어느날 갑자기 큐브 팔찌와 함께 큐브 요정 할아버지가 나타나서 다짜고짜 최강에게 싸이몬과 맞서라고 한다. 그때 팔찌에서 싸이몬 등장 경고음을 듣고 최강은 티라노와 함께 방화를 일으키는 싸이몬에게 조종 당하는 여성과 맞딱 뜨린다. 이에 티라노는 큐브를 통해 메타 티라노로 변신하여 싸이몬과 싸워 승리한다.

최강은 티라노와 함께 다이노파워즈가 된 사실을 단짝친구 반디에게 숨긴다. 학교에 등교했다 하교 버스에 오른 최강은 졸음을 유발하는 싸이몬과 만나게 되고 기사 아저씨도 잠들어 버려 티라노와 함께 위기에 처한다. 하지만 그때 나타난 메타 트리케를 통해 위기에서 벗어나고 최강의 티라노와 트리케의 활약으로 싸이몬을 물리 친다. 그리고 반디가 또한명의 다이노파워즈 멤버임을 알게 된다.

학교에 등교한 시원과 최강은 우연히 서로 다이노파워즈라는 멤버란 것을 인지하게 되는데! 최강은 시원과 오전에 만났던 남자는 엄마와 연애하는 아저씨임을 알게 되고 시원이 엄마와 아저씨의 연애를 못 마땅해 한다. 그러다 우연히 엄마와 아저씨의 프로포즈 장면을 목격하게 되는데 이때 사람들의 연애의 방해하는 싸이몬이 나타난다. 이에 시원의 메타 안킬로와 메타 티라노는 엄마와 아저씨를 구하고 싸이몬을 무찌르고 엄마와 아저씨의 연애를 인정하게 된다.

학교에서 점심시간에 최강과 시원, 반디는 함께 밥을 먹다가 팔찌를 통해 싸이몬이 나타났음을 알게된다. 그 싸이몬은 사람들의 식욕을 조종하는 싸이몬으로 사람들을 배고프게 만들어 음식물을 찾게 만드는데! 최강은 메타티라노와 싸이몬을 찾아내 공격하려 하지만 메타티라노 역시 싸이몬의 조종을 당해 배고픔을 느끼게 된다. 이때 음식에 대한 신념을 가진 동해가 나타나 메타 브라키를 소환하여 싸이몬을 무찌르게 된다. 이로써 4명의 다이노파워즈 멤버가 모두가 만나게 된다!

학교에 등교한 친구들이 모두 스마트폰을 통해 SNS에 몰두하는데 이에 이상한을 느낀 최강은 AR 고글을 통해 친구들이 좋아요를 유발하는 싸이몬에게 조종 당하고 있음을 알게 된다. 하지만 최강과 시원을 제외한 많은 친구들이 싸이몬에게 조종을 당하게 되고 이에 최강과 시원은 사람들을 조종하는 싸이몬을 찾아내 메타 티라노와 메타 안킬로의 협공으로 싸이몬을 물리친다.

강물 속에서 반딧불로 사람들을 홀리는 싸이몬의 출현에 최강은 메타티라노와 함께 싸이몬과 맞서지만 그만 물속에 빠져버리고 만다. 순간 큐브요정 할아버지가 나타나 메타봇을 소환하라고 한다. 최강은 큐브요정 할아버지의 이야기를 듣고 메타봇 파이로를 소환한다. 파이로는 우주왕복선으로 변신해서 싸이몬을 우주 밖의 태양으로 날려 싸이몬을 무찌른다.

근처 상가 공사현장에서 반복적으로 사고나 나는데! 자꾸 같은 공사장에서만 사고가 나는 것을 수상하게 여긴 동해는 공사장 인근에서 싸이몬의 신호를 수신하고 공사장으로 향한다. 동해는 그곳에서 싸이몬과 맞섰지만 위험에 빠졌다. 다행히 동해는 메타봇 무케의 도움으로 위기에서 벗어나고 때마침 도착한 최강의 합류를 통해 파이로와 무케가 힘을 합쳐 싸이몬을 물리친다.

반디와 동해는 거리를 걷다 우연히 선생님의 버스킹 공연을 접하게 된다. 선생님은 버스킹 공연을 하다가 무언가의 전파에 따라 우울한 음이 주변에 울려퍼지고 사람들은 우울감을 느끼게 된다. 이를 수상하게 여긴 반디와 동해는 그 원인을 싸이몬으로 예상하고 싸이몬을 추적하여 산에서 찾아내게 된다. 이에 반디의 메타봇을 불러내려 하지만 메타포인트가 1점 부족한 반디는 동해에게 메타포인트 1점을 받아 마침내 메타봇 볼타를 소환하고 동행의 메타봇 무케와 함께 싸이몬을 무찌른다.

