万木朝颜是在神奈川县兴云大学法医学教室工作的法医学者。她的父亲是野毛山署强行犯系的刑警万木平，她的丈夫是平的前部下、神奈川县警搜查一课刑警桑原真也，朝颜和桑原有个五岁的女儿亚美。一家四口过着幸福的日子。某天早上，朝颜等人一边吃早饭一边谈话，突然，亚美提出想要个弟弟。就在尴尬的气氛之中，平和桑原出去工作了。朝颜也去亚美送到保育园，然后像平时一样到兴云大学上班。途中，朝颜遇到人行立交桥上发生人群踩踏事故。本来附近的体育场预定要召开大型活动，但突然火灾警报器响起来，惊恐的人们为了躲避火灾涌上人行立交桥，结果发生了事故。朝颜赶紧前往兴云大学，在法医学教室，安冈光子、高桥凉介、藤堂绘美、藤堂雅史等人也在看着报道人群踩踏事故的电视新闻报道。20人被送到医院，其中有4名死者，一名昏迷的重伤员大参事。虽然主任教授夏目茶子去海外出差，但法医教室还是马上接受了解剖委托。与此同时，平与野行山署的森本琢磨、山仓伸彦等同事以及县警桑原带着检视官丸尾大作开始调查事故原因。但是，奇怪的是，体育场根本没有发生火灾，有证人说现场散发出古怪的气味，实际上，受害者中也有人提到出现抽搐、昏迷等像是吸入化学药品的症状。而且，多名证人提到，在事故发生前，有个金发男子在吵闹。某天，在群体踩踏事故中失去妻子的金发男子佐藤祐树在事故现场接受媒体采访。祐树表示，这次的事件不是意外事故，是杀人案。

野毛山署管界内一处空地上发现了男初中生的遗体。正在歇班的朝颜被兴云大学法医学教室打来的电话吵醒。朝颜刚下楼，平已经把一切准备妥当。平马上赶赴现场。被害者是14岁的矢野谅平，死亡时刻推定为上午五点到六点。上午七点时，正散步的附近居民发现遗体报警。遗体的胸口窝附近有大量皮下出血。而且，谅穿着棒球队的队服，遗体旁边有比赛用手套，棒球则夹在铁丝网上部。另一方面，桑原替朝颜照顾女儿亚美。但是，本来约好和朝颜出去玩的亚美很不开心。朝颜与藤堂等人开始解剖谅的遗体。除了胸口附近内出血之外，谅身上没有外伤。解剖后的会议上，藤堂告诉检视官丸屋和强行犯系长山仓，谅可能是因为胸口附近受到强力打击，伤及心脏，引起心跳停止。为了决定调查的方向，丸屋强烈要求法医们能确定死因是不是被殴打。但是现阶段朝颜她们很难下结论。就在双方争辩时，他们接到了意料之外的通知。据说，收到电话后准备赶来的谅的父亲从台阶上摔落，陷入昏迷。因为谅没有母亲，所以由谅的祖母咲江和谅的孪生哥哥一马来确认身份。

某天，检视官丸山打电话叫朝颜出来。朝颜前往山梨与神奈县交界的田园地带。警方引导她来到发现尸体的仓库。丸屋和从神奈川调到山梨的伊东都在那里。伊东主张首先接到报警的是已方，所以案件应由山梨县警调查。而丸屋强调，该案一直由神奈川县警调查，绝不会拱手让人。因为和伊东一起来到现场的山梨医大的法医的预约已满，所以此案由朝颜负责。神奈川县警的刑警介绍说，遗体在农具仓库里被发现，第一发现人是因为仓库主人亡故而前来调查走访的土木课职员。遗体已完全木乃伊化，附近也没有能证明死者身份的东西，所以，要确定死者年龄和死亡时间很困难。而且，奇怪的是，死者穿着礼服、打着蝴蝶结。丸屋还告诉朝颜，死者有可能是重大案件的嫌疑人。

朝颜一到法医学教室，茶子就打来电话说自己被关在车里了，所以今天请假。对此，藤堂说一定是撒谎，大家也都没有在意。另一方面，平在野毛山署遇到了一个意想不到的人。那就是与万木家颇有渊源的忍。这时，在某座公寓的一个房间内发现了一具二十多岁的女性的遗体。女死者是网页设师坂井亚衣。亚衣的姐姐美优打电话给房东说联系不上妹妹，所以房东才在警察陪同下进了房间，结果发现亚衣倒在床上已经身亡。朝颜与野毛山署强行犯系的刑警们一起赶到现场。经过调查，亚衣好像是窒息了，脖子上有轻微的被绳子状的东西勒出来的痕迹。但是，当房东进房间时，门和窗都是锁住的。森本等刑警认为这是密室杀人案，不禁紧张起来。美优在接受询问时，认为亚衣是被交际对象杀害的。

