Vegeta se recuperou e vai junto de Kuririn ao lugar onde Trunks estava lutando com Cell. Trunks explica a eles sobre o Torneio de Cell, e ele e Vegeta querem ir de novo treinar na Sala do Tempo. O Androide 16 também quer ajudar a derrotar Cell, e Kuririn o leva para Bulma consertá-lo. Os guerreiros Z se encontram na Corporação Cápsula, mas Bulma não está lá, então o pai dela cuida do #16. Cell encontra um lugar bom para realizar o Torneio, e ele mesmo constrói uma arena com as rochas do local.

Bulma encontra os guerreiros na Corporação Cápsula. Enquanto isso, Cell vai a uma estação de TV para anunciar o torneio ao mundo todo. Kuririn vai treinar com Yamcha, e Goku e Gohan continuam treinando na Sala do Tempo. De repente todos os programas da televisão começam a sair do ar e Cell aparece na tela. Depois ele avisa à todo o mundo sobre o Torneio de Cell e diz que se ninguém o vencesse, ele mataria todas as pessoas do mundo. Então, Vegeta e Trunks saem para treinar.

O mundo fica um caos com as pessoas sabendo do Torneio de Cell, todos querem se esconder e sair das cidades. Os guerreiros Z agora se reúnem na templo de Kami-Sama, esperando Goku e Gohan saírem, para que Piccolo pudesse entrar, e depois Vegeta e Trunks. Goku e Gohan saem da Sala do Tempo. Todos ficam impressionados ao ver os dois, porque eles estão Super Saiyajins naturalmente, sem fazer esforço. Eles trocam de roupa, Goku coloca seu tradicional quimono e Gohan usa uma roupa igual à do Piccolo. Goku se teletransporta para onde Cell está e diz para ele não matar mais ninguém até o torneio. Depois Goku volta, e diz que não precisa mais treinar na Sala do Tempo, porque prefere treinar com Gohan a seu modo e em 9 dias já estarão preparados.

Vegeta fica super furioso depois que Goku fala que é muito mais poderoso que ele. Goku desce para o templo do Mestre Karin, e pede para ele comparar o poder dele com o de Cell. Goku carrega metade de sua energia, quase destrói todo o templo, daí Karin fala que ele não pode vencer Cell. Para surpresa de todos, Goku não se desanima. Gohan e Goku vão para a casa do Mestre Kame e todos ficam surpresos com a aparência dos dois, principalmente a Chi-Chi, que fica desesperada ao ver o cabelo loiro de Gohan. Depois, os dois vão pescar com Kuririn.

Goku e Gohan continuam relaxados esperando pelo Torneio de Cell. Gohan foi numa cidade onde Cell já tinha passado, e um arrogante empresário chamado Barbon, com ajuda do velho inimigo Tao Pai Pai, estava construindo um forte para que os moradores pudessem se esconder de Cell e cobrava das pessoas para elas serem salvas quando o monstro chegasse. Logo, a população percebe que Barbon era um mentiroso, quando na inauguração uma menininha (que era neta de um antigo lutador e havia sido salva por Gohan) engana a todos gritando que Cell havia chegado e Barbon entra no forte sozinho, ordenando que se fechem as portas. Tao Pai Pai ataca o avô da menina e Gohan o salva. Tao Pai Pai foge de medo quando ele descobre que Gohan é filho de Goku. Depois Gohan facilmente destrói o forte, provando que era tudo enganação. Enquanto isso, Piccolo treina na Sala do Tempo.

Chi-Chi resolve dar uma festa para comemorar o aniversário de Gohan, já que ele ficou um ano na Sala do Tempo, seu aniversário passou batido. Goku e Kuririn vão pescar, enquanto Gohan fica estudando. Chi-Chi encontra um álbum de fotos e fica lembrando do passado. Goku vê um buraco numa árvore, e se lembra da primeira vez que Gohan mostrou seu poder. Goku estava segurando o carrinho de bebê com Gohan dentro, daí ele solta sem querer, e o carrinho vai descendo a montanha até chegar numa árvore, onde Gohan é arremessado, mas usa seu poder oculto, atravessando a árvore sem se ferir. Era a mesma árvore em que eles estavam colhendo frutas para a festa.

