58 anos antes de Battlestar Galactica, um avanço surpreendente está tomando forma no planeta Caprica. O criador de um projeto de robô de combate urbano fracassado, tenta trazer uma cópia virtual de sua filha morta para o mundo real, usando um processador roubado, seu chassi de combate e o código dela. Ele, assim, cria uma Forma de Vida Cibernética ou CYLON. A rápida evolução da engenharia humana e mecânica colidiram, juntamente com os destinos de duas famílias. Unidos pela tragédia em um instante explosivo de terror, dois clãs rivais liderados por poderosos patriarcas, Joseph Adama e Daniel Greystone duelam em uma era de ética questionável, maquinações corporativas e ambição pessoal desenfreada como uma guerra final pairando sobre a humanidade.

O avatar de Zoe tenta se adaptar à sua nova vida dentro do corpo de um robô, enquanto os Graystones e os Adamas lidam com suas perdas. Em outro lugar, Lacy janta com a irmã Clarice, e o jovem Will Adama passa algum tempo com seu tio obscuro.

Após a revelação pública de Amanda que sua filha foi responsável pela tragédia no Maglev, os Graystones devem enfrentar a ira dos capricanos furiosos.

Daniel se prepara para ir ao popular Backtalk com Baxter Sarno, para dar uma boa investigação do papel de sua filha na tragédia do atentado, apesar dos protestos de Amanda, que não sabe que Sam está esperando seu momento para realizar o golpe solicitado por seu irmão.

O avatar de Tamara Adama vagueia pelo mundo V, sem saber que ela morreu há quase um mês no atentado de Maglev, e descobre um novo lado do mundo V, a nova cidade de Cap, um lugar onde as pessoas vivem vidas aleatórias de violência e crime em busca do significado indescritível da vida.

Tomas Vergis confronta Daniel sobre o roubo do processador metacognitivo e os dois trabalhadores que foram assassinados no roubo. No entanto, seus meios de vingança não são exatamente o que Daniel espera.

A vida de Amanda fica fora de controle quando ela começa a ter visões de seu irmão, que morreu anos antes. Como resultado, Clarice vê uma oportunidade de ganhar sua confiança e descubrir um segredo obscuro do passado de Amanda, que pode ter grandes implicações para sua vida com Daniel.

Daniel está começando a suspeitar que Zoe Avatar está no robô, mas seus pedidos para que sua filha se revele são ignorados. Em um esforço para expulsá-la, ele lança uma campanha de tortura psicológica, resultando em testes crescentes que forçam Zoe a uma escolha que ela não pode voltar atrás.

Quando Daniel finalmente estabelece um prazo para redefinir o U-87 Cylon , e, sem saber, acabar com a existência de Zoe-A como ele a conhece, ela faz uma tentativa desesperada de se salvar. Mas quando seu plano sai pela culatra, ela se vê sem tempo e sem opções.

Tendo perdido sua esposa e companhia, Daniel se aproxima dos Ha'la'tha com um acordo para capitalizar avatares virtuais como meio de derrotar a dor.

O acordo de Daniel com os Ha'la'tha leva a algumas escolhas desagradáveis.

Linhas de lealdade foram traçadas. Aonde você fica?

O comércio ilegal de armas de Sam Adama coloca sua vida em perigo, pois ele se volta para um aliado improvável para obter ajuda. O envolvimento de Daniel com os Ha'La'Tha se aprofunda.

Joseph e Sam Adama revisitam seu passado em Tauron, e devem tomar uma decisão sobre onde estão suas lealdades. Daniel descobre que o avatar de Zoe sobreviveu, enquanto Duram é queimado no GDD.

Os Graystones procuram Zoe na nova cidade de Cap, enquanto Lacy descobre um mistério sobre os Cylons. Clarice descobre a verdade sobre Amanda.

Os Graystones encontram Zoe com uma Clarice vingativa se aproximando, enquanto os Ha'La'Tha se voltam contra os irmãos Adama.

Daniel, Amanda e Zoe correm para impedir o plano mestre de Clarice e salvar milhares de vidas antes que Caprica mude para sempre.