Carl Wormus egy baltimorei bárban iszogat, amikor felfigyel egy csinos, fekete hajú nőre, aki mélyen kivágott ruhát visel. Beszélgetni kezdenek, a téma a nő italában lévő jégkockák. Mint vízügyi szakember, Wormus elmondja a nőnek, hogy a kormány kloramint kever az ivóvízbe, amely egyáltalán nem olyan egészséges, mint azt állítják. Később Wormus kocsijával távoznak a bárból és egy felvonóhíd előtt meg kell állniuk. A titokzatos nő azonban váratlanul a gázpedálra tapos és a kocsi bezuhan a Potomac folyóba. Wormus kétségbeesetten próbál kimászni, de a halottnak hitt nő feléled és elkapja a férfi bokáját. Majd egyre mélyebbre kezdi húzni a sötét, hideg vízbe.

Egy tengerészkapitány számos biztonsági ellenőrzőkapun halad át egy II. világháborús hadihajó fedélzetén, majd elérkezik egy titkos laboratóriumba, ahol sejtmanipulációval foglalkoznak. Dr. Nordlinger nyit ajtót, átveszi a kapitánytól az üzenetet, és nem túl boldog a hír hallatán. A kapitány visszatér a hídra és utasítást ad Bamford elsőtisztnek, hogy irány a part.

Egy kisteherautó parkol Evelyn és Darren Mountjoy háza előtt, miközben a házaspár Scrabbel-t játszik odabent. Amikor a kutya ugatni kezd, Evelyn kiengedi az udvarra. Mindeketten hallják, ahogy az állat felvonít, majd csend lesz. Hirtelen elmegy az áram és sötétbe borul a ház. Darren kéri feleségét, rejtőzzön el a pincében, míg ő előveszi a revolverét. Meglát valakit a sötétben és rálő. Ám kiderül, az Evelyn volt, akinek száját betömték és kezeit összekötözték. Váratlanul furcsa hangokra lesz figyelmes, mintha valakik visszafelé beszélnének. Darren hátranéz és két alakot lát, akiknek démonpofájuk van.

Erwin Lukesh amikor hazaér, észreveszi, hogy Reyes ügynök szereli a biciklijét. Egy FBI rajtaütés közepén vagyunk, a lépcsőház be van kamerázva, egy furgonban, az utcán, pedig Doggett és Follmer figyelnek. Lukesh egy körözött bűnöző, aki a meggyilkolt nők nyelvét kivágja. Doggett aggódik Reyes biztonságáért. Minden esetre, az azonosítás végett, meg kell várniuk, amíg a férfi kinyitja a postaládáját, a 4-D lakáshoz tartozót. Lukesh azonban megérzi, hogy valami nincs rendben és elhalad a postaládák előtt.

Különböző biztonsági kamerák felvételeit látjuk, amelyeken Mulder és Scully látszik az együtt töltött évek során. Nemcsak a nyomozói munkájuk van megörökítve, hanem privát pillanataik is, a saját lakásaikban. Egy friss felvételen azt látjuk, hogy Scully egy vasútállomás peronján sír egy holttest mellett.

Doggett felébred egy elhagyatott épületben, ahol egy kábítószeres fickó épp ellopja az egyik cipőjét. Kirohan utána az utcára, és megdöbbenve látja, hogy egy lepusztult városka főutcáján áll. Minden felirat spanyolul van. Kéri vissza a cipőjét, de a kábszeres spanyolul rendőrségért kiáltozik. Doggett megpróbálja elmagyarázni a rendőrnek, hogy a másik ellopta a cipőjét. Hallva az amerikai akcentusát, a rendőr az útlevelét kéri. Mivel John nem találja, a zsaru a nevét kérdi. Doggett azt sem tudja.

Reyes ügynök átveszi a vezetést az egyik X-akta nyomozásában. Az ügy főszereplője egy férfi, akit élve kibeleztek azt követően, hogy látomásai voltak más élve kibelezett emberekről. Reyes-nek Scully szakértelmére is szüksége van a nyomozás során...

Az FBI egy űrhajó darabjaira bukkan Afrika partjainál, de megpróbálják távol tartani az ügyet az X-aktáktól, leginkább Scullytól, aki számára különösen nagy jelentőséggel bírna ez az információ.