Piccolo termina seu treinamento na Sala do Tempo, e sai muito mais forte. Vegeta diz que ele não mudou nada, perguntando se ele entrou lá para dormir, e depois, entra sozinho na sala para treinar. Goku e Gohan e Kuririn continuam na vida mansa, fazendo piquenique. E depois Goku os levou para dar um passeio de carro. O exército ataca Cell ferozmente, e ele nada sofre, matando todos os homens do exército. Goku então vai falar com Piccolo, porque eles precisavam das Esferas do Dragão de volta para ressuscitá-los. Então Goku tem a ideia de ir para o novo Namekusei se teletransportando, para achar alguém que queira ser Kami-Sama da Terra. Ele não consegue achar onde o novo planeta está, e então vai pedir ajuda ao Sr. Kaioh no planeta dele.

O Sr. Kaioh fala para Goku onde está o novo Namekusei, e Goku se teletransporta para lá. O novo Patriarca fala que Dende é o escolhido para virar Kami-Sama da Terra, e Goku volta ao templo com ele. Goku leva Gohan e Kuririn para eles falarem com Dende também. Enquanto isso, o Mr. Satan aparece pela primeira vez, ele que venceu o torneio de artes marciais diz que vai vencer Cell, e uma multidão de fãs dele fica gritando. Dende recria as Esferas do Dragão a partir da escultura do Deus Dragão feita pelo Sr. Popo, mas agora elas podem realizar 2 desejos. Tudo corre bem, e Goku já sai procurando as esferas.

Gohan continua estudando. O Mr. Satan dá uma "incrível" demonstração de força: ele puxa 4 ônibus em suas costas e depois rasga 3 listas telefônicas ao mesmo tempo. A multidão de fãs dele vai ao delírio, e acreditam que ele é a única chance de vencer Cell. Vegeta sai da Sala do Tempo. Goku continua pegando as Esferas. Ele encontra duas com Tao Pai Pai e, como não quer machucar ninguém, acaba tendo que resolver um quebra-cabeça, daqueles com argolas entrelaçadas difíceis de soltar, para conseguir as esferas. Ele resolve depois de muito tempo, e percebe que os caras tinham fugido com elas. Então, Goku se teletransporta, pega as esferas, encontra a última e reúne as 7 esferas. Os dez dias se passaram, falta só uma hora para começar o Torneio de Cell.

O Torneio de Cell vai começar. Todos os guerreiros Z se reúnem e partem para o estádio. O Mr. Satan chega antes e diz que Cell não é de nada, que foi tudo um truque quando ele destruiu o exército, e que vai vencer Cell. Depois chega Vegeta, depois o Nº 16 consertado por Bulma, e depois chegam juntos Goku, Gohan, Kuririn, Trunks, Piccolo, Yamcha e Tenshinhan. Agora sim, o torneio vai começar. O Mr. Satan vai lutar primeiro.

Chegam 3 discípulos do Mr. Satan, um gordão, um cara muito afeminado, e uma menina. Mr. Satan deixa eles lutarem com Cell. O cara afeminado vai primeiro e dá um pulo quando Cell o manda para longe com seu Ki. O cara cai e perde. Depois vai o gordão, que sai correndo na direção de Cell, e quando chega perto, Cell joga ele longe de novo sem nem se mexer. O Mr. Satan explica: "foi um truque, ele colocou uma armadilha no piso". E então, o Mr. Satan decide lutar. Ele ataca Cell de todo o jeito que nem se mexe, até que ele soca o Mr. Satan que voa longe e perde. Agora vai começar mesmo o Torneio de Cell. Goku vai ser o próximo a lutar.

