사자를 좋아하는 오라온과 독수리를 좋아하는 오가온은 엄마가 일하는 동물원에서 사육사 일을 돕고 있다. 그러던 어느 날, 지구의 어스 에너지를 노리고 다크 스피너가 나타난다. 오라온과 오가온은 정체를 알 수 없는 목소리를 따라서 동물원 지하의 지구 방위대 어스팀의 기지로 가게 된다. 그리고 그곳에서 기가 엔지너 레오와 기가 엔지너 이글을 타고 출동해 지구를 위협하는 적과 싸우게 되는데…

마하가 4연승에 도전하는 T1그랑프리가 열린다. 동물원에서 열리는 어린이 교실을 맡은 라온을 제외하고 가온과 대박은 마하의 예선전 경기를 보러간다. 라온은 마하가 실제로 경기장에서 달리는 모습을 보고 메가 엔지너를 탈 때 도움이 될 거라 생각한다. 한편, 지난 번 다크 에너지를 모으는데 실패한 스핀단은 T1그랑프리에서 경주용 차들이 도는 모습을 보고 회전을 써먹을 수 있겠다면서 기뻐한다. 대망의 결승전 날, 가온의 이야기를 들은 라온이 마하의 경기를 보러 경기장에 온다. 그런데, 그곳에 스핀단이 다크 에너지를 모으러 나타나는데...

라온과 가온은 아침부터 쓰레기를 버리는 일로 티격태격 다툰다. 라온은 힘과 속도로 모든 일을 밀어붙이려하는 반면, 가온은 냉정하게 머릿속으로 계획을 세우고 행동에 롬긴다. 그런 가온을 보며 이글은 사냥에는 끝까지 냉정한 판단력을 유지할 필요가 있다고 말한다. 한편, 스핀단은 쓰레기 처리장을 보고 다크 에너지를 모으는데 이용하기로 한다. 스핀단 때문에 도시 곳곳에 검붉은 연기가 퍼지고 모든 게 검붉게 물든다. 라온과 가온은 메가 엔지너를 타고 출동해 이를 막으려한다. 하지만 연기 속에 숨어서 공격하는 스핀킹 스모퍼스를 막기가 쉽지 않은데...

라온과 가온은 학교에서 해린을 만난다. 알고 보니 해린과 라온, 가온은 동갑으로 같은 학교를 다니고 있었다. 미술시간, 해린은 찰흙으로 사벨 타이거를 만든다. 그리고 쌍둥이는 해린한테 멸종된 사벨 타이거의 골격 표본이 박물관에 있다는 얘기를 듣고 구경 가기로 한다. 박물관에 간 두 사람은 그곳에서 해린을 만나는데, 때마침 다크 에너지 반응이 나타난다. 다크 에너지를 충분히 모은 다크 스핀단은 처음부터 제2형태의 우주 괴수 가멜레온으로 기가 엔지너에 맞선다. 가온과 이글은 가멜레온의 공격으로 움직일 수 없는 상태에 빠진다. 게다가 가멜레온이 카멜레온처럼 모습을 감추고 공격해오는 바람에 라온과 레오마저 위기에 처한다. 그 때 해린이 터보 파이어 파워카를 사용하라고 제안하는데...

동물원에서 토끼가 도망친다. 라온과 가온은 서로 토끼를 잡겠다고 나서다 놓치고 만다. 우리는 그런 두 사람을 보고 둘의 개성이 다르니 서로 힘을 합치면 최강이 될 거라고 말해준다. 한편, 다크 스핀단은 지하철 터널 공사장에서 빙글빙글 도는 실드 머신을 이용해 다크 에너지를 모으기로 한다. 이에 라온과 가온이 이들을 막기 위해 출동한다. 대박과 기조는 지하철 터널이 좁은 까닭에 라이드 온을 할 수 없으니 라온과 가온이 흩어져서 협공을 하라고 지시한다. 하지만 두 사람은 서로 앞서겠다면서 갈라지지 않고 나란히 달리는 바람에 기가 엔지너로 라이드 온할 기회를 놓치고 만다. 설상가상으로 지하를 뚫고 나아가던 스핀킹이 어스 본부를 향해 달려가는데...

