Wanneer Ash vol spanning aankomt in de Unova regio, samen met Pikachu, zijn moeder en Professor Oak, zien we dat tegelijkertijd Giovanni Team Rocket ook een belangrijke taak heeft gegeven in de Unova regio. Terwijl Jessie, James en Meowth zich voorbereiden op hun nieuwe opdracht, stelt Professor Oak Ash voor aan Professor Juniper, een van de top researchers van de Unova regio.

Plotseling verschijnt er een donkere onweerswolk en Pikachu wordt geraakt door een enorme hoeveelheid elektriciteit. Professor Juniper onderzoekt Pikachu en ontdekt niets vreemds. Maar later, als Ash met de kersverse nieuwe trainer Trip en zijn eerste Pokémon Snivy aan het vechten is, kan Pikachu geen Elektrisch soort aanvallen gebruiken!

Eenmaal terug in het lab van Professor Juniper, ontdekken we dat Pikachu toch is geraakt door de grote hoeveelheid elektriciteit, die hij heeft geïncasseerd tijdens de onweersbui. Op dat moment verschijnt diezelfde onweerswolk opnieuw! Professor Juniper vertelt dan het verhaal van de Legendarische Pokémon Zekrom, waardoor iedereen zich afvraagt wat de reden kan zijn van het mysterieuze verlies van Pikachu’s Elektrisch soort krachten. Zal Pikachu ooit weer in staat zijn om die krachten weer te gebruiken?

Zo snel als Pikachu een mysterieuze kwaal opgelopen had, die effect had op al zijn Elektrisch soort zetten, zo snel bracht een tweede onweersbui volledige genezing! Professor Oak en Professor Juniper wijten de problemen aan de acties van de Legendarische Pokémon Zekrom, en zijn het erover eens dat verder onderzoek noodzakelijk is. Ondertussen is Team Rocket aangekomen in de Unova regio, en bereidt zich voor om een operatie te beginnen met het doel om Pikachu en Zekrom beide te stelen. Ash heeft besloten om zijn reis te vervolgen in de Unova regio en dus, gewapend met een nieuwe Pokédex en nieuwe Poké Ball, trekt onze held erop uit om zoveel mogelijk nieuwe Unova regio Pokémon te ontdekken. Onderweg komt hij Iris tegen en haar Pokémon Axew, net als hij bezig is om zijn eerste Unova regio Pokémon Pidove te vangen. Al snel hierna verschijnt Team Rocket ten tonele met hun kwaadaardige plan en steelt Pikachu, Pidove en Axew! Natuurlijk laat Ash het er niet bij zitten en komt hij meteen in actie tegen zijn oude vijanden Jessie, James en Meowth. Met wat onverwachte hulp van Oshawott, die eerst een verlegen Pokémon leek te zijn en die Ash en Pikachu had gevolgd, krijgen Ash en Iris hun Pokémon veilig terug, terwijl Team Rocket geheimzinnig verdwijnt.

Na een bezoek aan het Pokémon Center, waar Pikachu, Axew en Pidove door Zuster Joy in goede gezondheid worden gebracht, geeft Iris toe dat, hoewel Ash zich gedraagt als een ‘klein kind’, ze onder de indruk is door de manier waarop hij in actie kwam bij het redden van hun drie Pokémon. Ash vraagt zich hardop af waarom Oshawott hen op die manier heeft geholpen…

Wanneer Ash en Iris hun reis vervolgen naar Striaton City, waar Ash zijn eerste Gym Gevecht in de Unova regio zal houden, vallen ze plotseling in een groot gat. Ze worden gered door een jongen met de naam Dan en zijn familie heeft een kuuroord en hotel. Ze komen er achter dat de gaten zijn gegraven door een groep Sandile en daardoor is het hotel nu gesloten. De Sandile zijn normaal gesproken erg vriendelijk en genieten ook van de warme zandbaden van het hotel, maar zijn plotseling erg nijdig geworden en keren zich tegen iedereen, zelfs tegen Pikachu en Oshawott! Maar dan komen de geisers in het gebied tot uitbarsting en worden de wilde Pokémon omringt door het kolkende en kokende water. Ash, Iris en Dan begrijpen dat de Sandile ze wilden waarschuwen rdden en in feite vriendelijk zijn, en dus komt Ash in actie! Terwijl de Sandile een brug vormen, door hun staarten in elkaar te haken en de bange wilde Pokémon kunnen ontsnappen, helpt Ash ze veilig aan de overkant. Maar dit doet hij niet zonder de hulp van Iris, die ook in actie komt en Ash op het nippertje in veiligheid brengt!

Het hotel gaat weer open en gebruikt het hete water uit de geisers voor een nieuwe attractie: een warmwaterbron. Onze helden gebruiken hun tijd om uit te rusten en relaxen in het warme water, voordat ze hun reis door de Unova Regio voortzetten!

Terwijl Ash, Iris en hun Pokémon hun reis vervolgen naar Striaton City, waar Ash zijn eerste Gym Gevecht in de Unova Regio zal houden, vertelt Iris hem over de Pokémon Vechtclub – een plek waar Trainers elkaar kunnen uitdagen om hun vaardigheden te verbeteren. Maar als Ash een uitdaging van een Trainer accepteert, is de Vechtclub opeens gesloten, omdat er iemand heeft ingebroken! Nadat Ash en Iris eerst denken dat de dader een Umbreon is, ontdekken ze dat de vage verschijning op de band van de bewakingscamera een vieze, magere Tepig, die op zoek naar voedsel is. Ze bevrijden Tepig van het touw dat om zijn snuit gebonden is, door een Trainer die hem heeft verlaten en daarna geeft Ash hem een heleboel Pokémon voedsel en al snel is hij weer in perfecte gezondheid. Ze komen er achter dat Tepig niet de enige inbreker is – Team Rocket heeft ook geprobeerd om proviand van de club te stelen. Maar als Team Rocket Pikachu ontvoert, wordt Ash door een verkwikte Tepig geholpen en brengt hij Pikachu weer terug. Als Iris Tepig probeert te vangen, maakt Tepig duidelijk dat hij Ash als Trainer wil en al gauw zit hij in de Pokéball van Ash en is hij zijn nieuwe vriend!

Nadat Ash heeft besloten om Tepig in te zetten tijdens zijn Striaton Gym Gevecht, vervolgen onze helden hun reis naar Striaton City, terwijl een ander team een geheime opdracht krijgt van Giovanni en daar ook voor hun volgende missie naartoe reist...

Als Ash arriveert in Striaton City, wil hij als eerste naar de Striaton City Gym om de Gym Leader uit te dagen, zodat hij zijn eerste Gevecht in de Unova Regio kan houden! Maar Ash komt er tot zijn grote verrassing achter dat er drie Gym Leaders zijn: Cilan, Chili en Cress. Ash daagt ze alle drie uit voor een Gym Gevecht! Ze accepteren de uitdaging en gaan het gevecht aan.

Intussen is Team Rocket ook gearriveerd in Striaton City met een nieuwe opdracht – het vinden van een voormalige researchfaciliteit en het absorberen van de “toekomstige energie”. Met deze energie kan Team Rocket hun dromen waarmaken. Jessie, James en Meowth zijn er van overtuigd dat de kwaadaardige organisatie afhankelijk is van hen voelen zich zeer belangrijk!

Ash wint de eerste ronde, maar hij en Pikachu verliezen de tweede en dus kiest onze held Oshawott als derde en laatste Pokémon. Ze nemen het op tegen Cilan’s Pansage en wij vragen ons af of Ash zal winnen en zijn eerste Gym Badge uit de Unova regio zal krijgen!

Ash’s gevecht gaat verder en hij hoopt de felbegeerde Trio Badge te winnen. Hij heeft al een keer gewonnen en verloren en neemt het nu tegen Cilan, de derde Gym Leader van de Striaton Gym op. Cilan’s Pansage is een uitstekende tegenstander, maar net als Cilan heeft besloten dat Ash’s vechtstijl nogal saai is, vraagt Ash aan Oshawott om zijn Water Pistool tegen de muur te doen. Ash blijkt onoverwinnelijk te zijn en wint de Trio Badge!

Intussen zien we dat Team Rocket druk is met hun nieuwe opdracht – de “Toekomstige Energie” absorberen uit de Dreamyard, een verlaten onderzoeksfaciliteit waar eens het praktisch gebruik van droomenergie werd bestudeerd. Maar een van de wetenschappelijke onderzoekers, dr. Fennel komt hierachter en samen met Ash, Iris, Cilan en Munna en Musharna probeert ze Jessie, James en Meowth tegen te houden. Helaas lukt dit niet en Team Rocket gaat er met de data vandoor. Cilan heeft bewondering voor Ash en de manier waarop hij met z’n Pokémon samenwerkt en vraagt hem of hij met hem mee mag op reis. Dit vindt Ash een goed idee en een nieuw reistrio dat uit Ash, Cilan en Iris bestaat is ontstaan!

