Il preside della facoltà di legge Alvah Case è incaricato di investigare le cause della rivolta e la gestione dell'incidente da parte del governatore Devlin.

Alvarez sa chi ha stuprato la figlia di Glynn, ma non vuole dirlo al direttore. Wangler fa progressi a scuola, ma il suo compagno di cella, Adebisi, non ama l'istruzione. Quando il giudice di Hill è condannato per corruzione, Said si occupa del caso.

L'appello di Augustus Hill è respinto nonostante gli sforzi di Said, che ha miglior fortuna con le poesie di Poet. Intanto, O'Reily sopravvive alla lumpectomia e ora si concentra sulla dott.essa Nathan.

Gli animi tra loro si infiammano e Adebisi avvelena Schibetta, ma non in modo fatale. Ora che suo fratello si è costituito per omicidio, Glynn non deve più alcun favore a Schibetta.

Schillinger prova ad arruolare Said per farlo uscire di prigione. Ripresosi dall'avvelenamento, Schibetta è aggredito da Adebisi e perde il "controllo" di Oz. Intanto, Alvarez è spodestato al comando dei Latinos da Raoul Hernandez, detto El Cid.

Cyril O'Reily, fratello di Ryan, è incarcerato e finisce sotto il controllo di Schillinger. Ryan prova a portarlo a Oz, ma Cyril finisce nella fossa. El Cid dice ad Alvarez che ha solo un modo per "restare nel gioco".

Nel finale della seconda stagione, Wittlesey è trasferito tra i criminali comuni e rimpiazzato da Metzger, un nazi. Mack e un altro Ariano provano a scappare dal buco di Busmalis e Rebadow. Hill ha l'idea di fuggire da Oz nascondendosi in una bara.