다크 스핀단은 지구의 70%를 차지하는 물을 이용해 다크 에너지를 모으려고 한다. 이를 막기 위해 라온과 가온 그리고 레오와 이글이 출동한다. 그리고 제2형태로 변한 우주 괴수를 물리치기 위해 라이드 온 하려 하지만 주변이 물바다가 되는 바람에 물을 싫어하는 레오가 움직일 수 없는 상태가 된다. 이에 라온과 레오 대신 가온과 이글이 치타와 합체하려 하지만 치타마저 레오와 같은 고양이 과라 물을 싫어하는 바람에 파워 합체도 할 수 없게 된다. 우주괴수 댐버스터는 자신을 막을 자가 아무도 없자 바닷물을 마구 빨아들여 곳곳에 뿜어대는데...

쇼핑몰 경품으로 테마파크 티켓에 당첨된 가온과 라온은 마하와 함께 테마 파크에 놀러간다. 한편, 다크 스핀단도 다크 에너지를 노리고 테마파크에 찾아온다. 하지만 세 사람은 놀이기구를 타는데 정신이 팔려 다크 에너지는 까맣게 잊어버린다. 라온 일행과 다크 스핀단은 서로의 정체를 알아차리지 못하고 함께 놀이기구를 즐긴다. 여섯 명은 고카트를 같이 타게 되고, 쌍둥이는 ‘뒤는 너에게 맡긴다’ 작전을 구사해 1등을 차지한다. 이렇게 즐거운 하루가 가고 다크 스핀단은 까맣게 잊었던 다크 에너지를 모으기 위해 다음 날 아침 일찍 테마파크를 다시 찾는다. 그리고 관람차와 닮은 우주괴수 광란차를 불러내는데...

브레이크의 충고로 다크 스핀단은 셋이서 함께 미스터리 서클을 만든다. 그 때문에 평소보다 훨씬 큰 스핀킹이 하늘 위에 나타난다. 라온과 레온은 하늘을 날지 못해 점프를 하다 땅에 처박히고 유일하게 하늘을 날 수 있는 이글이 스핀킹을 공격한다. 하지만 이글의 공격은 전혀 통하지 않아 이글과 치타가 파워 합체해 엔진봇 이글치타가 등장한다. 하지만 이글치타의 능력으론 하늘 높은 곳에 떠 있는 스핀킹에게 매달리는 게 고작으로 제대로 된 공격을 하지 못한다. 이 때, 기가 엔지너 샤크를 살펴보러 호주에 갔던 오대박 박사가 완성된 샤크를 가온과 이글이 있는 곳을 보내는데...

콤비 플레이로 스핀킹을 쉽게 이긴 라온과 가온은 자신들은 최강이라면서 의기양양해한다. 마하는 그런 두 사람에게 끝까지 방심하지 말라고 충고 해준다. 한편, 스핀단은 엔진봇을 이기지 못해 브레이크한테 벌을 받을까봐 우주선으로 돌아가지도 못한다. 그러던 중에 처음 보는 강력한 에너지 반응을 감지하고 그곳으로 향한다. 그리고 그곳에서 승주와 사벨을 만나게 되는데…

사벨과 싸우게 된 레오와 이글. 하지만 사벨이 너무 강해 레오와 이글은 제대로 반격조차 못한다. 그러던 중 사벨이 다크 에너지로 인해 이상 반응을 일으켜 싸움을 멈추고 떠난다. 그리고 사령관과 해린은 어떻게 승주와 사벨이 어스 본부에서 모습을 감추게 됐는지 얘기해준다. 엔진봇을 개발하는 과정에서 깨어나게 된 사벨 타이거의 영혼. 승주는 사벨 타이거의 목소리를 듣고 엔지너가 된다. 하지만 억지로 깨어난 사벨은 사람들한테 거부감을 가지고 어스 에너지 보급을 거부하는데...

동물원 식구들은 소용돌이 전통춤 대회에 참가하기 위해 라온과 가온의 할아버지인 오만능까지 불러 함께 연습을 한다. 스티브는 올해는 꼭 대회에서 우승하겠다면서 소용돌이 춤의 고향인 회오리 아일랜드로 수행을 하러 간다. 한편, 사벨에게 보급할 다크 에너지를 모으기 위해 빙글빙글 회전하는 무언가를 찾던 다크 스핀단은 회오리 아일랜드 근처에서 발생하는 소용돌이를 보고 그곳으로 향한다. 그리고 바다 속에 미스터리 서클을 만들고 다크 에너지를 모은다. 라온과 가온은 다크 에너지 반응을 감지한 어스 본부의 연락을 받고 회오리 아일랜드로 출동하는데...

