Vinte anos depois que o Projeto Elysion falhou e deixou a Terra em ruínas, Empress acorda em um centro de pesquisa subterrâneo. Sem memória de seu passado, Empress conhece Norito e Miya, e eles sobem para a superfície. No entanto, uma emboscada os aguarda.

Norito diz para Empress trazer suprimentos de um hospital próximo, mas há uma colmeia lá.

Empress salva Momiji da Instituição Educacional e tenta resgatar seus amigos.

Empress descobre que eles têm um mês até o Elevador Orbital estar completo. Dead Master reaparece.

Norito pede ajuda à Strength, mas os soldados aparecem. Strength expurga uma parte de si mesma.

Strength e Norito invadem o porta-aviões para salvar Miya. Eles também encontram Lunatic.

Black Trike não consegue se autoconsertar e eles vão atrás das peças.

Enquanto Empress e os outros cruzam o Oceano de Ferro, Monica age de forma estranha.

Empress wakes up in Light House No. 8.

Battle continues at Light House No. 8. The colonel is attacked by Charlotte, but Empress arrives.

The colonel receives a message that the Iron Ocean is spreading, causing much confusion. Despite a message confirming that the Orbital Elevator is connected, the colonel tells everyone the plan is to get Empress close to the Elevator to destroy it. At the eleventh hour, the Peacebuilding Force begins their bombardment and the final battle begins.

The deadly battle unfolds in the wastelands. Empress rejects Lunatic's offer, and makes it clear that she will fight to the very end. The colonel suffers a drone barrage and faces death. Strength and Dead Master have also sustained heavy damage, and the army is all but destroyed. Is there a way out of this hopeless situation?