Jordan Kent modarbejder sin fars ønsker om ikke at bruge sine superkræfter. Samuel Lane prøver at rekruttere Natalie Irons til D.O.D. Academy, men skuffer hende ved at tage hende med til en film i stedet for en date. Lois Lane lærer af en doppelganger af Dr. Irons, at John's dobbeltgænger har solgt våben til Bruno Mannheim og at Dr. Irons måske er gravid. Sarah Cortez fortæller Jordan, at hun har brug for tid alene. Clark stopper Henry Miller / Atom Man og konfronterer en hættet figur med et deformeret ansigt, der dræber og bortfører Miller. Næste dag giver Lana Kyle underskrevne skilsmissepapirer. Dr. Irons afslører, at hun ikke er gravid og at hun vil køre flere tests. Mannheim og hætteklædte figur ser Miller blive genoplivet.

Sarah og Natalie støder ind i tvillingerne til en fest. Dean ringer til Lana og siger, at alt var for "Smallvilles stolthed", og bliver dræbt af en figur. Lana og John finder en flash-drev, men figuren stjæler det. Clark og Lois interviewer dommeren, der løslod Miller, og Mannheim benægter involvering med Intergang. Lois afslører, at hun har inflammatorisk brystkræft, og figuren fortæller Mannheim om John, mens han sætter et sikkerhedssystem op i Lanas hus.

Clark har mareridt om, at Lois dør. De fortæller deres venner og familie om hendes diagnose. Lois misser sine kemoterapitider for at fortsætte sin efterforskning af Mannheim. Hun og Chrissy finder frisk blod og bliver senere overfaldet af Intergang-medlemmer i en lagerbygning. Superman og John redder dem, men kæmper mod Intergangs våben. Samtidig beslutter Natalie at give sin mors ur til Lois og graver navnene på de unge på det, men Emmitt stjæler uret fra Jonathans lastbil. Natalie og tvillingerne stjæler det tilbage, og Jonathan fortæller Candice om Eliza. Kyle spørger Lana om Johns sikkerhedssystem, og Lana beder Sarah om at stoppe med at fortælle Kyle visse ting, hvilket resulterer i en argumentation og en utilsigtet lussing. Senere opdager Sam, at blodprøven fra Lois er Supermans blod, som Intergang bruger til at helbrede Miller. Kyle snakker med Chrissy og trøster Sarah. Næste morgen giver Natalie ur til Lois, og hun og Clark tager til hendes behandling.

Efter Jordan ses med Superman, forsøger Sam at overbevise ham om at klippe sit hår. Kyle hjælper Sarah og Lana med at forsones. Emmet slår Jonathan og truer Lois med en pistol, mens John opdager sin dobbeltgænger er involveret med Intergang. Efter at have reddet Darlene fra Mannheim, som fastgjorde en bombe på hende, undlader John at dræbe ham, da han stadig truer hans dobbeltgænger og familie. Sam finder ud af, at Intergang syntetiserede Supermans blodprøver, og Superman ødelægger dem alle. Efter at have lært, hvad Emmet har gjort, skræmmer Clark Emmet til at forlade byen og beskytter hans familie. Sam præsenterer Jordan for en dragt, så han kan beholde sit lange hår. Lois tilmelder sig kemoterapi i Mannheims område, hvilket skaber spænding.

En måned senere deltager Clark i en støttegruppe for ægtefæller til kemopatienter. Distefano, som lider af tumorer, dør efter at være blevet afvist på hospitalet. Lois spiser sammen med en patient, der har tillid til Mannheims velgørenhed. Jordan forsøger at overbevise Clark om sin hjælpsomhed, men bliver frustreret over de endeløse lektioner. Under en undskyldning bliver Clark overrasket og angrebet af en skikkelse med Kryptonite-våben. Jordan forsøger at redde ham, men de undslipper og opdager, at Jordan er mindre sårbar over for Kryptonite end forventet. Imens mister Sarah og Jonathan spor af Sophie, men finder hende senere på det lokale marked. Lana og Kyle går offentligt med deres forhold. Skikkelsen, der viser sig at være Peia, Mannheims kone og en tidligere patient, fortæller Mannheim om sine svindende kræfter og han lover at redde hende.

Tvillingerne trygler Lara om at bruge kryptonisk teknologi til at redde Lois, men hun fortæller dem, at det kan dræbe hende. Clark tvinger dem hjem, hvor de finder Lois' testamente. Ved Hob's Bay afhører Clark Mannheim, og Peia bliver vred over Lois' spørgsmål. Lois undskylder og beder om at være venner, men Mannheim vender tilbage og afslører sit ægteskab med Peia for Clark og Lois. Imens udbryder Sarah mod Chrissy, men ender med at tage med hende for at se en film og opdager hendes spiselige produkter. Efter at John skræmmer Matteo under frokosten med Natalie, råder Lana ham til at stole på Natalies dømmekraft, og han undskylder over for Matteo. Den aften konfronterer tvillingerne deres forældre og minder dem om, at Lois ikke er uovervindelig. Clark og Lois fortæller dem, at de føler, det er uretfærdigt at bruge teknologi, som de ikke kan lade verden bruge. Sarah og Lana tænder fyrværkeri sammen. Matteos forældre afsløres som Mannheim og Peia.

Kyle forfremmer Jonathan. Der opstår en brand, og Jordan redder en person, hvilket får Kyle til at tro, at Jonathan har brudt reglerne. Sam forsøger at finde beviser mod Mannheim, mens Clark og Chrissy interviewer en kemopatient uden held. Gruppen opdager, at Mannheim har beskyldt Luthor for Moxies død. Natalie møder Matteos forældre uden at vide, hvem de er. John kæmper mod Mannheim og Peia og får hjælp fra Superman. Peia besvimer, og Superman bringer hende til DOD. Tvillingerne skændes om branden, men Sarah hjælper Jordan med at forstå Jonathan's perspektiv. Lois er bekymret for, at Peias evne til at efterligne stemmer førte til Luthors uretfærdige fængsling. John forbyder Natalie at se Matteo og tager hendes telefon, og Matteo skændes med sin far. Inverse Superman vågner op.

Superman and John Henry clash over how to handle Bruno Mannheim, while Lois worries over upcoming treatments and confides in Lana about her early courtship with Clark. Meanwhile, Jonathan, Jordan, and Sarah work together to help Natalie deal with the aftermath of meeting Matteo's family.

Lois attempts to interview Peia in the hopes of unearthing the truth about an old case, while Clarke struggles to spend quality time with the boys. Meanwhile, Jonathan and Jordan find themselves at a party, where tensions between Sarah and Jordan come to a head. As Kyle's suspicions about a local meta-human grow, Lana must juggle her personal life with a visit from the governor. Finally, Matteo makes a life-altering decision.

Clark helps Lois prepare for a procedure but must leave the boys with her to help John Henry and General Lane track down the Mannheims. Meanwhile, John Henry and Nat butt heads over her desire to help Matteo, and Bruno's plans go awry as Peia's condition worsens.

Lois and Clark clash with Jordan over his carelessness around using his powers in public, while Jonathan struggles with Kyle's change in behavior at the firehouse. Meanwhile, Sarah grows frustrated with Lana after she accidentally makes things more complicated with Jordan. And finally, after seventeen years behind bars, Lex Luthor is set to be released from prison.

All of Smallville comes together to view a meteor shower, Lex Luthor makes his move.