Naruto est un jeune orphelin du village de Konoha. Possédant en lui le démon renard Kyûbi qui a ravagé le village au moment de sa naissance et a été scellé en lui, il est rejeté par les autres villageois, et fait de nombreuses frasques pour tenter de se faire remarquer. Il étudie les arts ninjas à l’académie du village, mais est le seul élève qui ne parvient pas à obtenir le grade de genin. Un de ses professeurs, Mizuki décide alors de profiter de son ressentiment pour lui faire voler le rouleau des techniques interdites conservé dans le bureau du chef du village, le Hokage. Parti seul dans la forêt, il parvient à apprendre la première technique du rouleau, le « Multi clonage ». Son autre professeur, Iruka le retrouve, mais ils sont attaqués par Mizuki. Mizuki dévoile à Naruto qu’il est possédé par le démon renard et que c'est pour ça qu’il est rejeté, mais lorsque Naruto comprend qu’Iruka ne le rejette pas et reconnaît sa valeur, il défait Mizuki avec sa nouvelle technique et reçoit son bandeau frontal, signe qu’il est un ninja à part entière.

Konohamaru, petit-fils du 3e Hokage, exprime son désir d’être reconnu indépendamment de son grand-père et décide de suivre Naruto, qui est le seul à avoir osé lui donner une taloche en réponse à ses caprices, au grand désarroi de son professeur particulier Ebisu ; lorsque celui-ci les retrouve, Naruto est en train d’apprendre à Konohamaru la technique avec laquelle il a assommé le Hokage, le « Sexy-Méta » consistant à se transformer en une jeune fille nue et affriolante. Alors qu’Ebisu le défie, Naruto tente d’utiliser le « Multi clonage supra » qui lui a permis de vaincre Mizuki, mais le professeur n’est pas impressionné. Naruto transforme alors tous ses clones en jeunes filles nues, inventant la « Technique du Harem », qui met Ebisu hors de combat.

Lors de sa première journée en tant que genin, Naruto est mis dans l’équipe no 7 avec Sasuke, le petit génie de la promotion, et Sakura, une fille dont il est amoureux, mais qui le méprise et n’a d’yeux que pour Sasuke. Naruto attaque alors ce dernier par surprise pour le neutraliser, et se transforme en lui pour tenter de séduire Sakura et savoir ce qu’elle pense de lui, mais il est gêné par le lait périmé qu’il a consommé le matin même et doit s’éclipser rapidement. Sasuke se libère et part à la recherche de Naruto ; il rencontre Sakura qui tente de le séduire à son tour, critiquant le comportement de Naruto qu’elle met sur le compte du fait qu’il est orphelin, mais il la rejette brutalement, ayant lui aussi perdu ses parents. Déprimée, Sakura pense à Naruto qui doit ressentir la même chose qu’elle, et décide d’être plus gentille avec lui à l’avenir.

L’équipe no 7 est prise en charge par Kakashi, un jōnin ; il se présente et leur demande de faire de même. Le lendemain, il leur fait passer une épreuve de survie où ils doivent récupérer deux clochettes qu’il porte ; celui qui échouera au test sera renvoyé à l’académie. Ils commencent le test, Sasuke et Sakura partent se cacher pour se mettre en observation, mais Naruto reste face à Kakashi et tente plusieurs attaques de front qui échouent.

L’épreuve de survie continue ; Sakura est mise hors de combat par Kakashi avec une illusion, et ce dernier engage un face à face contre Sasuke, qu’il met hors de combat ; pendant ce temps, Naruto découvre où est caché le repas de midi et s’apprête à manger, mais il est découvert par Kakashi et attaché à un poteau. Le jōnin demande aux deux autres de manger pour prendre des forces avant de reprendre le test ; il les sermonne durement en leur disant qu’ils n’ont rien compris au test et devraient abandonner l’idée d’être des ninjas, avant de leur révéler que seul le travail d’équipe est payant dans cette épreuve, et part en leur interdisant de donner de la nourriture à Naruto. Lorsqu’il est hors de vue, Sasuke et Sakura aident Naruto à manger pour qu’il soit d’attaque lors de leur prochaine tentative ; Kakashi surgit alors en leur disant qu’ils ont réussi le test, car prendre soin de ses camarades est selon lui prioritaire aux règles.

Après une série d’ennuyeuses missions de rang D, l’équipe n°7 est finalement chargée d’escorter Tazuna, un constructeur de pont. Une attaque inattendue va rendre la mission plus difficile que prévue.

L’équipe n°7 rencontre et est forcée de combattre le ninja déserteur Zabuza Momochi, engagé par le puissant homme d’affaires Gatō pour neutraliser Tazuna.

Pendant que le combat contre Zabuza continue, Naruto promet de ne plus fuir et est déterminé à prouver à Sasuke qu’il n’est pas une poule mouillée.

Naruto et Sasuke libèrent Kakashi de la technique de la Prison Aqueuse de Zabuza, et le combat continue.

Après un rude combat contre Zabuza, l’équipe n°7 continue sa mission de protection et se prépare aux éventuelles rencontres avec d’autres ennemis.

Pendant leur séjour au Pays des Vagues, Naruto et ses compagnons découvrent un héros local (Kaiza) et son plus grand admirateur, un jeune garçon du nom d’Inari.

Les hommes de Gatō essaient de kidnapper Tsunami et de tuer Inari, pendant que l’équipe n°7 (sauf un) commence à combattre Zabuza et Haku.

Cet épisode spécial raconte une histoire totalement à part de la série dans laquelle Naruto décide de rendre service au petit Konohamaru. Ce dernier, qui vient de monter sa propre mini-organisation de ninjas, est amoureux d'une jeune fille du nom de Yoshino Kaede. La petite fille doit en effet quitter le village car son père est muté ailleurs. Konohamaru décide alors d'aller trouver le trèfle pourpre à quatre feuilles qui lui permettra d'exaucer n'importe quel vœu, notamment celui de faire rester Kaede. Il demande l'aide de Naruto pour récupérer cet objet magique. Nos deux jeunes villageois vont devoir se rendre à Akagahara, une zone interdite...

Haku révèle sa technique héréditaire à Sasuke et le combat s’intensifie entre l’équipe n°7 et le duo Zabuza/Haku.

Naruto rejoint finalement le combat, mais est rapidement piégé dans la technique d’Haku.

Kakashi continue le combat contre Zabuza, pendant que Naruto et Sasuke luttent pour échapper au piège d’Haku.

Le sceau de Naruto se brise et Kyûbi se manifeste.

Haku révèle sa réelle motivation à Naruto pendant que Kakashi et Zabuza continuent leur combat mortel.

Haku se sacrifie pour sauver Zabuza et Kakashi prépare son attaque finale.

Les villageois commencent à se soulever contre Gatô, pendant que Zabuza réalise le lien qu’il y a entre Haku et lui et décide de faire un dernier geste avant de mourir : tuer Gatô.

L’examen chūnin a été annoncé et tous les genin de Konoha sont invités à participer avec ceux des autres pays.

Naruto, Sakura et Sasuke découvrent qu’ils ont de puissants rivaux qui souhaitent eux aussi devenir chūnin.

L’excentrique Rock Lee défie Sasuke dans un combat avant que l’examen chūnin ne débute.

Tous les genin de Konoha sont rassemblés dans un test préliminaire pour déterminer qui va continuer l’examen chūnin.

Tous les genin se rencontrent et commencent un test écrit, qui est la première épreuve de l’examen des chūnin.

Les genin essaient de récupérer les réponses aux questions, et s’inquiètent de la 10e question, éliminatoire.

Konohamaru est chargé de faire un reportage sur Naruto et les participants à l’examen chūnin.

La seconde épreuve de l’examen chūnin commence : il s’agit d’une épreuve de survie dans une forêt hostile.

Le ninja ennemi apparaît et engage le combat avec Sasuke. Après la fuite de cet imposteur, l’équipe 7 subit une nouvelle attaque. Mais cette fois-ci, l’adversaire est plus coriace.

Naruto vient aider Sasuke, en difficulté. Lors de ce combat, Naruto fait preuve d’un grand courage alors que Sasuke est apeuré. Naruto le traite alors de poule mouillée.

Après avoir vu la leçon de courage que Naruto lui a donné, Sasuke décide d’affronter son adversaire au péril de sa vie. Après avoir battu le ninja de Kusa, Sasuke se fait mordre et une marque apparaît dans son cou. Le ninja ennemi dévoile sa véritable identité : il s’appelle Orochimaru.

Lee vient en aide à Sakura contre les ninjas d’Oto.

À la suite de la défaite de Lee, Sakura décide de protéger ses amis.

