עונה שנייה לדרמת החקירות מבית היוצר של דיק וולף, העוקבת אחרי מה שקורה בתוך האף-בי-איי בניו-יורק. יחידת העילית ישתמשו בכל היכולות, הכישרונות, החכמה והמומחיות שבידיהם כדי לשמור על תושבי העיר והמדינה.

בנו של אמא בלוגרית ידועה נחטף, והצוות צריך לחפש את האשם בין 2 מיליון העוקבים שלה. כריסטן ממשיכה להסתגל לחיים כסוכנת שטח עם שותפה החדש, סקולה.

כשמתפוצצת מכוניתה של מתמודדת לנשיאות מתחיל מרוץ נגד הזמן למצוא את המפגע, ובמהלך החקירה נחשף סוד אפל מעברה כתובעת.

ירי במועדון היפ-הופ מוביל את צוות החקירה לבדוק כיוון של פשע שנאה על רק גזעני, אולם מגי לא משוכנעת שזה כך.

ג'ובל ניצב בפני החלטה גורלית. הצוות חוקר את היעלמותו של נהג משאית שנראה אזרח תמים ושומר חוק.

הצוות חוקר מקרי רצח שקשורים לסחר במידע פנים באמצעות נערות פיתוי.

נשיא אוניברסיטה מכובד נרצח בקמפוס לאחר אירוע התרמה. צוות האף-בי-איי בודק כיווני חקירה שונים, חלקם בתחומי האוניברסיטה וחלקם קשורים לגורמים חיצוניים.

הצוות מקבל דרישה מוזרה לחקור תאונת דרכים, אך ככל שנחשפים יותר פרטים מתברר שמדובר במקרה שונה מאוד ממה שחשבו בתחילה.

הצוות חוקר היעלמות של מורה בתיכון ונחשף לאלימות של כנופיות הרחוב ולשרירותיות של מערכת האכיפה והמשפט.

הצוות מודאג לאחר שכריסטן נפצעת בתפקיד ומאושפזת בבית חולים במצב קשה. גבר עשיר שהואשם בתקיפות מיניות נרצח ברכבו והצוות חוקר אם הוא נרצח ע"י אחת מקורבנותיו.

הצוות חוקר שוד בנק מוזר שבו לא נלקח דבר מהבנק. ככל שהחקירה מתקדמת מתעוררות יותר שאלות. כריסטן חוזרת לעבודה אחרי הפציעה, אך בינתיים היא לא יוצאת לשטח.

בנו של סוכן אף-בי-איי שיצא לגמלאות נחטף. בהתחלה הצוות סבור שהסיבה היא עסקיו המפוקפקים של הנער, אך ככל שהחקירה מתקדמת מתברר שמדובר בעניין סבוך בהרבה.

חקירת רצח כפול של צעירה ותובע פדרלי ברחוב מובילה את הצוות לראפר הקשור לעולם הכנופיות של ניו-יורק.

שוד משאית עמוסה בנשק ותחמושת מתגלה כהרבה יותר משוד פשוט ונחשפת פרשה שגורמת לעברו הצבאי של או-איי לרדוף אותו.

בתו של מיליארדר נחטפת ליד ביתה. תחילה הצוות סבור שמדובר בחטיפה לצורך קבלת כופר, אבל מתברר שהמניע לחטיפה שונה לחלוטין.

מפגינה נגד שינוי האקלים וחבר בכנופיית רחוב נרצחים באותו היום. לכאורה, אלה שני מקרים נפרדים, אך כשהצוות מגלה שכלי הרצח זהה, עולות השאלות הקשות.

לאחר עזיבתה הזמנית של מגי, או-איי עובד עם צוות לכידת נמלטים של ג'ס לקרוס במטרה לתפוס גבר ניאו נאצי שלקרוס עצר בעבר, וכעת חטף אוטובוס עמוס ילדים. במרדף להצלת הילדים נחטפת גם ביתו של לקרוס והסכנה גוברת. ספיישל בשני חלקים שהמשכו ב-"אף-בי-איי: המבוקשים ביותר".

פרק סיום עונה. גופתו של צעיר בעל חזות אסיאתית שעבר עינויים קשים מתגלית בפארק. לצוות החקירה מצטרפת היילי אפטון ממשטרת שיקגו, שמצוותת לעבוד עם או-איי.