Having just discovered a new virus that could drive man to extinction, a young doctor begins a video journal to track her progress in preventing a global pandemic.

Dr. Scott outlines her theory on how global warming might have exposed the modern world to an ancient virus to which we have no natural immunity.

Dr. Scott pleads with her government benefactors for a ship to take her to the arctic so she can trace the deadly virus to its possible source.

Despite ridicule from her fellow scientists, Dr. Scott's concern over the new virus is amplified by the discovery of three new cases outside the original hot zone.

Dr. Scott shares her research with someone close to her - along with a plea to avoid populated areas - as she prepares to chase down a cure for the rapidly spreading virus.

About to board the USS Nathan James, Dr. Rachel Scott imparts a final note of urgency about the threat that mankind faces, revealing that the fate of humanity hangs on the success of her mission.

Americká válečná loď USS Nathan James je na tajné misi ve vodách Severního pólu. Musí udržovat radiový klid, aby utajila svou polohu, a neohrozila tak bezpečnost mise. I když se zprvu zdá, že jde o další rutinní misi na prověření bojeschopnosti lodi, pravda se brzy ukáže být poněkud jiná a o to více znepokojující. Bitevní loď je totiž jedním z mála míst na celé planetě, kam ještě nepronikl nebezpečný virus. Posádka lodi tak musí udělat vše proto, aby doktorce Scottové zajistila bezpečí a umožnila jí probádat virus a objevit protilátku. Když navíc začnou chodit zprávy z domova o tamní situaci, je jasné, že se jedná o nemilý závod s časem.

Na posádku bitevní lodi USS Nathan James čeká veledůležitý výsadek na liduprázdné základně v Guantanámu. Úkolů je hned několik. Zajistit dostatek potravin pro budoucí putování, najít prostředky důležité pro výrobu vakcíny a nástroje pro doktorku Scottovou, a doplnit palivo, kterého loď má již kritický nedostatek. Z toho důvodu se na souš vydávají tři taktické týmy. Každý s jedním z úkolů. Pár minut po výsadku ale začíná být jasné, že základna není zas tak neosídlená, jak se na lodi domnívali. A tak, když se postupně všechny tři týmy ocitnou pod palbou, z předem stanovených úkolů se rázem stává jediný. Přežít. Aby toho nebylo málo, na lodi je zrádce, který nehodlá nechat loď ze základny za žádnou cenu odjet. Na pomoc si zavolá dokonce bitevní loď ze své domoviny.

Poté, co Rusové dostali díky komunikaci s Quincym do šachu americkou loď v přístavu u základny Guantanámo, začínají se vyjednávat požadavky možného příměří. Rusové chtějí původní vir, doktorku Scottovou a celý její výzkum. Ovšem v jejich rukou by vakcína nesloužila všeobecnému blahu, nýbrž pro ně, aby se mohli chopit moci v nově utvářeném světě. S tím se ale kapitán Chandler nehodlá smířit. Začíná se tedy sestavovat plán, jak ruskou válečnou loď obeplout a dostat se z pasti, aniž by si toho kdokoliv s nepřátelské posádky všiml.

Doktorka Scottová sama vakcínu proti viru, který vyhladil již téměř celé lidstvo, extrahovat nedokáže. K ruce jí musí být někdo zkušený v oblasti biochemie. Takový je na palubě jen jeden, doktor Quincy Tophet. I když kapitán zprvu nesouhlasí s tím, aby Quincyho pustili z provizorní cely, nakonec mu nic jiného nezbude. Celý výzkum se ale zkomplikuje teprve ve chvíli, kdy vinou úniku paliva dojde na palubě k požáru, čímž dojde k vyřazení jak motorů, tak generátorů, a sání mořské vody. Loď je tedy nepohyblivá, laboratoř se nemůže chladit, a co víc, bez sání mořské vody není ani dostatek pitné vody. Posádka proto musí najít způsoby, jak nastalé situace vyřešit. Jak provizorně uvést loď do pohybu, jak provizorně ochladit vzorky doktorky Scottové, a jak se dostat k nejbližšímu ostrovu Serrana Bank pro pitnou vodu.