Terwijl Ash, nu vergezeld door Cilan en Iris, zijn reis vervolgd naar Nacrene City en de tweede Gym Gevecht uitdaging van Ash, komt het stel een wilde Snivy tegen. Natuurlijk wil Ash meteen deze intelligente en snelle Pokémon vangen, die door deze kwaliteiten juist moeilijk te vangen blijkt te zijn! Na een aantal pogingen om de listige Snivy te vangen met hulp van Pikachu en Oshawott, schakelt Ash de hulp van zijn Pidove in. En waar Snivy’s Verleid Pikachu en Oshawott had tegengehouden, heeft deze zet geen effect op Pidove, die van hetzelfde geslacht is als Snivy. Uiteindelijk, na een intens gevecht, blijft een vermoeide Snivy in zijn Poké Ball en heeft Ash zijn vijfde Pokémon in de Unova regio.

Tijdens een lunchpauze onderweg naar Nacrene city en het volgende Gym Gevecht van Ash, verdwijnt plotseling het eten van onze helden op geheimzinnige wijze. Later komen ze erachter dat twee Darumaka de etensdieven blijken te zijn. Ze realiseren zich echter ook dat dit vreemd gedrag is voor Darumaka en Ash besluit dat hij erachter wil komen wat de rede is voor het stelen van het eten.

Ash gaat achter de twee Darumaka aan naar de klokkentoren, die oud is en binnenkort afgebroken zal worden. Als onze helden naar binnen gaan, overtuigen ze de Darumaka ervan dat ze vrienden zijn en willen helpen.

Zo ontdekken ze al snel Darmanitan op de volgende verdieping, die Psychisch gebruikt om een gigantisch zware klok op te tillen die dreigt te vallen. Het blijkt dat de Darumaka voedsel hebben gestolen om aan Darmanitan te geven om zijn kracht te kunnen behouden. Het lukt de Pansage van Cilan om de haak te repareren waar de klok aan vastgezeten heeft, maar die verbogen was. Darmanitan kan dan de klok optillen en aan de haak bevestigen, waardoor hij een ramp weet te voorkomen.

Als de inwoners van de stad horen hoe de Darumaka en Darmanitan de klokkentoren hebben gered, besluiten ze om het oude gebouw te restaureren en te onderhouden en geven de drie Pokémon toestemming om daar te wonen!

Blij nemen onze helden afscheid en trekken weer verder naar Nacrene City en het volgende Gym Gevecht van Ash.

We treffen onze helden net op tijd om een ongewone gebeurtenis mee te maken; een Gevecht tussen Cilan, Pansage, Iris en Axew! Natuurlijk wil Ash ook meedoen, maar Iris wil het niet hebben. In plaats daarvan blijkt ze Cilan te hebben gevraagd om te helpen Axew te leren vechten door extra voorzichtig te zijn bij het gebruik van elke zet. Toch is Axew bang om te vechten en Iris legt uit dat Axew aan haar was gegeven door de wijze Oudste in haar geboorteplaats, met het verzoek aan Iris om Axew op te voeden en daarbij naar zijn hart te luisteren. De Oudste heeft ook uitgelegd dat het kennen van het hart van een Pokémon de sleutel is tot haar eigen ontwikkeling. Iris heeft besloten dat dit het moment is om daar iets aan te doen door te trainen met Axew.

Maar als Axew een boze Scolipede tegenkomt, springen Ash en Cilan te hulp en haalt Iris plotseling een andere Pokémon van haar tevoorschijn, een krachtige maar hooghartige Excadrill! Hoewel het Iris niet lukt om Excadrill ook maar een van haar bevelen uit te laten voeren, maakt Excadrill korte metten met Scolipede en keert Axew veilig terug.

Na wijze adviezen van Cilan, besluit Iris dat ze door zal gaan het met trainen van Axew in hun eigen rustige tempo. Ash wil echter nog steeds een Gevecht houden, dus als Iris hem aanraadt om maar met Pikachu te gaan vechten, is dat precies wat hij doet! We verlaten onze helden, als Iris vol ongeloof naar Ash staart terwijl die de ene na de andere aanval van Pikachu over zich heen krijgt, en Iris zich afvraagt hoe ver onze jonge held uit Pallet Town eigenlijk wil gaan…

Onderweg naar de Nacrene City Gym besluit Ash om te stoppen bij de Pokémon Vechtclub in Luxuria Town om een gevecht te houden ter voorbereiding op zijn komende gevecht in de Nacrene Gym. Tot zijn verbazing treft hij daar zijn Unova regio rivaal Trip ook! Ash daagt Trip uit en hoewel die eerst terughoudend is, stemt Trip ermee in om een Vijf-tegen-vijf Gevecht te houden. Maar de Tranquill van Trip is zeer sterk en maakt korte metten met de Oshawott en Tepig van Ash.

Ondertussen is Team Rocket aangekomen in de Dreamyard, waar ze worden omsingeld door een politiemacht onder leiding van Agent Jenny. Zonder enig probleem worden zij echter gered door een ander lid van Team Rocket, Pierce, die ze met hun nieuwe opdracht zal assisteren, en verdwijnen zij veilig uit het zicht.

Ash verslaat Tranquill met Pikachu, waarna Trip zijn Servine kiest. Als Pikachu is verslagen, kiest Ash Snivy, die Servine verslaat, waarna Trip Frillish kiest. Ash gaat verder met Pidove die wordt verslagen door Frillish. Ash haalt zijn laatste Pokémon Snivy nog een keer tevoorschijn. Frillish verslaat Snivy en Trip is de winnaar. Maar in plaats van kwaad te zijn, spant Ash zich extra in en zweert hij nog harder te trainen dan ooit voor de volgende keer dat hij en Trip een Gevecht zullen houden!

Als onze helden een lunchpauze houden onderweg naar de Nacrene City Gym, zien ze een uiterst ongewone Pokémon, Dwebble. Ongewoon, omdat hij nog geen steen op zijn rug heeft om zichzelf te beschermen tegen vijanden. Terwijl ze kijken hoe Dwebble aan de slag gaat om een steen uit te zoeken, vertelt Cilan Ash en Iris dat de steen ook gebruikt zal worden als huisje.

Plotseling, nadat hij een geschikte steen heeft gevonden, verschijnen er drie andere Dwebble en stelen de steen! En hoewel onze helden proberen vrienden te worden met de getroffen Dwebble, blijkt dit geen makkelijke opgave te zijn! Maar als Dwebble een tegenaanval begint en per ongeluk Pansage raakt en verwondt, voelt Dwebble zich slecht om wat er is gebeurd en neemt het aanbod om vrienden te worden met onze helden aan.

Dwebble wil de andere drie Dwebble vinden en zijn huisje terughalen, wat ook geen makkelijke opgave blijkt te zijn, aangezien het drie tegen een wordt. Maar als onze helden Dwebble helpen om de drie Dwebble huizendieven van elkaar te scheiden, blijkt de getroffen Dwebble sterk en dapper te zijn en het stelende Pokémon trio te verslaan.

Dwebble is tevreden, met zijn huis op zijn rug, en onze helden nemen afscheid van hem, maar Dwebble laat Cilan weten dat hij met ze mee wil gaan. En dus verlaten wij onze helden met een gloednieuw lid van de familie, terwijl zij hun reis naar de Nacrene City Gym vervolgen.

Ondertussen heeft Team Rocket tijdens al deze gebeurtenissen de nieuwste missie volbracht; inbreken in het Antimony Research Lab en de data stelen die betrekking hebben op de Meteoniet…

Wanneer onze helden op weg zijn naar de Nacrene City Gym zien ze plotseling een groep kleuters, die vrienden zijn geworden met een Trubbish, nadat ze hem hebben gered van een vuilnisbelt. De kleuters willen hem houden, maar hun lerares heeft daar geen oren naar en denkt dat het onmogelijk is om voor een Trubbish te zorgen en onveilig is voor de leerlingen. Ash biedt aan om met de kinderen te praten, maar als hij ziet hoeveel lol de kinderen hebben in hun clubhuis en om Trubbish geven, sluit hij zich bij hen aan! Als de lerares nog steeds weigert Trubbish te laten blijven, daagt Ash haar uit voor een Gevecht. Plotseling begint het “geheime Clubhuis” dat de kinderen en Trubbish uit afval van de vuilnisbelt hebben gebouwd in elkaar te storten! Ash en Pikachu stoppen met het Gevecht en helpen de lerares en haar Deerling het Clubhuis te behouden. Trubbish redt de boel door een paar krachtige Blubber aanvallen te doen. De lerares ziet nu hoeveel de kinderen om Trubbish geven en visa versa en komt op haar besluit terug en vraagt Trubbish of hij toch wil blijven. Dit tot groot genoegen van de kinderen, lerares, onze helden en natuurlijk Trubbish! Onze helden vervolgen hun reis naar Nacrene City en Ash belooft dat hij op een dag terug zal keren om met de kleuters te vechten!

