汽车人和霸天虎的战斗绵亘了几个世纪都未曾结束，而他们的后代——巨无霸和原始兽，更将新一轮的战斗推向了史前时代。在寻找新能源的途中，霸王龙（David Kaye 配音）指挥原始兽通过时空跳跃来到史前地球，而巨无霸也在擎天圣（Garry Chalk 配音）的带领下尾随而至。双方的拉锯战仍在继续，不久连早已盘踞在该星球的外星人沃克人也卷入其中。而穿越时空者身上承载的未来的信息，让外星人大为惊恐，由此使得战斗更加激烈。在此之后，霸王龙发现了汽车人留在地球的战舰方舟号，为了改变霸天虎战败的历史，他们试图摧毁处在沉睡中的擎天柱。 攸关全宇宙命运的战斗，在远古时代提前拉开了序幕……

Two spaceships, one manned by benevolent Maximals, the other by evil Predacons, crash-land on a pre-humanoid planet while en route to Earth. Their crews assume indigenous animal forms to protect themselves from an overabundance of natural energy, transforming into robots to do battle. Thus, the Beast Wars have begun...

Beast Wars è ambientata in una continuity intermedia tra l'inizio e la fine del primo episodio della serie animata del 1984. La fazione protagonista è formata dai Maximal, discendenti degli Autobot, quella nemica dai Predacon, discendenti dei Decepticon. Entrambe le fazioni, giunte sulla Terra in seguito a uno scontro interstellare nelle loro astronavi, acquistano la capacità di trasformarsi in animali e non in mezzi di trasporto.

I Maximal si trasformano quasi tutti in mammiferi, uccelli e pesci, i Predacon in invertebrati e rettili, perché la produzione considerava i primi meno pericolosi dei secondi. I Maximal, con l'appoggio degli Autobot non ancora senzienti, devono impedire ai Predacon di aiutare i Decepticon a vincere gli scontri della vecchia serie.

오토봇과 디셉티콘간의 대전쟁이 디셉티콘의 패배로 끝난 먼 미래,그 후손인 맥시멀과 프레데콘이 공존하는 사이버트론에서 메가트론과 소수의 프레데콘들은 불만을 품고 골든디스크와 전함 다크사이드를 훔쳐 달아난다.맥시멀인 옵티머스 프라이멀과 동료들은 탐사선 엑셀론을 타고 메가트론을 쫒게 된다.추격전을 벌이던 맥시멀과 프레데콘의 전함은 큰 피해를 입어 미지의 행성에 불시착하게 되는데...

O perverso vilão Megatron e seu bando, os Predacons, roubam um disco dourado de Cybertron. Megatron pretende conseguir energon suficiente para conquistar a galáxia. Optimus Primal e sua equipe, os Maximals, perseguem o bando de Megatron até os dois lados caírem em um planeta misterioso.

Nesse planeta, o nível de energon é muito alto, o que pode danificar as estruturas metálicas dos maximals e predacons. Para se protegerem, ambos os grupos combinaram seus códigos cibernéticos com o DNA de animais do planeta, ganhando assim o "modo animal".

…Давно окончилась эпоха Великих войн. Максималы (потомки автоботов) и предаконы (потомки десептиконов) мирно жили на Кибертроне до тех пор, пока один из предаконов, властолюбивый и воинственный генерал Мегатрон, не выкрал драгоценную реликвию — Золотой Диск, содержавший информацию о местах скопления энергона. Завладев Диском, Мегатрон с компанией своих приверженцев бежал с Кибертрона. Команда максималов во главе с Оптимусом Праймалом получает приказ догнать и вернуть преступников. Однако в ходе преследования оба корабля попадают во пространственно-временну́ю воронку и, серьёзно повреждённые, приземляются на неведомой планете.

Приняв формы органических живых существ, максималы и предаконы сражаются за обладание живительным энергоном. Кроме того, максималы пытаются найти способ вернуться назад на Кибертрон, в то время как предаконы всеми силами стараются им помешать. Однако вскоре обе стороны узнают, что, помимо них, на планете существует и некая третья сила — могущественная инопланетная раса Вок, которая не одобряет их присутствия. Чтобы заставить нежелательных пришельцев удалиться, Воки намерены сжечь все запасы энергона на поверхности планеты. Понимая, что это приведёт к гибели всего живого на планете, Оптимус Праймал отправляется в космос и, жертвуя собственной жизнью, взрывает космическую станцию Воков.

Megatron, un líder nato Predacon, roba junto con varios de sus Predacons el Disco Dorado, un disco con información muy valiosa sobre el pasado y el futuro. Durante su huida, una nave exploradora Maximal comandada por Optimus Primal, recibe el mensaje de que Megatron debe ser detenido y se dispone a perseguirlo. En la persecución, atraviesan una onda Transwarp temporal, que los lleva a quién sabe dónde. Las dos naves se enfrentan cerca de la atmósfera de un planeta, y ambas quedan dañadas, siendo atraídas inevitablemente por la fuerza gravitatoria del planeta, cayendo cada una, en un lugar distinto de aquel lugar inhóspito.

Beast Wars Tranformers là bộ phim nói về cuộc chiến của Autobot với Deception ở tương lai. Khi mà đội quân của Autobot dành chiến thắng ở The Great War Megatron và đồng bọn của hắn đánh cắp The Golden Disk thoát khỏi Cybertron trên con tàu Darktray để âm mưu thay đổi cục diện cuộc chiến. Đứng trước sự an nguy đó hậu duệ của Autobot là Optimus Primal đã lên đường truy tìm và 2 chiến cơ chiến đấu với nhau cùng mắc kẹt tại một hành tinh xa lạ và ở đó. Cuộc chiến của các Autobot bắt đầu.