Garmadon acidentalmente dá vida ao impiedoso Capitão Soto e seus piratas e agora os ninjas precisam evitar que eles saqueiem a cidade de Ninjago.

Os nossos heróis voltam para o Internato de Darkly e descobrem que caíram em uma armadilha do Lorde Garmadon e seus clones ninjas.

Quando os ninjas descobrem que o Mojo Dojo de Darreth será destruído, eles entram na corrida anual NinjaBall para ganhar o prêmio que os ajudará a salvar o Dojo.

Os ninjas impedem que Garmadon use sua mega-arma para dar vida a um mostro fossilizado, mas acabam transformados em crianças e precisam da ajuda do Lloyd.

Garmadon volta no tempo para mudar o passado e livrar o futuro dos ninjas, mas os ninjas o seguem e tentam detê-lo usando as Armas Douradas.

Os ninjas enfrentam o conteúdo de uma exibição no museu que ganha vida através do veneno tóxico do Grande Devorador.

The ninjas try to flee from the Stone Army, which has been brought to life by the Devourer's toxic venom. Garmadon tries to seize control of the army.

Lloyd, Sensei Wu, Misako e os ninjas viajam para a Ilha da Escuridão para tentar encontrar o Templo de Luz que poderá restaurar seus poderes elementares.

Após derrotar o Exército de Pedra, os ninjas seguem para o Templo da Luz para recuperar seus poderes elementares, concentrando-os em Lloyd.

Os ninjas tentam levar o Capacete da Escuridão do Garmadon de volta a seu lugar no Relógio Celestial, impedindo assim a batalha final entre Lloyd e seu pai.

Garmadon usa sua nova super-arma para transformar Jamanakai numa vila do mal, permitindo que o espírito do Lorde Supremo se apodere de seu corpo.

Garmadon usa sua super-arma e uma grande escuridão cai sobre Ninjago, mas os ninjas acabam descobrindo que a luz é mais poderosa do que a escuridão.