우울해하는 해린이를 위로해주기 위해 사령관은 휴가를 내 줄줄 타운의 동물원을 돌아본다. 마침 같은 곳에 있던 다크 스핀단도 관광을 하다 고가도로를 이용해 다크 서클을 만들어낸다. 그리고 그곳에 나타난 스핀킹의 영향으로 통신이 두절되고 어스 에너지를 수상쩍은 안개에 빼앗기게 된다. 사령관과 연락이 끊기자 라온과 가온은 두 사람을 구하러 출동하는데…

지하인간을 봤다는 제보가 어스 본부에 들어온다. 라온과 가온은 흐릿한 사진 속의 지하 인간이 다크 스핀단이 아닐까 싶어 제보자와 만나기로 한 석회동굴로 간다. 그리고 그곳에서 탐험가 새싹인 탐후를 만난다. 덜렁대다 자꾸 넘어지는 탐후를 대장으로 삼고 라온과 가온은 지하 인간을 찾아 동굴 안을 탐험한다. 장래 희망이 탐험가인 탐후는 아빠한테 인정받기 위해 지하인간을 꼭 붙잡고 싶어한다. 하지만 그 동굴 안에 있는 건...

할아버지의 직장인 오렌지 핏으로 현장 체험 학습을 간 라온과 가온. 두 사람은 체험 학습이 끝나자마자 다크 에너지 반응이 감지됐단 연락을 받는다. 그런데, 만능이 어스 본부로 달려가는 두 사람의 뒤를 쫓는다. 결국 미스터리 서클이 감지된 곳까지 쫓아온 만능은 어스 엔지너로 변신한 두 사람을 목격하게 된다. 원래 만능은 어스의 정비 주임이었지만 자동차에 동물의 혼을 불어넣고, 로봇으로 변신하게 만드는데 반대해 어스에서 나왔던 것이었다. 하지만 사벨의 공격에 상처를 입어가면서까지 자신을 보호하는 레오를 보고 마음이 바뀌는데...

라온과 가온은 미국에서 새로운 엔지너가 온다는 소식에 들뜬 마음으로 기다린다. 그런데, 카우보이 차림을 하고 나타나 격렬한 인사를 하는 조의 모습에 다들 당황한다. 게다가 조가 탑승하는 기가 엔지너 버팔로도 조처럼 상당히 특이한 모습을 보인다. 그러던 중 다크 에너지 반응이 나타나 라온, 가온과 함께 드디어 조도 출동하게 된다. 조는 사벨과 승주를 한 방에 해치우겠다고 큰소리치지만, 승주가 해린의 오빠라는 사실을 알게 되고는 승주와 싸울 수 없다고 하는데...

조가 다크 스핀단을 유인해낼 작전을 세운다. 라온과 가온 그리고 기가 엔지너들은 조의 계획에 따라 작은 시골 마을에 미스터리 서클을 만든다. 그런데, 마을 이장과 젊은 청년이 기가 엔지너들이 미스터리 서클을 만드는 모습을 목격한다. 덕분에 언론에서 취재를 오고, 전국 각지에서 사람들이 몰려들어 작은 마을은 마치 UFO의 성지와도 같은 관광 명소가 된다. 거기에 조가 계획한 대로 다크 스핀단과 사벨까지 모습을 드러내는데…

크로우 때문에 어스 본부가 파괴돼 어스 본부는 당분간 오렌지 핏을 임시 기지로 사용하게 된다. 그런데, 기가 엔지너의 에너지를 충전할 수 없어서 가장 가까운 곳에 있는 에너지 스테이션으로 충전을 하러 간다. 기가 엔지너들이 충전하는 동안 라온과 가온 그리고 조는 근처에 있는 씽씽 빌리지로 놀러가 즐거운 시간을 보낸다. 한편, 거대 우주선에 왁스를 칠하던 다크 스핀단은 승주와 사벨이 없어도 엔진봇을 이길 수 있다고 큰소리를 친다. 그리고 다크 에너지를 모으러 씽씽 빌리지 근처의 풍력 발전기를 찾아가는데...