Começa a luta entre Goku e Cell. Os dois são muito rápidos, e nenhum consegue acertar o outro com força. Até que Goku dá um chute e Cell cai fora do ringe, mas ele coloca apenas suas asas no chão, e volta. Os dois ainda não estão lutando com todas as forças, só estão brincando. Os dois começam a lutar voando, Goku consegue atingir Cell algumas vezes, e Cell também atinge Goku, mas nenhum dos dois sofre nada. Goku percebe que Cell é mais forte do que ele esperava, e Cell também. Então Goku carrega seu Ki. A verdadeira luta vai começar.

Goku e Cell carregam seus Ki. O poder dos dois é realmente impressionante, todos ficam impressionados, principalmente Vegeta. O Mr. Satan continua dizendo que é tudo um truque. Goku começa atacar Cell, e acerta vários golpes, o fazendo cair várias vezes, até que Cell começa a utilizar as técnicas dos Guerreiros Z. Ele usa a técnica do Tenshinhan, que faz multiplicar seu corpo em 4. Depois de atacar Goku um pouco, os 4 Cells usam a técnica do Piccolo: o Makankosapo. Depois ele utiliza a última técnica de Freeza e os discos perseguem Goku. E por último, Cell usa todo seu poder e dá um Kamehameha que iria destruir a Terra, mas Goku escapa, usando seu teletransporte.

Goku continua lutando com Cell e nenhum dos dois tem vantagem ainda. Os dois acertam vários golpes um no outro, até que Cell estranhamente voa e abre os braços na direção do ringe. Goku percebe o que ele queria fazer e fala para que todos se afastem. Cell destrói o ringe, para ter mais espaço para lutar. Agora não há mais regras e os dois lutam para valer. Goku voa, e começa a fazer um Kamehameha lá de cima. Todos, até Cell, ficam preocupados, porque ele iria destruir a Terra com aquele golpe, mas quando ele ia soltar, Goku se teletransporta para a frente de Cell e solta um Kamehameha em direção ao monstro. O corpo de Cell foi destruído, voaram pedaços para todos os lados.

Cell não morreu. A parte debaixo de seu corpo levantou-se, e regenerou totalmente a parte de cima, e a luta continua. Goku está ficando cansado, e Cell também. Cell acerta dois golpes muito fortes em Goku, que o fazem cair no chão. Goku se levanta e começa a atirar muitas bolas de Ki em Cell. Mas ele cria uma grande barreira em volta e nada o atinge. Goku está muito cansado, e o Mestre Kame percebe que ele não pode vencer Cell, porque enquanto o vilão ainda pode aumentar muito seu poder, o Super Saiyajin já está no limite. Vegeta também percebe isso, e admite que Goku é mais forte que ele, mas Cell é ainda mais. Goku então, para de lutar e fala que desiste. Todos ficam chocados.

Agora que Goku desistiu, todos se perguntam quem será o próximo a lutar, e muitos acreditavam em Mr. Satan, mas ele, que já tinha sentido o poder de Cell começou a fingir uma dor de barriga e não ia lutar. Então Goku finalmente anunciou o próximo lutador: Gohan. Todos ficaram surpresos, pois ninguém acreditava que Gohan era mais forte que Piccolo, Trunks e Vegeta, muito menos que Goku e Cell. Chi-Chi ficou desesperada ao saber, mas Goku confiava muito nos poderes de Gohan. Gohan aceitou o desafio, tirou sua capa e foi lutar. Goku, então, fez uma coisa mais inesperada ainda: deu uma semente dos deuses para Cell recuperar seu poder. Todos ficaram mais surpresos e disseram que Goku estava louco. Gohan carregou seu Ki, e logo os guerreiros perceberam que ele era realmente ficou mais forte. Cell, irritado por Goku ter desistido, jurou que iria matar Gohan. Eles começaram a lutar e Cell resolveu usar sua velocidade máxima e bateu em Gohan até ele ficar no chão. Gohan se levantou sorrindo.

