Os irmãos Elric participam de uma caçada ao poderoso Isaac, um ex-Alquimista Federal decidido a derrotar Führer Bradley.

Uma visão do passado revela a dor e o desespero que levaram os irmãos Elric a quebrar o maior tabu da alquimia: a transmutação humana.

Ciência e fé entram em conflito quando os irmãos Elric confrontam padre Cornello, que pode estar usando a pedra filosofal para manipular seus fiéis.

Os irmãos conhecem Shou Tucker, um pesquisador especialista em alquimia e em toda a crueldade que pode acompanhá-la.

Edward e Alphonse são atacados por Scar, um assassino incrivelmente poderoso que jurou vingança contra os alquimistas federais.

Os irmãos conhecem o Dr. Marcoh, um alquimista federal arrependido de seus erros e com informações importantes sobre a pedra filosofal.

Após descobrir o terrível ingrediente da pedra filosofal, os irmãos entram em um laboratório secreto em busca de mais pistas.

Ed e Al lutam contra os guardas do Quinto Laboratório. Em meio ao caos, o segredo da pedra filosofal pode estar escondido entre os escombros.

Al fica irritado ao pensar que ele só existe graças a seu irmão, e apenas Winry pode convencê-lo a mudar de ideia.

Quando a conspiração em torno da pedra filosofal chega ao alto escalão militar, um dos maiores aliados de Mustang é assassinado.

Nem a alquimia pode ajudar os irmãos quando uma nova amiga entra em trabalho de parto.

Ao visitar sua professora de infância, os irmãos relembram as dificuldades de entender o conceito de troca equivalente.

Al é sequestrado e Ed não consegue resgatá-lo. Izumi prova mais uma vez que só quer o bem dos irmãos.

King Bradley se mostra um adversário de peso para Ganância. Mas o homem que destrói o escudo máximo é mais potente até que o próprio Führer.

Os irmãos entram em conflito com Ling Yao, Lan Fan e Fu, visitantes de Xing que estão procurando pela pedra filosofal.

Inveja ainda está à solta entre os alquimistas, e outro homúnculo está prestes a se infiltrar na sociedade.

Até mesmo os seguidores mais leais do Alquimista das Chamas estão desconfiados das medidas controversas que ele tomou contra o suspeito do assassinato de Maes Hughes.

Em uma viagem a uma terra distante, Ed encontra pistas importantes sobre o encontro de Mustang e Ross e descobre um segredo sobre os pais de Winry.

Mustang, Alphonse, Havoc e Hawkeye se dividem para fazer buscas em um laboratório militar. Se depender de Luxúria, ninguém sairá vivo de lá.

A visita de Hohenheim termina com um alerta importante para Pinako. Entre as ruínas de sua infância, Ed encontra uma esperança para Al.

Ed e Al criam uma estratégia para atrair os homúnculos para fora de seu esconderijo, mas podem acabar morrendo pelas mãos de Scar.

Depois de saber do envolvimento de Scar na morte de seus pais, Winry é tomada pelos mesmos sentimentos assassinos do inimigo.

Uma parceria entre Mustang e Ling Yao resulta na captura de um homúnculo, mas também chama a atenção de um espião.

Os irmãos ficam confusos com os poderes de Gula. Mustang age de acordo com suas suspeitas sobre Bradley em uma situação difícil.

Ed e Ling enfrentam um inimigo horrível dentro de Gula. Mustang precisa observar calado enquanto Bradley divide seus soldados.

Verdades preocupantes vêm à tona quando Al encontra Pai. Ed novamente quebra o maior tabu da alquimia.

Hohenheim reflete sobre a loucura do homem: a dor que vêm com a família, as verdades da alquimia e as raízes da guerra.

Os irmãos ficam frente a frente com Pai e o veem criar um novo homúnculo com uma alquimia que parecia ser impossível.

Se os irmãos derem um passo em falso, as pessoas que mais amam sofrerão nas mãos de Bradley. E talvez a pedra filosofal não seja realmente necessária.

Edward ouve a história de uma época em que os soldados eram obrigados a cometer genocídio e descobre os horrores da batalha de Ishval.

Mustang descobre que ainda tem aliados, mas seus inimigos também. Os homúnculos libertam um assassino.

