Eleva Madoka are un vis ciudat și află la școală a doua zi că are o nouă colegă de clasă: o fată din visul său.

Madoka și Sayaka ajung într-o situație disperată și sunt salvate de Mami Tomoe, o fată cu puteri magice. Apoi, Mami le invită la ea acasă.

Madoka și Sayaka se obișnuiesc cu vânătoarea de vrăjitoare a lui Mami, dar dorințele lor rămân neclare. Mami își dezvăluie trecutul în fața lor.

După o bătălie brutală la care sunt martore, Madoka și Sayaka își dau acum seama ce înseamnă să ai de-a face cu lumea magiei.

Acum că dorința Sayakăi s-a împlinit prin încheierea unui contract cu Kyubey, mintea îi este clară și nu regretă că a devenit o fată magică.

Sayaka, deprimată, ezită între dorința îndeplinită prin acceptarea destinului de a lupta și prețul ridicat plătit pentru asta.

Grație magiei vindecătoare, Sayaka poate lupta fără să fie rănită. Dar ea pare epuizată. În drum spre casă, Madoka face comentarii despre stilul de luptă al Sayakăi.

Încolțește o Sămânță a durerii și apare o nouă vrăjitoare. Cu ajutorul Homurei, Kyoko reușește să scape din labirintul vrăjitoarei, luând-o și pe Sayaka.

Noua fată timidă este foarte speriată și rușinată. Ea se prezintă cu sfială, simțind toate privirile din clasă ațintite asupra ei.

Kyubey apare în fața Madokăi, care este sfâșiată de durere. Neînțelegându-i emoțiile, el îi spune povestea rasei umane și a rasei lui.

Madoka apare în fața Homurei, foarte hotărâtă și îi spune acesteia: „Mi-am găsit dorința”. Dar care va fi decizia ei?