Scully mindent megtesz, hogy visszaszerezze William-et az emberrablóktól. Miután az FBI kísérletei sorozatosan kudarcba fulladnak, a saját kezébe veszi az irányítást...

Reyes súlyos autóbalesetet szenved. Kórházba viszik, ahol az orvoscsoport megvizsgálja. Amikor Dr. Preijers belevilágít a szemébe, Monica felébred. Ám ekkor már egy másik kórházban van, a szobában pedig teljesen egyedül fekszik. Nincsenek se orvosok, se betegek. Rádöbben, hogy az űrben lebeg. A valóságban azonban a kórházban fekszik, s kómában van. Doggett Scully segítségét kéri.

Egy esős éjszakán egy szerelő érkezik egy brooklyni ház elé. Becsenget a házba, s egy lány nyit ajtót. A háziak nem tudnak semmiféle meghibásodásról, a szerelő is értetlenül áll az eset előtt. Hirtelen érthetetlen módon a házigazda, majd a lánya és a felesége is holtan esnek össze. Ekkor kinyílik a bejárati ajtó és két rendőr ront be, akik elfogják a szerelőt. Az egyik rendőr Dogget.

Egy kaszinóban lapokat osztanak egy csapat szerencsejátékosnak, akik közül az egyiknek, Mad Wayne-nek, börtönszerű tetoválás van a karján. A terem másik felében ül Mr. Burt, akivel Wayne szóba elegyedik, majd kisvártatva a toalettre megy, ahonnan sikoltás hallatszik. Ekkor Mr. Burt a pikk ászt, a halál kártyáját fordítja fel a pakliból. Scully az újságokból értesül az esetről.

A nyolcéves Tommy Conlon éjszaka recsegő hangot hall az ágya alól, félelmében odahívja apját, aki bár lát valamit, nem szól a fiának. Amikor a kisfiú újra hallja a bizonyos hangokat, ki akar szaladni szobájából, de apja az ajtó túloldalán nem engedi. Tommy édesanyja korábban öngyilkosságot követett el, azonban fia azt állítja: egy szörny végzett vele. Leyla Harrison ügynök megkeresi Scullyt az ügy kapcsán.

A Karib-tenger vízén ringó jacht fedélzetén Morris Fletcher ex-feketeruhás, egy bájos hölggyel enyeleg, miközben egy motorcsónak közelít feléjük. Az érkező férfiak elrabolják a lányt, és gázolajjal locsolják be a hajót. Fletcher a tengerbe veti magát, mielőtt a jacht felrobban. A lemerülő roncsok között jól kivehető egy UFO tervrajza is.

Egy vidéki farmon két szociális gondozó találkozik a Van de Kamp család két tagjával, hogy megbeszéljenek egy örökbefogadást. Amikor a férj aláírja a szükséges dokumentumokat, a két nővér átadja a kisbabát: Williamet.

Doggett behatol egy üresen álló házba a város elhagyatott részében. Egy alak rohan ki az egyik szobából, de John nem tudja elkapni. Tovább vizsgálva az épületet, Doggett kaparászást hall a fal mögül, ahol friss a vakolat. Kibontja egy picit a falat és a lyukból vér folyik ki.

A kaliforniai Van Nuys-ban, két fiatal, Mike és Blake, a kocsijuk motorházán fekve iszogatnak, amikor Blake azt mondja, hogy az előttük álló házban forgatták egykor, a hetvenes években, a népszerű tévésorozatot, a Brady-családot. Mike ezt nem hiszi el, így a két fiú bemegy az üres házba körülnézni. Mike kénytelen elismerni, hogy a ház belülről tényleg úgy néz ki, mint az a műsorban is látható volt. Hirtelen egy rugby-labda gurul le az emeletre vezető lépcsőről és Blake visszaemlékszik az egyik epizódra, ahol az egyik főszereplő orra betört, mert megrúgták egy labdával. Mike megijed és kirohan, de Blake felmerészkedik az emeletre. Itt szembetalálkozik két gyerekkel, akik pont úgy néznek ki, mint a sorozat szereplői. Pillanatokkal később Blake teste nagy erővel rázuhan annak a kocsinak a tetejére, amelyben Mike várakozik.

