Comienza el segundo año en la academia y ya que Dana se fue a Francia por un programa de intercambio, a Zoey y Nicole se les asigna una nueva compañera, Lola Martínez, quien resulta ser toda una rara. Mientras, Logan lleva a la habitación un sistema completo de entretenimiento que molesta a Chase y Michael.

Zoey y su clase harán una cápsula del tiempo, y todos deben elegir un objeto que los represente para poner allí. Lola usa sus técnicas de actuación y no pone nada, Nicole pone una blusa, Michael y Chase un CD con una canción sobre su vida en PCA, y Zoey un DVD donde habla de sus amigos. Chase siente curiosidad por saber qué dijo Zoey sobre él, y en la madrugada, junto con Michael; va a desenterrar la cápsula para ver qué contiene el disco.

Hay elecciones para elegir al presidente estudiantil, Chase nomina a Zoey, pero Zoey no quería así que ella nomina a Chase para "vengarse". Ambos están nominados y el que obtenga más votos ganará. Pero cuando Logan regala objetos por querer que Chase gane sin que el sepa ni quiera, Zoey se enoja mucho con él. Muchas cosas pasan, hasta que se sabe quién es el ganador. Mientras, Nicole se molesta porque Quinn ronca mucho por la noche y debe monitorear sus ronquidos, viendo cosas muy raras en cuanto a los métodos de Quinn, para que ya no ronque.

Logan está a cargo de hacer una casa encantada para los estudiantes de la escuela menor, prometiendo no sólo asustar a los niños, sino también hacerlos gritar. Mientras, Michael es perseguido por unos turistas franceses que piensan que está herido.

Dustin empieza a salir con una chica mayor que el llamada Trisha(Jennette McCurdy), pero ella es "mala" ya que se tatúa, no trabaja en clase y ofende a los maestros. Zoey se preocupa por el y le pide a Chase que la ayude, pero se confunden las cosas y Trisha insinúa que Chase quiere salir con ella, así que termina con Dustin y se va con Chase. Dustin se enoja ya que Chase "le robó a su mujer". Chase le pide ayuda a Zoey ya que ella lo metió en eso, así que idean hacerle creer a Trisha que ellos dos son novios para que deje en paz a Chase, y lo hacen, pero Trisha no les cree y les pide que para demostrárselo se besen.

Luego de una discusión con los chicos, las chicas no pueden relajarse en el techo de ellos, por lo que deciden probarles que ellos pueden comportarse como chicos aunque haya chicas cerca. Para ello, Lola se viste como hombre con ayuda de Michael, quien finge estar enfermo gustoso cuando una enfermera bonita está en la enfermería, pero él tiene que lidiar con la ruda enfermera. Mientras, Dustin tiene varicela y es cuidado por la enfermera bonita.

Zoey desafía a unos machistas nerds a una lucha de robots, pero para poder construir un robot, le piden ayuda a Quinn. Sin embargo, ella se niega a seguir ayudándoles cuando Logan se burla de ella. Luego de ello, le piden ayuda a Miles, el chico más inteligente de la PCA, quien acepta con la condición de que Nicole salga con él.

Lola empieza a decaer con sus calificaciones de biología y le pide a Chase que la ayude. Chase es muy amable y es muy buen profesor. Lola le está muy agradecida y le empieza a gustar. Le pregunta a Zoey si le importa que le pida salir a Chase y ésta le dice que no. Chase lo piensa, y le dice que sí. A Zoey le afecta mucho y se pone celosa. Lola se da cuenta de que a Chase no le hace ilusión estar con ella y dejan de salir. Mientras tanto Logan le enseña a Dustin como ligar con chicas aunque en realidad le enseña a ser como él. Al final Logan acaba bañándose en una fuente y Dustin con una cita.

Los chicos van a la casa de playa de Logan para el receso de primavera, donde descubren que van a ser probados para un programa nuevo del padre de Logan sobre batalla de sexos. En esto, tras recibir unos Tekmates, Chase le envía por accidente un mensaje a Zoey diciendo que la quiere.

Chase decide tomar el Tekmate de Zoey para tratar de borrar el mensaje, pero sin éxito. Luego de ello, obtienen la batalla de sexos la cual es grabada por cámaras escondidas. Al final Zoey y Chase platicaban sobre el mensaje que le envió a Zoey por accidente que decía que la ama pero Chase se quedaba callado sin decir nada para que ella no se enojara con él.

El Sushi Rox, el restaurante de sushi de la academia, es consumido por las llamas, por lo cual Zoey y la banda hacen una subasta de personas para reunir dinero para reconstruirlo. Sin embargo, no todo es miel sobre hojuelas para ellos, ya que Zoey y sus amigas son las animadoras personales de Logan, mientras Chase y Michael deben prepararle sushi al maestro de gimnasia.

Luego de llamar a su familia, la alpaca de Quinn, Otis, la extraña mucho, lo cual hace que Quinn se vuelva nostálgica y se deprima. Las chicas deciden hacerle una fiesta de alpacas para animarla, lo cual sólo hace que ella quiera irse de la academia a la mitad del semestre, arriesgándose a que la suspendan. Mientras, Chase, Logan y Michael deciden hacer una apuesta para no decir la letra S, lo cual es complicado para Michael, ya que le gusta una chica llamada Vanessa, quien quiere salir con él.