Audrey, Nathan i Duke muszą zapłacić ogromną cenę za zwycięstwo nad Williamem: Duke jest na skraju śmierci, Mara przejęła kontrolę nad ciałem Audrey, a tajemniczy Znak w nadprzyrodzony sposób zamyka usta mieszkańcom miasteczka.

Duke nie może pogodzić się ze śmiercią Jennifer, Nathan szuka w Marze choćby cienia Audrey, a Dwight musi utrzymać Haven w ryzach.

Nathan decyduje się na desperacki krok, by chronić Marę przed rozwścieczonymi mieszkańcami Haven. Dwight i Duke muszą zająć się Znakiem, przez który miasteczko może stanąć w płomieniach.

Dwight, nowy przywódca Straży, nie zgadza się z Nathanem w sprawie Mary. Dwight chce, by kobieta za wszelką cenę położyła kres Znakom, ale Nathan jest przekonany, że gdzieś w środku wciąż znajduje się Audrey.

Vince i Dave jadą do Karoliny Północnej, by odkryć sekrety przeszłości. Tymczasem Haven nawiedza Znak powodujący zamianę ciał .

Mara próbuje wykorzystać Znak dla własnych korzyści. To zmusza Nathana i Duke'a do niebezpiecznego zagrania, które ma sprowadzić Audrey z powrotem, nim stracą ją na zawsze.

Kiedy Mara przestaje być zagrożeniem, Audrey i Nathan ponownie są razem. Niestety rozdziela ich paranormalny Znak.

Kiedy Audrey przestaje być odporna na Znaki i grozi jej utrata Nathana, musi szukać pomocy z zewnątrz.

Największe sekrety Haven są zagrożone, gdy wielu mieszkańców Haven z Audrey włącznie zapada na tajemniczą chorobę, w momencie kiedy miasto odwiedza pewna pani doktor.

Główni bohaterowie nie mogą dojść do porozumienia w kwestii pani naukowiec z centrum zapobiegania chorobom zakaźnym CDC, której dociekliwość może doprowadzić do ujawnienia prawdy o Znakach, co może też pomóc w ich usunięciu.

Przeciążenie Duka kłopotami i Znakami oraz dziwne objawy u Audrey zmuszają oboje do poszukiwania pomocy u potencjalnie niebezpiecznych sojuszników.

Rozdarcie wewnętrzne bohaterów doprowadza do wielu konfliktów. Wszystko zmienia przerażające odkrycie.

Kiedy plany Mary zostają w końcu ujawnione, światu grozi zagłada, której Audrey i Nathan starają się zapobiec raz na zawsze.

Duke uwalnia Znaki. Bohaterowie Haven muszą walczyć o utrzymanie równowagi w miasteczku.

Kiedy za sprawą Znaku ciemność staje się śmiertelnie niebezpieczna, główni bohaterowie muszą walczyć o utrzymanie spokoju w mieście.

Audrey i Dwight desperacko próbują ratować Nathata przed gniewem mieszkańców domagających się jego głowy.

Audrey zostaje uwięziona w pozornie idealnym zmyślonym świecie. Nasi bohaterowie muszą działać szybko, jeśli nie chcą jej na zawsze stracić.

Nowe zagrożenie niweczy plany położenia kresu Znakom.

Główni bohaterowie, podzieleni z powodu wielkiej straty, szukają tajemniczego seryjnego mordercy.

Wyprawa w przeszłość odkrywa największą tajemnicę Haven.

Kiedy Nathan wyrusza na misję, która może uratować Haven, Audrey odwiedza niespodziewany gość.

Stary Znak pęta bohaterów, czyniąc ich łatwym łupem dla niebezpiecznego mordercy.

Audrey staje twarzą w twarz z niebezpiecznym przeciwnikiem, a Nathan i Dwight toczą walkę z byłym sprzymierzeńcem.

Nadzieja na usunięcie Znaków przygasa, więc główni bohaterowie podejmują ostatnią próbę uratowania Haven, choć jej koszt może być zbyt wielki.

Dochodzi do ostatecznego starcia. Walka bohaterów z Croatoanem przybiera nieoczekiwany obrót.