Onze helden vervolgen hun reis naar de Nacrene City Gym waar Ash zijn aankomende Gym Gevecht zal houden en ontmoeten Bianca, die gestuurd is door Professor Juniper om Ash zijn Badge Doos te geven. Maar als Bianca de doos wil geven, wordt deze snel door Minccino afgepakt. Minccino is een Pokémon die graag dingen schoonmaakt en de Badge Doos is vies geworden in Bianca’s tas. Bianca staat erop om de Doos van Ash terug te brengen en haalt haar Pignite te voorschijn. Maar Minccino is een behendige Pokémon en is niet snel te verslaan. Daardoor wil Bianca Minccino voor zichzelf hebben! Ash haalt zijn Snivy tevoorschijn om tegen Minccino te vechten, maar als dat onsuccesvol blijkt te zijn, neemt Pikachu het van hem over. Bianca smeekt Ash om haar tegen Minccino te laten vechten, maar als ze haar Pokéball tevoorschijn haalt is deze net zo vies als de Badge Doos van Ash. Als Minccino de vieze Pokéball ziet wil hij deze schoonmaken en komt hij er per ongeluk in.

Nadat Ash zijn Badge Doos heeft terug gekregen, houden hij en Bianca een één tegen één Gevecht en wint Ash. Daarna neemt Bianca afscheid van onze helden en wenst ze Ash veel succes met zijn aankomende Nacrene City Gym Gevecht.

Nadat onze helden in Nacrene City zijn aangekomen en hebben ontdekt dat de Nacrene Gym zich in het stadsmuseum bevindt, ontmoeten ze een zeer angstige man die de co curator van het museum blijkt te zijn. Hij heet Hawes en zegt dat hij spookachtige verschijningen heeft gezien, net nu hij bezig is met de opening van de zogenaamde Geheime Kunstvoorwerpen Tentoonstelling. Onze helden horen zijn verhaal aan en Iris besluit dat een ‘kwade geest’ een vloek over het museum heeft uitgesproken. Cilan zegt dat er een wetenschappelijke verklaring voor alles moet zijn.

Terwijl ze de nacht in het museum doorbrengen om te zien wat er aan de hand is, ontdekken onze helden en Hawes dat een Yamask masker, dat Hawes bij vergissing aangezien heeft voor een replica, in werkelijkheid echt blijkt te zijn. Een Yamask spookte in het museum rond, omdat hij zijn masker terug wilde krijgen. We ontmoeten de vrouw van Hawes, Lenora, die de Nacrene Gym Leader is. Nadat Hawes zijn excuses heeft aangeboden voor het per ongeluk wegnemen van het masker, vergeeft Yamask hem en vertrekt blij met zijn masker. Ash daagt Lenora uit voor een Gym Gevecht en zij neemt de uitdaging aan. Dus nu is het op naar het tweede Unova regio Gym Gevecht van Ash, en hopelijk zijn tweede Unova regio Gym Badge!

Wanneer het Nacrene Gym Gevecht tussen Ash en Lenora van start gaat, leert Ash al snel dat Lenora vanaf het begin haar uitdagers goed kan inschatten, en Ash is geen uitzondering. Ze ziet onze held als een trainer die direct is en zonder omwegen, en ze beginnen met een twee tegen twee Gevecht. Lenora met Watchog en Lillipup tegen Ash met Tepig en Oshawott. Maar meteen zet Lenora Ash op het verkeerde been door Brul te gebruiken, waardoor Ash wordt gedwongen om van Pokémon te wisselen. Dan gebruikt ze Valse Blik, waardoor Ash Oshawott in het Gevecht moet houden. Nadat Tepig is omgewisseld voor Oshawott, wordt Tepig opnieuw opgeroepen als Oshawott is verslagen. Maar Lillipups Haal neer is te sterk voor Tepig en Lenora wint. Ash neemt zich voor om de Nacrene Gym nog een keer uit te dagen en hard te trainen. Zuster Joy raadt hem aan om naar de Pokémon Vechtclub te gaan en Don George te vragen om hulp. Don George wil dat graag doen en we verlaten onze helden terwijl Ash zich klaar maakt op een stevige Speciale Pokémon Vechtclub Training, ter voorbereiding op zijn rematch tegen Lenora.

Voordat Ash terugkeert naar de Nacrene City Gym voor een tweede gevecht tegen Lenora, gaat hij eerst naar de Pokémon Vechtclub om samen met Don George een speciale training te houden. In de rijk uitgeruste trainingsruimte houden Ash, Tepig en Oshawott een intensieve training en alle drie gaan ze er qua snelheid en kracht op vooruit. En dat is nodig om van de Nacrene Gym te winnen! Ash keert terug voor een twee tegen twee gevecht en Lenora gebruikt haar Watchog en Herdier, en Ash zet natuurlijk zijn Tepig en Oshawott in. Lenora merkt gelijk dat de snelheid en kracht van onze helden enorm is verbeterd, maar ze is niet van plan het hen makkelijk te maken! Wanneer ze haar vorige strategie; Brul en Valse Blik doet, heeft Ash zijn eigen strategie voor dat scenario klaar en Oshawott komt in actie met zijn pasgeleerde Waterstraal! Hoewel de aanval onstabiel wordt uitgevoerd, zijn beiden Pokémon niet meer in staat om verder te vechten, dus hebben ze ieder nog één Pokémon over. Er ontstaat een hevig gevecht tussen Tepig en Herdier, maar Tepig’s snelheid is niet te evenaren en Ash en Tepig winnen de Basic Badge! Daarna gaan ze naar de Castelia Gym, waar Ash zijn derde badge uit de Unova Regio kan winnen!

Terwijl onze helden weer op weg zijn naar Castelia City, waar Ash zijn derde Gym Gevecht in de Unova Regio gaat houden, begint het Ei dat Ash heeft gekregen uit te komen! En het is niemand minder dan een Scraggy! Wanneer iedereen Scraggy probeert te begroeten, raakt hij van slag en gebruikt hij Kopstoot op de andere Pokémon. Later weigert Scraggy om met de anderen te eten en als onze helden wakker worden is hij ook nog eens verdwenen! Als ze eindelijk Scraggy vinden, geeft hij kopstoten op een boom, die vol zit met kwaadaardige Galvantula, klaar om aan te vallen! Maar Scraggy is moedig en probeert ze van zich af te houden. Onze helden komen hem te hulp en Pikachu’s krachtige Bliksemstraal stuurt de Galvantula terug hun boom in, maar niet voordat Scraggy geraakt wordt door een van de Galvantula. Iris zoekt wat plantaardige medicijnen bij elkaar en na een goede nachtrust is Scraggy weer de oude. Scraggy bedankt iedereen en verdwijnt in zijn nieuwe Poké Ball en wordt hiermee het nieuwste familielid! Intussen geeft Team Rocket samen met Pierce de gestolen Meteoniet aan Dr. Zager, die het onderzoekt en vaststelt dat het de echte is. Daarna is het tijd om het tweede gedeelte van hun kwaadaardige plan uit te voeren...

Onze helden bevinden zich in het enorme Pinwheel Forest, dat zich uitstrekt helemaal naar Castelia City. Ze proberen op het pad te blijven om niet te verdwalen, totdat ze een Sewaddle tegenkomen. Ash is onder de indruk van Sewaddles vechtkunst, en hij raakt van het pad af wanneer hij hem achterna gaat. De rest van onze helden volgen hem.

Ze raken Sewaddle echter kwijt en verdwalen. Dan komen ze Burgh tegen, de Castelia City Gym Leader. Burgh leeft in het bos om nieuwe inspiratie op te doen en uit zijn creatieve dip te komen. Als Sewaddle weer opduikt, probeert Burgh Ash te laten zien hoe je Sewaddle kan leren kennen, wat moeilijk blijkt te zijn. Maar als Sewaddle in gevaar is, komt Ash in actie en redt Sewaddle. Hierdoor verandert Sewaddle van gedachte en als Ash Sewaddle vraagt om met hem mee te komen, is het antwoord een klinkend ja! Burgh heeft dit alles gezien en besluit dat de onzelfzuchtige redding door Ash van Sewaddle zeer inspirerend is. Hij neemt afscheid maar belooft dat hij op ze zal wachten in de Castelia City Gym. Als ze weer op het goede pad zijn, gaan ze op weg door Pinwheel Forest en op naar de volgende Unova regio Gym Gevecht uitdaging van Ash, met een nieuwe vriend, Sewaddle!

Onze helden reizen naar Castelia City, de plek waar de derde Unova regio Gym Gevecht uitdaging van Ash zal plaatsvinden. Ze stuiten op een groot openingsfeest van een gloednieuwe Poké Markt die lijkt op een enorm winkelcentrum. Als ze naar binnen gaan, zien ze een winkel waar een Pokémon Deskundige de compatibiliteit tussen Trainers en Pokémon checkt. Ash gaat in de rij staan om dat ook te laten checken, maar op het moment dat het wachten eindeloos lijkt te duren, wenkt iemand hem om in haar winkel binnen te komen, omdat zij (Burgundy) ook een top klasse Deskundige is, zoals ze het zelf noemt.

