進入新越谷高中的武田詠深，與在旁邊的座位上超喜歡棒球的川口乃芳、以及雙胞胎姐姐息吹成為了好朋友。但詠深打算放棄棒球，然而入學儀式之後，與童年小夥伴的山崎珠姬再次相見。珠姬已是一名成熟的捕手，在夥伴的鼓勵下，詠深終於投出了“那種球”。

詠深等人和同樣是一年級學生的川崎稜和藤田堇向棒球部提出入部申請，得知棒球社因醜聞被迫停辦，據說兩位2年級學姐為了避免棒球社被廢除仍然保留著社員的身份，當兩位學姐來到棒球場後，詠深提出了讓她們留在棒球社的賭注。

在恢復了活力的新越穀棒球部，有2名1年級學生參加了體驗社團。其中一人是在福岡的強隊中村希。還有一個是棒球初學者，但是有劍道全國優勝經驗的大村白菊。兩個人都在當天成為了棒球部的一員，隊伍所需要的人數終於湊齊了。“以全國為目標！”在詠深發出聲音的同時，珠姬也不知為何露出了複雜的表情。

藤井杏夏作為棒球部的顧問就任，馬上組織了練習比賽。迎戰的對手是今年夏季大賽的備受矚目的隊伍·柳川大附屬川越，而最先上場的是2號投手大野彩優美。新越穀先得3分的話，詠深·珠姬的電池也會讓先頭擊球員三擊未中。在第2回表中，新越穀被三者平退壓制的時候，柳大川越的2年級王牌朝倉智景終於到了學校。

黃金周在學校進行集訓的新越穀99。從第一天開始就對預想不到的杏夏的猛烈敲門聲叫苦不迭，另一方面，在新越谷感受到了投手的必要性的芳乃看清了成員的投手適當性。那天晚上，憐向假裝不知道的理沙打招呼。回顧去年成為停賽部，中學時代相遇時的兩人，理沙繼續打棒球是因為意外的理由。

和守穀櫸台的練習比賽。正如在合宿中芳乃告訴的那樣，4號是希。沒能提高打分而煩惱的希，在第一集就打出了適時的安打。一口氣取得了6分的背面的守護，用珠姬的建議封印了“那個球”的詠深雖然招來了危機，但是杏夏的敲門和芳乃的分析被生存了的背部的守備幫助。但是，守穀欅台的投手也重新站了起來，在一步步地被追逼的情況下，比賽迎來了最後階段。

參加夏季縣大會抽籤的憐和芳乃。因为丑闻而停办的新越谷的名字一提到会场上就会有不稳定的气氛，但是在柳大川越・大野的帮助下得到了平安无事。抽籤結果顯示，第一場比賽的對手是影森高中，第二場勝利的對手是前年的優勝校梁幽館高中。立刻進入以梁幽館戰為假想練習的詠深等人。另一方面，芳乃和呼吸前往沒有資料的影森進行偵查。

縣大會開幕日。珠姬遇到了中學時代前輩梁幽館的投手吉川和美，看到了這一幕的詠深想要和吉川較量。在影森戰中保留了艾斯的詠深，理沙登上了首發的投手台。雖然也有失誤，但是靠先發制人得分了。

新越穀在影森的投手中山的低手投球中採用了良好的手法，擺脫了第六局的危機。那個背面的攻擊，破壞了中山的步調。雖然是理想的比賽，但芳乃卻責怪自己的指揮結果。

第二戰梁幽館戰山脊和堇在對方的選手層和大啦啦隊中畏縮不前，但詠深卻沒有氣勢。梁幽館的隊長中田奈緒看到這一幕緊張起來。初回，新越穀以憐的適時安打取得1分。在這背後的防守，詠深正是第一個擊球手陽秋月才用“那個球”三擊，之後在二壘設置了跑壘員，迎來了大會屈指可數的強打者中田。

梁幽館的嚴守阻礙了新越穀得分。再加上運氣不好的失誤，在滿壘的場面中，中田將迎來擊球位置，而新越穀則決定敬而遠之。雖然觀眾席上傳來了不好的聲音，但是詠深卻展現出堅強的一面，全力投球的直球突破。無法打開突破口的新越穀和無法捕捉到詠深球的梁幽館之間的攻防持續中，迎來了中田的第3擊球員位置。

在領先球之後，新越穀再次從憐的三壘打逼近1分之差。其中，詠深也沒有靠近梁幽館的下位擊球線，比賽以1分之差，終於進入最終回。前方的珠姬，接著的堇一起出壘的新越谷，梁幽館宣告投手交替，投手土臺上站著王牌中田。然後，4號希去了擊球員位置。滿懷著對同伴的思念而揮出的擊球手的去向是——。