Po odbočce na odlehlý ostrov, kde posádka lodi doplnila tekutiny, a poté, co se podařilo uvést loď zpět do chodu, se konečně mohou všichni vydat do Nikaragui, kde je jejich cílem nalézt rezervaci opic. Na těch hodlá doktorka Scottová provést testy nově extrahované vakcíny proti zákeřnému viru. I když všichni předpokládají, že rezervace bude liduprázdná, stejně jako na Guantanámu tomu tak nebude. V Nikarague zuří občanské nepokoje, a co víc, ostrov je rozdělen na dvě frakce, nakažené a nenakažené, kteří se ukrývají v osadě uprostřed džungle. Této osadě velí samozvaný vůdce El Toro, kterému se podaří zajmout výsadkovou jednotku. Na kapitánovi teď bude nalézt z této situace východisko, zachránit své muže a pokud možno i pomoci ostatním nenakaženým, kteří trpí pod El Torovou nadvládou.

Po téměř půlročním putování širým mořem začíná na lodi houstnout atmosféra. Námořníci začínají propadat beznaději a panice, po palubě se šíří fámy ohledně toho, na čem vlastně doktorka Scottová pracuje, a co námořníky čeká. Když navíc začne uvězněný Quincy podrývat morálku ještě víc, začíná jít do tuhého. Celou situaci pak ještě zhorší nákaza Dannyho, která způsobí nouzové utěsněné východů, vypnutí ventilace a nárůst strachu na palubě lodi. Část posádky proto žádá povolení opustit loď. Kapitán a jeho velící důstojníci tak musí rychle přijít s něčím, co by morálku námořníků pozvedlo a pomohlo námořníkům přečkat další dny, během kterých doktorka Quinnová bude dělat další testy na opicích.

Poté, co se Rusům podařilo dát svou loď opět do pořádku, vydávají se po stopách Nathan Jamese. Rusové se za žádnou cenu nehodlají vzdát a chtějí získat Dr. Scottovou. Ta ve svém výzkumu narazí na nečekaný problém. Původní virus je desetkrát zhoubnější a vakcína žádná. Navíc jí začínají docházet opice. Jako zázrakem se však ozve tísňové volání z rybářské lodi. Onou přeživší by mohla být osoba, která je vůči viru imunní a která by znamenala průlom ve výzkumu doktorky Scottové. Jenže záchranná operace nedopadne podle představ. Do cesty se americkým vojákům připletou Rusové. Začíná se boj o přežití jak vlastní, tak i jediné naděje na vytvoření funkční vakcíny.

Poté, co byli kapitán Chandler a Tex byli uneseni Rusy, musí sami na cizí lodi bojovat o přežití. Jedinou šancí se zdá být výměnný obchod, který navrhují Rusové. Tedy Dr. Scottovou výměnou za životy kapitána, Texe a Tophetovy rodiny. Rusové totiž mají na palubě Nielse Sorensena, člověka, který je imunním přenašečem onoho zhoubného viru a s jehož pomocí by měli přivést vakcínu na svět jako první a jediní. Na lodi USS Nathan James se mezitím pod dočasným vedením důstojníka Slatteryho rozbíhá záchranná mise, která členy své posádky zachránit ještě dříve, než dojde k obchodu. Nakonec se do léčky, kterou chystají, rozhodne zapojit i Dr. Scottová, která už má vakcínu hotovou. To ale Rusům sdělit nehodlá. S její pomocí, vychytralostí Texe a s pomocí statečného mariňáka Cossettiho se mise musí podařit. Otázkou je, zda se zpět vrátí ve zdraví všichni.

Poté, co je tělo Cossettiho pohřbeno se všemi poctami, které se s tím pojí, rozbíhá se testování prototypu vakcíny na vybraných dobrovolnících. Jenže věci nejdou podle plánu. Symptomy jednotlivých se až moc liší, a někteří dokonce nemají organismus natolik odolný, aby tomu vůbec odolal. Po smrti prvního z dobrovolníků je proto na čase rychle přijít s řešením a upravit vakcínu tak, aby nezemřeli další. Začíná se tedy závod s časem o záchranu životů. S řešením bude muset pomoc jak Bertrise, tak i Quincy. Na souši mezitím stále zuří boje mezi těmi, kteří se zatím nenakazili. Jednak ve snaze zabránit nákaze, ale také ve snaze přežít, získat zásoby a střechu nad hlavou. Mezi nimi je i žena kapitána Chandlera s rodinou.

Vojenská loď USS Nathan James po měsících dřiny splnila, co se od ní očekávalo. Na její palubě je nejen vakcína, ale i lék na zákeřný virus vraždící lidstvo. Jejím posláním je teď dostat se do funkční laboratoře, kde se dá lék distribuovat dál. Jenže najít takovou laboratoř není lehký úkol. Po problémech s původní laboratoří Fort Detrick se nakonec musí plout do Baltimoru. Do města ovládaného těmi, kteří z viru profitují, v čele s Thorwaldem. Do města, kde se oficiálně virus léčí, ale pravda je naprosto opačná. A právě takové realitě bude muset posádka USS Nathan James čelit, což pro nikoho z ní nebude jednoduché.