Cell começa a atacar Gohan ferozmente. Gohan se livra de vários ataques, até que ele leva uma porrada e fica enterrado embaixo de um monte de pedras. Cell acha que o matou e Piccolo desesperado, briga com Goku, dizendo que foi culpa dele. Goku diz para ele se acalmar pois Gohan está vivo. Gohan então reaparece dizendo que não gosta de lutar, e não quer matar Cell. Ele então percebe que Goku o mandou para a luta, para que ficasse nervoso e então liberasse os seus poderes ocultos e derrotasse Cell. Gohan então, começa a se lembrar de suas lutas anteriores, contra Raditz, seu treinamento com Piccolo e sua luta com Freeza. Cell fica impressionado com isso e começa a atacá-lo, para ele ficar nervoso. Era tudo que Goku queria.

Cell continua atacando Gohan, mas o Saiyajin não consegue liberar seu poder. Então, Piccolo convence Goku a intervir, porque Cell iria acabar matando Gohan sem que ele mostrasse seu poder escondido. Quando Goku pede uma semente dos deuses para Kuririn, Cell vai lá e toma as sementes dos deuses dele. Então Cell tem uma grande ideia: se ele machucasse os amigos de Gohan, então Gohan ficaria bravo o suficiente para liberar seu poder. Nesse momento, o #16 consegue pegar Cell e tenta se explodir junto com ele. Mas ele não consegue, porque Dr. Brief, o pai da Bulma, tirou o dispositivo de autodestruição dele quando o reconstruiu. Cell ataca o #16 e o faz em pedaços, sobrando apenas a sua cabeça que cai perto do Mr. Satan e seus discípulos. Depois disso, Cell cria 7 criaturinhas pequenas e azuis, parecidas com ele, e manda os sete destruir Goku, Vegeta, Trunks, Piccolo, Kuririn, Tenshinhan e Yamcha.

Os Cells Juniors estão lutando contra os 7 guerreiros, e Gohan assiste tudo, ficando cada vez mais nervoso. Vegeta e Trunks aguentam com dificuldades os pequeninos Cells, enquanto Kuririn, Yamcha e Tenshinhan apanham muito. Goku também apanha porque está muito cansado, e Piccolo consegue bater em vários deles. Como Goku está muito cansado, Piccolo pede a Yamcha e Tenshinhan que protejam ele, mas no final todos acabam apanhando dos Cells Juniores. O Mr. Satan, seus alunos e os repórteres resolvem ir embora, porque lá é muito perigoso, mas a cabeça do #16 pede para eles esperarem. #16 pede para que o Mr. Satan o leve para perto de Gohan. Satan faz um ato muito heroico, e sai correndo até perto de Gohan e Cell, depois joga a cabeça do Nº 16 lá. Nº 16 então, começa a falar com Gohan, e diz que ele não deve controlar seus sentimentos, pois precisa liberar toda sua raiva. Depois ele fala para Gohan salvar o mundo e salvar a natureza que ele tanto ama.

Gohan mostra sua velocidade depois da transformação. Ele toma o pacotinho de semente dos deuses das mãos de Cell, depois vai até o lugar em que os Cells Juniors estavam lutando, e começa a matá-los um a um, sem nenhuma dificuldade. Cell vê aquilo e começa a ficar surpreendido. Gohan tinha ficado muito mais forte e rápido que Goku. Gohan tinha matado dois Cells Juniors, então os outros 5 o atacam ao mesmo tempo. Eles usam as técnicas dos guerreiros Z, como Makenkosapo, Kikohuda e Kamehameha, mas nada atinge Gohan. Ele acaba facilmente com todos os Cells Juniors e dá as sementes para Trunks distribuir a todos os guerreiros feridos.