朝颜带女儿亚美去外公浩之所生活的仙之浦拜访之时，接到希望她判断是否应解剖某具遗体的电话。朝颜赶赴现场，却发现丸屋竟在那里，岩手县警的老手刑警佐山也在。被发现死在自家的是17岁的甲田雅子。8年前，她因脑梗塞病倒后就卧床不起。第一发现人是雅子的女儿奈奈子，她一直独自照顾母亲。丸屋怀疑奈奈子，从小认识奈奈子的佐山则反对丸山的看法，更反对进行解剖。然而，遗体的状况显示雅子已过世两天，而奈奈子今天早上才报警。朝颜向丸屋等人建议进行解剖。与此同时，兴云大学法医学教室里，藤堂和光子等人正在对宍户庆介进行解剖。据说庆介睡觉时，被强风刮飞的招牌砸破窗玻璃，碎玻璃刺中了庆介，导致他失血过多而死。但是，平注意到庆介胸口有伤，怀疑这是不是一起事故，遂再次去现场调查。在北上医大，朝颜准备解剖雅子，她请求光子和绘美来现场帮忙。另一方面，桑原在咖啡馆和一位叫田村圣奈的女性见面。

桑原一夜未归，电话也打不能，朝颜很担心。电视新闻说昨晚发生警察被杀案件。犯人袭击警察、抢走佩枪，现在正在逃窜中。这时，去仙浦的平打来电话。听了桑原的事后，平安慰朝颜说也许桑原是熬夜查案或审讯。与此同时，神奈川县警的刑警们在野毛山署管界内的港口集结。横在他们面前的尸体是曾与桑原联系的田村圣奈。她被人用枪打中头部。神奈川县警管理官泷川雄一郎唤来正好在案件现场的桑原。山仓等野毛山署强行犯系的诸人也赶到现场。然而，县警没有跟山仓他们详细说明案情就把他们打发回去了。受警察被杀案影响，保育园放假，所以朝颜带亚美到法医学教室上班。藤堂和绘美也因为小学放假，把儿子带到教室。后来，他们接受了紧急解剖委托，朝颜正打算开始解剖，却发生了意外的事。

朝颜的丈夫、神奈川县搜查一课的桑原因为涉嫌枪杀田村圣奈而被监察官五十岚严厉地追问。桑原主张杀害圣奈的是她的男友桐谷大和，并作证说自快曾击中了从圣奈背后枪击她的桐谷的右足。然而，警方找到桐谷时，他已成一具烧焦的尸体，解剖结果显示在圣奈被枪杀前他就死了。为桐谷进行解剖的就是朝颜。朝颜请检视官丸屋去看一下发现桐谷遗体的现场。但得知此事的五十岚来拜访朝颜，告诉她，丸屋已被排除于案件调查之外。五十岚表示，妻子也有可能为了丈夫而篡改记录。而且，他还问朝颜，不习惯于用手枪射击的桑原是否有可能失常。对此，朝颜表示无论结果如何自己在解剖时绝不会徇私，但也同意他们不让自己担任解剖负责人。另一方面，野毛山署的山仓等人得到了作为事件开端的警察被夺走手枪的现场周边的监控录像。这是平安排的，而且他还请求山仓帮忙让他与某人会面。然而，无论是法医学教室还是野毛山署的刑警们，都没法找到能证明桑原无罪的新证据。

朝颜与亚美一起参加保育园的运动会，她凝视着女儿快乐的身姿。与此同时，藤堂和光子等人正在解剖在公寓前死去的21岁大学生小凑真由的遗体。真由全身有十一处刺伤，死因是背部刺伤导致的出血性休克。因为真由是杂志的人气读者模特，在SNS上流传着该案件的各种情报。这其中，怀疑与真由交好的模特同事吉永明日花和曾传说与真由交往的橘凛太朗是犯人的说法最为流行。这时，高桥和牛岛在清扫解剖室，解剖台旁边的下水道出了毛病，突然喷出水来。因为这个原因，原本预定要做的解剖只能委托给其他大学。第二天，朝颜上班时，帮助要调查真由案件的光子。但是，茶子指示朝颜，到下水道修好前把带薪休假都休了。某天，朝颜带亚美去仙浦，与平重逢。然后，他们去看望因病入院的浩平。在这期间，她遇到了自称是母亲里子的中学同学的美幸。另一方面，桑原因为开枪事件而被刑事部长命令参加临时审议会。

