Después de una pelea con los Maestros del Mal, los miembros: Escarabajo, Goliat y Screaming Mimi, los Vengadores aprenden lo que es trabajar como un equipo nuevo en su lucha contra unos nuevos y mejorados Adaptoides que fueron desarrollados por el Científico Supremo de AIM. Los adaptoides se desarrollaron a través de una combinación de la tecnología Super-Adaptoide y un poco de metal desconocido del espacio que encontraron, ¿al saber que o quién es?.

Después de absorber los restos del metal del espacio utilizado por adaptoides del científico Supremo, Ultron está de vuelta y planea reemplazar a la humanidad con los robots a partir de duplicados de los Vengadores conocidos como los Ultimates. Ahora los Vengadores deben trabajar de una manera que ellos pueden derrotar a los Ultimates mientras que deben defenderse de Ultron.

Iron Man y Black Widow van a encontrar al Capitán América que no se encuentra en la Torre de los Vengadores. En Europa, el Capitán América lucha para rescatar a Bucky que ha sido capturado por el Barón Heinrich Zemo, el científico de HYDRA. Lo que realmente sucede es que el Capitán América ha sido hipnotizado por el Barón Helmut Zemo en la búsqueda del laboratorio de su padre para que pueda encontrar los dos sueros super-soldados que perfeccionó.

Hawkeye debe defender la Torre de los Vengadores del Barón Zemo que ha tomado a los Maestros del Mal: Escarabajo, Fixer, Goliath, Moonstone y Screaming Mimi bajo su comando.

Los Vengadores luchan para detener las nuevas fábricas de armas de Justin Hammer, pero son a la vez ayudados y obstaculizados por un nuevo equipo de héroes misteriosos conocidos como los Thunderbolts, desde que ayudaron a detener al simuldroide, Hombre creciente.

Al sospechar sobre los Thunderbolts, después de una pelea con el espía Klaw, Hawkeye descubre que ellos son en realidad, el Barón Zemo y los Maestros del Mal, usando un dispositivo que robaron de Industrias Stark para disfrazarse en un plan bajo brillo como los Vengadores. Cuando Hawkeye les dice a los otros Vengadores de esto, el resto de los Thunderbolts deben decidir si deben seguir trabajando con Zemo o ayudar a los Vengadores para detenerlo.

En Halloween, el Doctor Extraño va con Iron Man, Hulk y Thor por ayuda cuando los Seres Mindless y demonios alados de la dimensión oscura aparecen en la Tierra. Cuando Dormammu aparece brevemente cerca del Reactor ARK de Industrias Stark, se las arregla para robar el Ojo de Agamotto del Doctor Extraño. Ahora Iron Man y el Doctor Extraño deben dejar de lado sus diferencias en la ciencia y la magia con el fin de recuperar el Ojo de Agamotto y derrotar a Dormammu antes de que haga su plan para conquistar la Tierra y otras dimensiones.

El antiguo ayudante del laboratorio de Bruce Banner, Igor Drenkov, conduce a su grupo llamado los SteelCorps en una lucha contra los Vengadores y utiliza un arma de robar la energía gamma en Hulk. Ahora sin poderes, Bruce tiene que mostrar a los otros Vengadores que todavía su ex-compañero, Igor Drenkov que planea utilizar la energía gamma robada para convertirse en el héroe que quería ser.

Cuando la gente del pueblo de Maple Falls se asustan por la aparición repentina de Alphas Primitivos de una nave estrellada, el intento de los Vengadores para ayudarlos a ellos por ponerse en conflicto con los Inhumanos: Black Bolt, Medusa, Gorgon, Karnak, Lockjaw y Seeker. Mientras que Hulk y Lockjaw trabajan para obtener el cristal Terrigena para un dispositivo que ayudará a deshacerse de la niebla Terrigena que conducía al locos Alphas Primitivos, los Vengadores y los Inhumanos deben trabajar juntos para hacer frente al emergido recientemente Inhumano, Inferno.

Lockjaw trae a los Vengadores a Attilan cuando la mayoría de la familia real de Inhumanos han sido capturados. Los Vengadores y Black Bolt descubren que Ultron está detrás de la captura de los Inhumanos. Después que Seeker hizo a cambio de fase, Ultron comienza su siguiente plan para eliminar a la humanidad en la que termina usando a Black Bolt como fuente de energía. Ahora los Vengadores deben liberar a los Inhumanos y detener a Ultron antes de que utilice su arma peligrosa en la Tierra.

Capitán América y Iron Man se unen con Inferno y una nueva Inhumana llamada Ms. Marvel cuando lucha contra un robot Ultron callejero. Al mismo tiempo que Inferno y Ms. Marvel en un recorrido por la Torre Stark, terminan de luchar contra el viejo enemigo de Iron Man, El Fantasma, cuyas habilidades inhumanas despertadas, han mejorado sus capacidades de eliminación gradual y tiene planes para robar a F.R.I.D.A.Y., mientras que deshabilita a cada uno de los Vengadores, uno por uno.

Los Vengadores intentan detener a AIM sobre el robo de armas de alta tecnología del futuro, sino de atraer la atención, al señor de la guerra del siglo 30, Kang el Conquistador.

Los Vengadores quedan atrapados en el siglo 30, y deben vencer al señor de la guerra, Kang el Conquistador para encontrar su camino de regreso a su propio tiempo.

Black Widow se encuentra cara a cara con Yelena Belova, que en su determinación de crear el arma definitiva que convierte a Hulk en un Hulk Invernal.

