Everyone scrambles for their lives when things take a turn for the worse.

闯入富士上级皮拉光柱内部的克劳、宫古、阿祖、园香等人，在前方等待她们的是充满谜团的巨人与过去阵亡的战姬们的黑色英灵机体。和过去的伙伴交战而感到困惑与愤怒的女武神们，因日本各地的皮拉光柱开始朝着富士山集结而陷入绝境。此时，过去曾被称之为日本守护者的S级王牌冲田樱的黑色机体现身。

Les Valkyries et leurs escadrons Bouclier ont pénétré dans le Pilier Primaire, mais l'intérieur n'est que désolation à perte de vue. Surtout, un hôte fort peu commode semble les attendre dedans.

후지 프라이머리 필러의 내부로 돌입한 클라우, 미야코, 아즈즈, 소노카를 기다리고 있던 것은 수수께끼의 거인과 예전에 격추됐던 발키리들의 검은 영령기였다. 전사한 예전 동료들과의 전투에 당황하며 분노하는 발키리 일행. 그런 그녀들을 궁지에 몰아넣으려는 듯이 일본 각지에서 필러가 출현하여 후지를 향해 모여들기 시작한다. 게다가 예전 일본의 수호자라 불렸던 S급 네임드 오키타 사쿠라의 검은 기체가 나타나는데. '당신이 추락했던 어제보다, 오늘의 우리가 훨씬 강해!'

富士プライマリー・ピラーの内部に突入したクラウ、宮古、アズズ、園香らを待ち構えていたのは、謎の巨人と、かつて撃墜された戦乙女たちの黒い英霊機だった。かつての仲間たちとの戦闘に戸惑い、怒りを覚えるワルキューレたち。そんな彼女らを追い込むように、日本各地からピラーが富士に向かって集結しはじめる。さらには、かつて日ノ本の守護者と呼ばれたS級ネームド、沖田・桜の黒い機体が牙をむき――。「あなたの墜ちた昨日より、今日の私たちの方が、強い！」