오 박사는 승주와 사벨이 어스로 돌아오면 주려했던 드리프트 썬더 파워카를 크로우가 물고 갔다는 사실을 떠올린다. 승주와 사벨은 어스에서 만든 걸 이용해 엔진봇들에게 따끔한 맛을 보여주면 재미있겠다면서 드리프트 썬더 파워카를 써보기로 한다. 승주는 함께 들어있던 설명서도 읽지 않고 드리프트 썬더 파워카를 작동시켜보다 마침내 바르게 사용하는데 성공한다. 한편, 어스에서는 크로우가 물고 간 드리프트 썬더 파워카를 찾기 위해 라온과 가온 그리고 조가 출동하게 되는데...

사벨한테 당한 피해로 이글과 버팔로는 수리를 하느라 움직일 수 없는 상태가 되고, 무슨 일이 생기면 라온이 혼자 메가 엔지너로 출동할 수밖에 없는 상황에 빠지고 만다. 오만능 주임은 라온이를 위해 개발실에 틀어박혀 새로운 파워카를 만들기 시작한다. 오만능 주임의 열정으로 드디어 GT-R 메가 엔지너 파워카가 완성된다. 한편, 다크 스핀단은 기가 엔지너들이 사벨에게 당해 움직일 수 없는 틈을 타 다크 에너지를 모으러 나타난다. 결국 라온은 새로운 GT-R 파워카와 함께 메가 엔지너 레오를 타고 출동하는데...

다크 에너지의 영향으로 상태가 이상해진 사벨. 승주는 그런 사벨을 보면서 자신과 사벨이 어스 본부를 떠나왔던 당시를 회상한다. 사벨은 인간들의 사정 때문에 긴 잠에서 깨어난 까닭에 늘 불만을 품고 지낸다. 그러던 어느 날, 엔지너가 된 승주와 훈련을 하던 중에 다른 생각을 하다가 승주가 다칠 뻔한 사고가 일어난다. 사령관은 사벨의 데이터를 리셋 시킬 수 있는 장치를 사벨에게 추가하고, 승주에게도 엔지너를 교체할 거라고 통보한다. 결국 어스 에너지 보급을 거부하던 사벨은 승주와 함께 어스 본부에서 떠나게 된다. 그리고 이번에도 사령관은 사벨을 막으러 출동하는 엔지너들에게 폭주하는 사벨을 진정시킬 수 없다면 리셋 버튼을 누르라고 명령하는데...

승주는 돌아오라는 사령관의 말도 거부하고 사벨과 함께하기로 한다. 라온과 가온 글그리고 조는 사벨을 막기 위해 싸운다. 그런데, 승주와 사벨은 1대3으로 싸우면서도 결코 뒤지지 않는 깊은 우정의 힘을 보여준다. 사령관은 그런 사벨을 막기 위해 긴급정지 버튼을 누르라고 명령한다. 하지만 사벨의 기억이 사라지는 걸 원하지 않은 엔지너들은 사벨을 폭주하게 만든 다크 에너지를 빨아들이기로 하는데…

영국에서 초스피니움 반응이 감지된다. 어스 본부에서는 혹시 승주와 사벨에 에너지를 보급하기 위해 그곳에 갔을까 싶어서 조사를 위해 가온과 이글을 보내기로 한다. 영국에 도착한 가온은 스피니움 반응이 발생한 장소를 조사하러가는 길에 어스의 연구원인 국도영 교수와 조수인 아우토반을 만나 함께하게 된다. 한편, 초스피니움 반응을 감지한 브레이크도 그곳에서 발생하는 다크 에너지를 모으기 위해 다크 스핀단을 각각 보내는데…

가온 일행을 공격하던 스피뉴킹 골렘은 국 교수와 아우토반, 그리고 어스본을 함정에 빠뜨린다. 게다가 이글이 올 때까지 버티려던 가온은 골렘의 강력한 공격에 위기에 처하고 만다. 그 때 부적이 든 상자를 열어보라는 할아버지의 말씀이 생각난 가온. 상자 안에는 타입 체인지 파워카 수프라가 들어있었다. 가온은 수프라 파워카를 이용해 위기에서 벗어난다. 그리고 이글과 샤크가 도착해 마침내 파워 합체하지만 아무리 공격을 해도 계속 재생하는 적에게 고전을 면치 못하는데...

