Juustokakkukahvilan tarjoilijattarena työskentelevä Penny on innoissaan tavatessaan kiltit ja huomaavaiset naapurinsa. Leonard heittäytyy heti vieraanvaraiseksi, mutta sosiaalisesti rajoittuneempi Sheldon sen sijaan suhtautuu pirteään Pennyyn kuin ulkoavaruudesta saapuneeseen muukalaiseen, joka uhkaa muuttaa älykköpoikien turvallisen arjen lopullisesti...

Sheldon on järjestyksen ystävä: hän organisoi aamiaismuropakettinsakin siistiin riviin kuitupitoisuuden mukaan. Niinpä hän on pyörtyä nähdessään Pennyn sotkuisen asunnon. Öisen salasiivouksen jälkeen Sheldon on todella tyytyväinen itseensä, mutta jostain syystä Penny ei herättyään vaikuta lainkaan kiitolliselta...

Nähtyään Pennyn jonkin tumman komistuksen kainalossa Leonard masentuu siinä määrin, että kuuntelee kaikki päivät melankolista musiikkia ja suunnittelee hoitavansa yksinäisyyttään hankkimalla geenimanipuloidun kissan. Lohduttaessaan Leonardia Sheldon tulee vahingossa tarjonneeksi hänelle vaihtoehtoisen ongelmanratkaisumetodin.

Leonard ja Sheldon tapaavat uuden pomonsa ensimmäistä kertaa yliopiston kekkereissä, ja Sheldon onnistuu tekemään huonohkon ensivaikutelman. Pudottuaan työelämän oravanpyörästä hän viettää laatuaikaa kotona ja inspiroituu muun muassa kananmunista, hohtavista ameeboista ja kangaspuista. Onkin täysin ymmärrettävää, että Leonard vähitellen huolestuu kämppäkaverinsa mielenterveydestä.

Huikeasta älykkyysosamäärästään huolimatta Leonard ei ole ikinä ymmärtänyt naisten hienovaraista viestintää. Niinpä hän ei aavista lainkaan, mikä häntä odottaa, kun Leslie pyytää häntä sellistiksi yliopiston fyysikoiden jousikvartettiin. Sheldon puolestaan uskaltautuu kokeilemaan uutta ja löytää elämänsä tiistaihampurilaisen.

Penny kutsuu Leonardin, Sheldonin, Rajin ja Howardin luokseen halloween-hippoihin. Kyseessä on tietty naamiaiset, joten roolipelaamiseen viehtynyt nörttinelikko on aivan innoissaan. Ennen juhlia kunkin on ratkaistava vain yksi probleema: pukeutuako supersankariksi, fantasiaolennoksi, sarjakuvahahmoksi vaiko peräti joksikin fysiikan ilmiöksi...

Pennyn kevytkenkäinen ystävätär Christy saapuu vierailulle Omahasta ja omii hurmaantuneen Howardin kokonaan itselleen. Leonard, Sheldon ja Raj tuntevat olonsa aivan avuttomiksi ilman fyysikkoporukkansa neljättä pyörää, sillä mykyateria ja Halo 3 -turnaus eivät tunnu onnistuvan kolmestaan.

Harjoitellessaan baarimikon taitojaan Penny käyttää fyysikkokavereitaan koekaniineina. Makoisa grasshopper-drinkki tuo Rajista esiin aivan uuden ulottuvuuden! Voisiko siitä olla apua, kun Raj joutuu sokkotreffeille vanhempiensa hänelle valitseman morsianehdokkaan kanssa?

Välttyäkseen eräältä kiusalliselta tilanteelta Leonard valehtelee Pennylle. Perfektionistinakin tunnettu Sheldon ei tietenkään ole valmis osallistumaan Leonardin keskinkertaiseen narrausyritykseen, vaan päättää keksiä sen tilalle vielä paremman ja uskottavamman valheen. Lopulta Leonard huomaa rimpuilevansa Sheldonin kehräämässä petoksen verkostossa.

Bakteerikammoinen Sheldon pelkää tiukkaa tautitartuntaa ja aseistautuu viirusta vastaan, vaikka kyseessä onkin vain tuiki tavallinen flunssa. Leonard välttelee parhaan kykynsä mukaan paranoidista potilasta ja jättää näin Pennyn pulaan.

Sheldonin itsetunto järkkyy pahemman kerran, kun yliopistolle ilmaantuva lapsinero päihittää hänet tieteellisessä ajattelussa. Epätoivoinen Sheldon yrittää tuppautua mukaan Leonardin, Rajin ja Howardin tutkimusprojekteihin vain huomatakseen, etteivät hänen ystävänsä osaa arvostaa hänen ärsyttävää ja näsäviisasta olemustaan...

Leonard, Howard ja Raj päättävät ottaa osaa fysiikka-aiheiseen tietokilpailuun ja onnistuvat ylipuhumaan vastentahtoisen Sheldonkinkin joukkueeseensa. Vähitellen Sheldonin ylimielisyys käy kuitenkin ylitsepääsemättömäksi, ja niinpä kolmikko alkaa tähyillä uusien jäsenvaihtoehtojen perään. Mutta mistä he löytävät joukkueeseensa Sheldonin veroisen neropatin?

Leonard, Sheldon, Raj ja Howard ovat innoissaan ostettuaan nettihuutokaupasta elokuvan lavasteena toimineen hienon aikakoneen. Penny ei kuitenkaan ole yhtä ihastunut rappukäytävää tukkivaan rakkineeseen ja tekeekin suutuspäissään harvinaisen selväksi, mitä mieltä hän on aikuisista miehistä, jotka keräilevät scifi-figuureja, roolipeliasusteita ja elokuvaesineistöä...

Sheldonin kaksoissisko Missy saapuu vierailulle veljensä luo. Hehkeän Missyn kauneudesta huumaantuneet Raj, Leonard ja Howard ryhtyvät pikapikaa neitokaisen kilpakosijoiksi. Harmi vain, ettei Sheldon aio kelpuuttaa ketä tahansa siskonsa sulhaseksi!

Leonardin syntymäpäivä lähestyy, ja Penny kauhistuu kuullessaan, ettei Leonard-paralle ole ikinä järjestetty syntymäpäiväjuhlia. Nyt on siis korkea aika korjata tilanne ja järjestää Leonardille kunnon yllätyspippalot!

Penny heittää kelvottoman poikaystävänsä pellolle, joten Leonard uskaltautuu viimeinkin tekemään siirtonsa Pennyn suhteen. Sheldon puolestaan opettelee mandariinikiinaa päästäkseen haukkumaan paikallisen kiinalaisravintolan mandariinikanaa.