O estudante Iwatani Naofumi está lendo um livro intitulado "Os Registros das Quatro Armas Cardeais" na biblioteca quando de repente é convocado para outro mundo e diz que precisa salvar o mundo como o Herói do Escudo, um dos Quatro Heróis do Cardeal. E uma manhã, ele encontra todo o seu dinheiro e equipamentos.

Naofumi segue o comerciante de escravos até sua loja, onde procura um parceiro para agir como sua espada. Mas tudo o que ele tem dinheiro para comprar é uma garota semi-humana doente chamada Raphtalia, a quem ele força a uma batalha incrivelmente dura.

Naofumi obteve várias habilidades e seu trabalho em equipe com a Raphtalia também está atingindo a perfeição. Para se preparar para a onda recebida, ele atualiza seus equipamentos e segue para a ampulheta do dragão para descobrir exatamente quando ela chegará. Mas lá, ele encontra Motoyasu e os outros heróis mais uma vez.

A onda se foi, mas o alívio de Naofumi é de curta duração, quando Motoyasu o desafia para um duelo no meio do banquete comemorativo realizado no castelo Melromarc. Motoyasu insiste que possuir um escravo é impróprio para um herói e que Naofumi liberta Raphtalia de uma só vez.

Depois que Aultcray relutantemente oferece a Naofumi uma recompensa insignificante, ele se dirige ao comerciante de escravos para refazer a crista de escravos conforme os desejos de Raphtalia. Ele também compra um ovo monstro lá, que choca alguns dias depois e dá a ele um novo membro do grupo. Enquanto isso, Myne aparece em Lute Village, onde estão hospedados.

A garota misteriosa que apareceu do nada era na verdade Filo. Ela é uma rainha filolial com uma habilidade de transformação avançada, e pode até assumir a forma humana graças a ela. No entanto, suas roupas são rasgadas toda vez que ela se transforma, o que significa que Naofumi precisa comprar roupas mágicas para ele, se ele não quiser quebrar. A festa parte em uma nova aventura para reunir os materiais necessários.

Depois de ouvir sobre uma vila que precisa de herbicida, Naofumi e seu grupo vão para lá fazer negócios. A vila foi invadida por plantas que se transformaram em monstros e seus moradores foram forçados a abandoná-la. Essas plantas podem até enraizar-se nos seres humanos, e aparentemente Motoyasu foi quem as liberou na natureza.

Depois de ouvir sobre uma vila no leste que está sendo devastada por uma epidemia, Naofumi e seu grupo vão até lá para entregar remédios. A epidemia foi causada pelo cadáver de um dragão que havia sido morto um mês antes e deixado lá para apodrecer. O grupo de Naofumi aceita uma solicitação de trabalho para limpar o cadáver e seguir para as montanhas onde ele fica.

Na vila oriental, Naofumi conhece uma garota chamada Melty. Ela instantaneamente se torna amiga de Filo e depois pede para acompanhar a festa em sua jornada. Parece que ela se separou de seus guardas. Eles viajam juntos por um tempo, mas quando chegam à capital, encontram ...

Depois de se recusar a ouvir Melty, Naofumi muda para o planejamento da próxima onda. Quando um grupo de jovens soldados pede para se juntar ao seu partido, ele concorda, mas sob uma certa condição. Ao mesmo tempo, ele também tenta melhorar a classe de Raphtalia depois que ela atinge o limite de nível, mas tudo o que recebe é assédio.

Naofumi enfrenta outra onda, desta vez em uma vila remota. Com a ajuda dos soldados que se ofereceram para se juntar a ele, ele é capaz de garantir a segurança dos moradores, mas o Wave não mostra sinais de desistir. Ele vai lutar com os outros heróis, apenas para encontrar uma nave fantasma gigante flutuando no céu.

Naofumi começa a enfrentar Glass, que declara a batalha como a principal daquela onda. Naofumi novamente se desentende com o rei, mas percebe algo.

Naofumi frustra a tentativa de tirar a vida de Melty e luta contra os cavaleiros reais, mas ele é acusado de seqüestrar Melty e matar vários cavaleiros, então a festa é forçada a fugir. Com a segurança reforçada e os pontos de verificação em todos os lugares, a festa recebe um golpe adicional que só piora as coisas.

Devido a Myne de forma imprudente iniciar um incêndio na floresta, Naofumi e seu grupo são forçados a fugir para uma vila na base da montanha. No entanto, não será fácil romper a rede dos cavaleiros. Melty sugere ir a um nobre que ela conhece por ajuda, e acontece que o passado de Raphtalia está ligado ao seu domínio.

Raphtalia encurrala o ídolo com vingança nos olhos, sua lâmina sedenta de sangue alcançando a garganta dele. As palavras de Naofumi a trazem de volta momentaneamente, mas quando o Ídolo a ataca mais uma vez ...

Enquanto Naofumi e seu grupo tentam proteger as crianças enfraquecidas, Tyrant as ataca. Quando Naofumi percebe que está realmente atrás de Filo, ele traça um plano para atraí-lo para fora da cidade, mas eles não conseguem nem arranhar seu corpo maciço.

Fitoria diz a Naofumi que ela matará todos os quatro heróis cardinais se eles não voltarem à mesma página. Ela até faz Melty como refém, mas Naofumi continua a recusar. Entendendo de onde ele vem, Fitoria propõe um duelo individual com Filo.

Naofumi decide ir direto ao posto de controle para conversar com os outros heróis. Mas lá, ele acha o sujeito menos provável de ouvi-lo, Motoyasu, que ataca Naofumi sem se preocupar em ouvir o que ele tem a dizer. Por que Motoyasu estava tão decidido a matar Naofumi, mais do que nunca?

O papa tem em suas mãos a arma definitiva, que possui as propriedades das quatro armas principais. Diante de sua habilidade de ataque, "Judgement", e seu poderoso campo de força defensiva, Naofumi e sua gangue ficam desamparados. À medida que a crise piora, Motoyasu, que agora está na fila para ser punido como um herói "falso", toma uma decisão surpreendente.

Naofumi e sua gangue continuam no ataque apesar de estarem presos na Grande Catedral do Papa, mas seu subespaço sagrado anula seu Escudo da Maldição, deixando-os um passo à frente. Naofumi se vira para outro, recentemente desbloqueado Curse Shield, mas a ira do dragão ameaça engolir sua mente inteira.

Depois que Naofumi sobrevive graças à ajuda de Mirelia, ela vem visitá-lo e conta a verdade por trás da convocação dos heróis e da discriminação contra o Herói do Escudo. Ela também promete limpar o nome dele e realiza um julgamento pelos crimes de Aultcray e Myne.

No navio para Cal Mira, Naofumi mais uma vez encontra L'arc, que continua jogando-o fora. No entanto, a natureza amigável do homem estranho brilha, e Naofumi rapidamente gosta dele. Depois de passar momentos divertidos na moagem e de uma refeição animada, Naofumi se sente feliz e realizado pela primeira vez neste mundo.

Melromarc traz uma grande frota para combater a onda no mar. Enquanto a rainha assume o comando e lidera bem a operação, os outros três heróis se mostram inúteis mais uma vez, deixando Naofumi fazendo tudo sozinho. Mais tarde, ele recebe ajuda de L'arc e Therese para afastar os monstros, mas depois ...

Acontece que Glass, como L'arc, também é um herói de outro mundo. Naofumi mal luta contra seus ataques combinados e encurrala Glass em uma batalha individual, mas é confrontado com uma pergunta muito importante: ele realmente deseja proteger este mundo?