故事发生在公元2100年。公元2050年，月球在经历一次巨变后，竟出现了氧气和水。50年以后，月球已被完全开发并成为适宜人类居住的星球。地球人遥大地第一次独自来到月球旅行，却遇上了一种罕见的月球生物——兔人。

自称“长耳族人”的V-梅和咕哩咕哩原本居住在月球内部长耳族的世界兔之月，然而从外太空入侵的邪动族强行霸占了他们的土地，并让所有居住在那里的无辜族人都深陷水深火热中，因此祖孙俩为了找寻能对抗邪动族的魔动战士而来到了月球表面。

以后大地成功画出光的魔法阵并召唤出大地魔动王，成为了第一位魔动战士。接着是不断进行修炼的加斯（山本加斯），他成功召唤出风暴魔动王，成为了第二位魔动战士。最后就是召唤出水的魔动王的长耳族少年拉比（玛利乌斯），他也顺理成章地成为了第三位魔动战士。

一行五人从月球内部长耳族的世界兔之月（共分为六个区域）最外围的第五区（世界之树）出发，由此展开了与邪动族进行的漫长而又激烈的圣地战斗，其中包括了第四区（水之柱）、第三区（光之柱）以及第二区（冰之柱），直至战斗至第一区（巨人之柱），最后通过众人的齐心协力到达了由顶天立地的巨人用双臂撑起的中心区域（最顶部主区域）——圣地露娜，并最终战胜了实力强大的邪动帝国，恢复了往日圣地的和平与安宁。