Gohan começa a lutar com Cell. Trunks dá as sementes para todos os feridos, e eles se recuperam. Cell ataca com todas as suas forças, e Gohan vai desviando de tudo com facilidade. Piccolo percebe que Goku só lutou com Cell para mostrar a Gohan o jeito que o monstro lutava. Cell descobre que não pode vencer Gohan do jeito que está, e então resolve mostrar seu poder máximo, carregando todo seu Ki. Toda a Terra começa a tremer e Cell fica maior e mais forte. Gohan não fica impressionado, até que Cell dá um soco na cara dele. Não só a força de Cell aumentou, mas também sua velocidade, mas Gohan é muito mais forte, rápido e resistente. O soco não fez nada nele, e Gohan golpeia Cell com um soco na barriga, e depois um gancho que o faz cair no chão. Cell ficou totalmente ferido com as pancadas, e não consegue nem ficar de pé direito.

Cell voltou à sua segunda forma depois de vomitar a #18. Gohan continua espancando ele sem dó. Goku fala para Gohan terminar logo, mas Gohan não ouve, até que Cell usa sua última técnica. Ele começa a inflar como um balão, e vai explodir a Terra. Gohan percebe porque deveria tê-lo matado antes, e fica desconsolado. Goku, então, diz adeus a todo mundo, e se teleporta para perto de Cell. Goku diz a Gohan que ele lutou muito bem, e fala para Gohan pedir desculpas a Chi-Chi por ele. Depois Goku dá adeus a Gohan, e some junto com Cell. Goku se teletransportou com Cell para o planeta do Sr. Kaioh. Cell explodiu e matou Goku, o Sr. Kaioh, Bubbles e Gregory. Todos na Terra ficaram muito tristes com a morte de Goku, principalmente Gohan, que não se conformava. No paraíso, Goku percebeu que Cell não estava lá com eles. Cell estava vivo! Então, Cell aparece na Terra, com seu corpo perfeito de volta (apesar da #18 estar lá com Kuririn), e mata Trunks com um raio.

Cell ficou muito mais forte depois que reviveu, e ele explica porque: Dentro da cabeça de Cell existe um núcleo, que se não for destruído pode faze-lo voltar ao normal. Quando ele se explodiu, o núcleo milagrosamente ficou intacto, e Cell pode se regenerar por inteiro. E como ele também tem células de Saiyajin, ficou muito mais forte depois de estar próximo da morte. E ele voltou para Terra porque aprendeu a usar o teletransporte depois de ver Goku usando quando ele se teleportou para o planeta do Sr. Kaioh. Vegeta vê Trunks morto, fica furioso e ataca Cell com todas as suas forças. Porém, de nada adianta e Cell ainda dá uma porrada em Vegeta que quase o deixa aleijado. Cell então atira uma rajada de poder para matar Vegeta, mas Gohan pula na frente. A bola atinge os dois, Vegeta fica estirado no chão e Gohan se levanta, mas com um braço todo machucado. Cell começa a fazer um Kamehameha que irá destruir a Terra.

Gohan e os outros já não tem mais esperanças. Vegeta inclusive pede desculpas por ter se tornado um fardo para os outros. Cell está muito mais forte e não tem como pará-lo. Cell conta um pouco de seu passado. Ele lembra quando absorveu os androides, e percebeu que finalmente tinha alcançado o poder máximo tão sonhado pelo Dr. Gero que não tinha feito Cell para matar Goku, mas sim para dominar o universo. Gohan já tinha desistido, e estava só esperando Cell destruir a Terra, quando Goku começou a falar com Gohan. Ele disse para Gohan não desistir, que ele era o mais forte do universo, e que o destino da Terra estava nas mãos dele. Gohan começa a fazer um Kamehameha com um braço só, e ataca Cell. A imagem de Goku aparece nas costas de Gohan.