Wanneer Burgundy besluit dat Ash al zijn Pokémon moet vervangen, omdat geen van hen bij hem past, ontdekken we dat Cilan haar al eerder heeft ontmoet in de Striaton Gym, waar zij hem ooit heeft uitgedaagd. Hij heeft haar verslagen en dat heeft haar kwaad gemaakt. Dus heeft ze een opleiding gevolgd voor Pokémon Deskundige en is daarna teruggegaan om Cilan uit te dagen. Hij was echter niet daar; hij was op reis met Ash en Iris. Dus daagt ze nu Cilan uit voor een Gevecht om wraak te nemen en zegt dat als zij wint, Ash al zijn Pokémon op moet geven. Ash is diep geschokt en maakt zich zorgen. Maar Cilan neemt de uitdaging aan en probeert tijdens zijn overwinning op Burgundy rustig aan haar te leren dat het beoordelen van de compatibiliteit van Pokémon en Trainer niet altijd volgens het boekje kan. Kwaad zweert zij terug te zullen komen om Cilan te verslaan en ze gaat weg. Maar Ash is blij met het feit dat hij al zijn Pokémon kan houden en ze kunnen zich nu weer richten op de Castelia City Gym.

Onze helden trainen een beetje en lunchen onderweg naar Castelia City en worden plotseling opgeschrikt als Ash en Pikachu in een enorme kuil vallen en verdwijnen. Wat Iris en Cilan niet weten is dat Ash en Pikachu in een gat zijn gevallen dat is gemaakt door de zonnebril dragende Sandile, die ze een tijdje terug hebben ontmoet. Sandile heeft een lange reis gemaakt om Pikachu uit te dagen voor een Gevecht. Maar plotseling verschijnen een paar ondeugende Ducklett ten tonele. Eigenlijk zijn het drie Ducklett die met elkaar optrekken. Een voor een pakken ze de warmhouddeksel van Cilan, de zonnebril van Sandile en tenslotte de pet van Ash!

Het terughalen van deze voorwerpen blijkt een enorme opgave te zijn, aangezien de drie Ducklett dol zijn op kattenkwaad en niet zo vriendelijk zijn. Maar als Sandile tegen ze in actie komt en Pikachu hem helpt, leert Pikachu plotseling een nieuwe zet: Elektrobal! Die zet schiet de drie Ducklett de lucht in en onze helden kunnen dan hun gestolen voorwerpen terugpakken.

Dan komen we toe aan het oorspronkelijke doel van Sandile om tegen Pikachu te vechten. Hoewel het Gevecht onbeslist eindigt, evolueert Sandile in Krokorok. Krokorok neemt afscheid van onze helden en zij vervolgen hun reis naar Castelia City. Ash is blij dat de confrontatie die ze met de drie Ducklett hadden, heeft opgeleverd dat Pikachu een gloednieuwe, sterke zet heeft geleerd: Elektrobal!

Als onze helden de Skyarrow Bridge willen oversteken om in Castelia City te komen, worden ze tegengehouden door een boze Gothitelle. Vlak daarvoor zijn ze een vrouw tegen het lijft gelopen, die ze nooit eerder hebben gezien en hen vertelt dat voordat de brug was gebouwd er een watertaxi was die de mensen naar de overkant van de rivier bracht. Plotseling bevinden ze zich in een andere wereld, want ze zien dat de Skyarrow Bridge nog niet af is en Gothitelle werkt samen met de vrouw (Sally), die nog een jong meisje is, op de watertaxi! Volgens Cilan heeft Gothitelle de ruimte vervormd en een nieuwe wereld, waarin ze nu vastzitten, gecreëerd. Onze helden proberen Gothitelle zo ver te krijgen dat hij hen laat gaan, maar dat mislukt, totdat de volwassen Sally arriveert. Ze vertelt Gothitelle dat ze ook die geweldige dagen samen met hem op de watertaxi mist. Gothitelle is blij om Sally te zien en laat onze helden naar hun eigen wereld terugkeren. En nadat ze afscheid hebben genomen van Sally, steken ze de brug over en zijn dan eindelijk in Castelia City!

Nadat onze helden in Castelia City, waar ook de Castelia City Gym ligt, zijn gearriveerd, besluiten ze op onderzoek uit te gaan en komen ze Burgh, de Castelia City Gym Leader, tegen. Samen ontdekken ze ondergronds een Venipede in nood en natuurlijk wil Ash hem helpen. Maar terwijl ze daarmee bezig zijn, ontdekken ze dat de hele stad overspoeld wordt door een gigantische kolonie van nijdige Venipede!

De mensen zijn in paniek en de burgemeester van Castelia City stelt vast dat er onmiddellijk iets moet worden gedaan. Maar als onze helden Trip (de rivaal van Ash) tegenkomen, zien ze dat hij tegen ze wil vechten en wegjagen. Burgh stelt voor de Venipede naar het Stadsplein te leiden, terwijl Professor Juniper onderzoekt hoe dit heeft kunnen gebeuren en opgelost kan worden. De Venipede worden bijeen gedreven en naar het Stadsplein gebracht. En wanneer Professor Juniper een grote energiebron in het Woestijn Resort ontdekt, gaat ze samen met onze helden en Agent Jenny er naartoe om precies uit te zoeken wat daar aan de hand is. Burgh blijft achter om zich over de Venipede te ontfermen.

Het Castelia Gym Gevecht tussen Ash en Gym Leader Burgh gaat zo beginnen en we horen dat ieder maximaal drie Pokémon mag inzetten. Burgh begint met zijn Dwebble, een Insect en Steensoort, en Ash begint met zijn Tepig. Maar Dwebbles snelheid, die hij dankt aan een super lichte steen op zijn rug, samen met zijn Steenpletter zijn te sterk voor Tepig.

Vervolgens verbaast Ash iedereen door Sewaddle te gebruiken, die de steen van Dwebble van zijn rug afslaat en Ash de eerste winst bezorgt.

Burgh haalt zijn Whirlipede tevoorschijn en Ash blijft bij Sewaddle, die tijdens het Gevecht evolueert in Swadloon! Swadloons krachtige Energiebal verslaat Whirlipede en dan komt Burgh met zijn geliefde Leavanny. Leavanny overmeestert Swadloon en Ash kiest voor Pikachu. Hij herinnert Burgh eraan dat Pikachu anders is dan alle andere Pikachu die hij ooit heeft gezien. Wanneer Pikachu gevangen zit in de draden van Leavanny, laat Ash hem moedig duiken in de Bladstorm van Leavanny en bevrijdt hij zich. Dan, weer helemaal op kracht, verslaat Pikachu Leavanny met zijn sterke Energiebal en wint Ash zijn derde Unova Gym Badge, de Insect Badge!

Ondertussen lukt het Team Rocket niet om met Giovanni te spreken en krijgen zij het advies van zijn secretaresse om ‘het zelf te bepalen en te doen wat het beste is voor Team Rocket’. Ze besluiten om zich weer te richten op het vangen van Pikachu en worden dan plotseling benaderd door een hongerige Yamask, die de Pokémon van James wordt…

Samen met hun vriendin Bianca, zijn onze helden vertrokken uit Castelia City en nu op weg naar de Nimbasa Gym. Plotseling worden zij geconfronteerd met een super schattige Emolga, waar Bianca op slag verliefd op wordt. Ze zweert dat ze Emolga zal vangen, koste wat het kost, en probeert met hem te vechten, met gebruik van haar Mincinno. Maar Emolga ontsnapt en Bianca zet de achtervolging in, samen met Ash en Cillan.

Ondertussen zijn Iris en Axew zelf op pad gegaan om Emolga te vinden. Als ze hem vinden, lijkt er een vriendschap te ontstaan tussen hen drieën. Maar plotseling wordt Iris omsingeld door een zwerm kwade Swoobat die haar bedreigen. Iris, Axew en Emolga ontsnappen, maar worden door de kwade Swoobat achtervolgd. Ash, Cilan en Bianca vinden Iris net op tijd en redden haar met hulp van Pikachu. Maar Bianca is nog steeds vastbesloten om Emolga te vangen, hoewel ze ondertussen wordt geconfronteerd met een krachtige en boze Scolipede en Galvantula. Uiteindelijk wordt het duidelijk dat Emolga met Iris mee wil, tot grote teleurstelling van Bianca. Dan genieten onze helden en Bianca van een van Cilans heerlijke diners, terwijl Iris er een nieuwe vriend bij heeft, Emolga!

Onze helden trekken verder naar Nimbasa City en de vierde Unova Gym Badge uitdaging van Ash. Bianca, de vriendin van onze helden, daagt Iris uit tot een gevecht tussen de nieuwe Pokémon van Iris, Emolga, en Bianca’s Pignite. Maar Emolga gebruikt Verleid tegen Pignite, dus Bianca haalt haar Mincinno tevoorschijn. Emolga gaat zijn eigen gang en luistert niet naar Iris. Hij gebruikt Volt Wissel wanneer hij wil en huilt dan als Iris protesteert. Ook gebruikt Emolga stiekem Verleid tegen Oshawott, Tepig, Scraggy en Swadloon, om hun eten te stelen.

Als Emolga plotseling verdwijnt, houden Ash en Bianca een gevecht. Ash met Snivy en Bianca met Pignite. Wanneer Emolga wordt gevonden, wordt het duidelijk dat Emolga niet van plan is om te doen wat Iris zegt. Maar als een boze Simisear een aantal Pokémon van onze helden in gevaar brengt, komt Emolga eindelijk in actie en strijd fantastisch, waarmee iedereen wordt gered.

