Após uma longa viagem em alto-mar, o barco de Naruto finalmente chega em seu destino: a Ilha Paradisíaca do País do Raio. Mas antes que o pessoal da Folha possa comemorar, uma lula gigante ataca! Por sorte, a tripulação é salva por Bee, o Jinchuuriki do Oito Caudas.

Motoi alerta Naruto que ele ainda não está pronto para treinar controle de Besta de Cauda. Sem se intimidar, Naruto pede a Motoi que fale mais sobre Bee.

Com Killer Bee como seu novo mestre, Naruto começa seu treinamento para controlar o poder de sua Besta de Caudas.

Dentro de sua mente, Naruto continua sua batalha contra o Nove Caudas para controlar seu imenso poder.

Dezesseis anos atrás, o Quarto Hokage Minato e sua esposa Kushina estavam esperando seu primeiro filho, a alegria do casal.

Minato é forçado a usar seu Justu de Teleporte Voo do Deus Relâmpago, deixando sua esposa Kushina para trás para salvar seu filho recém-nascido, Naruto, de um malfeitor mascarado.

Minato usa sua Técnica de Transportação para retirar o Nove Caudas da Folha.

Gai chega para ajudar Naruto com seu treinamento. Mas acaba encontrando Kisame, que se infiltrou na ilha para achar Naruto e Killer Bee.

Kisame tenta escapar, mas Gai impede. Com o inimigo preso, Aoba entra em sua mente atrás de mais informações sobre a Akatsuki.

Madara aparece na Vila da Chuva procurando o corpo de Nagato com seu Rinnegan.

Madara usa o Jutsu Proibido Izanagi para escapar da armadilha de Bombas de Papel de Konan.

Os ninjas da Folha e Nuvem se preparam para realocar Naruto e Bee, já que a Akatsuki já pode ter conhecimento da localização deles.

Kabuto e um Deidara revivido tentam capturar o Jinchuuriki, mas são impedidos por Tsuchikage, que veio proteger Naruto.

O Tsuchikage e seu time conseguem proteger o Jinchuuriki, mas o preço a pagar é alto e um grande ninja e amigo importante é levado pelo inimigo.

Um flashback para a época quando Naruto e Sasuke se conheceram.

Durante o Exame Chuunin, Sasuke vê o crescimento de Naruto como ninja.

Sasuke é derrotado por Gaara, e então Itachi o força a perceber que ele não é forte o bastante para concretizar sua vingança.

Naruto está determinado a salvar Sasuke, que desertou da Folha.

As Forças Aliadas Ninjas estão em espera, prontos para confrontar o exército de 100 mil Zetsus Brancos reencarnados.

O Esquadrão sob comando de Kankuro entra no território inimigo para criar uma fortaleza para as Forças Aliadas Ninjas.

As Forças Aliadas Ninjas começam a primeira batalha contra a Akatsuki.

Sob o comando de Bee, Naruto entra no estágio final do treinamento para dominar a Bomba das Bestas de Caudas, a técnica mais poderosa de um Jinchuuriki.

Kakashi e seu esquadrão pensam numa estratégia para derrotar os ninjas com Habilidade Hereditária, mas Kabuto não vai deixar barato.

A Akatsuki manda um exército de poderosos ninjas revividos e Zetsus Brancos para o campo de batalha, causando caos na Aliança Ninja.

Darui e seu esquadrão lutam contra os Zetsus Brancos enquanto os outros lidam com os ninjas reencarnados.

Atsui, Samui e Darui enfrentam Kinkaku e Gintaku, os lendários irmãos da Vila Oculta da Nuvem.

Darui consegue selar Ginkaku. Incendiado pela fúria de perder seu irmão, Kinkaku transforma-se em um monstro que lembra o Estado de Besta de Cauda de um Jinchuuriki.

Ino vê Sakura caindo do céu. Mesmo conseguindo se salvar, o choque deixa Sakura com amnésia.

O Esquadrão de Kankuro é cercado pelo ataque venenoso de Hanzou. Felizmente, Mifune e seu esquadrão chegam a tempo para ajudar.

O Trio Ino-Shika-Cho recebe ordens diretas de Shikaku para derrotar Sarutobi Asuma, que foi revivido pela Reencarnação Impura. Lembrando-se das palavras finais de Asuma, Shikamaru e Ino estão determinados a parar seu antigo professor.

Chouji não consegue atacar Asuma e perde a vontade de lutar, mas Ino e Shikamaru tentam a todo custo trazer Chouji de volta para a realidade.

Enquanto treinando no Modo de Chakra, Naruto sente a presença do Chakra do Nove Caudas de dentro de Kinkaku.