《夏目友人帐》的动画版故事讲述的是一位因为看得见妖怪而被人类疏远的女子夏目玲子，为了打发寂寞的时间，她向妖怪们发起挑战，并将败在自己手下的妖怪的名字写在一纸契约上，以此做为妖怪们成为自己属下的证据。 玲子的孙子夏目贵志得到了那些契约书所做成的“友人帐”，还继承了玲子的力量，能看到不会显现在人前的物体。而且也和玲子一样成为了被周围人疏远的一员。 因为外婆死前和妖怪订下的契约的关系，并且有一些妖怪知道友人帐的威力并想得到它而总是被妖怪们追赶，可是，作为唯一继承了玲子血统的他却做出了一个重要的决定：将玲子夺过来的妖怪们的名字一一归还。在这样的夏目的身边，开始聚集起各种各样的妖怪们…… 能看到妖怪的少年夏目贵志，与被封印在招财猫外表下的妖怪斑（猫咪老师）一起，为大家讲述一个奇异、悲伤，怀念、令人感动的怪谈故事。片中充溢着细腻而动人的情感，再配上淡雅的音乐，让人在无意间为其喜为其忧，实在是一部好漫画！

Natsume is lonely; he has an ability that separates him from others: he can see and interact with spirits. Soon, however, Natsume discovers that he’s not alone: his grandmother Reiko also had the gift. But things get hectic and possibly dangerous for Natsume when he finds out that he also inherited the 'Book of Friends', a book that contains the names of all the spirits Reiko defeated and subjugated. He finds himself hounded by his grandmother's underlings and, with the help of a 'cat' charm spirit, decides to free them from the Book's shackles, as well as protect the book from those who seek to misuse its power...

Depuis sa plus tendre enfance Natsume a la capacité de voir les esprits (yōkai), ce qui n'est pas toujours facile à vivre pour lui et l'oblige à maintenir une certaine distance vis-à-vis de ses camarades, pour leur propre sûreté. Alors qu'il est pourchassé par un yōkai, Natsume libère par mégarde un puissant esprit scellé dans un Maneki-Neko. Cet esprit, qui semble connaître sa grand-mère, Reiko, montre également un intérêt certain envers l'héritage qu'elle a légué à son petit-fils : le Livre des Amis. Ce livre, qui permet de contrôler les yōkai dans lequel est écrit le nom, serait la raison pour laquelle Natsume est quotidiennement traqué par les esprits. Ceux-ci veulent soit récupérer leur nom, soit mettre la main sur le livre, source de puissance. C'est entre autres pour ces raisons que Nyanko-sensei, l'esprit que Natsume a libéré, va accompagner et protéger le jeune garçon dans sa quête pour rendre leurs noms aux yōkai.

妖を目に映すことができたため人間に疎まれた夏目レイコは、その寂しさからか、妖たちに勝負を挑み、隷属させる証として名前を書かせたという。その契約書の束「友人帳」を手にした孫の夏目貴志もまた、レイコの力を受け継ぎ、人にあらざるものを見ることができた。そして、レイコと同じように、周囲から疎まれる存在であった。しかし、唯一の血縁であるレイコの遺したものを大事に想い、レイコが奪った名を妖たちに返すことを決める。そんな夏目の元にはいつしか様々な妖たちが集い始め・・・・

В этой истории рассказывается о юноше Такаши Нацумэ, унаследовавшего от бабушки Рэйко Нацумэ способность видеть духов. От чего, впрочем, он совсем не в восторге — ведь всю жизнь духи доставляли ему одни неприятности.

Но всё меняется, когда Нацумэ находит «Тетрадь дружбы», принадлежащую его бабушке. Теперь он понимает, отчего всю его жизнь его донимали духи, как добрые, так и злые.

Осознав, чем на самом деле является «Тетрадь дружбы», Нацумэ совместно со своим телохранителем, могущественным духом Мадарой, начинает освобождать прочих духов от их контракта с Рэйко.