Mulderék megérkeznek a Mount Weather Complex kormányzati épületbe, Bluemontba. A többieket bevezetik, Muldernek azonban sikerül megszöknie a csoporttól. Behatol egy biztonsági területre, belép az egyik számítógépre, ahol elképesztő dolgokra bukkan. Ekkor Knowle Mulderre támad, de Krycek segít neki. Végül Mulder átlöki Rohrer-t a korláton, aki egyenesen a mélybe zuhan az elektromos vezetékek közé. Az őrök elfogják Muldert és börtönbe zárják. Skinner közben elárulja Scullynak, hogy Mulder visszatért, és együtt meglátogatják a börtönben. Miután Scullyék elmentek, megérkezik Krycek, hogy beszéljen Mulderrel. Később Kersch Quantico-ba megy, hogy a hadseregnél közbenjárjon Mulder érdekében. Skinner elmondja Muldernek, hogy hamarosan kezdődik a tárgyalás, amin az élete múlhat. Mulder Skinnert kéri fel a képviseletére, aki elfogadja a megbízást. Doggett és Reyes közben híreket hoznak: a hadsereg megtálalta Knowle Rohrer holttestét, ami elvileg lehetetlen, mivel Rohrer halhatatlan. Mulder elmondja Scullynak, hogy Új-Mexikóban bujkált az utóbbi időben, az igazságot keresve, mivel korábban fontos dolgokra bukkant. Másnap megkezdődik Mulder tárgyalása. Skinner kétségbe van esve, mivel a hadbírósági tárgyaláson elsőszámú tanuja egyszerűen eltűnt. Scully a tanuk padján arról beszél, hogyan került kapcsolatba az X-aktákkal, hogy hisz az idegenek létezésében, és beszámol a kormányzati összeesküvésekről, amelyekkel akadályozták munkájukat. A következő tanu Jeffrey Spender, aki a rejtélyes cigarettázó férfiról, Mulder eltűnt húgáról és titokzatos körülmények között eltűnt emberekről beszél. Ekkor megjelenik X, és tanácsot ad, hogyan találják meg az eltűnt elsőszámú tanut, Maria Covarrubiast. Skinner őt szólítja legközelebb. A nő idegen vírusokról és vakcinákról, Krycekről és a Szindikátusról mesél. Skinner ekkor Gibson Praiset hívja a tanuk padjára, aki azt állítja, ő bújtatta Muldert a sivatagban egy egész éven át, és leleplezi a bíróság egyik tagját is. Doggett elmondja, hogy Mulder nem lehet bűnös Rohrer megölésében, mivel Rohrer halhatatlan. Reyes Scully gyerekéről beszél. Miután Scully és Reyes megnéznik Rohrer állítólagos holttestét, Scully egyértelmű bizonyítékot talál arra, hogy a test nem Knowle Rohreré. Bizonyításként a bíróságra viszi azt, azonban Kersh megsemmisíti. Másnap Muldert bűnösnek találják, az ítélet halálbüntetés. Aznap éjszaka Doggett és Skinner betörnek a börtönbe és kiszabadítják Muldert. Kersh azt tanácsolja Muldernek és Scullynak, hogy menjenek azonnal Kanadába, és 24 órán belül hagyják el a kontinenst. Másnap reggel Doggett és Reyes megtudják, hogy az X-aktákat lezárták, és az irodájuk végleg bezárt. Mulder és Scully Új-Mexikóba tartanak és útközben találkoznak a cigarettás férfival. A férfi elmondja Scullynak, hogy Mulder a számítógépen egy kormányzati adatbázisra bukkant, mely szerint 2012 december 22-én az idegenek inváziót terveznek a Földön. Rohres még mindig a nyomukban van, azonban sikerül elmenekülniük. Mulder és Scully egy Roswell-i hotelszobába mennek. Mulder úgy érzi, kudarcot vallott, Scully viszont azzal bíztatja, hogy ő tudja, Mulder soha nem adja fel, és vele bármikor végigcsinálná újra az elmúlt kilenc évet...

Elkezdődik Mulder tárgyalása, akit Knowle Roher meggyilkolásával vádolnak. Védőügyvédjéül Skinnert kéri fel, aki elsőként Scullyt idézi a tanúk padjára. Igazi meglepetésként - az ufókkal és a kormánnyal kapcsolatban is - fény derül az igazságra, amely valóban odaát van.