Jake et Amy se sont passé la bague au doigt et s'envolent maintenant pour leur lune de miel. Ils s'apprêtent à passer un séjour mouvementé dans une station balnéaire mexicaine. Holt a reçu des nouvelles de sa promotion : elles ne sont pas bonnes. le capitaine du 99 a lui aussi besoin de vacances...

Jack et Charles se penchent sur une vieille affaire qu'Hitchcock et Scully avaient tenté de résoudre à leurs débuts, dans les années 80. A l'époque, les deux détectives étaient des stars. Jake veut comprendre ce qui leur est arrivé. Il semblerait que la hiérarchie veuille compliquer la vie du commissariat...

Jack et Gina participent ensemble à une réunion d'anciens élèves, dans le lycée qui a vu naître leurs «vocations» respectives. Ils soldent un vieux compte commun. De retour au commissariat, Charles essaie de donner un coup de pouce à Rosa pour relancer sa vie amoureuse...

Gina, sardonique mais dévouée à sa façon, passe du temps avec chacun de ses collègues, avant son départ programmé du 99. La jeune femme veut créer son entreprise et prendre son envol. En guise d'au revoir, elle laisse derrière elle une impression monumentale...

Terry pense que le voleur de Pontiac est de retour. Mais Jake, quant à lui, ne veut pas croire que son ami ait pu récidiver. Le reste de l'équipe se démène pour que le Shaw's bar reste son quartier général, et ne devienne pas celui des pompiers, qui revendiquent leur primauté sur les lieux...

Jake et Rosa doivent composer avec une mère de famille endeuillée, tandis qu'ils passent et repassent au peigne fin une scène de crime. L'affaire, complexe, leur donne du fil à retordre et les éléments dont ils disposent sont confus...

Jake et Holt se disputent les mérites d'un nouveau recrutement au sein de la 99e circonscription. Le reste de l'équipe tente de faire une percée sur un tout autre front...

Jake et Amy enquêtent sur une affaire délicate. Ils ne peuvent s'appuyer que sur des témoignages contradictoires. Il va pourtant bien falloir qu'ils tranchent pour savoir qui dit la vérité dans ce dossier. Holt, de son côté, devient méfiant quand il apprend que son ennemi juré est mort dans un accident suspect...

Jake aide Amy à naviguer dans la relation compliquée qu'elle a avec son frère, David. Il lui prodigue de précieux conseils. reste à savoir si cela sera suffisant pour faire évoluer la situation. Charles provoque un drame lors d'une mission d'infiltration qui implique Terry et Holt. Il doit réparer son erreur...

Boyle et Peralta semblent être suivis par un homme sur leur terrain d'intervention. L'homme est vêtu de jean de la tête au pied, un détail qui suffit à attirer l'attention des deux policiers. Il déclare être le père biologique de Nikolaj...

Charles présente une nouvelle affaire à Jake : un thérapeute a signalé la disparition soudaine d'un de ses patients. Parallèlement, Holt découvre que Rosa a une nouvelle petite amie, que tout le monde a déjà vue sauf lui. Amy pense avoir reçu par erreur un colis adressé à Terry...

Le commissariat croule sous le travail, du moins Jake et Amy, qui en sont réduits à fêter leur anniversaire de mariage sans quitter l'uniforme. Ils doivent en effet surveiller un patient comateux, à l'hôpital, au lieu de profiter de leur temps libre...

Holt et Jake enquêtent sur une affaire impliquant l'université dans laquelle enseigne Kevin, le mari du capitaine, qui n'a pas l'habitude de mêler vie privée et travail. De retour au commissariat, Terry et Amy emmènent l'équipe déjeuner dehors...

Jake et son équipe tentent d'enrayer les actions d'un hacker qui a pénétré le serveur du 99. Pendant ce temps, Rosa est aux prises avec ses problèmes amoureux. Hitchcock et Scully, plus préoccupés par le contenu de leurs estomacs que par le crime, ont l'ambition de cuisiner des lasagnes parfaites...

Jake, Holt et toute l'équipe tentent de distraire Terry, très stressé à l'approche de son examen de lieutenant. Le 99 décide de déplacer la grande fête annuelle d'Halloween à une nouvelle date, le jour de la fête mexicaine du Cinco de Mayo...

Jake et Charles prennent tous les risques en enquêtant sur un dangereux tueur en série. De son côté, Holt continue de se confronter à son rival, le commissaire Kelly. Terry s'apprête à savoir s'il a réussi ou non son examen pour devenir lieutenant...

A situation désespérée, mesures désespérées. Jake, Holt, Amy, Boyle et toute l'équipe du 99 doivent s'allier avec de vieux ennemis pour espérer venir à bout d'une affaire délicate. Et ils ne le font pas de gaieté de coeur...