Depois que uma tragédia abala a CIA, Annie e o resto da equipe se veem em uma situação difícil.

Annie e Auggie correm contra o relógio para localizar um vírus de computador na Espanha que atraiu o interesse da China.

Enquanto Annie tenta ser gentil com um investigador do FBI para descobrir mais sobre a invasão de uma empresa de alta tecnologia, Simon aparece inesperadamente nos EUA.

Quando uma tecnologia americana é encontrada em um míssil iraniano, Annie é enviada a Israel, onde, junto com Eyal Lavin, tenta descobrir quem vazou a informação.

Quando o primeiro-ministro do Iêmen chega aos EUA para uma cirurgia de emergência, Annie assume a tarefa de transformar o chefe de gabinete dele em colaborador da CIA.

Quando Simon convida Annie para uma viagem a Cuba, ela aproveita a oportunidade para descobrir o que ele planeja. Porém, essa é uma missão clandestina, sem o aval da CIA.

Annie e Auggie descobrem que Jai estava investigando Simon e decidem compartilhar a notícia com Arthur. Annie percebe que é hora de confessar seu relacionamento com Simon.

Enquanto Annie e Simon estão feridos no chão da cozinha, um entregador enviado por acaso por Danielle tropeça neles e tenta ajudá-los.

Meses após o tiroteio, Annie ainda está em processo de recuperação. Apesar de Joan, Arthur e Auggie insistirem para ela se concentrar na cura, ela está obcecada por vingança.

Annie é capturada pelos russos após completar sua missão, e Auggie lança um plano para sua fuga com a ajuda de outro velho amigo.

Annie deve trabalhar com Eyal novamente, enquanto a CIA e Mossad rastreiam um espião que investiga um magnata saudita da área do petróleo.

Annie convence a CIA a agir de acordo com a inteligência do Mossad que ela recebeu de Eyal. Arthur confronta Joan por seu comportamento suspeito, e a ex-noiva de Auggie reaparece.

Eyal ajuda Annie a rastrear um colaborador perdido, mas ela pode seguir confiando nele? Enquanto isso, Arthur tem de pagar o preço pela inteligência falha de Annie.

Annie escapa de uma armadilha preparada por Khalid Ansari, e ela e Eyal vão à Suíça para rastreá-lo. Enquanto isso, Auggie é enviado ao Iraque para ajudar um soldado.

Annie considera trair a agência para salvar Eyal. Enquanto isso, Henry Wilcox sai da prisão e observa Arthur e Joan.