朝颜等人接到解剖两具烧死的尸体的紧急委托。朝颜请求亚美所在的保育园延长托管时间，然后与光子、绘美等人分头解剖。光子他们出于好意让朝颜先下班。朝颜接了亚美回家，正好美幸发来的快递包裹送到了。美幸说平最近在食堂帮忙。包裹中除了肉包子、干货等仙浦土特产之外，还有据说是朝颜的母亲里子在合唱团时代使用过的钢琴谱。第二天，朝颜去上班，光子、高桥、藤堂已经在办公室了。原来，他们一直工作到早上。这时，在兴云大学西门移动售货车“白面包”打工的北村爱菜拿着传单过业。这一下，高桥突激动起来。其实，高桥是“白面包”的常客，似乎那里一有新商品他总是会捧场。就在这时，一个男性遗体运到朝颜他们的法医学教室。男性死者是清洁工，在维护管道时从大厦楼顶摔下来，但是，有人目击到是他自己解开的安全绳，此事件很是古怪。由于其他案件的关系，这场解剖由光子主持，朝颜做辅助。然而，在执刀过程中，光子误用手术刀刺伤了自自己的手指。

兴云大学法医学教室里，朝颜正与检察官开碰头会，光子、绘美、藤堂等也忙于各自的工作。这时，移动售货车“白面包”的店员爱菜上门来推销面包。实际上，高桥与爱菜约好下周和她一起吃饭。朝颜解剖了因药物摄入过量中毒而死的男性遗体。她从血液检出了兴奋剂成份，推想死者使作的是不纯物过多的粗劣药物。因为其他大学也有类似的案例，朝颜告诉高桥，尽可能对解剖的遗体进行药物检查。当天晚上，朝颜接到住院的外公浩之的电话。已经转院的浩之想知道以前交给朝颜的也许是里子的牙齿的检查结果。朝颜打电话给桑原说明此事，然后带亚美去看望浩之。第二天，朝颜、亚美和到车站迎接她们的万木平一起去浩之的新医院。然而，平却朝浩之过去住的医院走去，而且把会面的预约日也搞错了。经过医院方面协调，朝颜总算见到了浩之并告诉他没有检查牙齿。另一主面，桑原接到报警说，附近的隧道发出奇怪的声音，便前去巡视。那个地方许久以前就开始传说有妖怪出没。

朝颜等兴云大学法医教室的内仁接到了派遣委托，前往位于长野的隧道崩塌事故现场。朝颜听说在巡视中被卷入事故的桑原平安无事后，刚松了一口气，却又得知本应与忍一起留在家的亚美失踪了。她把事故现场的工作拜托给光子和绘美，急匆匆与桑原一起回到万木家。一到家，朝颜他们就分头寻找亚美的下落，却没找到。野毛山署的森本等人接到电话后，一下班也加入搜寻亚美的队伍。另一方面，藤堂在给据称在酒吧工作的年轻男人木岛和树做解剖。木岛的死因是服药过量，而且从尸体中查出了与前一天朝颜所解剖的死于药物中毒的男子体内成分完全相同的兴奋剂。这时，牛岛看了木岛的资料，说曾去过死者工作的酒吧。就在这时，他们又接到委托解剖一位从台阶上跌落致死的20岁的女性。

朝颜等人苦思冥想为何吸食兴奋剂过量而死后呈现奇怪姿势的22岁女性松野纱英无法恢复成正常的姿态。就在这时，离开法医学教室的前教授茶子突然出现。茶子与若林昭信在一起。实际上，若林是通过对遗体进行防腐处理使其恢得到近似生前状态的专家。茶子就是被猎头发掘到若林所创立的公司担任防腐处理助理的。若林的公司不仅是从事防腐处理，更旨在为失去重要亲人而深深悲伤的人们带去安慰。防腐处理必须由死者家属同意，所以朝颜和茶子一起去会见纱英的双亲。纱英的母亲翠对朝颜的提议表示感谢，但是父亲武弘却不肯原谅离家出走后死于药物中毒的女儿。另一方面，高桥告诉朝颜，从爱菜的毛发中也测出了兴奋剂阳性反应。朝颜与高桥一起去野毛山署，把检查资料交给强行犯系的山仓。山仓因为爱菜曾与卖兴奋剂的男人交往过，所以怀疑她可能也与贩毒有关，指示忍带爱菜回来协助调查。

朝颜决定再和父亲万木平好好谈谈。平在和朝颜通话之时，约好了第二天去医院，但是，第二天早晨他就把约定忘得干干净净。另一方面，桑原为了能帮助忙于工作和育儿的朝颜，每到休息日就从长野回到神奈川。同时，他尝试调加神奈川县警，但是没有回音。得知此事后，野毛山署强行犯系的系长山仓借个人商谈的机会，拜托部下们利用人脉帮助桑原回神奈川。朝颜带着亚美前往平所居住的仙浦。

