Para proteger Yuukimaru, Naruto e Guren lutam lado a lado contra a Besta de Três Caudas.

Abalado com a notícia que recebeu ao voltar de sua missão, Naruto vaga sem rumo pelas ruas da Folha. Como superar tamanha perda?

Hyuuga Hiashi convoca todos de seu clã para determinar os rumos que tomarão durante a guerra. Desapontada por não ser a líder ideal para seu clã, Hinata se deprime, mas suas amigas não vão deixar que ela fique para baixo por muito tempo.

Minato usa sua Técnica de Transportação para retirar o Nove Caudas da Folha.

Naruto e Bee correm para o campo de batalha quando, de repente, o Nove Caudas começa a conversar com Naruto em sua mente.

Um dos grupos da Aliança Ninja, incluindo Omoi e Maki da Areia, lutam contra diversos inimigos reencarnados. Maki reconhece um deles como Pakura, a grande heroína da Vila Oculta da Areia que um dia fora sua querida mestra.

Durante uma investigação na vila próxima a Tonika, Naruto e Kabuto se confrontam. Uma batalha épica começa quando Kabuto usa a Reencarnação Impura. Enquanto isso, Dokku e cinco sobreviventes se mantém em Tonika.

Naruto e Sakura decidem passar a noite na casa de Shiseru para ajudar a tomar conta dos sobreviventes. Embora as crianças chorem e sintam falta de seus falecidos pais, Dokku e Shiseru se esforçam para fazer com que todos se sintam como uma nova família.

Gaara e Ohnoki tentam vencer o ataque de miragem do Segundo Mizukage. Com seu interesse em Gaara despertado, o Segundo Mizukage decide fazer mais um teste das habilidades do jovem Kazekage.

Shikamaru, Choji, Neji e Kiba encontram alguns rostos familiares do passado. A Reencarnação Impura de Kabuto trouxe de volta os Quatro Ninjas do Som, e eles estão prontos para sua revanche.

Os ninjas da Vila Oculta da Folha tiveram sucesso em sua missão de sequestro e agora o jovem senhor feudal está sob sua custódia, enquanto Naruto permanece no castelo usando sua transformação para se passar pelo jovem senhor. Mas Naruto não apenas corre o risco de ser descoberto pelo velho samurai Tatewaki como também um perigo muito maior e iminente rodeia o castelo e ameaça a todos.

Uma criança reencarnada que consegue controlar o tempo aparece diante o time Ino-Shika-Cho, de Sakura e de Kiba, que lutam em locais diferentes. Para a surpresa de todos, o menino parece saber quem eles são.

Com uma ajuda de última hora, Naruto consegue escapar de ser pego pelo homem mascarado. A batalha está cada vez mais feroz, os seis Jinchuuriki revividos estão em seu modo Besta de Caudas e tudo parece perdido quando Son Goku, a Besta de Quatro Caudas, toma a sua forma e parte para a luta.

Os Cinco Kages estão sendo massacrados pelos ataques devastadores do verdadeiro Uchiha Madara. Quando está prestes a desistir dessa difícil luta, Ohnoki se lembra das sábias palavras do antigo Tsuchikage.

A identidade do homem mascarado finalmente é revelada e Kakashi fica profundamente chocado ao descobrir que se trata de seu querido amigo dado como morto da Batalha da Ponte Kannabi, Uchiha Obito. E a surpresa apenas aumenta quando Uchiha Madara surge como seu aliado, revelando que o Plano Olho da Lua foi algo minuciosamente planejado por ele durante anos.

Danzou engana Hanzou, falando que a bem intencionada Akatsuki quer, na verdade, sabotar as negociações de paz entre a Chuva e a Pedra. Acreditando em sua história, Hanzou arma uma emboscada para acabar com a Akatsuki pelo bem de sua vila.

Após ser salvo por aquele que deveria matar, Kinoe percebe que o Kakashi "Assassino de Amigos" é na verdade alguém que coloca a vida de seus companheiros acima de tudo. Agora o usuário do Estilo Madeira está determinado e toma a decisão que mudará para sempre sua vida.

