Audrey, Nathan i Duke muszą zapłacić ogromną cenę za zwycięstwo nad Williamem: Duke jest na skraju śmierci, Mara przejęła kontrolę nad ciałem Audrey, a tajemniczy Znak w nadprzyrodzony sposób zamyka usta mieszkańcom miasteczka.

Duke nie może pogodzić się ze śmiercią Jennifer, Nathan szuka w Marze choćby cienia Audrey, a Dwight musi utrzymać Haven w ryzach.

Nathan decyduje się na desperacki krok, by chronić Marę przed rozwścieczonymi mieszkańcami Haven. Dwight i Duke muszą zająć się Znakiem, przez który miasteczko może stanąć w płomieniach.

Dwight, nowy przywódca Straży, nie zgadza się z Nathanem w sprawie Mary. Dwight chce, by kobieta za wszelką cenę położyła kres Znakom, ale Nathan jest przekonany, że gdzieś w środku wciąż znajduje się Audrey.

Vince i Dave jadą do Karoliny Północnej, by odkryć sekrety przeszłości. Tymczasem Haven nawiedza Znak powodujący zamianę ciał .

Mara próbuje wykorzystać Znak dla własnych korzyści. To zmusza Nathana i Duke'a do niebezpiecznego zagrania, które ma sprowadzić Audrey z powrotem, nim stracą ją na zawsze.

Kiedy Mara przestaje być zagrożeniem, Audrey i Nathan ponownie są razem. Niestety rozdziela ich paranormalny Znak.

Kiedy Audrey przestaje być odporna na Znaki i grozi jej utrata Nathana, musi szukać pomocy z zewnątrz.

Największe sekrety Haven są zagrożone, gdy wielu mieszkańców Haven z Audrey włącznie zapada na tajemniczą chorobę, w momencie kiedy miasto odwiedza pewna pani doktor.

Główni bohaterowie nie mogą dojść do porozumienia w kwestii pani naukowiec z centrum zapobiegania chorobom zakaźnym CDC, której dociekliwość może doprowadzić do ujawnienia prawdy o Znakach, co może też pomóc w ich usunięciu.

Przeciążenie Duka kłopotami i Znakami oraz dziwne objawy u Audrey zmuszają oboje do poszukiwania pomocy u potencjalnie niebezpiecznych sojuszników.

Rozdarcie wewnętrzne bohaterów doprowadza do wielu konfliktów. Wszystko zmienia przerażające odkrycie.

Kiedy plany Mary zostają w końcu ujawnione, światu grozi zagłada, której Audrey i Nathan starają się zapobiec raz na zawsze.

Duke uwalnia Znaki. Bohaterowie Haven muszą walczyć o utrzymanie równowagi w miasteczku.

Kiedy za sprawą Znaku ciemność staje się śmiertelnie niebezpieczna, główni bohaterowie muszą walczyć o utrzymanie spokoju w mieście.

Audrey i Dwight desperacko próbują ratować Nathata przed gniewem mieszkańców domagających się jego głowy.

Audrey zostaje uwięziona w pozornie idealnym zmyślonym świecie. Nasi bohaterowie muszą działać szybko, jeśli nie chcą jej na zawsze stracić.

Nowe zagrożenie niweczy plany położenia kresu Znakom.

Główni bohaterowie, podzieleni z powodu wielkiej straty, szukają tajemniczego seryjnego mordercy.

Kiedy Nathan wyrusza na misję, która może uratować Haven, Audrey odwiedza niespodziewany gość.

Nathan, by przeżyć, musi zawrzeć sojusz z wrogiem. Duke zmaga się ze swoim przerażającym przeznaczeniem, kiedy Dave próbuje uwolnić się spod wpływu Croatoana.

Stary Znak pęta bohaterów, czyniąc ich łatwym łupem dla niebezpiecznego mordercy.

Audrey staje twarzą w twarz z niebezpiecznym przeciwnikiem, a Nathan i Dwight toczą walkę z byłym sprzymierzeńcem.

Nadzieja na usunięcie Znaków przygasa, więc główni bohaterowie podejmują ostatnią próbę uratowania Haven, choć jej koszt może być zbyt wielki.

Dochodzi do ostatecznego starcia. Walka bohaterów z Croatoanem przybiera nieoczekiwany obrót.