Gohan solta seu Kamehameha para parar o de Cell. Os dois se encontram e a Terra toda começa a tremer. Os guerreiros saem de perto para não serem feridos. O Kamehameha de Cell está passando o de Gohan. Então Goku, percebe que Gohan não está usando todo seu poder e manda ele usar toda sua força imediatamente. Gohan tinha medo de destruir a Terra e Goku disse que qualquer dano poderia ser revertido com as Esferas do Dragão. Piccolo, Kuririn, Yamcha e Tenshinhan decidem ajudar e atacam Cell, que os derruba várias vezes. Eles se levantam e insistem, mas por fim caem no chão esgotados. Vegeta que assistia tudo de longe, resolve ajudar também. Quando Gohan estava quase sendo derrotando, Vegeta ataca Cell com toda a sua força, e o deixa distraído. Então Gohan, usa todo o seu poder e seu Kamehameha ultrapassa o de Cell que o destrói totalmente. Nem o núcleo, nem nada do Cell sobrou. Gohan volta à sua aparência normal, e cai no chão. Finalmente Cell foi derrotado, e a Terra foi salva.

Todos parabenizam Gohan pela vitória e vão para o templo de Kami-Sama. Vegeta fica triste porque Goku e Gohan eram muito mais fortes do que ele. O Mr. Satan aproveita que não tem ninguém mais no campo de batalha e diz aos repórteres que foi ele que tinha derrotado Cell. No templo, Dende cura os feridos. A #18, que estava no colo de Kuririn acorda, e os guerreiros querem matá-la, mas Kuririn não deixa, e ela sai voando. Dende reúne as Esferas e invoca Shenlong. A #18 vê o dragão, resolve voltar e ficar escondida vendo. Shenlong poderá realizar 2 desejos. Primeiro eles pedem que todos os mortos por Cell (inclusive Trunks) sejam revividos. Depois eles tentam reviver Goku, mas ele já tinha sido revivido uma vez para lutar contra o Saiyajins, e não poderia. As esferas de Namekusei poderiam revivê-lo, mas Goku preferiu ficar morto, lá com o Sr. Kaioh. Então todos começam a se lembrar da vida de Goku.

Um desejo ainda poderia ser realizado, então Kuririn pede a Shenlong que retire as bombas dos androides, para ele poder ficar com a Nº 18. Shenlong realiza. A Nº 18 que estava lá perto assistindo tudo fica brava. Ela aparece, xinga Kuririn e sai voando, mas antes se despede dele. Depois, Tenshinhan vai embora do templo para se encontrar com Chaos de novo. Piccolo resolve ficar vivendo no templo junto com Dende e o Sr. Popo. Gohan vai para casa contar a Chi-Chi e ao Gyumaoh tudo o que aconteceu. Chi-Chi fica desesperada ao saber da morte de Goku. Todos se reúnem na Corporação Cápsula e Trunks dá adeus a todos, e parte de volta para o futuro em sua máquina do tempo. Na TV, o Mr. Satan aparece num programa especial, onde diz a todos que foi ele quem derrotou Cell e dá mais uma de suas demonstrações de força quebrando um monte de tijolos empilhados. Goku, Sr. Kaioh, Bubbles e Gregory andam pelo caminho da serpente, em direção ao Sr. Enma-Daioh.

Trunks chega ao futuro e vai falar com sua mãe, Bulma. Ele conta a ela tudo o que aconteceu, inclusive que Vegeta não era frio como todos pensavam, porque ele atacou Cell com todas as suas forças ao ver Trunks morto. Trunks então ouve no rádio que os androides estavam atacando de novo, e resolve ir atrás deles e acabar de uma vez por todas com aqueles dois. Bulma fala para ele não ir, mas Trunks ficou muito mais forte, depois de treinar na Sala do Tempo. Trunks então, vai atrás dos androides e acaba com os dois facilmente. Mas Cell já tinha crescido e estava absorvendo a energia das pessoas. Cell, que ainda estava na sua primeira forma, foi até onde Trunks estava, procurando a nave do tempo. Trunks fala que sabe de tudo sobre ele, e Cell fica surpreso. Então, os dois vão lutar num lugar deserto. Trunks faz ele sofrer um pouco, e depois acaba com ele muito facilmente. Agora o futuro também estava a salvo de ameaças.