Poté, co se Avocet v čele s Grandersonovou zmocnil lodi, drží posádku jako rukojmí. Jednomu členu posádky se však povede utéct. Záchrana ostatních je teď v jeho rukou. Na můstku mezitím probíhají snahy o záchranu života Quincyho. Ten je postřelený, ale jako jeden z mála ví, kde je původní vzorek vakcíny. Na souši mezitím operuje několik pozemních týmů lodi USS Nathan James. Kapitán Chandler se snaží dostat rodinu do bezpečí a s pomocí ostatních převzít kontrolu na lodi. Jedinou cestou se zdá být spalovna. Když se k němu navíc přidají místní povstalci v čele s neohroženým Thorwaldem a vládcem podzemního města, má operace opět o trochu větší naději na úspěch. Doktorka Scottová se snaží zachránit nemocné, a doktor Hamada i nadále zkouší vyvinout vakcínu na vlastní pěst. Když se ale nedaří najít původní vzorek, zbývá jediná možnost. Využít buněk plodu někoho, kdo má v těl vakcínu. A na palubě USS Nathan James někdo těhotný je.

Blíží se finální úder na obou frontách. Jak ve středisku Avocetu, tak na lodi. Zatímco v útrobách Avocetu operuje kapitán Chandler s povstalci pod vedením Throwalda s cílem udolat Grandersonovou a osvobodit místní lidi na jedné straně, a Tex v přestrojení za místní ochranku na straně druhé s cílem zachránit doktorku a Karu, na lodi se všichni spoléhají na trio námořníků, kterým se podařilo zmizet strážným. Když se k nim navíc přidá i velící Slattery, kterému se podaří proniknout do komunikačního střediska, je jen otázka času, než námořnictvo opět převezeme velení nad lodí. Nakonec i Grandersonová musí uznat, že na námořnictvo Spojených států jí síly nestačí. Ale co původní vzorek? Podařilo se posádce vzorek dobře ukrýt před Avocetem a doktorem Hamadou?

Na loď USS Nathan James a celou posádku teď po zajištění oblasti Baltimoru čeká cesta do Norfolku, do domovského přístavu, kde má většina posádky své rodiny. Odtud by se mohla naplno rozjet ozdravná akce s rozvozem protilátky do celého světa. V zašifrovaném počítači z kanceláře Prezidenta navíc posádka najde tajné materiály o funkčních laboratořích po celém světě. A právě ty by mohly být styčnými body celé akce. Alisha Grandersonová mezitím bojuje s tím, jak se postavit ostatním členům posádky. Tex se svěří Rachel se svou minulostí a odhalí jí, proč se v Baltimoru odtrhl od ostatních. A Kara se jako několik dalších vydává za svou rodinou. Její shledání s matkou bude velice emotivní. Mimo to se ale rýsuje i skupina zdravý lidí, kteří mají sami sebe za vyvolené. Mezi nimi nechybí ani jeden z Rusů, se kterými už USS Nathan James měla co do činění.

Na posádku USS Nathan James čeká další důležitý úkol. Na volném moři se nachází plovoucí nemocnice Solace, která je podle všeho plně vybavená a má provozuschopné laboratoře. S pomocí této lodi by se tak vakcína měla dostat i do těch nejzazších koutů světa. Jenže hned po nalodění zjišťují výsadkové týmy krutou pravdu. Na loď má spadeno i skupina žoldáku, která většinu doktorů na lodi chladnokrevně popravila. Jejich cílem je získat pro sebe protilátku, a nezastaví se před ničím. Námořnictvo tak musí o nadvládu nad lodí tvrdě bojovat, a to i s tím, že radiové spojení s mateřskou lodí USS Nathan James je téměř nulové. Bojeschopnost mají navíc možnost ukázat dva noví členi námořnictva. Uvnitř lodě je ale mimo jiné nastražená bomba jako pojistka pro žoldáky, kteří by v případě neúspěchu mohli celou loď vyhodit do vzduchu. Společnými silami musí posádka USS Nathan James žoldáky přemoci, zachránit přeživší a pokud možno zjistit, o co žoldákům skutečně jde a odkud se vzali.