Ino, Shikamaru et Chôji viennent en aide à Sakura.

Alors que Sasuke a battu les trois ninjas d’Oto grâce au pouvoir d’Orochimaru, Gaara, Temari et Kankurô ont réussi la seconde épreuve en une heure et trente deux minutes juste après Kiba, Hinata et Shino qui étaient arrivés avant eux. Mais le plus surprenant, c’est que Gaara a réussi l’épreuve sans égratignure et sans une tâche sur ses vêtements.

Naruto, Sakura et Sasuke n’ont plus de temps à perdre. Ils doivent à tout prix réussir la seconde épreuve avant le lever du prochain jour. Alors que Sasuke part chercher de l’eau, Naruto et Sakura tentent de lire le parchemin en leur possession. Mais Kabuto les en empêche juste à temps. Kabuto leur explique qu’il se dirigeait vers la tour avec son équipe mais s’est perdu en cours de route. Il accompagne donc l’équipe 7 mais une fois dans la forêt, ils se font piéger par une technique d’illusion et sont attaqués par des clones produits par les ninjas du pays de la Pluie.

Naruto, Sakura, Sasuke et Kabuto continuent de combattre les clones des ninjas du pays de la Pluie. Alors que les ninjas du pays de la Pluie montrent leur vrai visage, ils se font prendre à leur propre jeu. Mais ces derniers ne s’avouent pas vaincus et recréent des clones. Mais Naruto réussit à les battre et récupère le parchemin du ciel. L’équipe 7 a réussi la seconde épreuve.

Naruto, Sakura et Sasuke tentent de découvrir le mot mystérieux dans le texte du troisième Hokage qui est le suivant : « Si ton ciel déficient s’avère, approfondis tes connaissances et sois prêt. Si la terre défaut te fait, élance-toi vers les étendues sauvage où ta récompense tu trouveras. Ciel et terre tous deux ouverts, les dangers s’écarteront et sur le droit chemin tu avanceras. Des ****** l’élite tu deviendras et de guider digne tu seras ». Soudainement, Iruka fait son apparition grâce à la technique d’invocation produite par les parchemins. Il informe à nos amis que le mot manquant du texte était « hommes ». L’équipe de Kakashi a terminé la seconde épreuve et passe aux éliminatoires.

Sur les 78 genin participants à la deuxième épreuve des examens en vue de la sélection des chūnin, seuls 21 parviennent jusqu’à la tour. Malgré cela, le nombre encore trop important des aspirants ninjas oblige le troisième Hokage à faire précéder la troisième épreuve proprement dites par l’organisation d’une série de 10 matchs ou combats réels entre les candidats restants, qui verra donc l’élimination de la moitié des concurrents. Kabuto, qui craint de révéler sa véritable identité au cours de ces matchs préliminaires, préfère déclarer forfait, prétextant la fatigue. Aucun autre ne le suivra. Ils ne sont plus que 20.

Le premier combat, comptant pour les matchs préliminaires avant le commencement de la troisième épreuve, tourne à l’avantage de Yoroï. Sasuke, encore très affaibli par les séquelles dues à la marque du sceau, doit se contenter dans un premier temps de se défendre, à la surprise générale, face aux coups répétés de celui-ci qui tente de lui dérober son chakra. Finalement, le coéquipier de Naruto trouve la force de réagir et parviendra à terrasser son adversaire, en utilisant la technique dites de « l’ombre de la feuille », s’inspirant ainsi de « la fleur de Lotus » de Lee, avant de continuer sur un enchainement de sa création : « la fureur du lion ». Kakashi profite alors du temps laissé à Sasuke avant la troisième épreuve pour tenter d’endiguer le mal qu’il porte en lui. C'est le moment que choisit Orochimaru pour faire son apparition, tandis que débute le deuxième combat.

Ce combat oppose Shino aux Zaku, qui vient du village du son. Quant à Kakashi, il affronte Orochimaru qui veut capturer Sasuke.

L’épisode débute par le combat de Kankurô et Misumi. Vient ensuite le combat entre Ino à Sakura. Commençant par hésiter à se frapper mutuellement en raison de leur amitié de longue date, le combat ravive peu à peu tous leurs souvenirs d'enfance, leurs rêves et aspirations. La flamme ranimée, elles souhaitent toutes deux gagner ce combat.

Le combat entre Sakura et Ino continue. Au début, Sakura a l’avantage jusqu’à ce qu’Ino utilise sa technique de transposition. Mais celle-ci réussit à se débarrasser de l’esprit d’Ino grâce aux encouragements de Naruto ; le combat se termine en match nul. Combat de Tenten contre Temari ; Tenten qui utilise exclusivement des armes de jet ne parvient pas à trouver de faille dans la défense de Temari basée sur des bourrasques de vent créées avec son éventail.

Tenten est battue par Temari. Le combat suivant oppose Shikamaru à Kin, Shikamaru fait preuve de beaucoup de stratégie, ce qui va lui permettre de prendre le combat à son avantage.

Le match entre Kiba et Naruto démarre, avec Kiba qui montre immédiatement qu'il a le dessus durant le combat. Tout le monde continue de croire que Naurto est le ninja faible qu'il a toujours été, tout le monde sauf Hinata, Kakashi, et Sakura. Maintenant c'est le moment pour Naruto de briller, et cette fois... tout le monde va le regarder !

Naruto se retrouve en bien mauvaise posture face à Kiba. Mais la chance finit par tourner à son avantage. Il se sert de son pet pour déstabiliser son adversaire et finit par le battre grâce à sa « nouvelle » technique, « Uzumaki Naruto rendan », très largement inspirée de « la fureur du lion » de Sasuke.

Ce combat-là opposera Neji Hyûga à Hinata Hyûga. Neji n’a aucune pitié envers sa cousine.

Le combat entre Neji et Hinata se poursuit. Bien qu’elle soit en difficulté, Hinata refuse d’abandonner le combat car elle souhaite que Naruto reconnaisse sa valeur. Mais elle ne peut plus utiliser le juken, car Neji a stoppé le système de circulation de son chakra en frappant une cavité de celui-ci.

Le neuvième combat des éliminatoires oppose Lee à Gaara.

Lee, affaibli par la technique de la fleur de Lotus, résiste tant bien que mal aux attaques de Gaara.

Lee joue son dernier atout, la face cachée du Lotus. Mais sa tentative est vouée à l’échec et perd le combat sur une contre-attaque de Gaara. Gaï, fier du combat livré par son élève préféré, va apprendre qu’il ne pourra plus devenir ninja à cause des blessures graves subies au bras et à la jambe gauche.

Le dernier combat oppose Chôji à Dosu. Dosu réussit à battre Chôji en moins de 30 secondes. Les éliminatoires sont terminés. Le tirage au sort de la phase finale a lieu. Voici les prochains combats de la phase finale de l'examen : Naruto Uzumaki contre Neji Hyûga, Gaara contre Sasuke Uchiwa, Kankurô contre Shino Aburame et Temari affrontera le vainqueur du combat entre Dosu Kinuta et Shikamaru Nara.

Kakashi confie l'entraînement de Naruto au professeur du petit-fils du troisième Hokage : Ebisu. Naruto n'est pas d'accord et défie Ebisu à lui montrer sa valeur.

Alors qu'Ebisu enseigne à Naruto comment marcher sur l'eau, l'ermite Jiraya, ninja légendaire, fait son apparition, et assomme Ebisu.

Un soir, un combat a lieu entre Gaara et Dosu Kinuta. Ce dernier lui avoue qu'en l'éliminant, il affrontera Sasuke à la phase finale. Mais Gaara se débarrasse de lui en un clin d'œil. Pendant ce temps, non loin de là, Kabuto et Baki concluent une alliance entre Suna et Oto pour réduire en cendres le village de Konoha. Après des péripéties, l'ermite accepte d'enseigner à Naruto ses connaissances, et commence par une technique puissante : la technique d'invocation.

Le troisième hokage informe les jōnin et les chūnin de la mort d'Hayate Gekko, l'arbitre des éliminatoires. Son corps a été retrouvé par les membres de l'ANBU. Pendant ce temps, Sakura rend visite à Sasuke et Lee à l'hôpital en compagnie d'Ino.

Le seul moyen pour que Naruto réussisse à concentrer le chakra du démon-renard à neuf queues : une question de vie ou de mort.

Naruto invoque Gamabunta, l'actuel roi des batraciens, mais ce dernier ne croit pas ce petit bonhomme capable de l'avoir invoqué.

Le matin, Gaara reste introuvable. Shikamaru rend visite à Naruto et Sakura cherche Lee, qui devient la cible de Gaara.