Visión ayuda a los Vengadores en su lucha con el Hombre de Cobalto. Posteriormente, la Visión toma clases de amistad con Thor que lo lleva a Asgard para mostrar cómo sus amigos lo ayudaron a derrotar a Ulik, lobo Fenris, Fafnir y Loki. Después que Ulik lo rompe brevemente, la Visión termina asumido por Ultron hasta que la Visión combate su control suficiente para tomar el control de la armadura Destructor. Cuando Ultron en la armadura Destructor llega a la Tierra, Visión debe ayudar a los Vengadores en derrotar a Ultron.

Como T'Challa habla ante una asamblea, el Capitán América protege el conjunto de Crossbones que ha sido contratado para llevar a cabo por T'Challa. Después de ayudar al Capitán América en sacar a Crossbones, T'Challa hace con el escudo del Capitán América alegando que era propiedad robada. En un intento por recuperarlo, el Capitán América lleva a Iron Man, Thor y Hawkeye a Wakanda para enfrentar a Pantera Negra que afirma que Howard Stark robó el Vibranium para hacer el escudo del Capitán América. Cuando un reensamblado Ulises Klaue consigue el Vibranium, Pantera Negra debe poner sus diferencias a un lado para que él y Dora Milaje, miembro de Aneka para ayudar a los Vengadores en luchar contra Ulises Klaue.

En el set de una película de superhéroes llamado "Ant-Man y los Venganzores", el equipo de Hawkeye y Black Widow con Ant-Man para detener al descontento maestro, Egghead, de la destrucción de Los Ángeles con robots que viven, sensibles con trajes de hombres lava, y el huevo piloto automático de exo-trajes. Mientras tanto, Thor lleva al actor que es la imagen de rey vikingo alrededor para ver lo que era estar en Thor.

Al tratar de recordar las imágenes de su padre por su pintura, el Capitán América se avisó sobre las actividades sospechosas en los muelles. Una vez allí, el Capitán América descubre que el Barón Helmut Zemo ha regresado y ha utilizado la tecnología de Kang el Conquistador para traer a su padre, el Barón Heinrich Zemo desde 1943 hasta la actualidad con el fin de restaurar el honor de la familia Zemo. Durante la batalla entre los Vengadores y los Zemos, Hawkeye, Black Widow y Falcón son enviados a 1943 en el que trabajan con un joven Steve Rogers para hacer una antena que sería una señal de la máquina del tiempo. Al mismo tiempo, los otros combaten al tatara-tataranieto del Barón Heinrich Zemo que ha sido traído desde el año 2099 cuando Helmut comenzó a ser una decepción.

El Presidente ha firmado la Ley de Nuevos Poderes en respuesta a la Niebla Terrigena creando nuevos Inhumanos y Truman Marsh está asignado a ser el enlace de los Vengadores con el gobierno. Mientras tanto, los científicos respaldados por HYDRA entran en una tormenta gamma con una nave espacial robada y se transforman en los U-Foes donde planean hacerse cargo de HYDRA cuando el Barón Strucker no ha regresado.

Después de que Truman Marsh substituya a Hulk con Hulk Rojo, los Vengadores luchan apagando una invasión de los trolls de roca. Después, los Vengadores deben detener al Líder de construir y desencadenar su arma secreta con Tecnología A.I.M., incluso cuando él usa a Ultimo en ellos. Mientras tanto, Hulk había sido colocado en un collar de obediencia y vagabundea a la vez de averiguar qué hacer a continuación.

Ahora que el Líder ha usado su bomba gamma de aceleración de partículas para convertir a Hulk Rojo en "su arma definitiva", los Vengadores deben detener a Hulk Rojo de provocar en un alboroto, después de que el Líder pierde el control de él. En primer lugar, ellos tienen que encontrar a Hulk que acaba siendo asesorado sobre qué hacer por su lado de Bruce Banner.

Cuando Maximus ataca a toda una ciudad, Truman Marsh decide tener a todos los Inhumanos perseguidos y registrados. Sin embargo, cuando se pone Máximus con Inferno enojado, pierde el control de sus poderes y quema todo Attilan. Los Vengadores luego deciden para ayudar a que todos los Inhumanos estén registrados.

Cuando los Vengadores dejan a los Inhumanos en escapar sin estar registrados. Truman Marsh se enoja y los Vengadores salen. Truman Marsh forma entonces un nuevo equipo de Vengadores llamados los Poderosos Vengadores (que consta de Ant-Man, Pantera Negra, Capitána Marvel, Ms. Marvel, Hulk Rojo, Songbird y Visión) para ir a cazar a los Inhumanos. Pero cuando los Vengadores se interponen en el camino, se ven obligados a la batalla. Pero Songbird se une a los Vengadores originales cuando se da cuenta de que esto no es lo que lo que hay que hacer. Los Vengadores son arrestados, pero Black Widow escapa.

Los Vengadores están fuera de la cárcel en La Balsa por Black Widow y que están unidos por Black Bolt y Medusa. Pero todo va mal cuando los discos de registro de control están en la mente de los Inhumanos. Los Poderosos Vengadores luego deciden unirse a los Vengadores originales cuando uno de los suyos se ve obligado a estar registrado. Los Poderosos Vengadores y los Vengadores originales consiguen todo lo solucionado y se van a enfrentar a Truman Marsh, que resulta ser Ultron disfrazado.

La verdad de Marsh sale a la luz, y los Vengadores intentan liberar a los inhumanos y a Iron Man del dominio de Ultrón, pero puede que su única salvación sea Strange.