Emily, agente do FBI, desaparece por anos e é dada como morta. Seis anos depois, é encontrada com vida, porém sem memória do que aconteceu. Agora é considerada suspeita de uma série de crimes.

O suposto assassino em série de Emily, Conrad Harlow, está sendo libertado da prisão, e Emily ainda não está perto de resolver o mistério de seu sequestro e o tempo que passou em cativeiro.

Quando a testemunha contra Emily é assassinada, Nick e Emily devem provar sua inocência antes que Tommy Gibbs e o departamento de polícia a prendam.

Com a polícia de Boston exigindo que Emily se renda e sem que ela possa provar sua inocência, Emily tomará uma decisão que a manterá longe de Flynn para sempre.

A busca de Emily se intensifica quando um agente do FBI é morto. Esse evento faz com que Nick questione as verdadeiras intenções de Emily.

Depois de fugir das autoridades, Emily retorna a Boston para descobrir que a única pessoa que pode ajudá-la pode ser quem procura destruí-la.

Jack ajuda a salvar a vida de Emily e encontra uma conexão surpreendente com a infância de Emily. Emily descobre segredos do passado que se relacionam com um amigo de infância, Charles.

Alice e Flynn são seqüestrados por uma pessoa misteriosa. Nick suspeita que Emily foi quem sequestrou sua família e tenta desesperadamente encontrá-los. Um repórter assalta Jack toda vez que ela deseja obter informações exclusivas.

ommy faz uma nova descoberta que põe uma nova luz sobre a investigação. O passado de Emily enfrenta o presente quando ela finalmente encontra seu captor, e será como o rato e o gato.