猛犸擎天柱带领巨无霸新兵小队找到了数年前失踪的白狮一行人飞船的黑匣子，得知了灭世魔能的事，并与炎冲天率领的原始兽在银河内搜寻存有灭世魔能的平衡舱，双方互有输赢。中途突然出现了神秘的三人组，他们自称灭世魔仆，并夺走了所有平衡舱，原始兽和巨无霸双方追击到了一颗小行星上。炎冲天发现，在他眼前的是数年前同人工行星复仇星一起爆炸毁灭的前任破坏大帝——惊破天。经过一番交战，发现眼前的不是惊破天，而是借助惊破天身体复活的宇宙大帝。宇宙大帝的目的是完成大帝之战（Great War）时代（G1大电影）的野心——统治全宇宙，让整个宇宙只剩下宇宙大帝自身一个生命体。而灭世魔能正是从前宇宙大帝为以防万一而封印到盖亚星的自己的能量。因为过去使用的恶魔般的身体在漫长岁月里已经彻底毁坏，想要夺取塞伯特恩为身体。宇宙大帝一路进攻到塞博特恩，并以能量体光之龙形态摧毁了整个巨无霸、原始兽联合舰队，与魔力神球结合，并在塞博特恩上出现了他象征性的大角。但因为灭世魔能绝大部分都在众多平衡仓内封印着没能取回，消灭巨无霸原始兽联合舰队时又损耗过大，能量体形态下的宇宙大帝在力量恢复前变得非常虚弱，被炎冲天抓住机会将他从魔力神球赶了出来，最后被猛犸擎天柱结合领导模块和全体巨无霸的正义之力打败。

Beast Wars Neo is een Japanse televisieanimatieserie en speelgoedlijn van Transformers uit 1999 en een vervolg op Beast Wars II.

Beast Wars Neo is a 1999 Japanese Transformers television animated series and toy line, and a sequel to Beast Wars II.

A série se concentra em uma batalha entre facções Maximal e Predacon por posse de misteriosas Cápsulas angolmois. O único "exército de um homem só" grande comboio é atribuído a tarefa de ser professor para um grupo de jovens recrutas contra o grupo de Magmatron. No final da série, no entanto, ambas as forças se unem para se opor à ira do deus negro Unicron e seu subgrupo; os Blentrons.

Beast Wars Neo es la secuela directa de Beast Wars II, continuando los acontecimientos de la serie anterior. La serie de televisión y la línea de juguetes fueron realizadas a lo largo de 1999