고대 문명의 유적을 찾아 숲을 헤매던 러치는 넘어지는 바람에 우연히 유적의 입구를 발견한다. 러치는 그곳에서 가디언을 만나고, 거대한 나무는 스피뉴킹 나무크로 변신한다. 마침 그 근처에 있던 승주와 사벨은 나무크에 탑승한 러치를 만나게 된다. 러치는 승주와 사벨에게 다시 손을 잡고 함께 싸우자고 권한다. 하지만 승주는 어스로 돌아가겠다며 러치의 제안을 거절한다. 러치는 어스로 돌아가려는 승주와 사벨을 적으로 판단하고 나무크로 공격한다. 승주와 사벨은 열심히 싸우지만 에너지가 모자라 위기에 처하게 된다. 마침 그 때 승주와 사벨의 라이드 온 반응을 감지하고 위치를 파악한 조와 버팔로가 나타나는데...

승주가 어스로 돌아오게 돼 다 함께 상호 통신으로 승주와 사벨의 복귀를 환영한다. 그런 와중에 라온은 다들 외국에서 스피뉴킹과 싸우는데 혼자 국내에서 심심하다면서 불평한다. 한편, 고대 우주 문명의 유산을 찾아다니던 일러는 달맞이 시티의 보트섬에서 그곳을 지키던 가디언과 만난다. 그리고 일러와 가디언의 활약으로 보트섬이 항공요새로 변신해 스피뉴킹이 된다. 스피뉴킹의 영향으로 과거에 그려놨던 미스터리 서클이 되살아나 전국 곳곳에서 소란이 벌어진다. 라온과 레오는 도시로 날아오는 항공요새 천공러를 막기 위해 출동하는데...

새로 등장한 엔진봇 티라노 덕분에 라온과 레오는 위기에서 벗어난다. 라온은 티라노를 조종하는 엔지너G의 정체를 궁금해 한다. 해린이가 그런 라온에게 엔지너G의 정체를 밝히려하지만, 어스 본부 사람들은 엔지너G와 약속했다면서 그의 정체를 비밀에 부친다. 티라노와 엔지너G는 라온과 레오를 대신해 항공요새 자라러와 맞서 싸운다. 하지만 자라러가 너무나 단단해 티라노의 공격이 통하지 않는다. 그러자 엔지너G는 자라러의 공격을 빠른 속도로 계속 피하면서 상대를 도발한다. 이에 일러는 굉장한 꼬리 빔에 다크 에너지를 잔뜩 모아 티라노를 공격하는데...

제1회 파워카 엔진봇 퀴즈 대회. 마하와 어스본이 사회를 보고, 전반전에는 라온, 가온, 해린이가 참가해 파워카 엔진봇에 대한 문제를 푼다. 그리고 후반전에는 라온이와 가온이는 물론이고 조와 승주도 참가해 엔진봇에 관한 지식을 겨루는데…

사벨의 수리 때문에 어스 미국 지부에서 지내는 승주는 낯을 가리는 성격 때문에 사람들과 잘 어울리지 못한다. 그런데, 때마침 해린이가 승주를 위해 검객 의상을 보낸다. 덕분에 승주는 미국 지부의 스태프들과 친하게 지낼 기회를 갖게 되고, 환영파티까지 열린다. 그러던 중 모스터섬에서 초스피니움 반응이 감지돼 조와 버팔로가 출동을 한다. 하지만 버팔로는 소와 비슷한 모습을 한 스피뉴킹을 보고 조상님 같다면서 달아나버린다. 그런 조와 버팔로를 돕기 위해 승주가 출동하는데...

남미의 머스카에서 새로운 유적이 나타나 엔지너G인 마하와 티라노가 조사를 하러 간다. 그곳에서 마하와 티라노는 국도영 교수와 조수인 아우토반을 만나 머스카 유적을 조사하게 된다. 마침 그곳에 러치가 찾아와 유적에 다크 에너지를 주입한다. 이에 스피뉴킹인 벌새돈이 움직이기 시작하고, 유적의 수호자인 빨간돈과 파란돈까지 나타난다. 그러던 중 마하와 국 교수 일행은 빨간돈과 파란돈의 유적 수호 계약이 끝난 걸 알게 된다. 일행은 빨간돈과 파란돈을 친구로 삼기 위해 작전을 펼치는데...