Na lodi USS Nathan James se snaží zjistit, co byli zač vojáci, kteří je přepadli při průzkumu lodi Solace, nemocniční lodi, která vyvíjela protilátku. S tím by jim měl pomoct jeden z nepřátelské posádky, který ale v sobě skrývá jedno velké tajemství. Posádka navíc musí čelit problému v podobě bitevní ponorky první třídy Achilles, která by je mohla jedinou střelou poslat ke dnu. Na řadu tak přicházejí taktické schopnosti kapitána Chandlera. Ukáže se, že ponorce nejde jen o zničení USS Nathan James. Jelikož jsou totiž na palubě ponorky všichni přirozeně imunní nákaze a za pomoci zrádce Nielse vyvíjejí vlastní protilátku, snaží se zničit všechny laboratoře po celém světě, kde se protilátka též syntetizuje, aby si tak mohli podmanit celý svět. A to kapitán Chandler nemůže nechat dopustit.

Mezi posádkou ponorky panují rozkoly. A to jak mezi mužstvem, tak i mezi velením. Ned a Sean, ač bratři, nesdílí stjené názory na budoucí postup při znovuobnovování společnosti. Zatímco Ned prahne po zničení lodi USS Nathan James, Sean má v plánu začít volbu nového prezidenta Spojených států. Tým USS Nathan James mezitím pátrá po oné ponorce, a zároveň skrze výsadkový tým proniká do řad imunních přeživších. V přestrojení infiltrují jejich řady a přes močály se dostanou až do shromažďovacího areálu všech imunních. Beze zbraní, bez vysílaček. Jedinou nadějí jim je ozbrojený Wolf s jejich vybavením. Doktorka Scottová zase vyrábí protilátku proti nákaze, tentokrát už s pomocí nákresů a poznámek doktora Huntera, kterého však vyvolení zabili. Jejím úkolem je tekutou vakcínu přeměnit na aerosol, aby se mohla práškovat celá města, či na tablety, aby se ty mohly shazovat i do nejzapadlejších koutů světa.

Jak se ukáže, prezidenta drží Sean a Ned proti jeho vůli. A právě toho by výsadkový tým mohl využít. Kapitán Chandler totiž s využitím efektu davové paniky pronikne až k samotnému Seanovi a prezidentu. Teď už zbývá jen jediné, dostat ho odtamtud pryč. Mezitím Tex s Dannym zjišťují, kdo je onen vědátor, o kterém všichni mluví. Je jím Niels, se kterým už měli co do činění. S tím se pojí i riziko toho, že je prozradí a celou operaci překazí. Když už se k tomu schyluje, je potřeba jednat. Ještě, že mají střeleckou podporu Wolfa. Na lodi USS Nathan James mezitím drží radiový klid, aby unikli ponorce. Ta se je snaží za každou cenu dostat. Když se najednou ozve výsadkový tým s požadavkem na vyzvednutí, je potřeba se rozhodnout mezi ponorkou a záchranou týmu.

Na palubě lodi USS Nathan James je přítomen prezident. I když je tu zpočátku držen proti své vůli a s ostatními nechce spolupracovat, neboť je stále přesvědčen, že patří ke skupině Seana Ramseyho, postupně ho jak Slattery, tak kapitán Chandler přesvědčí, že skupina imunních není tou, která chce spasit svět. K přesvědčení Michenera napomůže až tragická událost, kterou mají on a Chandler společnou. Michener by tak mohl být ve spolupráci s USS Nathan James prvním postapokalyptickým prezidentem a právě on jediný může přemoci propagandu imunních proti námořnictvu. Prezidente Michener má navíc spoustu vnitřních informací o struktuře, taktice, komunikaci a budoucích plánech imunních, a ty jsou teď pro USS Nathan James velice důležité. Spolupráce je více než žádoucí.

Niels je nyní na palubě USS Nathan James. S jeho pomocí by mohla Dr. Rachel Scottová přijít na to, jak lék převést do podoby aerosolu a poté i do pevného skupenství. Jenže musí z Nielse dostat přesnou sekvenci viru, který v sobě má. Ten, kdo přivedl svět do záhuby, je jediný, kdo mu může pomoci. A toho si je Dr. Scottová dobře vědoma. Navíc ale potřebuje sladkovodní slávky, aby mohla s výrobou protilátky pokračovat. Prezident se mezitím seznamuje s posádkou a pomalu se chopí své fuknce. Ostatní mají za úkol výsadek na břeh s cílem získat ony důležité slávky. Na souši ale narazí na tým přeživších dorostenců, které je nutno nejprve zneškodnit. S jejich pomocí se pak může námořnictvo postavit těm, kdo prahnou po jejich hlavách za tučnou odměnu.

