A EDF cria trajes robóticos baseados em Orgun para defender a Terra. Orgun e Tomoru encontram dois Evoluder: Leave, que morre protegendo Orgun, e Rang, que luta contra Orgun com raiva por sua traição. É revelado que os Evoluder são descendentes de uma missão espacial tripulada à Terra enviada à constelação de Cygnus 200 anos antes, cuja tripulação evoluiu para formas de vida mecânicas devido a experimentar milhões de anos de dilatação do tempo durante a viagem. Alguns dos Evoluder estão telepaticamente ligados a certos humanos, como Tomoru com Orgun e Kumi com o líder do Evoluder, Mhiku.

Usando seus trajes robóticos, a EDF repele a força de invasão do Evoluder. Kumi usa seus poderes telecinéticos para mover o Sol para que Orgun possa salvar a Terra. Zoa, a comandante militar do Evoluder, dispara o canhão de antimatéria. Orgun usa seu ataque da Grande Cruz para matar Zoa e destruir o canhão. Orgun cai na praia e morre enquanto Tomoru sobrevive. Mhiku volta a governar os Evoluder, que deixam a Terra pacificamente. Tomoru e Kanzaki caminham ao pôr do sol enquanto os restos mortais de Orgun são exibidos em um museu.