유럽에서 우주 고대 문명에 대해 조사를 하던 가온은 발라칸 반도에서 초스피니움 반응이 감지됐다는 연락을 받고 달려간다. 그곳에서 우주 고대 문명의 유산인 무쇠공과 무쇠팬이 발견된다. 피자를 좋아하는 아우토반은 무쇠팬을 가지고 우주 제일의 피자를 만들기에 도전한다. 한편, 일러는 낡은 무쇠공 내부를 수리해 스피뉴킹인 데굴킹으로 가온과 이글을 공격한다. 무쇠공의 빠른 속도에 고전을 면치 못하던 가온과 이글은 엔지너G와 티라노의 도움으로 위기에서 벗어난다. 그 후, 새로 개발된 블루 커스텀 파워카를 이용해 합체한 이글과 파란 프테라가 한층 더 빠른 속도로 데굴킹에게 맞서는데...

레오는 꿈속에서 왕이라면 그 자격을 증명하라는 하얀 라이온을 만난다. 그리고 라온은 우주 고대 문명의 유적을 조사하기 위해 중국으로 가게 된다. 처음으로 외국에 나가게 돼 들뜬 라온. 하지만 레오는 꿈속에서 만난 하얀 라이온 생각에서 헤어 나오지 못한다. 그런 와중에 도영과 아우토반은 호수 속의 유적을 조사하게 된다. 마침 그 때, 챔챔이 다크 에너지를 공급하면서 유적이 움직이기 시작한다. 그리고 그곳에서 레오가 꿈에서 봤던 스피뉴킹인 하얀 라이온이 나타나는데...

하얀 라이온을 보고 ‘우주 초초 고대 문명’이 존재한다는 자신의 가설이 옳았다고 확신한 도영은 앞으로 우주 초초 고대 문명에 대한 단서를 찾아 나가겠다고 다짐한다. 승주와 조는 그런 도영을 호위해 지옥의 불가마라는 새로운 우주 고대 문명의 유적을 조사하러 간다. 도영은 지옥의 불가마 유적을 보고 외계인이 음식을 만드는데 썼던 가스레인지라고 추측한다. 그리고 도영은 유적을 조사하기 전에 승주에게 다크 스핀단에 대해서 묻는다. 승주가 그린 다크 스핀단의 그림을 보고 그들이 보석을 통해 우주 고대 문명의 장치와 의사소통을 하고 있는 건지도 모른다고 추측한다. 한편, 초스피니움 반응을 찾아 뒤쫓던 일러는 그곳에서 러치를 만난다. 둘은 가디언을 이용해 스피뉴킹인 불가마 지킴이를 불러내는데...

오랜만에 어스 본부로 돌아온 가온은 가족과 함께 즐거운 시간을 보낸다. 다음 날, 라온과 가온은 엔지너G와 함께 중요한 임무를 수행하러 나선다. 이번 임무는 사상 최대 규모인 해저의 우주 고대 유적을 다크 스핀단이 깨우지 못하게 막는 것이었다. 라온과 가온, 그리고 엔지너G는 해저 유적을 지키는 가디언들을 물리치며 어렵게 미로를 돌파해 마침내 제어 크리스털이 있는 곳에 도착한다. 그런데, 마침 그곳에 함정에 빠져 헤매던 다크 스핀단이 나타난다. 결국 다크 스핀단은 스피뉴킹인 크라켄을 깨우고 마는데...

우주에 있던 다크 스핀단의 거대한 우주선이 지구를 향해 다가온다. 다크 스핀단은 유적과 우주선을 연결해 단숨에 지구의 어스 에너지를 대량으로 빼앗아 가려 한다. 어스 엔지니어들은 가족과 함께 휴식을 취한 뒤, 각자 다른 길을 통해 유적이 있는 미국의 구랜드캐니언을 향해 출발한다. 그런데, 우주 고대 유적이 어스 터널을 지나 구랜드캐니언으로 가는 라온과 가온의 앞을 가로막는데…

폭주! 울트라 횡단 레이스!