Um encontro secreto permite que Mustang incentive um velho amigo a ter uma nova ambição. Ed e Al conhecem um grande fã.

As fronteiras ao norte se tornam um campo de batalha quando Kimblee se aproxima de Scar. Ed e Al tentam chegar a Fort Briggs.

Os soldados de Fort Briggs continuam vigilantes contra as ameaças dos espiões. O local parece impenetrável, mas um invasor violento prova o contrário.

Ed descobre uma conspiração de grandes proporções que já fez inúmeras vítimas. As evidências mostram que a matança chegará a Fort Briggs.

Enquanto Raven tenta corromper Armstrong, os irmãos aguardam em uma cela. Tempos atrás, seu pai também esteve em uma situação parecida.

Hawkeye fica chocada ao descobrir o primeiro homúnculo. Kimblee faz uma oferta para Edward, mas primeiro ele precisa aceitar uma difícil missão.

Scar é encurralado por uma dupla de quimeras, e os irmãos acabam se tornando seus aliados. A tentativa de Winry de confrontar Scar acaba em tragédia.

O responsável pelo sequestro de Winry é revelado, mas ainda é necessário um plano de resgate. Uma tempestade brutal está chegando, e só Alphonse poderá enfrentá-la.

Muito tempo atrás, o sangue de um escravo foi usado em um experimento que criou um ser estranho de formato indefinido.

Ligados por muito mais do que apenas sangue, os irmãos Elric compartilham alegrias e tristezas. Mas agora, a ligação mística entre suas almas pode ser fatal.

Os esforços de May e Marcoh para desvendar a pesquisa do irmão de Scar dão certo, mas pode ser tarde demais para impedir uma catástrofe.

No gélido norte, os soldados de Fort Briggs enfrentam um exército invasor. Marcoh lidera um ataque contra Inveja.

Hohenheim e Alphonse aproveitam a chance de se reconectar, e o encontro inspira o pai a compartilhar seus segredos com os filhos.

Pequenos alertas podem ser vistos em toda parte: o dia prometido está chegando.

Os planos para a tomada do país acabam sendo descobertos. O caos se multiplica depois que um assassino atinge um líder poderoso.

Uma voz sinistra sai da armadura de Al. Ed e Ganância são atacados.

Depois de investigar as origens estranhas da árvore genealógica de Bradley, Mustang reúne suas tropas mais leais.

Com a ajuda de seu pai, Al toma providências para conter o monstruoso Orgulho.

Mustang lidera uma força de ataque das tropas do norte contra a Central e acolhe alguns conhecidos do passado.

A equipe de Ed enfrenta uma horda de manequins abomináveis controlados por almas humanas.

De posse de uma pedra filosofal, Alphonse enfrenta Orgulho e Kimblee.

Um boato sobre um suposto golpe de estado ajuda os rebeldes. May atrai Inveja para uma armadilha que leva a um confronto com Mustang.

Edward percebe o plano de Inveja de causar discórdia entre o grupo. A situação começa a mudar na batalha entre os Armstrongs e Preguiça.

Uma batalha termina e outra começa. Hohenheim e Pai lutam pela pedra filosofal.

Bradley e Fu se envolvem em uma luta mortal. O grupo de Edward encontra o médico que criou Bradley e enfrenta um novo desafio.

Ling evoca os poderes de Ganância para destruir o inimigo. O grupo de Edward encontra Hohenheim e cai em uma armadilha.

Edward, Alphonse, Hohenheim, Izumi e Mustang aguardam seu destino no covil do Pai.

Pai executa seu plano de absorver todas as almas em Amestris para desbloquear o céu e o Olho de Deus.

Um eclipse traz esperança para as almas amestrianas. Edward tem sua luta final contra Orgulho.

Edward, Armstrong e Izumi encontram uma forma de impedir os ataques do Pai. Alphonse faz um sacrifício para ajudar Edward.

Após a batalha final contra Pai, Edward recompensa o sacrifício de Alphonse. Hohenheim finalmente encontra paz.

Os irmãos Elric voltam para Resembool para encarar um novo futuro. Edward e Winry finalmente expressam seus sentimentos.