“舰娘”是一位将昔日舰艇的灵魂寄居在自己身上的少女。面对来自海底的被称为“深海栖舰”的异形敌人，作为唯一能与之对抗的她们，置身于保护人们和大海的战斗中。但是，在以压倒性的数量为傲的深海栖舰队面前，她们要么受伤，要么倒下，战局正在大幅倾斜。其中，被分配到新舰队的驱逐舰“时雨”号。她被分配的新舰队是“第一游击部队”，其“第三部队”(1YB3H)。但这支舰队是由配备在后方的旧式战舰“山城”、“扶桑”以及唯一的航空巡洋舰“最上”号和四杯驱逐舰组成的，可以说是“拼凑”的部队。作为企图举残存战力的总力量起死回生的作战的一翼，为了掩护主力部队的诱饵也能看到的任务向命运的海峡出击的“时雨”们1YB3H。在愈发激烈的战斗中，等待她们的是——。

這是一個人類已經失去制海權的世界中，敗給了“深海棲艦”，對抗這種威脅的唯一希望是擁有艦艇靈魂的年輕女孩，艦娘。故事圍繞著一艘新分配到第一游擊部隊第三部隊，名為時雨的驅逐艦展開。

L’aube d’une bataille décisive approche dans le golfe de Leyte contre la Flotte des Abysses, les mystérieux ennemis qui occupent la mer. Seules capables de les combattre, les filles-navires incarnant l'esprit des navires d'antan et leurs armes de geurre. Le destroyer de classe Shiratsuyu, Shigure est affectée à la 1re escadre de Raid, 3e escadre également connue sous le nom de 1YB3H.

Malheureusement pour Shigure, le 1YB3H se compose des quelques filles-navires restants et sert de diversion. Devant affronter la Flotte des Abysses de front, il se pourrait bien qu'il s’agisse de leur première et dernière mission ensemble.

在りし日の艦艇の魂を、その身に宿す少女、「艦娘」。

海の底より生まれくる敵性艦艇群「深海棲艦」と呼ばれる異形の敵に、唯一対抗できる存在である彼女たちは、人々と海を護るべく戦いの中に身を置いていた。

しかし、圧倒的な物量を誇る深海棲艦隊の前に、彼女たちは傷つき、あるいは斃れ、戦局は大きく傾きつつあった。

その中で、新たな艦隊に配属される駆逐艦「時雨」。

彼女が配属された新たな艦隊は「第一遊撃部隊」、その「第三部隊」（1YB3H）。だがその艦隊は、後方に配備されていた旧式戦艦「山城」「扶桑」、そして唯一艦の航空巡洋艦「最上」と駆逐艦四杯という、「寄せ集め」ともいえるような部隊だった。

残存戦力の総力を挙げた起死回生を企図した作戦の一翼として、主力部隊を援護するための囮にも見える任務で運命の海峡へと出撃に向かう「時雨」たち1YB3H。激しさを増す戦いの中で、彼女たちを待ち受けるものは——。

인류가 해상권을 잃어버린 세계에서 '심해서함'은 적이다. 이것에 대항하는 해 뜨는 곳에 있는 함대의 영혼을 가진 소녀들, 통칭 '칸무스'. 그리고 심해서함에 대항하는 함대의 거점 '진수부'. 이곳에서 칸무스는 공동생활하며 매일 연습을 한다. 어느 날, 진수부에 특형 구축함 1번함 후부키가 부임하게 되는데...... 후부키와 칸무스들의 이야기 시작!

A história se passa em um mundo onde criaturas conhecidas como Frota Abissal começaram a atacar a humanidade.

Como forma de proteção, garotas capazes de usar os espíritos dos grandes navios de guerras foram escolhidas como última defesa, ficando então conhecidas como Kanmusu.

«Канмусу» ー юные девы, чьи души принадлежат военным кораблям былых времен. Лишь они могут противостоять загадочному Глубинному флоту, вражеским кораблям со дна морского, защищая людей и поддерживая мир. Однако ресурсы Глубинного флота безграничны, и военная ситуация сильно переменилась, многие канмусу были ранены или убиты.

Эсминец Сигурэ распределяют в отряд 1YB3H. К её удивлению, в соединении оказались лишь парочка устаревших линкоров Фусо и Ямасиро, уникальный в своём роде авианесущий крейсер Могами да кучка эсминцев. Новому «отряду неудачниц» выпала роль диверсионного соединения, единственная задача которого ー стать приманкой для врага и совершить самоубийственный поход в один конец.

Se acerca el amanecer de una batalla decisiva en el golfo de Leyte contra la Flota Abisal, los misteriosos enemigos que ocupan el mar. Como únicas capaces de luchar contra ellos, las Kanmusu -jóvenes que poseen el alma de los buques de guerra- se organizan para prepararse. El destructor Shigure, de clase Shiratsuyu, es asignado a la Primera Fuerza de Ataque, Tercera Sección, también conocida como 1YB3H.

Por desgracia para Shigure, la 1YB3H está formada por los pocos Kanmusu que quedan y sirve como flota de distracción. Al tener que enfrentarse a la Flota Abisal, puede que sea su primera y última misión juntos. Aun así, Shigure se niega a que el enemigo le arrebate otro camarada. A medida que avanzan hacia el golfo de Leyte durante esta misión suicida, los miembros del 1YB3H deben apoyarse mutuamente y perseverar para demostrar su valía como naves competentes.

Secuela en formato serie de los eventos posteriores a la película "KanColle: The Movie", dentro de la serie "Kantai Collection: KanColle".