但是，当幽灵来找猎杀他们时，巴拉兰人面临着村子的背叛。

一群组成“联盟”的人类文明对亚特兰蒂斯号探险队针对飞马星系的犯罪进行审判，其中一个Latiran人可能为Genii工作。Richard Woolsey最终加入联盟并为亚特兰蒂斯队辩护，尽管Latiran贵族指责他们为Asurans人破坏了自己的家园。 Woolsey最终设法说服一名公正的法官，使他们相信自己是无辜的，同时说服一名为Genii工作的法官，亚特兰蒂斯作为联盟的军事力量会更好，这使他们被判无罪。

Michael Kenmore has infiltrated Atlantis with an army of his Hybrids, and closes off Stargate Operations and the surrounded levels to prevent anyone from taking it back. His plan; take Teyla Emmagan and her child to perfect his Hybrids, and to destroy the base when they're done. Meanwhile, Lt. Colonel John Sheppard, Dr. Rodney McKay and a team try to take back the city before Michael leaves with what he wants.

Sheppard被Acastus Kolya绑架。。在亚特兰蒂斯，Woolsey、McKay和其他团队成员发现一个名为Sakari的古老种族，这是一个基于硅的生命形式，它使用强烈的幻觉来操纵人们。

McKay带着Keller被邀请参加一个老对手关于解决全球变暖问题的科学演讲， 随后一切都出现了问题。 该计划使用物质桥将热量传递到替代现实，该计划基于McKay和Jeannie在《McKay和Miller夫人》一集中的研究而产生的效果。 最终，这个计划被关闭了，McKay挽救了Keller的性命后，她承认自己爱他，于是他们开始了恋爱关系。

SGA小队调查了幽灵蜂巢上的神秘事件，Todd和他的船员正患病，因为幽灵船本身是有机的，所以连整艘船也患有这种疾病。 据透露，他们在尝试Keller的基因疗法后就得了这种病，这种疗法确实有效，副作用是免疫系统被削弱。

Keller医生被诊断出患有心理疾病。 但是，亚特兰蒂斯号探险队几乎没有意识到她已经接触过身体转换技术，这与SG-1在SG-1情节“ Avalon”中发现的那种要求受试者不靠近身体的技术相似。 同时，Keller的意识面临着一个通缉的逃亡妇女Neeva的拼命挣扎。 最终，SGA小队找到了该装置，而Ronon则将其销毁。

在另一个现实中，侦探Sheppard和联邦调查局特工Woolsey陷入一起类似CSI的谋杀案，其中涉及几起明显来自内华达州拉斯维加斯的幽灵的谋杀案。 最终表明，这只幽灵是攻击地球并被摧毁的蜂巢船的唯一幸存者。 幽灵计划向另一只幽灵发送一个传送带，将他们引到地球，但Sheppard找到了他，一场战斗之后Sheppard受到致命伤。 当幽灵要杀死他时，Woolsey派出的两架A-10雷电II就到达了。

Wraith计划通过将Hive船与来自Asurans的失窃的零点模块集成在一起来升级Hive船，并从替代现实（“ Vegas”）中拾取来自地球的微弱信号，确定该船地球的位置。