Com a ajuda de Orochimaru, Sasuke finalmente pode tirar todas as suas dúvidas direto com aqueles que sabem de tudo: os quatro Hokage.

Lee desafia Shira para uma batalha entre usuários de Taijutsu!

Ino e Chouji lutam para proteger Sakura, mas a discípula de Tsunade não quer mais ser protegida, ela quer ser alguém forte também.

Gai enfim libera os Oito Portões Internos e uma brutal luta entre ele e Madara começa. Enquanto isso, em seu leito de morte, Naruto desperta em um lugar diferente onde um homem o aguarda para conversar.

Tenten precisa descobrir um jeito de sair do poderoso Genjutsu que a prendeu naquele mundo, porque lá não é a sua casa, não é o seu lugar.

No livro "As Aventuras de Naruto, o Herói", experientes ninjas Jounins estão desaparecendo misteriosamente, mas ninjas Genins são deixados em paz. Para investigar e procurar pelos desaparecidos, quatro times da Folha são designados: Time Kurenai, Time Gai, Time Asuma e Time Kakashi, com seus respectivos Genins.

O homem mascarado fica feliz que os Genin da Folha escolheram salvar vidas em vez de continuar sua missão, mas ordena a seu time que continue sua vigilância. Enquanto isso, Naruto está frustrado com sua falta de habilidade e lembra por que seu pai Minato selou o Nove Caudas dentro dele.

O Homem Mascarado finalmente tem sua identidade revelada. Além disso, os Genins da Folha passaram em seu teste e seus professores serão libertados. O final feliz se aproxima, mas a história ainda não acabou.

As diferenças entre Sasuke e Naruto estão cada vez mais insuportáveis e um atrito entre os dois é inevitável. Sem querer perder e com o desejo intenso de ficar mais forte, ambos decidem pelo seu próprio caminho.

Sasuke usa seu Susano'o para evitar que ele, Naruto, Sakura e Kakashi caiam no poderoso Genjutsu de Madara. E enquanto todos caem no mundo do sonho infinito, Sasuke se lembra de tudo que seu irmão lhe passou antes de dizer adeus: seu passado, seu conhecimento, seus pensamentos.

Otsutsuki Kaguya surge de repente dos céus, causando surpresa às pessoas do País do Sou. Mas o rei do País do Sou, o Lorde Tenji, ficou encantado com ela e quer tê-la como sua concubina. Nesta época de guerras sem fim, Kaguya deseja apenas a paz. Como a protetora da Árvore Divina, ela logo se vê engolida pelas marés de caos e da guerra.

Ashura descobre o motivo da doença das pessoas do vilarejo e tenta resolvê-lo! Os habitantes do vilarejo descobrem a ligação do Ashura com o NInshu...

A procura por Sasuke nos espaços-tempo de Kaguya continua. Zetsu descobre o plano de Naruto.

A batalha no Vale do Fim entre Naruto e Sasuke continua. Serão Naruto e Sasuke capazes de acertar suas desavenças?!

A confusão entre Naruto e Sasuke finalmente chega ao fim. Naruto se surpreende ao descobrir o novo Hokage da Vila da Folha.

Sasuke vai em busca de Fuushin e descobre o alvo dos ataques dos humanos explosivos.

O casamento de Naruto e Hinata agora já tem data. Quando Kakashi nota que o casamento está se aproximando, vê um problema: os amigos de Naruto e Hinata são todos ninjas de primeira linha da defesa da vila. Eles trabalham 24 horas por dia, então haverá alguns que não poderão ir à celebração. Assim, Kakashi tenta encontrar a maneira mais justa para solucionar isso, então anuncia uma missão supersecreta: arrumar um presente de casamento para o casal.

Naruto faz um pedido inusitado a Iruka. O dia do casamento de Naruto e Hinata finalmente chegou!