Il preside della facoltà di legge Alvah Case è incaricato di investigare le cause della rivolta e la gestione dell'incidente da parte del governatore Devlin.

Il Paradiso riapre dopo essere rimasto chiuso dieci mesi. Sebbene McManus cerchi di riportare la calma, continuano i disordini. Peter Schibetta assume la gestione della cucina per vendicarsi di Adebisi che gli ha ucciso il padre.

Alvarez sa chi ha stuprato la figlia di Glynn, ma non vuole dirlo al direttore. Wangler fa progressi a scuola, ma il suo compagno di cella, Adebisi, non ama l'istruzione. Quando il giudice di Hill è condannato per corruzione, Said si occupa del caso.

L'appello di Augustus Hill è respinto nonostante gli sforzi di Said, che ha miglior fortuna con le poesie di Poet. Intanto, O'Reily sopravvive alla lumpectomia e ora si concentra sulla dott.essa Nathan.

Gli animi tra loro si infiammano e Adebisi avvelena Schibetta, ma non in modo fatale. Ora che suo fratello si è costituito per omicidio, Glynn non deve più alcun favore a Schibetta.

Schillinger prova ad arruolare Said per farlo uscire di prigione. Ripresosi dall'avvelenamento, Schibetta è aggredito da Adebisi e perde il "controllo" di Oz. Intanto, Alvarez è spodestato al comando dei Latinos da Raoul Hernandez, detto El Cid.

Cyril O'Reily, fratello di Ryan, è incarcerato e finisce sotto il controllo di Schillinger. Ryan prova a portarlo a Oz, ma Cyril finisce nella fossa. El Cid dice ad Alvarez che ha solo un modo per "restare nel gioco".

Nel finale della seconda stagione, Wittlesey è trasferito tra i criminali comuni e rimpiazzato da Metzger, un nazi. Mack e un altro Ariano provano a scappare dal buco di Busmalis e Rebadow. Hill ha l'idea di fuggire da Oz nascondendosi in una bara.