Hinata est surprise par la « déclaration » de Naruto. Lors de leur discussion, Naruto remarque que le festival a déjà commencé. Kiba vient rejoindre Hinata, qui ne lui prête aucune attention. Le festival commence et déjà 3 concurrents sont absents. Naruto arrive donc dans le stade, par une entrée de « bouffon » comme dit Shikamaru.

Le premier combat de la phase finale de l'examen des chūnin va opposer Naruto Uzumaki à Neji Hyûga. Naruto est prêt à donner le meilleur de lui-même pour venger la défaite d'Hinata.

Neji utilise sa technique défensive du tourbillon divin, et paralyse Naruto avec les 64 poings du hakke. Neji dévoile alors le sort réservé aux membres de la branche parallèle des Hyûga.

Alors que Neji est sur le point de remporter le combat, Naruto puise dans le chakra de Kyûbi et retourne la situation à son avantage, à la surprise générale.

Neji découvre la vérité sur la mort de son père. Pendant ce temps, Sasuke n'est toujours pas arrivé. Les autres combats sont donc avancés.

Le combat suivant oppose Shikamaru à Temari. Bien que peu motivé, Shikamaru finit par dévoiler ses capacités.

Alors qu'il allait être disqualifié, Sasuke fait finalement son apparition dans le stade. Pendant ce temps, en coulisses, Naruto et Shikamaru assistent à une scène terrifiante.

Sasuke prend l'avantage sur Gaara grâce à sa rapidité. Gaara se réfugie dans une carapace de sable, et prépare sa contre-attaque.

Sasuke dévoile sa technique du chidori, enseignée par Kakashi. Pendant ce temps, autour du village, des ninjas ennemis rôdent.

Des ninjas d'Oto et de Suna font leur apparition dans l'enceinte du village. Orochimaru profite de la confusion pour maîtriser le 3e hokage.

Kakashi charge Naruto, Sakura, Pakkun, et Shikamaru de rattraper Sasuke, parti seul à la poursuite de Gaara. Le combat entre Orochimaru et le 3e hokage commence.

Le groupe de Naruto est poursuivi par des ninjas ennemis. Shikamaru décide de préparer une diversion pour semer les poursuivants.

Orochimaru utilise une technique interdite pour ressusciter le 1er et le 2nd hokage et les obliger à le servir. Entre ces deux là et le 3e hokage, un terrible combat commence.

L'affrontement final entre Orochimaru et le 3e hokage se rapproche. Le 3e hokage regrette alors de ne pas avoir pris la vie d'Orochimaru quand il en a eu l'occasion, quelques années auparavant.

Mortellement blessé, le 3e hokage décide d'utiliser une technique de sceau secrète pour éliminer Orochimaru. Pendant ce temps, Sasuke est sur le point de rattraper le groupe de Gaara.

Alors que Kankurô s'interpose pour protéger Gaara, Shino fait son apparition et engage le combat. Sasuke rattrape enfin Gaara, qui commence à se changer en Shukaku.

Sasuke affronte un Gaara de plus en plus puissant. Malgré les avertissements de Kakashi, il décide d'utiliser une fois de plus son chidori, augmentant l'emprise du sceau maudit d'Orochimaru.

Naruto et Sakura arrivent à temps pour protéger Sasuke à la merci de Gaara. Flashback sur l'enfance de Gaara.

Naruto décide tout de même de combattre Gaara afin de protéger ses amis alors qu'il est seul face à lui. Second flashback sur l'enfance de Gaara. Et Naruto finit par comprendre ce que ressent Gaara, étant donné qu'il a vécu la même chose que lui par le passé.

Naruto passe à l'attaque pour sauver Sasuke et Sakura. Alors que le Shukaku a pris sa forme définitive, Naruto invoque Gamabunta.

Face à Gamabunta, Gaara utilise sa dernière technique pour libérer toute la puissance de Shukaku. Naruto et Gamabunta vont devoir trouver de nouvelles ressources.

Le 3e Hokage enlève les bras de l'âme d'Orochimaru et périt sur le coup. Tous les habitants du village sont à son enterrement pour lui rendre hommage et Iruka tente de consoler Konohamaru.

Itachi Uchiwa revient au village de Konoha, pour venir chercher quelque chose.

Kakashi est le seul à pouvoir résister au terrible pouvoir du Sharingan du clan Uchiwa.

Jiraya emmène Naruto à la recherche d'une femme. Arrivé à la première ville, les instincts du ninja légendaire refont surface.

Après tant d'années, les deux frères du clan Uchiwa sont face à face.

Jiraya fait soudainement son apparition et prend part au combat contre Kisame et Itachi. Mais Sasuke refuse de laisser Jiraya se mêler de son combat contre Itachi. Il continue de se battre mais hélas, le pauvre Sasuke ne fait pas le poids face à son grand frère. Il se demande alors pourquoi il a passé ses années à Konoha à s'entraîner sans relâche puisqu'il ne fait aucun progrès. Sasuke subit ensuite la technique d'Itachi : « Les arcanes lunaires » remontrant l'extermination du clan par son frère. Sasuke se retrouve alors sans connaissance et les côtes cassés. Jiraya décide donc de partir à la recherche de Tsunade en compagnie de Naruto afin de lui demander de devenir le 5ème Hokage du village de Konoha.

Naruto et Jiraya se mettent en route à la recherche de Tsunade. Ils décident de s'arrêter dans une ville où un festival a lieu afin d'y séjourner pendant quelques jours et de commencer l'entraînement.

Jiraya enseigne une nouvelle technique de concentration de chakra à Naruto, l'occasion pour ce dernier de se distinguer à nouveau comme un ninja original.

2ème étape de la nouvelle technique enseigné par Jiraya.

Vers la 3e et ultime étape de maitrise de la technique, le 4e Hokage a mis 3 ans à maitriser cette technique, combien en faudra-t-il à Naruto ?

Alors que Tsunade fait face à Orochimaru, Jiraya et Naruto arrivent en ville.

À la suite de la proposition d'Orochimaru, Tsunade se remémore les événements attachés à son pendentif maudit. Jiraya la rejoint pour lui faire également une autre proposition : celle de devenir le 5e Hokage.

Tsunade avoue à Jiraya que Naruto lui fait beaucoup penser à son petit frère Nawaki, mort il y a quelques années. Elle piège ce dernier en ajoutant de la drogue dans son sake. Le lendemain, elle rejoint Orochimaru afin de donner réponse à sa proposition.

Tsunade a fait son choix, et ça n'est pas en faveur d'Orochimaru, la bataille commence Tsunade contre Orochimaru et Kabuto Yakushi. Après quelques minutes de combat, Naruto, Jiraya et Shizune arrivent en renforts pour prêter main-forte à Tsunade.

Jiraya affronte Orochimaru et Shizune s'occupe quant à elle de Kabuto. Mais Shizune n'a aucune chance face à Kabuto et perd le combat en moins de 10 min. Kabuto s'en prend ensuite à Tsunade mais Naruto l'empêche de continuer à la torturer. Il résiste tant bien que mal aux assauts de Kabuto. Kabuto tentant de l'attaquer de front, Naruto utilise sa nouvelle technique.

Naruto parvient finalement à réussir à maîtriser le Rasengan et la lance sur Kabuto. Mais ce dernier parvient à l'affaiblir en lui sectionnant les muscles cardio-vasculaires avant de subir l'assaut du Rasengan. Tsunade soigne Naruto, arrive à le sauver et lui donne son pendentif, reconnaissant avoir perdu son pari. Après avoir soigné Naruto, Tsunade subit les assauts d'Orochimaru qui tente de tuer Naruto. Elle décide de le protéger coûte que coûte en mettant sa vie en jeu. Elle finit par accepter la proposition de Jiraya et devient le 5e Hokage du village de Konoha. S'ensuit ensuite un combat acharné entre Tsunade et Orochimaru.

Face à Orochimaru, Tsunade invoque Katsuyu, une limace géante, Jiraya invoque Gamabunta le maître crapaud. Orochimaru invoque alors Manda le maître des serpents.

Sur le chemin du retour, Tsunade décide de faire une pause aux sources thermales. Naruto découvre alors les aspects négatifs de la faiblesse de Tsunade.

Tsunade arrive au village caché de Konoha, les préparatifs pour son intronisation commence. Pendant ce temps-là, elle se rend à l'hopital, pour soigner Kakashi, Sasuke et Lee.

Naruto est interrompu en pleine conversation avec Lee par Moegi et Udon qui lui apprennent que Konohamaru s'est enfermé dans le bureau de l'Hokage. Naruto décide d'aller le voir et de tenter de le raisonner. Va-t-il réussir ?

