Finisce l'isolamento. Dopo che ad Hamid Kahn viene staccata la spina, i Musulmani scelgono Arif come loro leader. Intanto, Cyril ha incubi sull'aver sferrato il colpo mortale a Khan nell'incontro di boxe. Ryan chiede a Sorella Pete di intervenire.

I detenuti afro-americani puntano il dito contro McManus per essersi fatto sfuggire di mano il Paradiso. Dopo i suoi ultimi comportamenti bizzarri, McManus prende l'ascia di Glynn. La copertura di Mobay è quasi saltata.

Glynn apprende da Adebisi che la pistola gli è stata data dall'ex comandante Hughes. Con l'aiuto di Rebadow, Morales prende il posto di Hernandez nel traffico di droga gestito da Adebisi e Pancamo. Mobay si ritrova in una posizione pericolosa.

Il Paradiso ha un nuovo responsabile, Martin Querns, dai metodi decisamente poco ortodossi. Il crivello di Beecher sui figli scomparsi peggiora quando Schillinger gli presenta un pacchetto inaspettato. McManus torna a Oz in una nuova veste.

Mentre Querns avvia il suo nuovo piano d'azione, le dinamiche al Paradiso iniziano a cambiare, causando frizioni con l'ufficiale Murphy. Beecher sprofonda nella depressione mentre si interroga sul destino dei suoi figli.

Le cose si fanno dure al Paradiso. O'Reily inizia una relazione inattesa. Zabitz chiede a Schillinger protezione da Keller, che cerca di entrare in riabilitazione per scusarsi con Sorella Pete. Beecher vuole vendicarsi del rapitore dei suoi figli.

Dopo l'attacco di Hughes a Devlin, Glynn si ritira dalla corsa. Miguel Alvarez è ancora a piede libero. Supreme Allah riceve una sgradita sorpresa. Hill la paga quando dice a Mobay di sapere che lui è sotto copertura. Intanto, Said fa l'impensabile.

Una troupe televisiva arriva al Paradiso, ma i risultati non sono da prima serata. O'Reily vede la visita come un'occasione per vendicarsi del conduttore dello show, Jack Eldridge, che fece un pezzo negativo sui fratelli O'Reily quindici anni prima.

Arriva un nuovo detenuto, Burr Reading, pronto a prendere il comando del giro afro-americano della droga. La dott.essa Nathan torna al Paradiso e ha difficoltà ad accettare i suoi sentimenti per O'Reily. Tidd prova ad accordarsi con Schillinger.

Morales vuole mettere i Cinesi contro Redding. Alvarez si offre a Glynn come informatore per provare a uscire dall'isolamento. La dott.essa Nathan annuncia che i detenuti saranno selezionati per testare un farmaco e ciò potrebbe ridurre la loro pena.

O'Realy si pente di aver coinvolto Cyril nel test clinico quando il farmaco inizia a fare effetto. Giles richiede un'esecuzione inusuale: ciò crea polemiche e i rifugiati cinesi sono espulsi… ma non prima di aver tramato lo loro vendetta su Morales.

Una sorpresa attende O'Reily quando un visitatore rivela la verità sul suo passato, mentre Cyril va incontro a problemi per il suo comportamento. Intanto, Morales e Redding preparano un piano che potrebbe portare a una guerra totale nel Paradiso.

McManus chiede una tregua di facciata tra Redding e Morales. Basil vede finalmente la moglie, ma Hughes rovina la loro felicità. Intanto, l'ultima scenata di Cyril si rivela essere la goccia che fa traboccare il vaso.

McManus non può voltare le spalle a White. Beecher dice ai genitori della ragazza che ha ucciso di aver chiesto la condizionale. Howell prova a ricattare O'Realy così da arrivare a Cyril, ma lui la spiazza, prima che un segreto spiazzi lui.

Nell'ultima puntata della quarta stagione, Hill scopre chi sono i suoi veri alleati a Oz. Il piano di Redding di usare il colonnello contro Morales ha un esito inaspettato. L'angoscia di Beecher per l'udienza porta a un finale sconvolgente.