Niels je mrtvý. Ale kdo za to může? Na to se teď na palubě USS Nathan James snaží s vypětím všech sil přijít. I když Niels přivedl svět do záhuby, zabít ho byl zločin. A za ten někdo musí nést odpovědnost. Rachel je proto vyšetřována a nakonec dána do domácího vězení své kajuty. Loď se mezitím blíží k New Orleans, kde má být stanoviště imunních. Jenže cestu jim komplikuje ponorka bratrů Masonových, která je do zátoky nehodlá pustit, a raději celou oblast vyhodí do povětří. To navíc hodlá použít jako propagandu proti americkému námořnictvu. Jenže netuší, že na lodi už se podařilo rozklíčovat komunikační síť imunních a odhalit plán Valkýrie. Boj kdo s koho začíná.

New Orleans je v troskách. Bratři Ramseyovi ho vyhodili do vzduchu, aby si vlivem následné propagandy získali lidi na svou stranu. A tomu se námořnictvo v čele s kapitánem Chandlerem snaží zabránit. Když objeví nedaleko břehů ropnou plošinu s centrem všeho vysílání, vypadá to, že by konec nadvlády imunních mohl nastat co nevidět. Navíc se námořnictvu podaří zadržet Valkýrii, mladou slečnu, která stojí za celou komunikační sítí imunních. Jenže. Poté, co se video s lodí USS Nathan James, která má údajně ničit New Orleans dostane na veřejnost, na ropnou plošinu zaútočí ozbrojení civilisté. Z mise, jejímž cílem bylo napíchnutí sítě prezidentovým motivačním projevem a která měla očistit jednou provždy celé americké námořnictvo, se rázem stává boj o přežití. A na jeho konci budou ztráty na životech bohužel na obou stranách. Námořnictvo přijde o 4 další cenné členy ze svých řad a dalších několik skončí s vážnými zraněními.

Boj mezi bitevníkem USS Nathan James a ponorkou s bratry Ramseyovými se chýlí ke konci. Teď, nebo nikdy. Tak zní rozkaz kapitána Chandlera. Ještě předtím je ale z paluby potřeba dostat všechno, co by boj mohl ohrozit, tzn. lék, prezidenta a doktorku. A tak se na souš vydává taktický tým s Texem, Dannym a Mikem v čele. Zatímco na moři se taktizuje, jak bez sonaru a bez prozrazení vlastní pozice nepřátelskou ponorku obejít a jednou provždy ji zničit, a to i s pomocí Val, na souši se postupuje k bezpečnému místu, kde by se mohl národní poklad schovat. Při sví cestě tým narazí i na pár nakažených lidí, a Rachel tak konečně bude mít možnost lék vyzkoušet v praxi. Mimo to ale zjistí šokující zprávu. Na námořnictvo na souši totiž čeká superúčinná zbraň, která jejich loď potopí ke dnu. Na Texovi, Dannym a Mikovi tedy je i s nasazením vlastních životů tuto zbraň najít a zneškodnit.

Námořnictvo Spojených států se blíží k cíli. Konečně nadešel Den D a je načase začít šířit vakcínu mezi lid. Jenže tahle myšlenka je trnem v oku McDowellovi, který teď stojí v čele imunních. Ten se rozhodne pro odboj. Poté, co USS Nathan James přistane v přístavu, vydá se McDowell i se svými poskoky mezi ostatní v námořnických uniformách a nakaženými lidmi, aby ostatní přesvědčil, že námořnictvo ušilo na lidi léčku a chce je jen nakazit. Pod vedením kapitána Chandlera je potřeba McDowella zastavit a vrátit se k původní misi. Bohužel zájem o vakcínu není tak vysoký, jak se čekalo. S takovou se vakcína nebude účinně šířit. A nepřidá tomu ani snaha velícího důstojníka Jetera. Nakonec se do celé věci musí vložit prezident Michener a Tex, který mezitím hledá na souši svou ženu a dceru. Finálním místem je pak St. Louis, kde musí loď z technických důvodů zakotvit děj se co děj. Jestli přijde dost lidí, toť otázka... Ať už to dopadne jakkoliv, nakonec se bude slavit a pít na padlé členy posádky.