늘 공부는 인생의 전부가 아니라던 최강의 엄마 아빠가 변했다. 갑자기 최강의 부모님이 성적에 집착하기 시작했는데. 최강 뿐이 아니라 많은 아이들의 부모님들이 아이들의 성적에 신경을 쓰기 시작하는데! 이에 이상한을 감지한 시원과 통해는 동네에서 싸이몬의 흔적을 발견하고 싸이몬의 뒤를 추적한다. 싸이몬을 먼저 발견한 동해는 메타봇 무케를 소환하지만 무케도 싸이몬에 마력에 의해 조종을 당하고 이에 시원의 메타봇 로카를 소환하고 스피드가 장기인 로카는 무케와 함께 힘을 합쳐 싸이몬을 물리 친다.

갑자기 도로에 커다란 싱크홀이 생겼다. 이에 다이노파워즈 멤버 모두가 메타봇을 출격하여 조사하는데 싸이몬을 발견하고 맞서는 중 더 강력한 허머라는 괴물이 나타난다. 분노로 가득한 허머는 메타봇 볼타와 무케를 사라지게 만든 후 로카 마저도 사라지게 한다. 이에 최강은 메타티라노를 다이노웨폰 모드로 변신시켜 싸이몬을 물리치지만 허머는 감쪽같이 사라지고 만다.

평상시 성실한 반디가 숙제를 안해 왔다. 반디는 숙제를 했지만 글씨가 없어졌다고 했다. 그런데 길거리 간판도 그림들도 모두 없어져 버리고 만다. 알고 봤더니 싸이몬이 그림과 글씨를 모두 없애서 도시를 혼란에 빠뜨리고 있었다. 이에 싸이몬을 막고자 시원과 반디는 메타봇을 소환하고 시원의 메타봇 로카는 다이노웨폰 모드로 변신하여 싸이몬을 무찌른다.

오늘은 좋아하는 사람에게 초콜릿을 주는 발렌타인데이다. 이에 동해는 여러 개의 초콜릿을 만들어 선생님과 친구들에게 나눠 줬는데 동해의 초콜릿을 먹고 다들 배탈이 났다. 이를 수상 하게 여겨 배후를 찾는데 이는 곰팡이 균을 퍼트리는 싸이몬 때문이였다. 이에 파이로와 무케가 출격하여 싸이몬과 맞서는데 파이로는 더러운 것을 기피하는 성격이라 싸이몬과 제대로 대적하지 못한다. 이에 무케는 다이노웨폰 모드로 변신하여 싸이몬을 물리치는데 그때 허머가 나타나 다음엔 너희를 없애겠다! 는 경고를 남기고 사라진다.

학교에서 숲으로 현장학습을 떠났다. 그런데 누군가 동해의 도시락을 훔쳐먹고, 나무의 이파리도 죄다 갉아 먹었다. 알고보니 이는 메뚜기떼를 내뿜는 싸이몬의 스팸의 소행 이였고. 이에 로카와 메타 트리케의 협공으로 메뚜기떼를 없애 지만 또다시 많은 무리의 메뚜기 떼가 나타나 볼타는 다이노웨폰모드로 메뚜기떼와 맞선다. 이후 스팸의 이불 공격을 받지만 가까스로 메뚜기 떼를 물리쳤지만 메뚜기떼를 조종하던 스팸은 사라지고 만다.

시원의 생일을 맞아 다이노파워즈 및 많은 친구들이 시원의 생일 서프라이즈 파티를 준비했다. 파티에 참가한 친구들은 갑자기 웃음을 멈추지 못하는데 이에 수상함을 느낀 최강과 동해는 고글을 통해 웃음을 유발하는 비누방울을 접한뒤 싸이몬을 쫒는다. 파이로와 무케는 싸이몬을 찾아 내고 싸이몬과 맞서는데 비누방울에 갖혀 제대로 힘을 발휘 하지 못하는데 그때 또다른 적 님다가 나타난다. 이에 파이로는 다이노웨폰을 티라쏘드 모드로 변형시켜 싸이몬을 물리치고 님다와 맞서는데 님다는 다음을 기약하며 자리를 뜬며 상황이 종료 된다!

사람들이 갑자기 쇼핑 중독에 빠지고 이를 수상하게 여긴 시원과 반디는 다싸라는 어플을 의심하게 되고 이에 다싸의 물류 센터로 향하게 된다. 물류센터에서 쇼핑을 유발하는 싸이몬과 맞서게 되는데 그때 흑색 최면술을 쓰는 스컬스가 나타나 볼타가 로카를 공격하게 된다. 하지만 시원의 기지로 볼타는 최면에서 벗어나게 되고 시원은 다이노웨폰의 새로운 라이징모드를 통해 싸이몬을 물리치지만 그이후 싸이몬 스컬스는 역시 다음을 기약하고 사라지고 만다.

허머가 사람들을 분노에 휩싸이게 하는데 이에 동해는 허머를 막기 위해 무케를 소환했다. 하지만 허머는 지금까지의 싸이몬과 전혀 달랐다. 이에 무케는 다이노웨폰 모드로 허머와 맞서 싸우지만 끝내 패배한다. 과연 동해와 무케는 이 위기를 극복할 수 있을까?

터널에 이상한 괴물이 나온다는 소문을 듣고 반디는 볼타와 함께 터널로 항한다. 그런데 터널에서 마주친건 다른 아닌 스컬스 였다. 볼타는 스컬스와 켤투를 벌이는데 스컬스는 자연을 훼손한 인간들을 파괴하려고 한다. 볼타는 다이노웨폰 트리보우로 맞서지만 공격이 먹히지 않는다. 게다가 복타는 어딘가로 사라져 버렸다.