Wanneer Bianca ontdekt dat Ash al drie Unova Gym Badges heeft verdiend, zegt ze snel gedag en gaat naar de Castelia Gym om zelf een Badge te verdienen. Onze helden trekken dan weer verder naar Nimbasa City.

Op weg naar Nimbasa City en de volgende Gym Gevecht uitdaging van Ash, komen onze helden in een enorme onweersbui terecht. Ze vinden een landhuis, gaan er naar binnen om te schuilen, maar treffen niemand aan. Het blijkt bewoond te worden door een groep Litwick en ook bezet te zijn door niemand anders dan Team Rocket. Jessie, James en Meowth geloven dat het landhuis de perfecte geheime basis kan zijn en wanneer zij er stiekem achter komen dat de Ettertjes er ook zijn, vragen zij de Litwick, via hun Yamask, om PIkachu te vangen en de rest weg te jagen. Maar de Litwick hebben andere plannen.

Hoewel de Litwick proberen te voorkomen dat onze helden iets over ze te weten komen door de Pokédex van Ash, ontdekken zij uiteindelijk toch dat de Litwick mensen lijken te helpen om de weg te vinden, door donkere plaatsen te verlichten, maar in werkelijkheid leiden ze hen naar de Geestenwereld. Ze voeden zich met de levensenergie van zowel mensen als Pokémon en gebruiken die als brandstof voor de vlammen op hun hoofd.”

Tegelijkertijd wordt de levensenergie van Team Rocket door de Litwick weggezogen, dus gaan onze helden samenwerken met Team Rocket. Na een stevig gevecht van al hun Pokémon, worden de Litwick (en een Lampent, die zich aangesloten heeft bij het Litwick kwartet) teruggestuurd naar de Geestenwereld.

Team Rocket vertrekt en belooft ooit Pikachu te zullen vangen, en onze helden trekken weer verder naar Nimbasa City.

Onze helden trainen een beetje onderweg naar de Nimbasa City Gym, en komen bij verrassing een Druddigon tegen die nogal kwaad lijkt te zijn. Al snel ontmoeten ze zijn Trainer, Emmy, die naar haar Draaksoort Pokémon op zoek was. Hoewel Druddigon dreigend overkomt, is Iris absoluut niet bang en ze herinnert iedereen aan het feit dat zij is opgegroeid in een dorp waar mensen en Draaksoort Pokémon goed met elkaar op kunnen schieten. Als ze duidelijk maakt dat ze een Drakenmeester wil worden, vraagt Emmy haar om haar meer te leren over Draaksoorten, aangezien Emmy een kersverse Trainer is. Iris stelt haar voor om met Druddigon te vechten en Ash biedt aan om tegen hem te vechten.

Ondertussen heeft Team Rocket het oog laten vallen op het vangen van Druddigon en Axew, en niet te vergeten, Pikachu. Met hulp van Woobat en Yamask lijkt het erop dat de drie Pokémon van onze helden zijn gevangen, maar Pikachu ontsnapt.

Onze helden zweren dat ze hun Pokémon terug zullen krijgen en samen met Emmy vechten ze verwoed terug. Plotseling kan Druddigon Drace Meteoor gebruiken, en Axew heeft eindelijk geleerd hoe hij Drakenfurie moet gebruiken. Team Rocket beseft dat het voor nu verloren heeft en verdwijnt en Emmy besluit dat ze klaar is om op reis te gaan met Druddigon! Onze helden nemen afscheid van Emmy en Druddigon, en Ash en Iris beloven dat ze hun droom waar zullen maken om respectievelijk Pokémon Meester en Drakenmeester te worden!

Als onze helden op weg naar Nimbasa City, waar Ash zijn volgende Unova Gym Gevecht zal houden, bezig zijn met een geïmproviseerde training, staan ze opeens oog in oog met een eenzame Cottonee. Dit is ongewoon, want Cilan legt uit dat Cottonee in grote groepen naar de nabijgelegen Regenboog Vallei komen om daar een maatje te vinden en samen op de Diamant Bries weg te zweven. Het blijkt dat deze Cottonee is afgedwaald van de groep Cottonee om een andere Cottonee te volgen, maar hij wordt afgewezen! Onze helden leren de afgewezen Cottonee de kunst van het vechten, waardoor hij het hart van de andere Cottonee kan winnen. Na een intense training is de Cottonee er klaar voor om de andere Cottonee weer te benaderen, maar Team Rocket verschijnt op het toneel en steelt alle Cottonee stelen en stopt ze in een enorme zak! Met de hulp van Pikachu’s Bliksemstraal worden de Cottonee uit de zak bevrijd en overweldigen ze Jessie, James en Meowth. Team Rocket gaat er vandoor en zweert dat ze op een andere dag terug zullen vechten. Cottonee’s zelfvertrouwen is gegroeid en hij besluit de andere Cottonee te benaderen, hoewel maar liefst vijf andere Cottonee hetzelfde van plan zijn. Gelukkig is de training van onze helden niet voor niets geweest en de twee Wattenbol Pokémon komen samen en zweven weg op de Diamant Bries om samen nog lang en gelukkig te leven!

Onze helden zijn onderweg naar Nimbasa City en liggen te slapen als ze plotseling wakker worden door een vliegende UFO. De volgende dag stoppen ze bij een café om de gebeurtenis van de afgelopen nacht te bespreken en horen daar van de mensen een verhaal over een postbode die ooit een visioen van het heelal kreeg en dat ze toen verhaal zijn gaan halen bij Professor Icarus. Niemand weet iets af over de wetenschapper, (een Ufo specialist) maar als ze hem confronteren krijgen ze last van een hevige hoofdpijn. Cilan, die een enorm fan van de professor en zijn werk is, besluit dat ze zelf naar zijn huis en laboratorium moeten gaan om het mysterie uit te zoeken. Terwijl ze onderweg een brug overgaan, krijgen ze een visioen uit de toekomst en weten ze van te voren dat de brug niet deugd. Intussen, heeft Team Rocket in het geniep de Pokémon Elgyem geobserveerd. Elgyem woont bij de professor en Team Rocket wil hem vangen.Onze helden arriveren bij het huis van de professor en als Cilan uitlegt dat hij een groot fan van Icarus is, ontdooit de professor en nodigt hen uit om binnen te komen. Als hij hen zijn theorie over donkere materie uitlegt en vertelt dat de UFO die ze hebben gezien zelf heeft gebouwd, krijgen ze plotseling een visioen te zien van de exploderende schotel! Als ze zich naar het lab haasten, ontmoeten ze Elgyem en komen ze er achter dat Elgyem en de professor samen in het huis wonen. Ze horen ook hoe ze elkaar hebben ontmoet. Het blijkt dat Elgyem verantwoordelijk is voor alle visioenen die ze hebben gezien. Plotseling verschijnt een vermomd Team Rocket op het toneel en wil Elgyem vangen. Er ontstaat een hevig gevecht en onze helden komen als overwinnaars uit de strijd, maar niet voordat Team Rocket de vliegende schotel van de professor verwoest. De professor belooft dat hij een nieuwe schotel zal bouwen om Elgyem terug naar de ruimte te brengen. Maar het blijkt dat Elgyem hier gelukkig is. Uiteindelijk nemen onze helden afscheid van de professor en Elgyem en gaan ze weer op weg naar Nimbasa City.

Terwijl onze helden op weg zijn naar Nimbasa City, stoppen ze voor de lunch en bereidt Cilan zoals gewoonlijk een maaltijd. Maar omdat Ash en Iris te wild spelen belandt de lunch op de grond en vraagt Cilan hen om ergens anders te gaan spelen, terwijl hij een nieuwe lunch bereidt.

Intussen Is Ash’s rivaal Trip bezig met het vangen van een Palpitoad, maar Ash gooit roet in het eten en Trip’s moeite is tevergeefs. Als Trip zich realiseert dat Iris uit het Drakendorp komt en een Drakenmeester wil worden, daagt hij haar uit voor een gevecht. Maar Ash wil met hem vechten, en dat zou dan voor de derde keer worden. Ash haalt Trip over om met hem een Drie-tegen-drie Gevecht te houden. Trip Haalt zijn Servine te voorschijn en Ash zijn Snivy ( tot grote verbazing van Trip en Iris) Maar Snivy wordt verslagen op het moment dat Trip Ash vertelt over de Unova Kampioen, Alder, die Trip toen hij nog een kleine jongen was heeft ontmoet. Alder heeft hem beloofd dat hij Kampioen zal blijven, totdat Trip groot genoeg zal zijn om hem uit te dagen.

