Sofrendo de um câncer terminal, um senhor decide passar por um tratamento médico radical. Após ter sua consciência transferida para o corpo de um jovem, ele percebe o envolvimento de uma organização secreta e muito perigosa.
Chegando de Washington, a jovem Marti Malone (Gabrielle Anwar) está se mudando com seu pai Steve (Terry Kinney), sua madrasta Carol (Meg Tilly) e seu meio-irmão Andy (Reilly Murphy) para uma base militar, onde seu pai investigará possíveis problemas ambientais e ecológicos. Antes de chegarem eles param num posto de gasolina, onde Marti vai ao banheiro. Lá um militar com olhar ensandecido diz: "te pegam, quando você está dormindo". Marti foge e pede socorro, mas o autor de tão estranho aviso tinha desaparecido. Na base Marti flerta com um piloto, Tim Young (Billy Wirth), e faz amizade com Jenn Platt (Christine Elise), a filha rebelde do general Platt (R. Lee Ermey), o comandante da base. Logo Marti descobre que as pessoas estão sendo substituídas por cópias perfeitas de si mesmas vindas do espaço, mas sem nenhum sentimento, que invadem o corpo delas quando estão dormindo.
Rob, o herói do primeiro "Nekromatik", suicida-se. Monika rouba o cadáver do túmulo e inicia uma relação necrófila que é, no sentido metafórico, uma inverossímil história de amor eterno.
O Barão Frankenstein foge da execução na guilhotina e usa o pseudônimo Dr. Stein para abrir sua clínica na Alemanha. Lá, recomeça seus experimentos com cadáveres, mas um de seus pacientes tem um destino diferente do que Stein planejou.
Edinburgh, 1831. Among those who undertake the illegal trade of grave robbery is Gray, ostensibly a cab driver. Formerly a medical student convicted of grave robbery, Gray holds a grudge against Dr. MacFarlane who had escaped detection and punishment.
After the suicide of her beloved father, the biologist Daniella Logan visits her catatonic mother in a mental institution to tell the tragic event and her mother calls her "Josephine". Daniella goes to the cemetery and finds that her father's grave had been opened and his corpse was profaned. She decides to investigate, and receives a message of a diabetic priest, Father Elias, who tells her about an ancient fanatic religious sect of followers of Abraham that kills the first child. Later, she meets a weird man, Toby Harris, who claims to be his legitimate father. Daniella continues seeking the truth about her origins and discloses very dark secrets about her family and friends.
A couple's car runs out of fuel on a lonely country road. When the husband returns to his pregnant wife with the fuel, he's in for a deadly surprise.