Prezident Michener je ve svém úřadě již půl roku. Za tu dobu se daří vakcínu šířit mezi populaci Spojených států a jinde po světě. Jenže ne všichni jsou nápomocni. Čína v čele s prezidentem Pengem podle všeho zadržuje vakcínu a používá ji k vydírání okolí. A tomu je třeba zabránit. Krom toho se ukazuje, že v Japonsku vakcína nezabírá a vir zmutoval. Jenže teď, když už doktorka Scottová není mezi živými a její odkaz je připomínán její podobiznou na známkách, není nikdo, kdo by takový problém uměl vyřešit. A tak bývalý kapitán Chandler, teď ministr obrany, odlétá s Valkýrou do Číny řešit nastalou situaci, zatímco posádka lodi Nathan James v čele s novým kapitánem Slatterym řeší problémy s vakcínou ve Vietnamu. A tak zatímco Chandler se starou známou Sashou večeří s prezidentem Pengem, několik členů posádky Nathan James je ve Vietnamu uneseno. Začíná boj o přežití.

Po únosu části posádky Nathan James je třeba rychle jednat. Zbývající členi na lodi v čele s dočasným důstojníkem hledají tři tajemné lodě, které těsně před útokem na klub s unesenou posádkou vpluli do Vietnamských vod. Na palubě těchto lodí by mohla unesená posádka i s kapitánem být. Na souši zatím operují dva týmy. Danny Green a Burk, kterým se podařilo uniknout při přestřelce v baru a kteří se snaží kontaktovat loď a zároveň pomoci unesené posádce, a Chandler s Wolfem, Sashou a její kamarádkou Jesse, kteří se snaží urychleně dostat k lodi, aby mohli naplno zahájit záchrannou operaci. Oba týmy musí bojovat o holý život, aby se nakonec k lodi dostali. Ve Spojených státech zatím prezident Michener a jeho okolí sledují napjatě situaci a z útržků zpráv dohlíží na celou operaci.

Posádka USS Nathan James je vlečena do zajateckého tábora, kterému velí bájný pirát Takehaya. Ten byl původně u námořnictva, kde získal zkušenost s vojenskou taktikou, ale s koncem světa v podobě viru se dal na druhou stranu. Teď má v plánu využít krev unesené posádky pro vlastní prospěch, jelikož americká vakcína nezabírá. Zbytek lodi USS Nathan James zatím po svých unesených spolunámořnících usilovně pátrá. Vydává se do Shanzaie, kam je vedou stopy, a s pomocí místních se posouvají krůček po krůčku dál. Chandler má navíc dávné problémy se Sashou, které vyplouvají na povrch. Do toho všeho musí posádka zpacifikovat nespolupracující Jesse, která jako jediná z nich má vrtulník. Vše vrcholí přímým přenosem ze zajateckého tábora, kde se po nevydařeném útěku chystá poprava posádky.

Unesená posádka se rozhodne využít videa, které Takehaya pouští do světa a zakóduje do něj tajnou zprávu o své poloze. Jenže odkáže ji osazenstvo USS Nathan James rozluštit? A nepřijde na to samotný Takehaya? Zatímco se ostatní snaží unesenou posádku všemocně hledat a bojují s nedostatkem paliva a nepřízní Číny, kterou musí řešit až vloupáním do Pengova sídla a drsným vyjednáváním, houstne atmosféra i doma na pevnině. Lidé se bouří a chtějí, aby prezident vysvětlil, co hodlá s únosci dělat. Novináři videa od Takehayi vysílají do celého světa a Michenerova pozice je čím dál více oslabená. Naštěstí Peng spolupracuje lépe, než se původně očekávalo a posádka je ve výsledku zase o krůček blíže k záchraně svých přátel.

USS Nathan James je uprostřed minového pole, ze kterého není na první pohled cesty ven. Je třeba vymyslet plán, jak miny deaktivovat a loď vysvobodit. Po neúspěšném pokusu manuální deaktivace se ale musí přijít s něčím chytřejším, co by miny ošálilo a zároveň nikdo nezemřel. Navíc musí za pochodu řešit problém s torpédem, které se nezadržitelně blíží a které by mohlo aktivovat ono minové pole. Na domácí půdě zatím prezident Michener informuje okolí o přistoupení na požadavky Takehayi, stahuje flotilu z čínských vod a připravuje se na meeting s lídry světových celků, kterým se začíná jeho styl vlády nelíbit. U Takehayi je zatím stále vězněna část posádky. K tomu ale onemocní Takehayova žena malárií a doktor Rios musí zasáhnout. Na jejím životě teď závisí životy všech vězněných členů posádky.

