Il Mobile Shinsengumi è stato organizzato per il motivo specifico di mantenere Kyouto al sicuro da influenze che avrebbero ostacolato gli sforzi del Giappone verso l'occidentalizzazione, siano quei demoni e mostri di ogni forma e dimensione o una banda di misantropi decisi a riportare indietro l'orologio per la città di Kyou.

Yuuko Kondou, Toshie Hijikata e Kaoru Okita sono figlie del famoso Isamu Kondou, Toshizou Hijikata e Soushi Okita, leader del temuto Shinsengumi originale. Si sono riuniti sotto la bandiera della "Verità" come avevano fatto i loro padri una volta e sotto la guida della signora Oryou.

Con l'aiuto del figlio di Oryou, Ryuunosuke, Shintarou, Gennai e il mostro gatto Nekomaru, proteggono Kyouto dal male che si nasconde nell'ombra. Ma chi protegge il popolo di Kyouto dal Mobile Shinsegumi?