Rock Lee, découragé par les propos pessimistes de Tsunade sur le risque élevé de mortalité pendant l'opération qui pourrait le guérir, hésite à accepter cette dernière. Il se rappelle ses rêves de débutant, sa première rencontre avec son maître et modèle, Gaï Maito qui, inspiré par la détermination de ce genin, lui a redonné l'espoir dans les moments les plus difficiles. Encore une fois, Gaï Maito va lui redonner le courage de continuer.

Mais que se cache-t-il sous le masque de Kakashi Hatake ?

Tsunade confie une mission de rang B à Naruto, Sasuke et Sakura au pays du Thé.

Naruto, Sasuke et Sakura s'aperçoivent que leur mission consiste à protéger Idate Morino, le jeune frère d'Ibiki. Ils ont rencontré ce garçon dans un restaurant et se sont faits piéger par ce dernier, soi-disant pour accord de paye des deux additions. Le lendemain, la course a lieu. Mais au lieu de prendre le bateau, Idate décide de se diriger vers le Nord, pensant que c'est le chemin le plus rapide pour aller sur l'île de Nagi. Mais alors qu'ils se dirigent vers l'île de Nagi en bateau, Naruto, Sasuke, Sakura et Idate se font attaquer par les ninjas du pays de la Pluie : Oboro, Kagari et Mubi qu'ils ont déjà rencontrés lors de l'examen de sélection des chûnin.

Leur bateau en feu, nos amis se dirigent vers l'île à la nage. Mais Oboro et son équipe les attaquent à nouveau et Naruto réussit à s'en débarrasser grâce à son Rasengan. Une fois sur l'île, Naruto, Sasuke et Sakura viennent en aide à Idate et se retrouvent face à Aoi. Idate raconte alors à nos amis qu'il était un ancien ninja de Konoha et qu'il était déprimé d'avoir raté l'examen des chûnins. C'est à partir de cet instant qu'Aoi s'est servi de lui pour se rebeller contre le village de Konoha et de rejoindre le pays de la Pluie. Idate n'étant plus en état de courir à cause de ses blessures, Naruto se porte volontaire pour lui donner un petit coup de pouce.

Naruto et Idate poursuivent la course ensemble. Arrivés au temple de Todoroki, Naruto se repose tandis qu'Idate continue la course seul. Alors qu'il s'apprête à rattraper Fukuzuke, Aoi empêche Idate de continuer la course. Mais Naruto vient en aide à Idate en compagnie de Sasuke et Sakura. Sasuke défie Aoi en premier mais se fait battre à plats de couture. Sakura lui vient en aide, mais Aoi coupe le pont et les deux équipiers de Naruto tombent de la falaise.

Naruto est maintenant seul contre Aoi et arrive à prendre le dessus. L'arrivée est proche et Idate rattrape Fukuzuke.

L'équipe 10 fête la promotion de Shikamaru qui passe de Genin à Chûnin. Mais à l'hôpital, Sasuke provoque Naruto en duel.

Le combat entre Naruto et Sasuke est interrompu par Kakashi alors qu'ils étaient sur le point de s'entretuer. Sasuke ne supportant pas le fait que Naruto soit devenu plus fort que lui, se met en colère et part. Pendant ce temps, à la recherche de Sasuke, quatre ninjas d'Oto réussissent à s'infiltrer dans le village de Konoha sans se faire repérer. Après que Kakashi a fini sa discussion avec Sasuke, Kidômarô, Jirôbô, Sakon et Tayuya s'attaquent à lui et tentent de le convaincre de changer de camp.

Kidômarô, Jirôbô, Sakon et Tayuya expliquent à Sasuke que s'il veut atteindre son objectif, il doit obtenir de la puissance. Ce dernier, prend alors la décision de quitter le village de Konoha pour les suivre et rejoindre Orochimaru. Sakura intercepte son départ et essaye de l'arrêter en lui déclarant son amour, lui demandant de l'emmener avec lui si possible, mais Sasuke reste de marbre et lui adresse un « merci » avant de lui faire perdre conscience.

Tsunade convoque Shikamaru et lui explique la situation. Elle lui dit de former une escouade composée de genin. Shikamaru forme une équipe de 5 avec Naruto, Kiba, Chôji et Neji. Avant le départ de l'équipe, Sakura vient voir le groupe et demande à Naruto en pleurant de ramener Sasuke au village. Naruto accepte la proposition de Sakura et lui fait la promesse de tout faire pour ramener Sasuke.

Sasuke avale un stimulant et entre dans un état comateux le temps d’assimiler le niveau deux du sceau maudit. Il est enfermé dans un tonneau qui le ramènera à la vie grâce à une technique spéciale. Les ninjas d'Oto dévoilent leurs pouvoirs sur les jōnin de Konoha.

L'équipe de Shikamaru se fait prendre au piège dans une prison de terre. Alors que les autres ninjas de Konoha essayent de s'en sortir, Shikamaru discute avec l'ennemi.

Chôji décide de combattre Jirôbô. Grâce à ses pilules, Chôji tient tête au ninja d'Oto. Ce dernier dévoile ses pouvoirs et traite Chôji de déchet.

Chôji augmente sa force et écrase Jirôbô. Celui-ci utilise son sceau démoniaque au niveau 2 et surpasse Chôji. Chôji n'a plus d'autre choix que d'utiliser la pilule mortelle au piment.

L'équipe de Shikamaru rattrape celle des ninjas d'Oto. Kidômarô va se battre et met toute l'équipe en échec. Neji se désigne pour affronter Kidômarô.

Neji continue à combattre Kidômarô, qui a trouvé le point faible du Byakugan de Neji. Pendant ce temps, Shikamaru, Naruto, Kiba et Akamaru continuent leur chemin.

Le combat entre Neji et Kidômarô se poursuit. Malgré toutes les blessures graves, Neji finit par vaincre son adversaire.

Sakon et Tayuya continuent leur chemin en direction du repère d'Orochimaru. Mais l'état de santé de ce dernier se dégrade, et il doit se résoudre à changer de corps avant l’arrivée de de Sasuke. Shikamaru, Naruto et Kiba finissent par les rattraper et s'emparent du tonneau dans lequel est enfermé Sasuke.

Kiba et Sakon se retrouvent dans le même piège qu'a posé Akamaru et tombent d'une falaise. Alors que Tayuya rattrape Naruto et Shikamaru, un ennemi fait son apparition : il s'agit de Kimimaro, dernier représentant du clan Kaguya et membre du quintet d'Oto, il emporte Sasuke avec lui pour le ramener à Orochimaru. Shikamaru permet à Naruto de rattraper Kimimaro pendant que lui s'apprête à affronter Tayuya.

Le combat entre Kiba et Sakon fait rage. Ukon, le frère de Sakon se réveille et les 2 frères passent directement au stade n°2 de leur sceau maléfique. Kiba et Akamaru décident d'utiliser la redoutable technique du loup bicéphale.

Naruto créé plusieurs clones pour son combat contre Kimimaro. Mais ce dernier les bat facilement. Kiba se blesse lui-même gravement lors de son combat contre Ukon qui a réussi à s'introduire dans son corps. Shikamaru observe le style de combat de Tayuya pour élaborer une stratégie afin de trouver son point faible.

Le combat entre Shikamaru et Tayuya continue. Tayuya envoie ses créatures à l'attaque à l'aide des notes jouées sur sa flûte. Shikamaru met alors son plan en marche et parvient à redresser la situation à son avantage. Mais Tayuya est contrainte de passer au stade n°2 de son sceau maléfique pour inverser la tendance.

Comme prévu, Kimimaro s'est facilement débarrassé des clones de Naruto à l'aide de sa technique de la danse du camélia. Tout à coup, le tonneau se brise en mille morceaux et Sasuke réapparait sous la forme de stade n°2 de sa marque maudite. Alors que Naruto tente de rattraper Sasuke qui a pris la fuite, Kimimaro s'apprête à l'éliminer. Mais Lee intervient à temps et empêche Kimimaro de s'en prendre à Naruto. Lee rappelle à Naruto qu'il a promis à Sakura de ramener Sasuke. Naruto approuve et part donc à la poursuite de Sasuke. Un combat commence entre Lee et Kimimaro. Mais au bout de quelques minutes, Lee interrompt le combat car il doit prendre son médicament. Il boit du saké à la place de son médicament et devient accidentellement ivre.

Lee est accidentellement ivre et sa force augmente. La technique de l'homme ivre est trop puissante pour Kimimaro qui décide d'utiliser ses os. Pendant ce temps, Kiba et Shikamaru sont dans un état critique.