朝颜、桑原还有女儿亚美从仙浦回家，还是和平一起生活。一家四口波澜不惊地度过了年末年始。朝颜准备着迎接正月头三天一早就来拜访的桑原的双亲和桑原的姐姐忍一家。这时，茶子打电话来和朝颜商量解剖的事。茶子和若林来到兴云大学法医学教室，向朝颜等人说明与这次案件有关的情况。遗体是一位叫猿渡正夫的65岁男性。猿渡在欧洲某国的宾馆中去世。他生前与妻子佳织、独生女优香生活，但某天突然失踪，家人提出了搜索申请。猿渡的遗体劲部有上吊的痕迹，当地解剖的结果断定是自杀。佳织她们委托若林重新做尸体防腐处理，并希望做第二次解剖。听佳织和优香说了事情经过后，他们

发现是女儿优香强烈希望重新解剖。实际上，优香是野毛山署刑警森本在学生时代的朋友。因为优香不能接受父亲是自杀的结论，所以森本提议她选择再次解剖。朝颜她们接受了优香的委托，重新对猿渡进行解剖。

朝颜接电话得知住院的外公浩之病情恶化后赶往岩手医院。她准备待浩之苏醒后就把可能是母亲的牙齿检查结果告诉他。但是，浩之没有醒来，因为面临庭审朝颜只好回到神奈川。另一方面，重返神奈川县警的桑原，意外地与以前因偷井盖被捕的今野重逢。今野说看到了了不得的东西并从口袋里掏出传单。那是呼吁人们为10年前发生、至今未解决的三田村一家杀人案提供情报的传单。该案中，30多岁的三田村夫妻与7岁的长子在自家住宅内被人杀害，所有尸体的右脸都被划出十字形伤口。根据目击者情报，三田村家的熟人市川被逮，但因为证据不足而免于起诉。今野说，他看到了与案发现场三田村家附近的传单上描绘的犯人的模拟画像长相相似的男人。这时，发生了不可思议的事。在保持案发时原状的三田村家中，又发现了一具男尸。那个被认为有50多岁的死者，被人以同样手法杀害，右脸颊也有十字形伤口。尸体被送到兴云大学法医学教室解剖。

朝颜帮助女儿亚美烤情人节用的巧克力饼干。似乎亚美要把它送给保育园的男孩。桑原知道后气乎乎地说现在谈恋爱还太早，把万木平吓呆了。电视新闻正在介绍宫城县警和当地消防队自从大地震发生以后每逢月命日都进行搜索活动。这时，兴云大学法医学教室接受了为仅八月大的女婴做解剖的委托。女婴的母亲田崎直子说，她在做饭时目光刚移开一会儿女儿就昏过去了，她马上把女儿送去急救。根据朝颜的解剖结果，女婴是气管被塑料玩具卡住导致窒息而死。野毛山署强行犯系的桑原忍和冈岛问朝颜死者是否受过虐待。直子是位单亲母亲，据说生活得并不轻松，所以，无论如何，当孩子死亡后，警方必然会怀疑虐待的可能性。以忍首的刑警都感到直子很古怪。朝颜和光子他们也很困惑，因为直子看起来并不为女儿的死悲伤。

朝颜与父亲万木平、女儿亚美一起出席外公浩之的葬礼。另一方面，桑原接到管理官五十岚的指示，与万木平的同事糀谷搭档，调查“三田村一家杀人事件”。这时，检视官伊东纯打电话给朝颜，称胡同里发现一具女尸。葬礼一结束，朝颜就前往发现尸体的现场。死者住在现场前面的公寓，公寓楼有遗书和女性的鞋，死者可能是跳楼自杀的。但是，朝颜觉得公寓另一侧下面是停车场，死者不朝那里跳，反而特意向狭窄的胡同里跳，这很可疑。遗体被运到兴云大学法医学教室，由已取得认定医资格的光子主刀进行解剖。与此同时，一位意料之外的人物出现在野毛山署。

朝颜等人遇上了凶恶的案件。野毛山署络行犯系的森本被脸上有烧伤的男人刺杀，被发现时已满身是血。桑原在自家接到通知，赶到搜查本部。万木平得知自己当刑警时最后一位搭档森本被刺后，非常生气，他请求朝颜说也想去现场。山仓等野毛山署的刑警们正在森本被刺的现场周围探查与凶手有关的痕迹。山仓告诉与朝颜一起来到现场的平，森本遇刺与2011年发生的三田村灭门案、最近三田村家发生的男性遇害案有关。另一方面，兴云大学法医学教室的人们在茶子帮助下，重新检查当年与三田村灭门案有关的解剖资料、相关论文等。桑原与管理官五十岚一起询问市川。市川当年曾作为三田村灭门案嫌疑犯而被捕，但后来因为证据不充分而被免于起诉。就在这时，袭击森本的脸上有烧伤的男人又犯下新的罪行。