Les Cheyennes offrent au Dr. Quinn un magnifique pur-sang baptisé Éclair. Michaela n'a plus qu'une idée en tête : s'inscrire à la prochaine course de chevaux de Colorado Springs. Comme les femmes ne sont pas autorisées à participer, elle se déguise en cowboy...

Dorothy Jennings, la belle-soeur de Loren est accusée du meurtre de son mari, un homme rustre et violent. Elle plaide l'auto-défense. À quelques heures du procès, le Dr. Quinn effectue une autopsie sur le corps de la victime pour prouver l'innocence de Dorothy...

Le mystère règne à Colorado Springs : un étrange individu, « l'homme mort », hante les rues de la ville pendant la nuit d'Halloween. Brian soupçonne Dorothy d'être une sorcière et Michaela est hantée par le souvenir d'Abigail, la défunte épouse de Sully...

Jake, Loren et Horace partent chasser dans la réserve indienne. Jake commet l'irréparable : il abat Aigle Noir, persuadé qu'il s'agit d'un cerf. L'affaire fait grand bruit et passionne la ville. Jake est kidnappé par les Indiens pour être jugé mais le Dr. Quinn doute de sa culpabilité...

L'arrogante Soeur Ruth prêche le pouvoir de guérison par la prière et bannit tout traitement médical au profit de la foi. Elle a une violente altercation avec le Dr. Quinn au sujet de l'état de santé de Kid Cole, atteint de tuberculose. Grace et Robert E. décident de se marier...

Le Dr. Quinn reçoit un télégramme lui annonçant que sa mère est gravement malade. Elle décide donc de se rendre à Boston avec ses trois enfants. Sur place, son diagnostic déconcerte ses confrères et impressionne un jeune médecin, le Dr. William Burke...

Durant son séjour à Boston, Michaela se rend compte à quel point ses proches lui ont manqué et son attirance pour William Burke, le jeune médecin de l'hôpital, la trouble. La santé d'Elizabeth s'améliore et l'heure est venue d'envisager un retour à Colorado Springs...

Une terrible sécheresse s'est abattue sur Colorado Springs et sa région. Michaela Quinn est persuadée que les Cheyennes pourraient aider les habitants à survivre. Mais Jake et Loren décident de s'approprier l'eau d'une source secrète située en territoire indien...

Un bal est organisé par les habitants de Colorado Springs. Michaela reproche à Sully de passer du temps avec Dorothy. Elle ignore qu'il apprend à danser en secret. Colleen tente de consoler son amie Becky mais la jeune fille l'accuse de vouloir séduire son petit ami...

Suite à un malentendu, Sully est gravement blessé par les soldats de la Cavalerie et sa tête est mise à prix. En l'absence de Michaela, Matthew, Colleen et Brian décident de cacher Sully. Mais Jake et Hank sont prêts à tout pour le capturer afin de toucher la prime...

La veille de Noël, le Dr. Quinn est au chevet d'une femme enceinte. Pendant l'accouchement, Michaela est victime d'une étrange hallucination : l'esprit de son amie Charlotte Cooper lui apparaît pour l'aider à réexaminer sa vie et les choix qu'elle a faits...

Les mineurs de Colorado Springs sont en grève pour dénoncer leurs conditions de travail. Matthew décide de remplacer les grévistes pour gagner de l'argent. Inconscient du danger, il pénètre dans la mine et se retrouve piégé par un éboulement...

Le gouvernement passe un accord avec les Indiens : il subviendra à leurs besoins en échange de leurs territoires. Mais les couvertures offertes comme cadeau de réconciliation sont infectées par le typhus et elles provoquent une épidémie de fièvre mortelle au sein de la communauté cheyenne. Sully et le Dr. Quinn se sentent responsables de ce drame...

Un cirque ambulant, dirigé par Heart, une femme autoritaire, s'installe pour quelques jours à Colorado Springs. La ville est en effervescence. Matthew se sent très attiré par Atlantis, la fille de Heart. Il découvre par hasard qu'elle est atteinte d'une malformation aux mains...

Après le massacre de la Cavalerie, Catherine, une jeune femme blanche qui a adopté le mode de vie des Indiens, est retrouvée gravement blessée. Soignée par le Dr. Quinn, Catherine tombe amoureuse de Sully. Michaela est jalouse de cette idylle naissante...

Michaela aide le Révérend Johnson à placer de jeunes orphelins dans des familles d'accueil. Ce dernier, secrètement amoureux de la jeune femme, la demande en mariage et lui propose d'adopter les enfants. Matthew, Colleen et Brian ne sont pas du tout d'accord...

Matthew décide de tenter sa chance en jouant au poker. Michaela et Sully tentent de le convaincre que sa passion dévorante pour le jeu finira par le ruiner. Mais le jeune homme, persuadé d'avoir trouvé un moyen facile de gagner sa vie, refuse de les écouter...

Tom, le fils de Dorothy, est de retour à Colorado Springs. Héros de la guerre de Sécession, il souffre d'une grave blessure à la jambe. Michaela lui donne un puissant médicament pour le soulager mais elle s'aperçoit que Tom joue la comédie pour se faire prescrire de la drogue...

Un banquier de Denver, Jedediah Bancroft, s'installe à Colorado Springs. Michaela et Sully apprennent que Bancroft est un membre actif du Ku Klux Klan. Il cherche à étendre l'influence du cercle en recrutant de nouveaux adeptes. Les incidents se multiplient...

Le Dr. Quinn se lie d'amitié avec Louise, la nouvelle maîtresse d'école de Colorado Springs. Mais plusieurs élèves commencent à se plaindre des méthodes brutales de l'institutrice. Michaela suspecte alors Louise d'infliger aux enfants des punitions corporelles violentes...

Le Dr. Quinn accepte d'accompagner deux soldats à la réserve indienne afin de livrer des provisions. Les hommes du général Custer sont abattus par des Cheyennes. Sully ordonne à Michaela de garder le silence mais la jeune femme est enlevée par des Indiens renégats...

Déterminé à venger la mort de ses deux soldats, le général Custer fait arrêter tous les Indiens de la réserve et menace de les tuer. Sully part à la recherche de Michaela, retenue prisonnière par les renégats. Les ravisseurs souhaitent faire un échange de prisonniers...

À l'approche des élections municipales, Jake, qui se croit seul en lice, doit affronter un adversaire de taille : le Dr. Quinn. La campagne prend une tournure inattendue : les femmes peuvent-elles se présenter aux élections alors qu'elles n'ont pas le droit de vote ?

Myra se décide enfin à quitter Hank afin d'épouser Horace. Fou de rage, Hank fait irruption au repas de fiançailles des futurs époux, armé d'un revolver. Il menace de tuer Myra mais Sully intervient en lui jetant un morceau de bois à la tête. Hank tombe dans le coma...

Andrew Strauss, héros de guerre, arrive à Colorado Springs. Il souhaite écrire un livre sur les Indiens et la vie du Far-Ouest. Michaela se sent inexplicablement attirée par cet étranger...

Michaela découvre qu'Andrew n'est pas un étranger. Il s'agit de David Lewis, son ancien fiancé de Boston qu'elle croyait mort au front. Entre David et Sully, son coeur balance. Elle est confrontée à un choix douloureux. Matthew, Colleen et Brian plaident la cause de Sully...