Alors que les combats de Lee, Kiba et Shikamaru vont s'achever, d'autres ninjas viennent y prendre part ; en effet, Temari, Kankuro et Gaara arrivent juste à temps. Pendant que Temari affronte Tayuya, Kankuro doit faire face à Sakon et Ukon.

Pour protéger Lee en mauvaise posture, Gaara se bat contre Kimimaro en utilisant des attaques encore plus puissantes qu'avant. Naruto continue de suivre la trace de Sasuke.

La maîtrise du sable de Gaara pousse Kimimaro à ses limites. Mais celui-ci porteur d'un lourd passé montre toute la puissance héritée de son clan. A la frontière du pays du feu, Naruto rattrape Sasuke et essaye de le raisonner.

Naruto a enfin rattrapé Sasuke mais à sa grande surprise, il s'aperçoit très vite que ce dernier a bel et bien plongé dans les ténèbres et est devenu plus fort que jamais grâce à la puissance de son sceau maléfique. Le dernier combat entre Naruto et Sasuke est sur le point de commencer.

Sasuke affronte Naruto, qui de son côté ne se bat pas sérieusement. Pendant l'affrontement, le jeune Uchiwa se remémore son enfance passée aux côtés de son frère Itachi envers qui il était plein d'admiration. Cependant, Sasuke était quand même jaloux que son père s'intéresse plus à Itachi qu'à lui-même. Il voit Itachi devenir de plus en plus distant avec le reste de son clan.

Sasuke décide de battre Naruto rapidement en activant son Sharingan ; il replonge une nouvelle fois dans ses souvenirs d'enfance, à l’époque où il déployait de nombreux efforts pour prouver sa valeur à son père.

Suite des souvenirs d’enfance de Sasuke. Le jeune garçon découvre que son frère possède une autre version du Sharingan, le « Kaléidoscope hypnotique du Sharingan ». Pour l’obtenir, il faut tuer son meilleur ami. De retour au présent, Sasuke annonce à Naruto qu'il est son meilleur ami et que c'est pour ça qu'il cherche à l'éliminer.

À Konoha, Kakashi apprend que Sasuke a quitté le village. Il part tout de suite à la recherche de Sasuke et Naruto qui ont véritablement commencé leur combat. Sasuke est bien décidé à en finir avec Naruto.

La bataille entre Naruto et Sasuke fait rage, les deux amis découvrent que ce sont leurs liens qui les rendent plus fort. Sasuke fait évoluer la forme de son sharingan et veut trancher ces liens qui le lient à Naruto. Mais ce dernier ne le laisse pas faire et se transforme, sous l'emprise de Kyûbi.

Sasuke utilise son sceau maléfique pour augmenter sa puissance. Le dénouement est tout proche et Naruto et Sasuke tentent le tout pour le tout. Sasuke laisse la vie sauve à son équipier et part en direction du village d'Oto.

Pendant que Kakashi ramène Naruto au village, Shikamaru est inquiet pour Kiba et Akamaru, Chôji et Neji qui se font soigner. la vie d Kiba n'est pas menacée, malgré une blessure grave, mais Neji et Chôji se trouve en situation critique. Shikamaru a échoué dans sa mission et s'en inquiète. Sasuke a rejoint Orochimaru après son combat contre Naruto et ce dernier essaye de se faire pardonner auprès de Sakura en lui promettant de ramener leur ex-compagnon. Jiraya informe Naruto des plans de l'Akatsuki vis-à-vis de lui qui aboutiront dans 3 ans et lui demande d'oublier Sasuke. De nature entêtée, Naruto refuse et déclare qu'il veut toujours sauver Sasuke des griffes d'Orochimaru quoi qu'il puisse arriver.

Sakura ne peut se résoudre au départ de Sasuke et décide de partir à sa recherche. Naruto qui a deviné ses pensées veut l’accompagner. L’ermite réussit à obtenir de Tsunade une mission lui permettant d’accompagner les deux amis au pays du riz afin d’y collecter des informations sur le village caché du Son où se trouverait Orochimaru.

L’Ermite part de son côté collecter des informations et profiter des avantages d’une ville. Il y rencontre des « voyous » autrefois respectables et appartenant au clan des Fûma. De leur côte Sakura et Naruto font la connaissance de Sasame Fûma, faisant également partie du clan des Fûma.

L’Ermite a rejoint Naruto, Sakura et Sasame, cette dernière connaît le chemin qui mène au village caché du Son. Son cousin a suivi Orochimaru qui lui a fait croire qu’il pouvait redonner la gloire au clan des Fûma. Sasame veut le ramener au village même si pour cela elle doit trahir ses nouveaux amis.

Les intentions de Sasame n’étaient pas mauvaises, elle souhaitait seulement sauver son cousin des griffes d’Orochimaru. L’Ermite et ses deux acolytes l’ont bien compris. Elle les mène à l’entrée de l’antre d’Orochimaru et Naruto lui promet de ramener son cousin. Pourra-t-il tenir promesse ? Le palais d’Orochimaru est parsemé de pièges.

Naruto est tombé dans un piège. Sakura se retrouve seule face à Kabuto qui lui apprend que Sasuke a succombé à la suite des effets de la marque maudite. Sasame désobéit et rentre dans la demeure d’Orochimaru, ce qui lui permet de libérer Naruto qui à son tour va porter secours à Sakura. Naruto se retrouve aux prises avec un bien étrange Kabuto, qui en réalité est un membre du clan Fûma ayant revêtu l’apparence de Kabuto.

Sasame retrouve son cousin Arashi, mais ce dernier, sous l’emprise d’Orochimaru s’est transformé en monstre. Sakura est prête donner sa vie pour sauver ses amis, Naruto l’en empêche et vainc Arashi qui se repent avant de disparaître et leur apprend que Sasuke est en vie. Orochimaru le garde pour prendre possession de son corps dans trois ans. L’Ermite qui a combattu de son côté retrouve son équipe. Sakura qui veut trouver sa voie demande à Tsunade de devenir sa disciple.

Alors que tout semble reprendre son cours normal dans le village de Konoha, Tsunade découvre une ordonnance égarée dans ses dossiers. Le vol du rouleau interdit perpétré par Mizuki un an auparavant pourrait bien être commandité par Orochimaru. Tsunade envoie Asuma et Kurenai interroger Mizuki en prison, lorsqu’ils arrivent, les prisonniers sont en liberté…

Shizune qui vient porter renfort à Asuma et Kurenai se fait piéger à son tour par Mizuki accompagné des frères Fûjin et Raïjin. Heureusement TonTon, son goret, s’échappe pour prévenir Tsunade de la situation. Cette dernière dépêche une équipe composée de Iruka Sensei, Naruto, Tonton et Pakkun pour porter secours à Shizune et son équipe.

Naruto doit affronter les deux colosses Fûjin et Raïjin à la force surhumaine. De son côté, Iruka se bat avec Mizuki. Iruka fait appel au souvenir de leur ancienne amitié pour raisonner Mizuki, mais ce dernier qui a toujours été jaloux de l’affection que portait le 3ème Hokage à Iruka compte bien en finir avec lui. La situation semble compromise lorqu’arrivent Ino, Shikamaru et Chôji.

Ino, Shikamaru et Chôji vont combattre les frères Fûjin et Raïjin pendant que Naruto va porter secours à Iruka. Mizuki ne fait pas de cadeau à Iruka, il lui en veut toujours de sa réussite à Konoha alors que lui n’a jamais réussi à se faire accepter.

Mizuki a pris la fuite et cambriole un laboratoire afin de se procurer les composants nécessaires à une potion. Sa relation avec Orochimaru ne fait plus aucun doute. Tsubaki, la fiancée de Mizuki a rejoint Naruto, Iruka et Pakkun et va les aider à retrouver le fugitif, mais lorsqu’ils vont le retrouver il est trop tard, Mizuki a ingurgité la potion prescrite par Orochimaru.

Tsunade vient prendre la relève auprès de la formation Ino, Shikamaru et Chôji qui étaient toujours aux prises avec les frères Fûjin et Raïjin. Naruto se bat avec Mizuki qui subit différentes transformations suite à la prise de la potion censée lui donner du pouvoir. Mais Orochimaru s’est joué de lui et la potion détruit ses cellules, Naruto aura raison de lui avec son Rasengan.

Naruto est toujours aussi déterminé à récupérer Sasuke. Hinata, Shino et Kiba veulent l'aider à le retrouver. Les 4 amis partent alors à la recherche des insectes flaireurs, destinés à retrouver la trace de Sasuke.