어스 엔지너들이 구랜드캐니언에 도착하지만, 다크 스핀단에게 선수를 빼앗기고 만다. 어스 엔지너들은 우주선 우오가 지구의 어스 에너지를 빼앗아 가는 걸 막기 위해 오우에 돌입하기로 한다. 엔지너들은 세 팀으로 나뉘어 접근을 시도하지만 적의 가디언들과 방어라인에 막혀 조와 승주가 차례대로 탈락한다. 결국 라온과 가온 그리고 마하가 최종 방어라인을 뚫고 간신히 우주선 오우 앞에 다다르는데…

마침내 우주선 오우에 돌입하게 된 라온과 가온 그리고 마하. 셋은 두 팀으로 나뉘어 다크 에너지 저장 탱크와 중심 회전축을 파괴하기로 한다. 하지만 브레이크의 거센 저항에 라온과 가온은 고전을 면치 못한다. 사령실에서는 브레이크가 다크 에너지를 공급 받지 못하도록 중심 회전축을 파괴해야 한다는 결론을 내린다. 그렇지만 마하 역시 하나로 합체한 챔챔, 러치, 일러를 상대하느라 애를 먹고 있었다. 그러던 중 그곳에 덫에서 빠져나온 조와 승주가 나타나는데...

어스본의 진행 하에 라온과 가온 그리고 레오와 이글이 모여서 파워카 엔진봇에 관한 비밀을 샅샅이 파헤친다.

모습을 감추지 않고 여전히 우주에 머물러 있는 다크 스핀단의 우주선. 어스에서는 직접 우주로 출동해 적을 무찌른다는 스페이스 커스텀 계획을 실행에 옮긴다. 엔진 봇을 우주로 보내기 위해서는 막대한 양의 어스 에너지가 필요하기 때문에 단 두 대만 우주로 가기로 한다. 엔지 나들의 의견에 따라 라온과 가온이 우주로 가게 되고, 이에 아 대박 박사와 어스의 대원들은 레오와 이 글을 우주에서도 활동할 수 있도록 개조 작업에 들어간다. 그러던 중 기조는 대학시절 공학부의 천재로 이름 날렸던 대박에 대해 얘기해 주는데...

우주에서 무사히 궤도에 진입하게 된 라온과 가온 일행. 한숨 돌릴 겸 잠시 눈을 붙이기로 한다. 그런데 갑자기 빛이 번쩍이며 가온과 이글의 꿈에 하얀 독수리가 나타나 왜 싸우는 건지, 왜 지구를 지키는 건지 묻는다. 하얀 독수리는 어차피 모든 게 사라져버릴 텐데, 왜 애써 지켜야하냐고 말하면서 공격한다. 이글은 이러한 하얀 독수리의 질문에 넘어가 모든 게 아무런 의미가 없단 생각에 하얀 독수리와의 싸움을 포기한다. 모든 걸 포기해버린 이글 때문에 둘의 우정 레벨이 급격히 내려가 가온은 엔지너가 아니게 되고, 급기야 눈물까지 흘리고 마는데...

마침내 하얀 독수리의 석판을 발견한 국교수와 아우토반. 금고에 넣어둔 하얀 라이온의 석판을 꺼내 우주 초초 고대 문명이 남긴 최상의 힘에 대한 수수께끼를 풀려한다. 그런데, 금고의 비밀번호를 잊어버려 온갖 네 자리 숫자를 넣어보지만 금고는 열리지 않는다. 한편, 가까이 접근해오는 라온과 가온 일행을 맞아 다크 스핀단은 “우주 스핀킹 환생” 작전을 실행에 옮긴다. 간신히 다크 에너지를 모은 다크 스핀단은 지금껏 만들어냈던 스핀킹들을 우주에 다시 불러내는데 성공하지만...

갑자기 새하얗게 변한 엔진봇들. 하얀 라이온과 하얀 독수리의 힘을 얻어 사비에게 반격을 가한다. 하지만 곧 원래 모습으로 돌아오는 바람에 힘을 잃고, 결국은 사비의 공격을 피해서 달아난다. 그 무렵 지구에서는 한 때 우주 초초 고대 문명을 쌓아올렸던 하얀 라이온과 하얀 독수리가 자신들이 어떻게 사비에게 멸망당하게 됐는지 긴 사연을 말해준다. 한편, 브레이크는 완전히 사비에게 먹혀 버리고, 이에 위험을 느낀 챔챔과 러치, 그리고 일러는 지구로 도망친다. 갈 곳을 잃은 세 사람은 승주에게 연락을 하는데...

