L'Andromeda se retrouve aux confins de la galaxie. Un message du chef de la sécurité de la République rend Dylan responsable de la débâcle contre les Nietzschéens et revendique la capture de l'un des triumvirs. Dylan décide de se lancer à sa poursuite...

La triumvir Tri-jema demande à Dylan d'enquêter sur un mystérieux augure. L'Andromeda se rend sur la station Ganglia, contrôlée par le «Citoyen Huit», un riche industriel qui fabrique les futurs vaisseaux de la flotte. Il semble avoir l'intention de remplacer la Triumvir au pouvoir...

L'Andromeda est envoyé vers une étrange lune par le Triumvirat. Arrivé sur place, le vaisseau est pris par un champ gravitationnel qui menace de le faire s'écraser sur la lune...

Un jeune pilote prévient l'Andromeda qu'une flotte nietzschéenne a attaqué et détruit un croiseur de la République dans le système d'Almagast. Une fois sur place, Dylan décide d'aller enquêter sur la planète. Mais une violente éruption solaire brouille les systèmes informatiques de son chasseur et de l'Andromeda...

L'Andromeda découvre une épave à la dérive, dont l'équipage a été attaqué par les Nietzschéens. Ceux-ci auraient utilisé une nouvelle arme destructrice à l'échelle planétaire...

L'Andromeda croise un transport de prisonniers sous le feu des Nietzschéens. Le pilote n'est autre que Télémaque Rhaïdé, en mission secrète. Les Nietzschéens parviennent à libérer Tyr Anasazi, qui s'est autoproclamé chef des tribus. Il s'est uni avec un puissant Collecteur pour récupérer la voie de l'éternité, une carte spatiale qui pourrait permettre de vaincre l'Abysse...

Beka rejoint Tyr et lui promet de l'aider à obtenir la Voie de l'éternité, seul espoir dans la lutte contre l'Abysse et les Magogs. Avec les forces nietzschéennes aux trousses, l'Andromeda se lance sur la voie indiquée par la carte spatiale, et traverse le portail qui mène à l'univers dont est issu l'Abysse...

Dylan et son équipage font une halte dans le secteur de Baltria, planète où règne le désordre. Patrius, le maître de la planète, sollicite l'aide de Dylan pour court-circuiter le système de protection du cristal, source énergétique de Baltria...

Alors que Dylan doit superviser une conférence de chercheurs et de scientifiques, des baillis de la garde suprême font irruption et l'emmènent pour l'interroger. Harper découvre le corps sans vie d'un chercheur, qui a subi une opération cérébrale suspecte...

Le leader de l'un des plus grands empires de la république demande l'aide de Dylan et de son équipage pour retrouver sa fille, la princesse Aleiss. Celle-ci a été enlevée lors d'un détournement du vaisseau cargo où elle se trouvait...

Dylan est emmené sur la planète Tarazi pour y être jugé. Tri lorn et les autres Triumvirs lui reprochent d'avoir comploté contre la République. C'est le Collecteur Pish, son ennemi juré, qui expose à Dylan les preuves plus ou moins réelles de sa culpabilité. L'équipage est prêt à témoigner pour sauver son capitaine, voire à prendre les armes contre la République...

Le capitaine Dylan et son équipage interceptent un vaisseau cargo de contrebande en provenance du système du vice-roi Moldar. Celui-ci nie toute implication dans un quelconque trafic d'armes. Dylan découvre que la contrebande ne concerne pas du matériel, mais des entités vivantes...

L'Andromeda repère dans l'espace deux vaisseaux en perdition, chacun délivrant un message de détresse. Ces deux vaisseaux transportent les deux leaders ennemis de la planète Trillin, qui se livre à des guerres depuis la fin des temps. Pendant ce temps, sur l'Andromeda, le capitaine Dylan est blessé et contaminé par un étrange virus...

Rev, un vieil ami du capitaine Dylan, invite celui-ci à le rejoindre sur la planète Juko, peuplée de criminels et délinquants. Mais Rev, qui a fait alliance avec les «collecteurs», tente de kidnapper Dylan...

Le capitaine Dylan soupçonne la présence d'un traître à bord de l'Andromeda. En effet, les chasseurs rebelles parviennent systématiquement à localiser le vaisseau. Au fil de l'enquête, il apparaît qu'une étrange force a pris possession de Béka...

Harper est kidnappé par le patriarche, un forcené qui a pour projet de construire une machine à voyager dans le temps, permettant de relier sa planète et sa lune. Le patriarche compte sur les talents de scientifique de Harper pour l'aider dans sa tâche...

Indra Xicol, un agent secret au service de Tri-Jema, est chargée de récupérer la carte spatiale pour la République. Afin de tester sa loyauté, Dylan lui fait croire que le document a été volé mais qu'il en existe un double sur une planète labyrinthe...

L'intelligence artificielle de l'Andromeda juge que Rommie se laisse submerger par ses émotions et met en danger le vaisseau ainsi que son équipage. Elle la déconnecte de l'ordinateur central, interrompant toute activité à bord. Mais un énorme vaisseau satellite Magog est sur le point de venir lui livrer bataille...

Un vieillard se faisant passer pour un prêcheur est assassiné par des agents de l'Abysse. Beka reconnaît en lui un ancien équipier de son père, qui travaillait sur le Maru alors qu'elle était enfant. Il s'agit en réalité d'un vrai collecteur, qui réunit des archives pour préserver le savoir et non pour prendre le pouvoir. Tout l'équipage se met alors à la recherche des documents, qui pourraient contenir un moyen de vaincre l'Abysse...

L'Andromeda sauve un vaisseau diplomatique qui s'était aventuré dans une zone dangereuse. L'ambassadeur explique à Dylan que sa station spatiale, l'Arcologie, vient de négocier un traité de paix avec les Magogs. Peu de temps après, il meurt, dévoré de l'intérieur par des larves Magog. L'Andromeda décide de rejoindre l'arcologie pour avertir ses habitants du danger...

Les Magogs attaquent l'Arcologie, une station spatiale dont le peuple est pacifiste. Son ancien chef, Marlowe, en a confié la défense à Dylan. Le reste de l'équipage est divisé. Harper et Trance veulent aider Dylan, alors que Beka, qui refuse de se sacrifier, préfère fuir à bord de l'Euréka Maru...