La brigade d'Escouade 99 rencontre le nouveau commandant Célestin. Jeff, son bras droit, tente de l'aider à faire régner un semblant de discipline dans l'équipe pendant que le détective Max s'amuse à narguer la hiérarchie et faire des blagues.

Un graffiteur s'amuse à peindre des pénis sur les voitures de la brigade. Valérie introduit à l'équipe une amie voyante pouvant aider à résoudre des cas. Le jeune graffiteur est arrêté, mais Max se rend compte qu'il est le fils d'un des grands patrons des policiers de Québec.

Fanny doit diriger le programme des jeunes contrevenants de la ville de Québec.

L'escouade veut déchiffrer le non verbal du commandant puisque Fanny aimerait lui plaire. Max est l'assistant de Charles dans une enquête sur la mort d'un homme. Rosalie, exaspérée par le comportement de Max, veut que Charles porte ses culottes dans l'enquête dont il est chargé.

L'escouade veut prendre sa vengeance sur le Vautour, un horrible agent des crimes majeurs. Max convainc l'équipe de trouver l'arme du crime avant le Vautour. Parallèlement, le commandant et Valérie piègent Jeff.

L'escouade dispose de 48 heures pour prouver que le suspect arrêté par Max est coupable. Dans cette course contre la montre, ils sont forcés de dormir au poste tout le week-end afin de réparer la gaffe de Max qui n'avait pas les preuves nécessaires.

Une escouade reçoit la visite d'un journaliste qui couvrait la police durant les années 60. Max veut à tout prix impressionner son idole de jeunesse, mais celui-ci est loin d'être captivé par l'enquête de Max et Fanny sur la fraude des vols d'identité.

L'escouade et les pompiers revendiquent l'enquête d'un incendie survenu dans une pizzeria. La rivalité entre les deux départements incite Max à infiltrer les lieux du crime pour prouver l'innocence de Luigi, le propriétaire et le principal suspect.

Pour l'Action de grâce, Fanny organise un souper chez elle et y invite toute l'escouade. Max et le commandant quittent pendant le discours de Fanny. Ils font équipe afin de coincer le voleur ayant dérobé 10 000$ dans le local des archives au poste.

Une escouade veut protéger le commandant, celui-ci ayant reçu des menaces de mort à sa fête. Contre toutes attentes, le commandant choisit Max comme garde du corps attitré, croyant ainsi être moins surveillé, seulement Max perçoit son rôle autrement.

Après huit ans d'enquête, un témoin assure pouvoir conduire l'escouade au voleur de Pontiac. En effet, Richard Charest, un petit voyou, se lie d'amitié avec Max et accepte de collaborer avec la police afin de les aider à arrêter ledit voleur imprenable.

L'escouade souligne la médaille de bravoure de Charles en lui organisant une fête au bar. Charles, affecté par ses antidouleurs, ne peut s'empêcher de dire la vérité à ses collègues. La femme de Jeff découvre sa réaffectation sur le terrain. L'équipe apprend qui de Max ou Fanny gagne le pari pris il y a un an.