사비가 지구를 위협해오지만 지금의 엔진봇으로는 상대가 안 되는 까닭에 엔지너들은 모두 대기 상태에 들어간다. 그리고 우주 초초 고대 문명의 영혼들과 강하게 연결되면 사비를 이길 수 있을지도 모른다는 레오와 이글의 제안에 따라 오 박사와 만능은 HE 스피릿 시스템 개조에 들어간다. 또한 대기 중이던 엔지너들은 가상공간에서 훈련을 시작한다. 한편 라온과 가온의 집에 숨어있던 다크 스핀단은 우리한테 들키고 마는데…

사비가 꽂아둔 닻 때문에 지구의 회전축이 틀어져 지구의 환경은 황폐해져간다. 시뮬레이션 훈련을 하던 엔지너들은 바로 출동할 수 없어 조바심을 내면서도 거듭되는 훈련에 지루함을 느낀다. 그러던 중 마하의 제안으로 지금까지의 싸움을 돌이켜보기로 한다. 한편, HE 스피릿 시스템 개발에 박차를 가하던 오 박사와 만능은 마침내 갓 체인지 파워카를 완성하는데...

모든 준비가 끝나 다섯 대의 엔진봇이 총출동해 사비를 공격하기로 한다. 하얀 라이온과 하얀 독수리의 조언에 따라 사비 브레이킹과 사비가 꽂아둔 닻을 하늘과 땅에서 동시에 공략하게 된다. 처음엔 사비의 공격에 고전하는 듯했으나 다크 스핀단의 도움으로 사비에게 가까이 접근하는데 성공해 마침내 제어 코드를 파괴하지만…

레오와 이글, 그리고 다른 친구들의 동물 영혼이 사라지자 라온과 가온은 주위 사람들에게 화풀이를 하고, 더는 사비를 쓰러뜨릴 수 없다면서 기운을 잃고 만다. 그런 라온과 가온을 보고 다크 스핀단은 기운을 내라면서 열심히 카레를 만들어 갖다주지만 거절당한다. 라온과 가온 그리고 다른 엔지너들의 힘없는 모습을 보고 화가 난 챔챔은 빼앗긴 건 되찾아 와야 한다면서 러치와 일러를 데리고 떠나버린다. 챔챔의 말에 정신을 차리게 된 라온과 가온 그리고 엔지너들은 자신이 할 수 있는 일을 찾기로 한다. 덕분에 놀랍게도 기가 엔지너들의 우정 레벨이 올라가는데...

사비를 물리치고 지구는 평화를 되찾는다. 이제 남은 문제는 다크 스핀단이 무사히 고향별 다크로 돌아가 폴 시프트를 해결하는 것. 다크 스핀단은 지구가 막혀있던 어스 에너지를 분출해준 덕분에 그 에너지를 모아 다크로 가져가기로 한다. 그리고 그들의 귀한을 위해 만능은 우주선 오우를 수리해주고, 대박은 에너지 수송 장치를 개발하기로 한다. 그 사이 엔지너들과 다크 스핀단은 놀이공원에서 즐거운 시간을 보낸다. 마침내 모든 준비가 끝나 다크 스핀단은 다크로 돌아가게 된다. 평화로운 일상으로 돌아간 엔지너들은 이제 다크 엔지너가 된 다크 스피너와 손잡고 우주의 평화를 지키기로 하는데...

사비 브레이킹 공략 작전을 시작한 어스 엔지너. 공중에서 사벨, 버필로, 티라노가 사비 브레이킹의 주의를 끄는 사이에 다크 스핀단의 뚫어쾅과 레오와 이글이 땅속으로 파고 들어가 사비 닻을 뽑아내 파괴하기로 한다. 하지만 갓 체인지 파워카를 겨우 3분밖에 사용할 수 없어서 염려하는 와중에 우주 초 고대 문명의 스피뉴킹들이 나타난다. 그리고 스피뉴킹들이 우주 초 고대 에너지 넘겨준 덕분에 갓 체인지 파워카를 계속 사용할 수 있게 된다. 그리하여, 마침내 모든 엔진봇과 다크 스핀단이 사비 브레이킹 공략에 나서는데...

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