Shino, Kiba, Naruto et Hinata arrivent à destination. Ils se mettent donc à la recherche des insectes flaireurs. Pendant leur recherche, Shino, Hinata et Kiba repèrent des personnes eux aussi à la recherche de ces insectes. Ils decident alors de ne rien dire à Naruto.

L'heure de l'échange arrive, alors que Shino, Kiba et Naruto se rendent sur place, ils ont alors à faire à des clones en cire d'abeille et se mettent donc à la recherche d'Hinata, par un autre marché.

Suzume bachi coince Naruto, Kiba et Shino dans le repère des Kamizuru. Shino n'a alors d'autre choix que d'énerver la reine. Hinata tente de se débattre mais la prison de cire qui la retient prisonnière tombe dans les chutes ! Shino propose un marché aux Kamizuru : en échange d'Hinata, ils récupèreront l'insecte flaireur. Ils découvrent avec surprise que Hinata a disparu ! Naruto va se faire achever quand Hinata arrive ! Celle-ci se débarrasse sans difficulté des ninjas ennemis grâce au 64 poings du Hakke protecteur qui tranchent les abeilles et la reine. Mais Suzumebachi revient avec la reine que Naruto neutralise grâce au Rasengan. La mission se terminera par un échec à cause d'un pet émis par Naruto.

Nos héros doivent aider des mineurs opprimés par une famille. Leur chef est Raïga, l'un des sept ninjas renégats, ce qui serait une piste pour retrouver Sasuke car en fait, Raïga permettrait de trouver Kisame afin de trouver Itachi puis trouver Sasuke, mais cette piste est nulle pour 2 raisons car Sasuke à ce moment-là sait qu'il est trop faible pour défier Itachi et Raïga déteste les sept ninjas renégats.

Naruto, Lee, Neji et Tenten sont hébergés chez mémé Sancho, la mère de Karashi. Ils apprennent par cette dernière que son fils est parti de la maison et vont découvrir qu'il a rejoint la famille Kuruzuki.

Les quatre jeunes ninjas affrontent Raïga et après l'avoir battu, ils trouvent un sac où un petit garçon est enfermé à l'intérieur : il s'agit de Ranmaru, l'ami de Raïga. Karashi, bien qu'il ait promis à Lee de rejoindre sa mère, reste chez la famille Kuruzuki.

Naruto, Lee, Neji et Tenten retrouvent Karashi qui est resté chez la famille Kuruzuki et lui passent un savon. Le jeune homme décide finalement de rentrer chez mémé Sancho et se fait pardonner auprès d'elle. Les quatre jeunes ninjas vérifient l'état de Raïga avec l'aide de Ranmaru.

Raiga a été ressuscité par Ranmaru et revient a la charge.

Lee affronte Raïga pendant que Mémé Sancho, Tenten et Ranmaru apportent le curry providentiel à Naruto et Neji. Lee y a aussi droit puisqu'il a subi un assaut de Raïga qui le met hors-combat. Mais il devient ivre en mangeant ce curry et affronte à nouveau Raïga. Ranmaru tente de convaincre son ami de goûter le curry mais ce dernier ne lui pardonne pas de l'avoir trahi. Cette fois-ci, c'est Naruto qui affronte Raïga et le bat avec son Multiclonage.

Les genins sont assignés chef d'équipe aux petits de l'académie. Chacun avec son groupe, ils enseignent tous des choses essentielles aux plus petits, Lee vit un vrai bonheur en se faisant appeler Sensei. Quand Naruto et son équipe arrivent au pied du rocher, les choses se compliquent.

Naruto, Hinata et Kiba sont envoyés en mission au pays de la terre rechercher un dangereux criminel, Gosunkougi, qui aurait assassiné des familles dans le but de les dépouiller de leur argent. Ils rencontrent alors Sazanami, qui leur apporte de l'aide, mais celui-ci ne s'avère pas très fiable. Kiba découvre alors que le vrai nom de Sazanami est Toukichi, un dangereux criminel.

Dans l'auberge au petit matin, Sazanami essayera de tuer Naruto, Kiba et Hinata, de peur qu'il révèle qu'il est un dangereux criminel et qu'il se cache dans cette auberge. Sans succès, Kiba, Naruto et Hinata décident alors de l'aider à retrouver Gosunkougi, qui veut récupérer la cloche d'or.

Un matin, deux étranges visiteurs essayent d'infiltrer Konoha pour obtenir de précieux renseignements.

Naruto, Tenten et Neji voyagent jusqu’au Pays des Oiseaux pour exterminer le guerrier maudit, un fantôme.

Naruto et les autres tentent de prouver que Kômei est responsable de l’existence du fantôme. Cependant, ce que Naruto et la bande vont découvrir révèle encore davantage d’énigmes à résoudre.

Naruto décide de se lancer dans une enquête personnelle au sujet du fantôme. De leur côté, Neji et Tenten tentent une approche différente. Avec l’aide de deux crapauds, Naruto s’approche de plus en plus de la vérité et est même sur le point d’apprendre la véritable identité du fantôme. C’est peut-être Sagi qui est derrière le masque. Mais Sagi est toujours un seigneur féodal. Sagi refusera de laisser Naruto faire cette révélation, même au risque d’être condamné à mort.

Kakashi ordonne à Neji et à Tenten de rentrer au village avec lui, mais ils sont suivis. Pendant ce temps, Kômei est sur le point d’être exécuté. Mais le guerrier maudit apparaît et le sauve. Neji et Tenten ont reperé celui qui les suit et observent attentivement son manège. Ils parviennent à le tromper. Neji et Tenten confrontent Kômei et le fantôme. Mais Kakashi leur dit de partir. Le fantôme est-il un ami ou un ennemi ? Et qu’est-il advenu de Naruto ? Sagi répond à ces questions en révélant toute la vérité.

Un événement va avoir lieu à Konoha, avec la participation de tous les ninjas du village, qu'il soit Genin ou Jônin. Le gagnant sera autoriser à créer une nouvelle règle à Konoha, mais également à Suna. Mais Naruto est davantage intéresser par combattre son maître, Kakashi-sensei. Arrivera-t-il à ses fins ?

Sagi prépare sa vengeance et il est bien décidé à ne laisser personne contrecarrer ses plans. Déguisé en guerrier maudit, il affronte Musou, mais celui-ci sait tout. On apprend aussi que les ninjas errants ne peuvent pas vraiment voler des jutsus, ce sont des faux. Encore plus surprenante, la révélation par Sagi et Musou de leurs véritables identités.

Shima délivre Naruto du piège genjutsu de Ooki, avant de le protéger d’une attaque. Au moment où Naruto semble vaincu, Toki abandonne toute volonté de vivre. Naruto voit une silhouette blanche surgir devant lui. C’est Sagi. Sagi demande à Naruto d’avancer le Temps afin d’aider à nouveau sa soeur. Naruto s’apprête à exaucer son voeu et à protéger Toki. Après la défaite d’Ooki, le Pays des Oiseaux retrouve son calme d’antan. En tant que gouverneur du Pays des Oiseaux, Toki veut améliorer la situation générale. Cependant, il subsiste une question : Naruto a-t-il rêvé qu’il voyait Sagi, ou bien s’agissait-il après tout vraiment d’un fantôme ?

Teuchi, propriétaire du restaurant « chez Ichiraku », a été provoqué en duel gastronomique par un riōnin qui a enlevé sa fille Ayame et demande de l'aide à Naruto, Sakura et Chôji.

Faisant partie des quelques rares Genins disponibles, Naruto, Ino et Shino sont obligés d’accompagner Anko dans sa mission au Pays de la Mer, au cours de laquelle elle doit détruire un monstre marin et protéger un bateau qui transporte de l’or. Cependant, à mesure que son passé lui revient en mémoire et qu’elle se souvient de son ancienne relation avec Orochimaru, Anko se met à agir bizarrement.

Naruto guérit grace à Isaribi, la mystérieuse jeune fille. Pendant qu’il est en convalescence, Anko, Shino et Ino le recherchent. Ce faisant, ils rencontrent aussi l’homme qui s’occupe des salaires pour la cargaison. Les quatre amis finiront par se retrouver, mais seulement après avoir découvert le repère du monstre marin.

Après qu’Isaribi se soit échappée, Naruto et son équipe décident de se rendre sur l’île interdite pour affronter Orochimaru et ses sbires. Ils découvrent rapidement qu’Orochimaru n’est pas une éminence grise, mais un homme connu sous le nom d’Amachi. Amachi est le responsable de la transformation d’Isaribi en monstre. Alors pourquoi Isaribi l'aide-t-elle ?