동해의 전화를 받고 동해와 무케가 위험에 빠졌다는 사실을 인지한 시원은 로카와 함께 동해를 찾아 나선다. 그러다가 싸이몬 스팸을 만나게 되는 스팸은 사실 사람들에게 학대받던 실험용 동물 이였다. 사람들이 약한 동물들을 괴롭힌다고 분노하는 스팸! 로카와 스팸은 서로 맞서는데 스팸의 이불이 로카를 끈질기게 공격하고 로카는 정신을 잃고 쓰러진다.

최강은 신나게 보드를 타고 있었는데 갑자기 님다가 나타났다. 님다는 다짜고짜 메타봇을 걸고 내기를 하자고 한다. 님다의 공격으로 파이로는 팔 한쪽을 못 쓰게 돼는데. 알고보니 님다는 과거 경주마 였고 사람들에게 이용만 당하고 버려저서 큰 상처를 받았던것. 파이로는 티라쏘드조차 잡지 못하는 상태가 되는데.. 최강과 파이로는 이 위기를 벗어날 수 있을까?

허머와 싸우던 동해와 무케는, 그리고 스컬스와 싸우던 볼타가 알 수 없는 공간으로 차원 이동을 했다. 무케는 허머에게 잡혀 어딘가로 끌려가버리고 혼자 남겨진 동해는 싸이몬과 마주친다. 엇! 저 싸이몬은 이미 제거했던 싸이몬인데! 대체 이곳에서 무슨 일이 벌어 지고 있는 걸까?

파이로는 님다에 의해 다른차원으로 끌려가는데 이에 최강과 반디는 그 차원으로 함께 이동한다. 시원과 로카는 스팸을 따라 다른차원으로 이동한다. 다른 차원에서 파이로는 메타티라노와 함께 님다와 맞서 싸우느라 여력이 없다. 로카 역시 스팸과 싸우다가 이미 물리쳤던 싸이몬들에 의해 또다시 공격 받게 된다.

다른 차원에서 우연히 만난 반디와 동해는 서로의 의견차이로 싸우게 되고 반디는 혼자 볼타를 찾아 나선다. 동해는 이러지도 저러지도 못하는 상황에서 용기를내 안티성으로 향한다. 성의 입구에서 볼타는 무케와 합류하여 허머와 스컬스와 맞서게 된다. 이때 스컬스는 안티의 계획을 방해하려는 것이 드러나 안티에 의해 소멸되고 볼타와 무케는 허머를 쓰러뜨리는데...

큐브요정 할아버지가 메타봇을 찾아 합체로봇을 만들라고 한다. 이에 최강과 파이로는 님다를 쓰러뜨리고 시원과 로카가 스팸과 싸우고 있는 현장에 합류한다. 파이로와 로카가 힘을 합쳐 스팸 역시 스러뜨리고 그들은 안티의 성으로 향한다.

동해와 반디, 무케와 볼타는 안티의 지팡이를 따라 성으로 들어가고 그곳에서 안티의 실체를 만나게 된다. 그리고 그곳에서 또다른 일행 큐브 박사 (큐브 요정 할아버지)를 만나게 된다. 그리고 볼타와 무케가 거대 괴물화된 안티와 맞서던 중 파이로와 로카가 합류 하여 모두 합체 하려 하지만 실패하고 만다. 이에 메타봇들은 안티와 맞서 싸우지만 역부족으로 인하여 안티에게 잡히고 만다. 안티는 메타봇들을 통해 메타디멘터를 작동 시키고 다이노파워를 손에 넣으려고 하는데...

메타디멘터 작동에 의해서 메타봇들은 정신을 잃는데 이에 메타봇들을 구하기 위하여 다이노파워즈 멤버들은 메타다이노를 소환하고 메타다이노는 메타봇을 구하기 위하여 안티와 맞서 싸운다. 이때 큐브 박사는 메타디멘터의 기능을 정지 시키고 다이노파워즈 멤버들의 응원과 염원에 메타봇은 마침내 다이노봇으로 합체 하게 된다. 하지만 다이노봇은 첫 합체에 있어 서로의 마음을 맞추지 못해 제대로 움직이지 못한다. 이에 안티의 계속 되는 공격에 다이노봇은 서로 하나라는 믿음으로 각성하게 된다.

메타존이 점차 붕괴되기 시작하고 메타존과 현실 세계의 경계를 허물기 위한 안티의 노력이 결심을 맺으려 하는데 다이노봇은 경계를 허물려는 안티들을 물리치고 허물어지는 경계를 다이노스톤으로 막아 낸다. 이에 화가난 안티는 더욱 강력하게 다이노봇을 몰아치지만 다이노봇은 안티가 메타존의 경계를 허물기 위해 사용한 메타디멘터를 활용해 안티를 물리친다. 모든 것이 끝났다고 생각했던 그때 다이노파워즈 멤버들은 다시 한번 안티게임 회사로 공간이동을 하고 마는데...