Trip haalt zijn Timburr tevoorschijn en Ash zijn Oshawott. We ontdekken de reden waarom Oshawott niet goed is in Waterstraal: omdat hij zijn ogen dichthoudt tijdens die zet! Maar een laatste Messchelp van Oshawott zorgt ervoor dat ze gelijk komen te staan. Als laatste neemt Trip’s Vanillite (die als IJssoort Pokémon, Iris de stuipen op het lijf jaagt) het op tegen Ash’s Tepig. Na een hevig gevecht, eindigt de match in gelijkspel! Trip realiseert zich dat het bizarre spel van Ash niet zijn stijl is en vertrekt. Plotseling herinneren Ash en Iris zich dat ze Cilan hebben achtergelaten met de lunch en rennen ze snel naar de lunchplek, waar de Pokémon Deskundige treurig met het eten aan het wachten is...

Onderweg naar Nimbasa City stoppen onze helden voor de lunch aan een prachtig meer. Ash besluit om wat speciale training te doen met Oshawott. Het doel daarvan is om Oshawott te helpen om zijn ogen open te houden onder water. Cilan bereidt de lunch en Iris let op de rest van de Pokémon terwijl die spelen.

Plotseling komt Scraggy een groep Foongus tegen en maakt ze kwaad door een van hen een kopstoot te geven. Zij vallen dan de Pokémon van onze helden aan met gifsporen. Pikachu en de anderen worden daar ziek van.

Iris weet dat Remeyo Wier hen zal genezen van het gif, dus Ash, Cilan en Oshawott gaan erop uit om het te zoeken. Het groeit in smalle spleten op de bodem van het meer. Maar alweer is Oshawott bang om zijn ogen open te doen onder water. Opeens worden zij aangevallen door een groep Tympole, die onder leiding staat van een krachtige Palpitoad! Oshawott worden meerdere malen aangevallen en Ash herinnert hem eraan om zijn ogen open te doen. Zodra Oshawott dat doet, valt hij de Tympole aan en vertrekken die angstig.

Maar dan verschijnt Stunfisk, de vriend van Palpitoad ten tonele en valt Ash en Oshawott aan. Het lijkt nu voor hen onmogelijk om ooit het Remeyo Wier nog te kunnen plukken. Maar ook nu weer, bedenkt Oshawott dat hij zijn ogen open moet doen onder water en door een krachtige Waterstraal komt alles goed! Ash besluit om Palpitoad te vangen, en Cilan besluit om Stunfisk te vangen. Uiteindelijk kan Oshawott makkelijk het Remeyo Wier plukken en brengt hij het naar Iris, die het medicijn maakt waarmee alle Pokémon van de helden genezen worden. En zo hebben onze helden twee nieuwe vrienden aan de familie toegevoegd en heeft Oshawott zijn grootste angst overwonnen!

Terwijl onze helden hun reis naar de Nimbasa City Gym vervolgen, komen zij plotseling een “Drakenkraker’ tegen die Georgia heet. Zij daagt Iris en Axew uit tot een Gevecht. Geobsedeerd als ze is met het verslaan van Draaksoort Trainers en Pokémon die uit het Drakendorp komen, haalt Georgia haar Beartic tevoorschijn. Iris en Axew worden snel verslagen en dan vraagt Georgia welke andere Draaksoorten Iris heeft. Die heeft er echter niet meer. Iris haalt Excadrill tevoorschijn en het gevecht begint, maar een krachtige Steenknal van Beartic verslaat Excadrill, die zich snel terugtrekt in de Heremiet modus.

Het blijkt dat Iris en Excadrill lang geleden met dezelfde zet waren verslagen en dat Excadrill zich sindsdien schuil houdt. Maar wanneer Iris hier verder over praat met Cilan en Ash, ontdekt zij dat zij misschien niet genoeg rekening heeft gehouden met de gevoelens van Excadrill tijdens het vechten en belooft zij in tranen om dat goed te maken. Er volgt een training die de hele nacht duurt. De volgende dag vraagt Iris Georgia om een rematch en Excadrill vecht als een herboren Pokémon en biedt heftig weerstand aan Beartic. Het eindigt in gelijkspel, maar een dolgelukkige Iris en Excadrill zijn nu zo hecht als in vroeger tijden en misschien nog hechter dan ooit!

Wanneer onze helden onderweg naar Nimbasa City lunchen, stormt er plotseling een Roggenrola op hen af en verpest hun smulpartij. Ash besluit om hem te vangen en doet een paar pogingen met Tepig en Oshawott. Die mislukken en hij moet met ze naar een Pokémon Center. Al deze tijd lijkt de Roggenrola ze iets belangrijks te willen vertellen. Onze helden hebben echter haast, negeren de Roggenrola en laten hem achter.

Bij het Pokémon Center komen we erachter dat de waterbron die zich in een grot bevindt, op mysterieuze manier is stilgevallen. Samen met een vertegenwoordiger van het waterbedrijf, Garrison, gaan onze helden naar de grot voor onderzoek. Ondertussen zien we dat Team Rocket verantwoordelijk is voor de blokkade van de watertoevoer. Zij hebben ook de Roggenrola gevangen die in de grot leven, om een nieuw wapen dat Dokter Zager heeft ontworpen in werking te stellen. Dit wapen concentreert de kracht van de energie kern van de Roggenrola. Onze helden zijn woedend en vechten tegen Jessie, James en Meowth en al snel worden de Roggenrola bevrijd. Garrison zorgt dat de watertoevoer wordt gerepareerd in het Pokémon Center. Ash ontdekt dat de Roggenrola die ze eerder hadden ontmoet met hem mee wil. Er volgt een gevecht tussen Roggenrola en Tepig, met als resultaat dat Roggenrola de nieuwste Pokémon vriend van Ash is!

Onze helden zijn onderweg naar Nimbasa City verdwaald in dichte mist en komen een ronddwalende Audino tegen, die in een soort trance lijkt te zijn. Plotseling worden ze aangehouden door Agent Jenny en twee kinderen, Doyle en Christie, die hen beschuldigen van betrokkenheid bij de recente verdwijningen van meerdere Audino.

Na inlichtingen te hebben ingewonnen, bekent Jenny dat ze onschuldig zijn en wordt onze helden verteld wat er aan de hand is, waarna zijn hulp aanbieden. Ze verdelen zich in drie groepen en beloven de verdwenen Audino te vinden en de drie overgebleven Audino in het gebied te bewaken. Dat doen ze door zendertjes/mobiele telefoons te gebruiken om in contact te blijven. Plotseling komen de overgebleven Audino in beweging en gaat iedereen achter ze aan.

Als het signaal verstoord raakt, heeft Cilan een theorie dat iemand misschien de Audino aanstuurt, die er op mysterieuze wijze vandoor gaan, en de zendertjes stoort.

Met de hulp van de Roggenrola van Ash, worden ze naar een verlaten windpark geleid, waar we ontdekken dat Team Rocket achter dit alles zit. Zij gebruiken een machine die psycho golven uitzendt, waardoor de Audino naar hen toe geleid worden, om te worden gebruikt voor een nieuw type radar dat Dokter Zager ontwikkelt.

Een heftig gevecht barst los en Team Rockets machine wordt vernietigd, waarbij de gevangen Audino vrijkomen.

Echter, wanneer Jenny Team Rocket wil arresteren, ontsnappen zij. Maar de Audino zijn nu vrij en veilig en onze helden vervolgen weer hun reis naar Nimbasa City.

Tijdens hun reis naar Nimbasa City, brengen onze helden een bezoek aan hun oude vrienden, Professor Juniper en Doctor Fennel. Fennel staat op het punt om haar ongelofelijke restaureermachine te gebruiken om uit een Veer Fossiel, de oeroude Pokémon Archen tot leven te wekken. En professor Juniper is bezig met een onderzoek over de oorsprong van Pokémon. Het experiment is een succes en ze wekken Archen tot leven, maar hij is erg geërgerd, maar als hij kalmeert zien we dat Archen ( de stamvader van alle Vliegsoort Pokémon) niet kan vliegen. Dit geeft onze helden en de professors de kans om te zien hoe een Vliegsoort leert vliegen! Archen doet een paar vliegpogingen en evolueert uiteindelijk in Archeops. En dan kan hij wel goed vliegen!

Intussen is Team Rocket bezig met het stelen van de computerdata van de Pokémon restauratiemachine en willen ze ook Archeops vangen. Ze krijgen de data in hun bezit, maar Archeops krijgen ze niet te pakken. We zien en horen Archeops iets roepen en niemand begrijpt waarom, maar plotseling zien we drie andere Archeops, die waarschijnlijk miljoenen jaren op een verborgen plek in Unova hebben geleefd. Archeops voegt zich bij zijn eigen soortgenoten en vliegt met hen mee. En onze helden zwaaien hen uit.

Doctor Zager feliciteert Team Rocket, want zij hebben met succes de Pokémon restauratiedata gestolen….

Terwijl onze helden hun reis naar Nimbasa City vervolgen voor de volgende Gym Gevecht uitdaging van Ash, botsen ze per ongeluk tegen hun vriendin Bianca, die haastig op weg is om zich in te schrijven voor een vis wedstrijd. Hoewel ze nooit eerder heeft gevist, komen we erachter dat Cilan dat wel heeft, en dat hij ook nog eens een Sportvis Deskundige is! Het is duidelijk dat Cilan een expert in vissen is (zoals in zoveel dingen) en we ontdekken ook dat al onze helden samen met hem mee zullen doen aan de wedstrijd.

