Les rebelles sont chargés de voler une marchandise par Cikatro Vizago, un chef de la pègre de Lothal. Durant le vol, ils récupèrent deux droïdes, R2-D2 et C-3PO. Mais l'Empire, avec l'agent Kallus, les retrouvent et les rebelles sont obligés de détruire la marchandise pour éviter qu'elle ne tombe entre de mauvaises mains.

Afin de réconcilier Ezra et Zeb, qui ne cessent de se disputer, Hera les envoie en mission à la recherche d'un fruit rare, le meiloorun. Alors qu'ils trouvent enfin une caisse de fruit, l'Empire leur tombe dessus. Zeb est contraint de voler un chasseur TIE et va, avec l’aide d’Ezra, délivrer des fermiers emprisonnés par l’Empire.

Kanan décide de partir sauver le maître Jedi Luminara Unduli retenue par les impériaux dans une prison fortifiée sur Stygeon Prime, avec l'aide d'Ezra. Alors qu'ils parviennent à la retrouver, ils tombent dans un piège tendu par l'Inquisiteur.

Ezra infiltre l'académie Impériale de Lothal afin de récupérer dans le bureau de l'agent Kallus un décodeur menant à une cargaison secrète. Dans un lieu rempli d'ennemis, le jeune rebelle trouve un allié en un autre cadet impérial, Zare Leonis...

Au cours d'une mission de Ravitaillement, Le Phantom se retrouve à court de carburant, Laissant Hera et Sabine piégées sur une Base abandonnée lors de la Guerre des Clones ... mais elles ne sont pas si seules que ça ...

Après avoir fait des ravages lors de la Journée de l’Empire – l’événement annuel célébrant la création de l’Empire -, l’équipage du Ghost rencontre un réfugié Rodien. Celui-ci a bien connu les parents d’Ezra et le jeune homme espère en savoir plus sur ce qu’ils sont devenus grâce à lui. Kanan, lui, n’a qu’un seul objectif : faire évader ce réfugié de Lothal et ainsi protéger les informations capitales qu’il détient.

Alors qu'il devient un membre de plus en plus important de l'équipe, Ezra fait face à l'un de ses plus gros challenges.

Un mauvais jeu avec une nouvelle connaissance force l'équipage du Ghost à transporter une cargaison inhabituelle.

Lors d'un entraînement, Ezra a une vision du groupe rebelle avec le sénateur Gall Trayvis. Peu après, ce même sénateur leur propose un rendez-vous sur Lothal. Une fois sur place, ils tombent tous dans un piège de l'agent Kallus.

Le Grand Moff Tarkin se rend en personne sur Lothal pour superviser la traque de Kanan et sa bande. Pendant ce temps, les rebelles prévoient de pirater l'Holonet Impérial pour émettre un message à tous les habitants de la planète.

Après avoir échoué à trouver où Kanan est détenu, Hera est sollicité par Fulcrum afin de mettre l'équipage du Ghost hors de danger en se cachant. Contre les ordres d'Hera de laisser Kanan, Ezra conçoit un plan pour le sauver.

L'équipe entreprend de délivrer Kanan, prisonnier de l’inquisiteur sith. En tentant de s'échapper du vaisseau de l'Empire, ils sont secourus par plusieurs vaisseaux rebelles. C'est alors qu'ils rencontrent leurs sauveurs : le sénateur Bail Organa et Ahsoka Tano.