Posádka lodi Nathan James dál pokračuje v prohledávání ostrovů podle mapy od prezidenta Penga. Nicméně najít unesenou část posádky se stále nedaří. Pomůže až chytrý plán v rukou Garnettové. Jen o pár momentů později se začíná přestřelka na ostrově s cílem zachránit rukojmí a své přátele v jednom. Celá situace se však komplikuje ve chvíli, kdy se na ostrově objeví čínská tajná služba. Nakonec je třeba použít i zbraně většího kalibru. Ani to však nezabrání Takehayovi v útěku. Prozatím. Prezident Michener zatím ve Spojených státech potají jedná s novinářem Jacobem, kterému schůzku s ním slíbila Kara. Zjišťuje, že situace není ani zdaleka tak stabilní, jak si myslel, a že regionální vůdci jdou jeden proti druhému a všichni dohromady proti němu. I tady bude třeba situaci uklidnit.

Posádka lodi Nathan James teď musí urychleně na otevřené moře, aby se zbavila čínských vojáků a mohla kontaktovat velení na souši o úspěchu záchranné operace. Jenže cestu jí zkříží čínská flotila. Až ten, proti komu posledních několik dní bojovali, jim pomůže ztratit se čínské flotile s dohledu a kontaktovat souš, to vše za přísných bojových podmínek na lodi. Takehayova žena Kyoko navíc začíná rodit a je potřeba rozhodnout, zda dát dítěti protilátku, nebo ne. Ve výsledku začne Chandler se Slatterym vyjednávat s Takehayou o formě vzájemné spolupráce. Na souši zatím Jacob dál pátrá po Michenerově minulosti, aby ho dostal z pozice prezidenta. Za tím účelem kontaktuje i Curtise, vraha Rachel Scottové. A to, co zjistí, se nebude Michenerovi, natož veřejnosti, zamlouvat. Převrat se blíží.

Národ truchlí. Prezident Jeffrey Michener je po smrti. Nedokázal totiž unést tíhu své minulosti a poté, co mu ji reportér Jacon Barnes vmetl do tváře, se oběsil. Novým prezidentem se stává Howard Oliver, kterému se stejně jako řadě senátorů nelíbí lístečková potravinová politika jeho předchůdce. A tak jako první krok musí najít její náhradu. Jenže to se Kaře nelíbí a ostře proti tomu vystoupí. Na lodi Nathan James zatím doctor Rios obnovuje laboratoř Rachel Scottové. Posádka se ale chystá na zátah na pašeráka Wu Minga, který je napojen na prezidenta Penga. S pomocí Takehayi se posádce nakonec daří Wu Minga lokalizovat. To ale netuší, že celá síť je mnohem rozsáhlejší, a že i Čína s ním má své plány. Navíc je třeba najít lodě, které jsou označeny tajným symbolem a které slouží jako nástroje pro pašování.

Zelená mlha, která způsobuje genocidu obyvatel a staví je proti americké armádě vezoucí protilátku, se podle všeho vyrábí na ostrově Paraiso. Když se tam posádka lodi Nathan James vydá, zjišťuje, že ostrov je plně obydlen přeživšími, kteří se tam pouze skrývají před nákazou. Ovšem to vše platí jen do chvíle, kdy malá dívenka začne prosit vojáky o pomoc. Všechno je jinak. Obydlený ostrov je jen zástěrkou pro výrobu raket se zelenou mlhou. A za vším stojí Peng. Ten se svou bojovou lodé teď uhání směrem ke Koreji, aby vyhubil další své nepřátele. A v tom mu musí Nathan James zabránit. Je však potřeba podpory, a tak Tom Chandler žádá velení o podporu v podobě lodé Hayward Actal a Shackleton. Netuší však, že plují přímo do pasti. V Bílém domě je totiž špion, který Penga informuje o přesných pozicích lodí a o úmyslech amerického námořnictva. A tomuto špionovi je teď Kara na stopě.

Kara je na útěku. Poté, co byla svědkem dvojnásobné vraždy řízené Bílým domem, se teď musí skrývat a zachránit si život. I ta, které tolik věřila, je totiž ve spiknutí namočená. A tak hledá útočiště i reportéra Jacoba, se kterým si prvotně nemohla vůbec přijít na jméno. Společně musí světu odhalit, co se za zdmi Bílého domu děje. To vše na pozadí probíhajícího dělení amerického území a stavby zdi, která by jednotlivá teritoria měla separovat. U čínského pobřeží zatím dále eskaluje konflikt mezi kapitánem Chandlerem a kapitánem Meylanem. Jeho loď byla potopena a tak teď přebývá na USS Nathan James. To však jen do té doby, než přijde tajná depeše, že Tom Chandler má být zbaven velení. S Chandlerem ve vazbě se ale posádka USS Nathan James odhodlává ke vzpouře ve snaze svého skutečného kapitána osvobodit a nastolit, respektive obnovit starý pořádek.