Ondertussen blijkt dat de wedstrijd in het geheim is overgenomen door niemand minder dan Team Rocket, dat van plan is om alle Watersoort Pokémon te stelen die de deelnemers zullen vangen en de beste daarvan aan de baas te geven. Nadat Cilan een enorme Basculin heeft gevangen en Bianca ondertussen verwoed probeert om een nog grotere Frillish te vangen, besluit Team Rocket om er in alle commotie vandoor te gaan met alle Vis Poké Ball. Onze helden hebben ze door en er ontstaat een heftig gevecht. Met hulp van hun raket jetpacks, lukt het Jessie, James en Meowth om te ontsnappen, maar zonder de gestolen Vis Poké Ball, dankzij Frillish, die ze allemaal bevrijdt.

De wedstrijd wordt afgelast vanwege Team Rockets stommiteiten en onze helden nemen afscheid van Bianca, waarna hun reis naar Nimbasa City wordt vervolgd.

Onze helden zijn weer op weg naar Nimbasa City en hebben een trailer gezien van een film die ze allemaal willen zien. Plotseling verschijnt de hoofdrolspeelster van de film! Het blijkt dat het personage een Zorua is en samenwerkt me een aankomend, jonge filmmaker genaamd Luke. Omdat Zorua zich in ieder persoon of Pokémon kan transformeren speelt hij alle rollen in Luke’s film. Maar Zorua wil alleen maar de rol van de prinses spelen. Onze helden bieden aan de rest van de rollen te spelen en ze beginnen met filmen!

Ash wordt de ridder, die Prinses Yuria (gespeeld door Zorua en gedubd door Iris) moet redden uit de handen van Kapitein Cilan. De scènes worden allemaal succesvol gefilmd. Intussen heeft Team Rocket het op Zorua (een zeldzame Pokémon) gemunt en wil hem vangen. Tijdens de laatste scène duiken Jessie, James en Meowth opeens op en wordt Zorua gevangen genomen! Maar Cilan (die ook een Film Deskundige is) stelt voor dat Luke blijft filmen en dankzij Cilan’s improvisatietalent wordt de nederlaag van Team Rocket een spannend slot. Het publiek is laaiend enthousiast, maar meneer Matthews, de bioscoopmanager, zegt dat de vechtscènes wel wat spannender hadden gemogen. Daarom besluiten Luke en onze helden mee te doen aan het Nimbasa Gevechtstoernooi! En dus gaan onze helden samen met hun filmvrienden, Luke en Zorua op weg naar Nimbasa City!

Al snel na aankomst in, wat onze helden dachten dat Nimbasa City was, maakt hun vriend Luke duidelijk dat ze nu in Nimbasa Town zijn, waar het Pokémon “Don” Gevechtstoernooi plaatsvindt. Het is vernoemd naar Don George, hoofd van de Pokémon Vechtclub, die het evenement sponsort, het belooft zeer spannend te worden. Een voor een komen vrienden rivalen van onze helden opdagen om ook mee te doen. Bianca, Georgia, Burgundy, Stefan (waarvan nog steeds niemand de naam goed kan uitspreken) en Trip, voegen zich bij Ash, Iris, Cilan en Luke. Als iedereen zich heeft ingeschreven voor het evenement, wordt de indeling bekend gemaakt en kan het toernooi van start gaan.

Drakenkraker Georgia gaat als eerste, samen met haar Beartic en zij winnen. Dino (de winnaar) en Omega, vechten als tweede, Antonio (de winnaar) en Emmanuel zijn als derde en vervolgens vinden we Ash tegen Burgundy. Zoals altijd vol zelfvertrouwen tikt Burgundy Ash op zijn vingers omdat hij niet al zijn Pokémon heeft vervangen, maar onze held en zijn Palpitoad wint! We verlaten de actie op het moment dat Cilan klaarstaat om tegen Trip te vechten. Ondertussen is Team Rocket stilletjes aangekomen in Nimbasa City, en bereidt zich vol vertrouwen voor op hun volgende opdracht.

Terwijl het Nimbasa Pokémon Gevechtstoernooi (oftewel Club Gevecht) aan de gang is, zien we dat Cilan het tegen Trip moet opnemen tijdens de eerste ronde. Trip heeft wel eens tegen Cilan’s broer, Chili, gevochten in de Striaton City Gym. Hoewel Burgundy, Cilan’s rivale, hoopt dat Cilan gaat verliezen en Trip en zijn Gurdurr erg goed vechten, wint Cilan net zoals Ash, Iris en Luke de eerste ronde. Daarna is het tijd voor de tweede ronde! Ash en Snivy moet het tegen Georgia en haar Pawniard opnemen. Georgia is zelfverzekerd en verwaand en laat zien dat ze een waardige tegenstander is. Iris, Cilan en Stefan (die graag wil dat Ash wint zodat hij zelf tegen hem kan strijden) moedigen Ash langs de zijlijn aan. Het gevecht gaat alle kanten op, maar tegen het einde lijkt het er op dat Georgia en haar Pawniard iets sterker zijn…

Terwijl de tweede ronde van het Nimbasa Pokémon Club Gevecht verder gaat, zien we het gevecht van Ash en Snivy tegen Georgia en Pawniard. Pawniard is sterk, maar kan niet tegen Snivy’s Bladmes en Bladstorm op. Ash wint en is de eerste deelnemer die doorgaat naar de halve finale.

Nadat Dino ook door is, moet Cilan het tegen Luke opnemen. Luke is onzeker over zijn vaardigheden, maar doordat Cilan hem advies geeft wint Luke met Larvesta! De volgende zijn Stefan en zijn nieuwe Pokémon Sawk, tegen Iris en haar Emolga. Sawk is meedogenloos en sterk en begint een heftig en agressief gevecht door keer op keer aan te vallen. Iris is gefrustreerd en besluit een zet die alleen Emolga kan te gebruiken… wat resulteert in een versperring van Verleidingen. Sawk wordt overweldigd en raakt verlamd. Tijdens de halve finale moet Iris tegen Dino en Ash tegen Luke vechten. Dat kan niet anders dan spannend worden!

Terwijl het Nimbasa Pokémon Club Gevecht in volle gang is, heeft Ash zichzelf verzekerd van een plek in de laatste ronde. Iris en Axew (die voor het eerst aan een toernooi deelneemt) moeten tegen Luke en zijn Golett. Er volgt een heftig gevecht en het lijkt erop dat Golett zal winnen wanneer Axew op de loop gaat voor de krachtige aanvallen van Golett. Maar plotseling zien we dat Axew de nieuwe zet, Woede, heeft geleerd, terwijl Axew verwoed terugvecht en Golett verslaat.

Dan volgt de laatste ronde en Ash en Pikachu staan tegenover Iris en Excadrill. Tegelijkertijd heeft Burgundy Cilan uitgedaagd tot een Deskundigen Gevecht, maar Burgundy realiseert zich als snel dat de techniek van Cilan gewoon te overweldigend is en geeft haar verlies toe. Ondertussen gooien Pikachu en Excadrill alles in de strijd en het duurt niet lang voordat ze uitgeput raken. Hoewel zowel Ash als Iris vastbesloten zijn om te winnen, zorgt een laatste Focus Dreun van Excadrill ervoor dat Iris wint: het gevecht en het toernooi!

Er is veel applaus voor Iris en ook voor Ash, een waardering voor de vastberadenheid van beide partijen. En zo wint Iris de felbegeerde “Eerste Klas Drifveil Verenset”, waaronder Gezondheid, Kracht, Verzet, Genie, Pienter, Vlugge en Mooie Veer!

Onze helden zeggen hun vrienden gedag en gaan door naar Nimbasa City en het volgende Unova Gym Gevecht van Ash.

Onderweg naar Nimbasa City komen onze helden tot hun verbazing Meowth tegen, die gewond is. Ze ontdekken later dat Meowth is ontslagen bij Team Rocket en besluiten dat hij het beste met hen mee kan gaan, zolang Meowth zich goed gedraagt.

Kort daarop wordt Axew weggelokt en gevangen door een Scrafty (de geëvolueerde vorm van Scraggy) die dreigt dat ze Axew nooit meer zullen zien, als onze helpen Scrafty niet helpen met een gevecht (zonder duidelijk te maken tegen wie of waarom Scrafty wil vechten).

Meowth biedt aan om te onderhandelen en gaat met de Scraggy van Ash naar een schuur waar Axew wordt vastgehouden, terwijl Ash, Pikachu en Snivy achterom gaan om Axew te bevrijden.

Maar als Scrafty Ash uitdaagt tot een gevecht, neemt Ash de uitdaging aan en verslaat Scrafty. Plotseling barst Scrafty in tranen uit en met Meowth als tolk, ontdekken we dat de woonplek van Scrafty is afgepakt door een Mandibuzz. Als Mandibuzz hiermee wordt geconfronteerd, barst hij ook in huilen uit! Dan ontdekken we dat Mandibuzz uit huis is geschopt door een andere Mandibuzz omdat hij het eten van de ander had opgegeten, zonder toestemming te vragen. Meowth stemt ermee in om met de uitgezette Mandibuzz mee te gaan om bij zijn vriend om vergeving te vragen, en weer in te mogen trekken en de uitstekende onderhandelingskwaliteiten van Meowth resulteren in een deal! De twee Mandibuzz zijn weer vrienden, Scrafty heeft zijn plekje terug en onze helden vervolgen hun weg naar Nimbasa City, maar nu, met Meowth als reisgenoot!

