Uscito di prigione dopo sei anni, Walter Huneck tenta di vendicarsi su Rex tendendogli un attentato: benché ferito, il cane risulterà infine determinante per smascherare il colpevole.

L'omicidio di un uomo avvenuto all'interno di un vagone ferroviario svela un traffico di denaro sporco in cui vengono usati, come corrieri, alcuni bambini provenienti dall'Europa dell'Est.

Un anziano avicoltore viene ucciso da un pacco-bomba portato da uno dei suoi uccelli: le indagini mettono inizialmente in luce un intrigo con la malavita croata.

Due persone muoiono avvelenate dopo aver assunto delle vitamine in pillole: indagando su di una delle vittime si viene a scoprire che, dietro ad un possibile complotto, si nascondono in realtà questioni di gelosia.

La squadra omicidi indaga su una serie di crimini avvenuti all'interno di una clinica psichiatrica.

Tra i bagnanti del Danubio si diffonde la notizia della possibile presenza di un coccodrillo che minaccia gli avventori: la scoperta del cadavere di una donna sembra confermare codesta supposizione, ma le indagini portano ad una pista ben diversa.

Niki si finge una detenuta per indagare su un omicidio avvenuto all'interno di un carcere.

Una conduttrice radiofonica che aveva lanciato una campagna contro l'alcoolismo, viene sospettata di un omicidio: malgrado alcuni disaccordi tra Marc e Niki, viene individuato il vero colpevole.

Una coppia di adolescenti uccide per errore un barbone: tale omicidio svela una serie di attività illecite in cui è coinvolto il padre della ragazza.

Accanto ad alcune donne morte assassinate vengono rinvenuti degli indizi simili ad oggetti presenti in alcune fiabe: le indagini porteranno ad uno psichiatra che, durante l'infanzia, ha subìto degli abusi da parte dei famigliari.

Una giovane coppia sospettata di omicidio tenta di rifugiarsi in Italia, ma viene fermata da Rex e dalle contrazioni della ragazza, in procinto di partorire.

La squadra omicidi indaga su un presunto omicidio avvenuto all'interno di una casa di riposo per anziani.