Jess LaCroix e la sua squadra d'élite di agenti dell'FBI Fugitive Task Force sono sulle tracce di un medico profondamente coinvolto in un mondo di criminalità organizzata, droga e bugie, il quale è in fuga dopo che una telefonata lo registra mentre spara il colpo fatale a sua moglie.

Una madre single va su tutte le furie mortali nell'ufficio di un difensore civico, prendendo giustizia nelle sue mani dopo che suo figlio è stato condannato a una dura condanna per un piccolo crimine. Inoltre, Jess si preoccupa di come sua figlia Tali stia affrontando la vita senza sua madre.

Quando un giovane è traumatizzato dall'esperienza di essere sopravvissuto a una sparatoria di massa e radicalizzato fino a diventare un terrorista anti-governativo, la squadra deve agire rapidamente per rintracciarlo prima che possa vendicarsi di coloro che crede abbiano fallito.

Barnes intraprende una pericolosa missione sotto copertura che coinvolge un ambizioso capobanda che sta tramando guerre per il territorio e massacri in tutto il Bronx nel tentativo di ottenere più potere.

Quando un veterano militare che soffre di PTSS scatta dopo la morte di suo fratello d'armi, le abilità esperte del cecchino decorato spingono la squadra al limite. Inoltre, le lotte personali di Crosby riaffiorano in superficie quando il caso inizia a colpire troppo vicino a casa.

Dopo che la scomparsa di sua figlia viene ignorata dalla polizia locale, un nativo americano decide di prendere in mano la situazione. Quando la sua ricerca si trasforma in omicidio, la squadra deve rintracciarlo prima che la sua crociata reclami altre vite.

Quando un uomo prepotente e la sua ragazza si imbarcano in una terrificante follia omicida in più stati, la squadra corre per trovare uno schema dietro gli atti di estrema violenza apparentemente casuali della coppia squilibrata. Inoltre, Jess teme di essere escluso dalla vita di Tali quando scopre che sua figlia ha già vinto un premio a scuola.

Dopo aver catturato un terrorista, l'FBI e i loro colleghi della Fugitive Task Force rivolgono la loro attenzione alla moglie del terrorista che è fuggita con un milione di dollari ed è determinata a portare a termine il piano mortale di suo marito. Inoltre, la figlia di LaCroix, Tali, viene portata via dall'ICE, ma, mentre la rintraccia, Jess si rende conto che la sua detenzione potrebbe essere più di una semplice coincidenza.

Il crossover inizia in FBI 2x18 "Il sogno americano" (I).

Dopo che un ex ufficiale del controspionaggio viene sorpreso a divulgare informazioni riservate a un governo straniero e attacca i suoi ex partner, la squadra deve rintracciarlo prima che fugga dal paese.

Dopo che un agente di polizia di una piccola città afferma di essere vittima di una cospirazione radicata e inizia a vendicarsi di coloro che crede siano responsabili della sua rovina, Jess e il team scoprono che potrebbe avere ragione, nel primo di due nuovi back-to -episodi indietro

Dopo che uno studente manipolatore commette un omicidio in un impeto di gelosia, la squadra corre per catturarla prima che scappi oltre il confine. Inoltre, Jess insegna a Tali come resistere ai bulli, nel secondo di due nuovi episodi consecutivi

Quando un caso di cyber-stalking si trasforma in omicidi multipli, la squadra deve rintracciare un hacker che non si fermerà davanti a nulla per vendicarsi di coloro che crede gli abbiano fatto un torto. Qualcuno del passato di Hana le offre il suo aiuto per il caso, ma a un prezzo che lei non è disposta a pagare.

Quando un padre e un figlio rapinano una banca scappano da un furgone per il trasporto di una prigione mentre si recano al processo e riprendono da dove avevano lasciato, la squadra deve dar loro la caccia prima che rubino abbastanza soldi per fuggire dal paese. Jess attinge alla sua storia personale per delineare la dinamica padre-figlio del duo.