Kara prchá s Jacobem před pronásledováním, a pomoci jim může jediný člověk. Staronový přítel Tex Nolan. Ten ale sám bojuje o život, a tak se jejich vzájemné setkání stane jednoduchým terčem pro ty, kteří je pronásledují. Společně jim ale mohou vzdorovat, a co víc, společně se mohou pokusit osvobodit prezidenta z moci Allison a poodhalit světu, že za zdmi Bílého domu není něco v pořádku. USS Nathan James mezitím pokračuje k břehům Japonska. Tom Chandler už totiž s pomocí Takehayi zná úmysly prezidenta Penga. Ten chce vyplenit muzeum japonské kultury a celou japonskou rasu vyhladit se vším všudy z povrchu zemského. A tomu musí posádka USS Nathan James zabránit. Podaří se jim tentokrát s Pengem zatočit jednou provždy?

Loď Nathan James má být potopena. Kapitán Chandler to však předpokládá a místo Jamese použije čínský torpédoborec, který zabavil...

Boj o Ameriku se chýlí ke konci. Kapitán Chandler stojí před náročným úkolem, který by mohl navždy změnit jeho život.

Více jak rok poté, co bylo v Americe zabráněno převratu, čelí svět další katastrofě. Zatímco posádka lodi Nathan James mobilizuje, kapitán Chandler je bůhví kde...

Zatímco se Chandler pouští do honby za pomstou, posádka lodi Nathan James pátrá po vzácné plodině, která může zachránit svět...

Posádka lodi Nathana Jamesa hledá vzácný předmět, který je zavede na podivné místo hojnosti a násilí, kde zkříží své cesty s velice nečekaným spojencem.

Nejhorší obavy kapitána Chandlera se stávají skutečností, když se posádka lodi Nathan James a její spojenci snaží zabránit tomu, aby nepřítel dokázal postoupit dál na sever...

Když zachytí posádka lodi Nathan James tísňové volání, odkládá misi a vydává se za záchranou potápějící se lodi...

Posádka Nathan James se snaží dostat do bezpečí, zatímco se musí potýkat s nedalekou obrovskou bouří a blížícím se dalším nebezpečí.

Pátrání pokračuje průzkumnou misí, ale vše se náhle změní v násilí, když se objeví starý nepřítel.

Mise v utajení v zemi mrtvých vyústí ve znepokojující odhalení zlověstných plánů doktora Velleka...

Posádka lodi Nathan James se chystá na bitvu všech bitev s cílem zachránit svět před šíleným vědcem...

Na pozadí bitvy všech bitev svádí kapitán Chandler i jednu bitvu osobní...

Tři roky po skončení světového hladomoru je americké námořnictvo, poprvé od vypuknutí epidemie Rudé chřipky, připraveno odhalit svou plně funkční flotilu, ale nová hrozba předznamená další světovou válku.

Náhlý úder vrací vojenské technologie zpět do doby druhé světové války. Posádka lodi Nathan James musí rychle přijít na způsob, jak přežít v boji s omezenými prostředky.

Posádka lodi Nathan James se pokouší sjednotit dvě znepřátelené země, aby získala spojence proti mocnému nepříteli, který obsazuje stále nová území...

Posádka lodi Nathan James a její spojenci se pokoušejí zastavit nepřítele v postupu na moři. Jsou Chandlerovi spojenci opravdu dostatečně loajální...?

Po odkrytí tajných válečných plánů protivníka, vyráží Chandler se svým týmem operovat na Jamajku.

Zatímco v Americe pátrají po zrádkyni, posádka lodi Nathan James se připravuje na riskantní výsadek na Kubě.

Posádka lodi Nathan James se vydává na pomoc Chandlerovi a jeho týmu při dobývání tajného tábora, aby odhalili, jaké tajemství skrývá...

Na americké velitelství vtrhli povstalci a americký prezident je v ohrožení. Kapitán Chandler okamžitě vysílá loď Nathana Jamese na pomoc...

Posádka lodi Nathan James se připravuje na invazi do Panamy. Ne vše jde ale podle plánu.

Zatímco invaze do Panamy je v plném proudu, Chandler stojí před osudovou volbou… Závěr seriálu