Terwijl onze helden hun reis vervolgen naar Nimbasa City, waar Ash de Gym voor zijn vierde Unova Gym Badge wil uitdagen, komen ze een Purrloin tegen. We zien eerder dat deze Purrloin voedsel steelt van Tranquill, die op hun beurt erg nijdig worden. Hoewel Meowth helemaal voor de charmes van de Pokémon valt, heeft Cilan vroeger zo’n nare ervaring met een Purrloin gehad, dat hij er niet eens over wil praten. Ook Oshawott en Iris vinden Purrloin onweerstaanbaar. Purrloin vertelt onze helden (via Meowth die dat natuurlijk vertaalt) dat er een goede vriend in een grot zit opgesloten en smeekt hen te komen helpen. Cilan gelooft Purrloin niet en blijft achter, maar iedereen besluit Purrloin te helpen. Ze komen er later achter dat ze in de val zijn gelopen, en Purrloin ze heeft meegelokt om Ash’s rugzak met voedsel te stelen. Intussen is Purrloin’s eigenaresse Misha bij Cilan en vertelt ze hem dat zij de eigenaresse van Purrloin is. Ze gaan naar de grot en zien dat de rest van de helden door een soort drijfzand wordt opgeslokt. We ontdekken dat Misha Purrloin niet heeft verlaten (zoals Purrloin dacht). Hij rent naar de troep Tranquill waar hij eerder voedsel van heeft gestolen. De Tranquill redden dankzij Purrloin onze helden. Als iedereen veilig is ontdekken Meowth en Oshawoth tot hun grote verdriet dat Purrloin geen vrouwtje is. We verlaten onze helden en zien dat James en Jessie, zonder Meowth, bezig zijn met een geheime missie.

Terwijl onze helden zich klaarmaken voor de avondmaaltijd, onderweg naar Nimbasa City, komt Meowth een Beheeyem tegen, die Meowth brandhout aanbiedt. Wanneer Meowth Beyeehem meebrengt om voor te stellen aan de anderen, beweert Beheeyem dat hij elke wens die ze maar hebben in vervulling kan laten gaan. Maar, nadat Cilans wens om een mooie kamer in een hotel te krijgen, middenin het bos, op wonderbaarlijke manier is vervuld, begrijpen we dat Beheeyem in werkelijkheid de Pokémon is van Leon, de Droom Dief, die heimelijk van plan is om de Pokémon van onze helden te stelen door ze in een van Beheeyem’s dromen te stoppen.

Agent Jenny is zich bewust van wat er zich werkelijk afspeelt, en samen met haar partner Duosion verschijnt zij vanuit de Afdeling Psycho Misdaden in de droom van onze helden, dankzij de Psycho krachten van Duosion. Jenny vertelt hen dat ze aan Leon en Beheeyems droom kunnen ontsnappen als ze zich realiseren dat ze echt in een droom zitten en er dan uit wakker worden. Onze helden kunnen al hun Pokémon wakker maken, maar met Meowth lukt dat niet makkelijk.

Verschillende Bliksemstralen van Pikachu om Meowth wakker te maken, blijken zinloos, totdat Cilan een paar hete, door Beheeyem gemaakte, Figy Bessen in Meowths mond stopt, waardoor die wakker schiet!

Nu iedereen wakker is, vinden ze een laatste nooduitgang uit hun droom, waarna een krachtige en kwade Furie Slag van Meowth Leon laat verdwijnen.

Ondertussen, terwijl onze helden afscheid nemen van Agent Jenny, ontdekken we dat Jessie en James in het geheim een metro trein laten vertrekken via afstandsbediening en treffen we twee zeer bezorgde metro verkeersagenten aan die zich afvragen wat ze moeten doen om een mogelijke ramp te voorkomen.

Terwijl onze helden hun reis naar Nimbasa City vervolgen, komen we er achter dat er een grote, gevaarlijke storm is geweest, waardoor een Cubchoo is verdwaald. Als ze de verdwaalde Cubchoo vinden en hem naar de groep nijdige Beartic willen terugbrengen, vertelt de verdrietige Cubchoo hen (met Meowth als vertaler) dat hij door de storm zijn vrienden is kwijtgeraakt, maar hij zich verder niets meer kan herinneren. Een bergopzichter genaamd Cliff (en Mienfoo, zijn partner) informeert hen dat er twee groepen Beartic zijn. Beartic en Cubchoo leven op de berg en de mysterieuze, nijdige Beartic die ze hebben ontmoet horen bij een andere groep. Als ze de verdwaalde Cubchoo naar zijn vrienden willen terugbrengen, komen ze nog meer nijdige Beartic van de andere groep tegen en door Beartic’s sterke aanvallen worden Meowth, Cubchoo en verscheidene andere Pokémon van onze helden gescheiden. Als Meowth op zoek naar voedsel gaat voor de hongerige Pokémon, vindt hij een hoopje bessen. Maar de bessen zijn van de hongerige en nijdige Beartic van de andere groep. Meowth probeert tevergeefs met hen te onderhandelen. Gelukkig besluiten de groepen Beartic met elkaar samen te werken en wordt iedereen gered. Cubchoo wordt herenigd met zijn vrienden en de twee groepen Beartic sluiten vrede met elkaar. Onze helden vervolgen hun reis naar Nimbasa City. Intussen begint het sinistere plan van Jessie en James vorm te krijgen. Ze zijn iets van plan met het ondergrondse systeem van Nimbasa City. Ingo en Emmet, de Metro Bazen, zijn vastbesloten om dit tot de bodem uit te zoeken. Jessie en James zijn er zeker van dat hun plan zal slagen, hoewel Dr. Zager hen waarschuwt uit hun buurt te blijven…

Terwijl Meowth en onze helden in Nimbasa City arriveren, staan Jessie en James, onder leiding van Dr. Zager, op het punt een sinister plan uit te voeren. In het opmerkelijke Pokémon Center overtuigt Meowth hen er van om al hun Pokémon een massage te laten ondergaan. Deze massage vindt plaats in de beveiligde Pokémon Center Kluis. Het blijkt dat Meowth nog steeds bij Team Rocket hoort en het reizen met onze helden slechts een manier voor Meowth was om in de Kluis te komen en alle Pokémon te stelen!

Intussen hebben de Metro Bazen van Nimbasa, Ingo en Emmet, het mysterie omtrent de Spooktrein onderzocht. Er gebeuren daarna een paar gebeurtenissen, die door Dr. Zager en Team Rocket worden uitgevoerd en chaos in Nimbasa City veroorzaken. Maar Cilan is in staat een overzicht van de situatie te krijgen: De Spooktrein, de vermiste Poké Ball in het Pokémon Center, de Nimbasa City’s ophaalbrug die niet meer omlaag kan. Het hoort allemaal bij Team Rocket’s plan om heel veel Pokémon, inclusief die van onze helden, te stelen. Cilan, Ash en Iris gaan met een postwagen, die via een spoor van het postkantoor van Nimbasa City loopt achter de Spooktrein aan. Maar onze helden, Ingo en Emmet staan perplex als er opeens heel veel LokSpooktreinen opduiken! Zullen ze in staat zijn hun Pokémon te redden en Nimbasa City voor een ramp te behoeden?!

Terwijl het duistere plan van Team Rocket om alle Pokémon van het Nimbasa City Pokémon Center te stelen in noodtempo wordt uitgevoerd, worden zij op de hielen gezeten door onze helden en de Metro Bazen Ingo en Emmet. Obstakel na obstakel wordt op hun weg gegooid, totdat Cilan zich herinnert dat de Spooktrein ooit bovengronds moet komen en naar het rangeerterrein van Anville Town moet gaan, wat precies het geval is.

Ondertussen proberen de gevangen Pokémon van onze helden te ontsnappen uit de Spooktrein. Pikachu, Snivy, Excadrill, Roggenrola, Tepig en Pansage bundelen hun krachten en weten zichzelf uit hun kooi te bevrijden.

Met hulp van onze helden en Ingo’s Chandelure, lukt het ze om de koppeling los te maken die hun treinstel verbindt aan dat van Team Rocket. Tenslotte kunnen zelfs de inspanningen van Dokter Zager niet voorkomen dat de plannen van Team Rocket worden verijdeld.

Hoewel Pikachu woedend is over het feit dat Meowth al die tijd deel uitmaakte van Team Rocket, zegt Ash tegen Meowth dat hij hun gezamenlijke reis naar Nimbasa City heel plezierig heeft gevonden. Team Rocket en Dokter Zager ontsnappen in hun helikopter, en zweren dat ze terug zullen komen om te vechten.

Ash richt zijn blik op zijn Gym Gevecht in Nimbasa City, waarbij hij zal strijden tegen de Nimbasa gym Leader Elisa!