Après avoir échappé de justesse à l’effondrement du laboratoire, Naruto et les autres doivent rattraper le convoi qui transporte l’argent. Cependant, Amachi a déjà tendu son piège et l’équipe du convoi a mordu à l’hameçon. Naruto et les autres arrivent à la rescousse, au moment où toute l’équipe se prépare au combat. Mais le groupe peut-il vaincre Amachi, alors même que celui-ci révèle sa véritable identité ? Et que se passera-t-il lorsque Isaribi comprendra jusqu’où Naruto est allé pour la sauver ?

Le combat entre Naruto et Amachi est de courte durée, enfin…apparemment. De son côté, Anko retrouve de plus en plus d’éléments de son passé, notamment un événement très important.

Naruto se voit confier comme mission de s'occuper d'un jeune garçon nommé Kuni.

Naruto, Kiba et Hinata sont chargés de trouver un trésor caché dans une grotte dans la montagne. À peine partis, Naruto et Kiba se disputent, c'est alors qu'ils se mettent à faire toutes sortes de paris, que Kiba gagne à chaque fois, mettant Naruto en rage. Arrivés à la grotte, rien ne se passe exactement comme prévu, Naruto n'en fait qu'à sa tête et décide de rentrer dans la grotte qui, d'après Kiba, n'est pas la bonne. Dans la grotte, Hinata se blesse, Kiba décide alors d'aller chercher le trésor tout seul.

Les doubles de Naruto, Kiba et Hinata sont prêts à partir pour le village de Konoha. Pendant que Kiba, Naruto et Hinata essayent de sortir de leur prison, Naruto et Kiba sont encore en train de se disputer. Grâce à la brillante intervention d'Hinata et de son Hakke, ils s'en sortent indemne. Kiba utilise alors « La morsure de l'homme bête » pour sortir de la grotte pendant que Naruto prend le coffre et ils laissent Hinata se remettre de sa blessure. Arrivés au village, Naruto et Kiba rencontrent leurs clones, qui sont aussi fragiles que de la porcelaine.

Naruto croise en chemin un messager ninja et le sauve d'une chute mortelle. Arrivé dans un petit village, il retrouve Jiraya, pensant que celui-ci était parti en mission.

Il y a deux cents ans, une étoile est tombée sur le village caché de l’Étoile. On dit que cette étoile a des pouvoirs mystiques. Mais comme le village compte trop peu de ninjas, il demande l’aide d’autres villages. Naruto accompagne Lee, Neji et Tenten en mission pour protéger le village.

Maintenant que l’étoile a été volée, le petit groupe n’a plus de pistes pour retrouver le voleur qui sait utiliser le chakra permettant de voler. Néanmoins, Sumaru et Akahoshi détiennent peut-être quelques réponses. Poursuivant leur recherche, Naruto apprend la vérité sur les parents de Sumaru. Mais quel est au juste le rapport entre Sumaru et le voleur ? Et quel est le secret de la berceuse de Sumaru ?

Sumaru kidnappé, la situation empire pour Naruto et son équipe. Pendant que Tenten et Rock Lee sont partis chercher des indices et des informations, Neji et Naruto croisent de nouveau le chemin du voleur.

Akahoshi dit que la mission pour les ninjas de Konoha est terminée. Mais Neji ne veut pas s’arrêter là. Naruto est sauvé par le voleur, qui est en réalité la mère de Sumaru combattant pour la fin de l’entraînement de l'Étoile. De leur côté, Lee et Tenten sauvent Sumaru et le ramènent vers les autres ninjas du village de l'Étoile. Akahoshi trouve l’Étoile mais Naruto et Natsuhi ne donneront rien sans se battre.

Après sa défaite face à Akahoshi et aussi en raison de l’effet de l'Étoile, Natsuhi se retrouve en bien mauvaise situation. Si elle utilise ses techniques une fois de plus, elle risque la mort. Sumaru passe un peu de temps avec sa mère, qu’il croyait morte et l’on chante à nouveau la berceuse. À présent, Natsuhi se prépare une dernière fois à aller voler l’Étoile, et elle est prête à donner sa vie pour ça !

Après qu’Akahoshi ait tenté d’exécuter Sumaru, Hakuto et les autres enfants se préparent à lutter pour protéger leur village. Ayant appris la vérité, les adultes condamnent également Akahoshi. Akahoshi a failli tuer Mizura, il n’aura donc aucune seconde chance. Akahoshi n’étant pas du genre à accepter la défaite, il fusionne l'étoile dans son corps, mettant ainsi son chakra hors de contrôle. Tous les autres ont été vaincus, Naruto est le seul à pouvoir défaire cette menace. Avec l’aide de l’esprit de Natsuhi, Naruto se prépare à démolir Akahoshi lors d’un ultime combat ! Mais sera-t-il suffisant ?

Infecté par un virus, Akamaru devient une menace pour Konoha, et devient la cible d'une traque impitoyable. Malgré le danger, Kiba Inuzuka est prêt à tout pour le protéger, et il s’enfuit avec lui. Tsunade donne alors l'ordre de le poursuivre, afin d'injecter à Akamaru un antidote fabriqué par l'équipe médicale. Hanna, sa grande sœur, décide de prendre cette responsabilité, et lorsqu'elle arrive à destination, elle est étonnée de voir qu'Akamaru a bien changé… Celui-ci ne se laissant pas faire, malgré les efforts de Naruto et elle-même, Hanna décide de le tuer, affirmant qu'il n'y a pas d'autres solutions. Mais Kiba, prêt à tout pour son chien, décide de raisonner ce dernier, qui le blesse alors gravement. Kiba est alors hospitalisé, et à peine réveillé, il explique à Tsunade, Naruto et sa sœur aînée, que si Akamaru l'a laissé en vie, ce n'est que par volonté.

Durant son entrainement, Naruto tombe sur un étrange animal légendaire, Onboo, une sorte de singe qui s'agrippe au dos des gens

Shino Aburame et Naruto sont envoyés pour une mission étrange : jouer un rôle durant un enterrement, et éviter de rire à tout prix. Shino ne semble pouvoir échouer, mais rien ne se passe comme prévu.

Naruto, Hinata Hyûga et Chôji Akimichi sont envoyés pour protéger des marchands durant leur périple. Mais la mission se corse rapidement : trois jōnin les traquent.

À la suite de la prise de contrôle de Nano no Kuni par les trois jōnin, et la mort de l'une des personnes que le trio de Konoha devait protéger, la vérité est révélée : ce qui devait être une mission de rang D est en fait une mission de rang A.

Les combats font rage contre les deux premiers jōnin.

Tandis que Tsunade envoie des ninjas à Nano no Kuni pour éviter une guerre avec les autres pays, Naruto est grièvement blessé par le jōnin qui utilise un ninjutsu magnétique. Pour sauver celui qu'elle aime, Hinata l'affronte en duel.

Chôji Akimichi, Hinata Hyûga et Yurinojo sont neutralisés par le troisième jōnin, qui intercepte Naruto avant qu'il ne réussisse à cacher Haruna. L'ultime combat s'annonce bien difficile.

Ino Yamanaka et Naruto sont envoyés en mission : Ino doit jouer le rôle d'une princesse.

Rock Lee ouvre un dojo afin que les ninjas expérimentés puissent le défier, et pour qu'il puisse ainsi perfectionner son entraînement. Tandis que son premier adversaire est Naruto, Maito Gai se déguise pour défier incognito son élève.

7 personnes disparaissent du côté de la cime Kubisaki. Tsunade y envoie Naruto Uzumaki, Kiba Inuzuka et Hinata Hyûga. Surpris par la pluie, ils entrent dans un château plein de mauvaises intentions.

Lee ne s’est pas présenté à son contrôle médical. On envoie Naruto à sa recherche. Avec l’aide de Tenten, il trouve Lee dans son dojo. À l’issue de son contrôle, Tsunade apprend à Lee qu’il ne doit pas faire le Lotus inversé. Gai essaie de lui remonter le moral en l’emmenant s’entraîner. Pendant l’exercice, Lee rencontre Yagura qui est entraîné par Gai. On décide alors d’un combat d’entraînement entre Lee et Yagura. Lee sera-t-il capable de vaincre le nouvel élève ?

Gai est retenu prisonnier dans une forteresse faite de batons d’entraînement. Yagura apparaît à l’extérieur et révèle qu’il n’est pas le vrai Yagura. Il est Genshou, l’aîné des frères Ryuudoin qui ont voulu se venger de Gai, car Gai a vaincu leur père, Ryuudin Agira. Naruto, Neji et Tenten arrivent alors pour sauver Gai. Les trois frères multiplient les batons d’entraînement. Neji trouve comment vaincre ces batons. Naruto, Neji et Tenten commencent à en démonter quelques uns mais les frères ordonnent d’autres actions aux batons. Lee arrive alors pour sauver ses amis. Lee pourra-t-il vaincre tous les batons et sauver Gai des mains des frères Ryuudoin ?

Naruto rencontre un vieil homme, ouvrier dans le batiment, du nom de Gennou. Mais lorsque Gennou vole les plans de certains des batiments de Konoha, les forces spéciales se lancent à sa poursuite. Il s’avère que Gennou est un ninja expert en pièges et qu’il était référencé dans le livre de Bingo. Puis, Gennou se fait exploser à l’aide d’une ceinture d’explosifs attachée autour de sa poitrine et les plans sont perdus. Craignant une invasion de Konoha par le commanditaire inconnu de Gennou, Tsunade demande à Shikamaru, ainsi qu’aux dix genins de Konoha, d’ouvrir l’œil. Mais ils ne trouvent personne pour les renseigner. Le seul qui pourrait leur fournir les informations nécessaires, c’est... Naruto.

Afin d’obtenir les informations dont ils ont besoin sur Gennou, les forces spéciales mettent Narotu en transe, espérant ainsi extraire ces informations des souvenirs de Naruto. Mais obtiendront-ils, même avec tout ça, les renseignements nécessaires ?

Naruto et les autres poursuivent leur quête d’indices sur Gennou ou son plan. Lors d’une enquête à l’Académie Ninja, ils trouvent un très curieux baton d’entraînement qui les mène à une découverte bien plus effrayante encore.

La ville de Konoha est à présent quadrillée d’explosifs, une décision s’impose : faut-il les ôter ou bien évacuer tous les habitants de Konoha. L’évacuation de tout le monde éveillerait les soupçons. L’équipe de Shikamaru doit donc supprimer tous les explosifs, sans que quiconque s’aperçoive de quoi que ce soit. Ils les suppriment et les anciens remarquent quelque chose d’étrange. Quelle est cette chose étrange dans les explosifs ? Et peuvent-ils déminer sans risquer d’en faire exploser un ?

Pendant que Shikamaru essaie de trouver ce que Gennou a planifié pour la suite, Naruto combat Gennou aux Grands Visages de Pierre. Shikamaru pourra-il empêcher à temps la prochaine étape du plan de Gennou de se réaliser ? Et Naruto sera-t-il capable de vaincre le Maître du Piège ?

Vous êtes vous déjà demandés quels étaient les cinq meilleurs combats ? Regardez cet épisode et vous aurez la réponse !

Une mystérieuse jeune fille peint Konoha, Naruto remarque que cette peinture comporte un ciel orageux. Il montre du doigt le ciel clair, mais des nuages l’envahissent aussitôt. Lorsque la jeune fille peint un éclair foudroyant la place de Hokage, un éclair apparaît ! La jeune fille est bientôt appréhendée par les forces spéciales qui précisent à Naruto que ce qu’il a vu est sans importance. Pendant ce temps, Kurenai annonce qu’elle quitte l’équipe 8 ! Quelles sont les raisons de ce départ ? Et quel est le rapport avec les événements présents ?

Yakumo est menacée de capture. Elle se sert de son genjutsu pour éviter d'être capturée. Kurenai l'aide à riposter aux bandits. Mais que cachent-ils tous les deux, Yakuma et Kurenai ? Naruto, Hinata, Sakura, Shino, Kiba et Gai sont sur la bonne voie pour le découvrir !

Naruto trouve l'occasion de parler à Yakumo d'elle et de Kurenai. Yakumo lui révèle alors que Kurenai ne voulait pas qu'elle devienne une shinobi. Mais elle, de son côté, veut prouver à ses parents qu'elle est capable de devenir une jounin. Naruto apprend que le troisième Hokage et Kurenai ont prévu de sceller ses pouvoirs.

Naruto et son groupe ramènent Kurenai et Yakumo à Konoha. Mais à leur arrivée, ils trouvent le village en ruines. Ils déposent Kurenai et Yakumo à l'hôpital, puis partent enquêter. Après avoir regardé tout autour de lui, Shino comprend que ce qu'ils voient sous leurs yeux n'est pas réel. Parti de son côté, Naruto apprend qu'ils sont victimes du pouvoir du genjutsu de Yakumo. Pourront-ils tous échapper à l'emprise de Yakumo ? Quel est son but dans tout ça ?

Le genjutsu de Yakumo est de plus en plus fort. Kurenai commence à disparaître et Naruto ne peut pas utiliser ses jutsus avec le genjutsu de Yakumo. Naruto sera-t-il contraint d'utiliser son pouvoir caché ?

Naruto et Kiba sont envoyés en mission pour livrer à Habotangai un trésor. La mission s'annonce longue étant donné que Naruto et Kiba ont un problème contre Shingemon, leur employeur.

Naruto, Sakura et Lee doivent escorter un prisonnier shinobazu, du nom de Gantetsu, jusqu'à la capitale du Pays de la Forêt. Ils viennent en renfort au groupe d'escorte, au cas où l'autre shinobazu, son équipier, viendrait le libérer. Arrivés au bateau qui doit transporter Gantetsu, ils rencontrent Todoroki qui semble haïr Gantetsu et être totalement persuadé de sa culpabilité. Les trois Ninjas seront-ils capables de repousser une attaque éventuelle des amis de Gantetsu, venus le libérer ? Et quel est le rapport entre Todoroki et Gantetsu ?

Lorsque le bateau se fend en deux, Naruto, Todoroki et Gantetsu se retrouvent séparés de Sakura, de Lee et de l'escorte. Naruto doit, à présent, faire face aux trois autres shinobazu qui accompagnaient Gantetsu. La situation s’annonce mal pour Naruto et Todoroki, quand le chef des shinobazu essaie de les tuer ! Ils s'échappent de justesse et se retrouvent dans la forêt, sur la base même des shinobazu. Naruto saura-t-il les sortir de là, ou bien devra-t-il faire confiance à Gantetsu pour les guider ?

Todoroki veut venger sa famille et tuer Gantetsu. Le seul inconvénient, c'est que Naruto refuse de le laisser faire, car ils doivent emmener Gantetsu à la capitale. Pendant que Naruto et Todoroki se battent, le shinobazu saisit l'occasion et capture Gantetsu. De leur côté, Lee et Sakura sont encerclés par des enfants qui exigent qu'ils leurs livrent Gantetsu. Naruto et Todoroki pourront-ils ramener Gantetsu ? Pourquoi les enfants veulent-ils Gantetsu ? Et comment se fait-il que l'un des enfants soit le petit frère de Todoroki ?

Naruto parvient à sauver Gantetsu et les enfants, mais a bien des ennuis quand Akio se fait enlever, et que Todoroki comprend que son frère est vivant. Naruto et Todoroki pourront-ils sauver Akio ?

Naruto sauve un enfant blessé. Mais il n'est pas de Konoha. Tsunade ordonne à Naruto de s'occuper de lui jusqu'à ce que la mémoire lui revienne. Que faisait cet enfant aux alentours de Konoha et pourquoi ne se souvient-il de rien ?

Naruto et Menma parviennent à persuader Tsunade de les laisser partir à la recherche de la mémoire de Menma. Mais c’est à la condition que Neji et Tenten les accompagnent pour les protéger. Ils passent par un village qui a été brûlé. Ils vont voir les villageois et leur demandent ce qui s'est passé. Malheureusement ceux-ci ne sont pas très heureux de les voir.

En apercevant la marque que Menma a au bras, Ran veut le tuer. Mais Neji s’interpose, en disant qu’il serait injuste de tuer un criminel qui n’a aucune mémoire de ses crimes. Ran finit par se ranger de son avis. Il opère Menma et lui sauve la vie. Mais les villageois sont mécontents. Sont-ils préparés à la deuxième attaque d’un groupe shinobi étranger ?

Un shinobi de sable, Matsuri, a été enlevé par un mystérieux ninja. Afin de les ramener, Gaara doit accepter le défi du mystérieux ninja. Naruto pourra-t-il empêcher ce combat, qui serait catastrophique, d’avoir lieu ?

Gaara, Temari et Kankurô poursuivent les ninjas. Naruto, Shikamaru, Kiba, Chôji, Ino et Lee courent leur venir en aide.

Shikamaru et Ino arrivent à sortir Temari des griffes de Kyaku, pendant que Kiba at Chôji secourent Konkuro. Naruto et Lee voient que Garra s’en sort très bien tout seul. Tout semble aller pour le mieux et le groupe est apparemment en bonne posture.