岩永琴子對在醫院偶然相遇的櫻川九郎一見鍾情。相遇後的兩年後，一直虎視眈眈的琴子對九郎提出以結婚為前提交往的要求。在九郎述說與前女友紗季分手的過程中，琴子向他表明了自己的「真實身份」。沒過多久，妖怪狸現身來找琴子，告知圖書館的結界被破壞了。

深山中的築奈沼之主大神派遣使者找琴子商量煩惱。一起殺人事件的犯人谷尾葵把屍體遺棄在湖中，然而當中卻發生了令大蛇無法理解之事。琴子詢問九郎擁有的「力量」真相後，邀請他當晚一起前往深山，但卻被他用一個理由拒絕了。

琴子被沼主大蛇詢問犯人將屍體丟入湖中的真正原因，開口述說自己的推理。那正是連大蛇都會感到恐懼顫慄的、谷尾葵的愛與後悔的故事。時光飛逝，兩年過後、在真倉阪市發生多起隨機殺傷事件。謠傳其犯人竟為原偶像的亡靈·鋼人七瀨。

琴子為瞭解決鋼人七瀨事件而來到真倉阪市，在這裡遇見了成為警官的紗季。紗季調查鋼人七瀨的相關訊息才得知原來其由來的原偶像七瀨花凜死因成謎，而要打倒鋼人七瀨，就不得不詳細瞭解七瀨花凜的死因。

琴子注意到鋼人七瀨是從情報總結網站產生的怪異。想要攻克藉由人們的想像力成為不死之身的鋼人七瀨，就只能構築超越真正怪異的故事。為了對抗鋼人七瀨，琴子向紗季尋求協助。前往七瀨花凜死亡現場的他們遇見了聲稱目擊事件的幽靈。

寺田刑警被鋼人七瀨殺害了。網絡上傳著鋼人七瀨殺人鬧得沸沸揚揚。琴子在和九郎談話之際，確信事件背後的確存在著黑幕。琴子一行人思量著說不定還會再出現犧牲者，下定決心要趁著今夜打倒鋼人七瀨。

紗季回想起和九郎的堂姊櫻川六花初次見面時的事情。聽說六花已經過世了的紗季，試圖從琴子口中探聽傳聞真？。期間，情報總結網站的留言板又開始活躍了起來，鋼人七瀨漸漸展現出越來越強大的存在感。

做好了萬全準備，鋼人七瀨攻略議會拉開序幕。鋼人七瀨是否真實存在？還是只是捏造出來的都市傳說？圍繞著鋼人七瀨的存在與否，謊言與真實的戰鬥正式展開。琴子面對著電腦，開始把自己的推理寫上情報統合站的留言板。

才以為琴子提出的解決方案已經為留言板的人們所接受，那個推理卻被立刻放棄了，不過琴子早已準備好下一個推理。為了打倒鋼人七瀨所擊出的第二、第三個解決方案、橫擋在眼前的櫻川六花和鋼人七瀨。這樣究竟能不能消滅亡靈呢……？

琴子提出的三個解決方案都被一一否決。九郎嘗試著要抓住可能打倒鋼人七瀨的未來，然而那個未來卻因六花從中作梗而消失。不過琴子還有更進一步的對策。鋼人七瀨不是亡靈。為了消滅其存在，琴子擊出的第四解決方案究竟是……！？

妖怪、精怪、怪異、魔物、物怪、幽靈，世間萬物皆存在其秩序，違反秩序的行為是絕對不可容許的。統合站上接受了琴子的第四個解決方案，九郎對鋼人七瀨釋放最後一擊。兩人真的能成功消滅鋼人七瀨嗎！？而六花做出這種計畫的目的又是……

琴子接到一處公寓地縛靈的委託，它聲稱附近有「謎樣的怪異」。該棟公寓的空屋每到深夜就會傳出奇怪聲響，並且地上出現有著四隻手臂、長得像怪物的人偶。為了查出這神祕怪異的真面目，琴子與九郎一同前往調查，但兩人卻遇見了……智慧之神．岩永琴子今天也為了守護怪異們的秩序展開推理！

室井昌幸於11年前在雪山中被雪女救了一命。他遭受妻子與同伴背叛、從此變得極度不信任人類，因而選擇移居到遇見雪女那座山的山腳小鎮。當昌幸在小鎮中散步時，竟偶然看見與救命恩人的雪女有著相同容貌的女性……！？

因為前妻於離婚後死亡，昌幸遭警方懷疑可能是他痛下殺手，而且警方還在遺體的掌心找到對昌幸不利的死亡訊息。能夠證明他清白的，只有案發時刻與他在一起的雪女，但身為怪異當然無法成為不在場證明的證人，於是雪女委託琴子協助找出真正的犯人。

琴子梳理著真實與虛構步步逼近事件核心，不但斷言她已經知道殺人事件真正的犯人，還宣稱昌幸的嫌疑其實早已大大減輕，真正的犯人是為了嫁禍給昌幸才偽造死亡訊息。然而昌幸能夠承受漸漸明朗的殘酷真相嗎……？

六花瞞著琴子與九郎獨自搬到單身公寓居住，因為只拎著一個包包就入住、也沒有保證人，所以只能租到前三位房客接連自殺的凶宅。房東紺野和幸目睹六花被車撞飛卻沒受傷、聽到自己租的是凶宅也毫不動搖而感到十分不可思議。他們在聊天之際，談起了她搬家的理由以及之前自殺的房客們…

嶋井多恵與一隻妖貓一同住在港口小鎮，近期路過漁港時總是發現海浪將大量魚隻屍體拍上海岸，鎮民們全都嚷嚷著「這是善太的詛咒」而恐懼不已。戶平善太以過世孫子的模樣做了一尊木頭人偶後含恨逝世，不知何時開始，這尊人偶竟動了起來、半夜於鎮上徘徊，不禁令人聯想到童話木偶奇遇記的異變在小鎮蔓延……

在怪異們的委託下前往拜訪多惠的琴子聽聞事情經過，馬上察覺這尊一到夜晚就以電擊殺死魚群的木偶身上的「異物」、也就是隕石中藏有與常理相悖的神祕力量。琴子等人馬上著手計劃消滅木偶，但它身上卻隱藏著一個祕密……！？

旗下多角化經營旅館等各種事業的音無集團董事長音無剛一向琴子提出祕密會面的請求。剛一對琴子聲稱，其亡妻多年前在路上遭遇強盜身亡的事件，其實是自己暗地策劃的。如今自己因絕症時日無多，想在死前向孩子們坦白並令他們相信自己是殺人犯的事實，因而請求琴子的協助。

「我在23年前殺死了我的妻子澄。先聲明，這句話是真實的。與此同時，我將給予對這題目提出最佳解答的人優先繼承遺產的權利。」親戚們紛紛對剛一的題目提出自己的看法，這時琴子拋出了一個疑問。為什麼事發當下如此偶然地所有兒女都有不在場證明？事情的發展竟迎向出乎意料的局面……

音無莉音和亮馬回顧遭害身亡的澄的一生。澄一輩子都遵從其父音無傳次郎的教育方針而活，儘管她為了集團發展奉獻自己的一輩子，前人的成功法則卻不再有效、使得家族企業瀕臨崩毀。就在這時，發生澄遇害的事件，竟成了集團重振的契機。莉音表示從這經過或許能推敲出事件的真相……！？

音無剛一肯定了莉音給出的答案，然而琴子卻推翻她的回答，並一口咬定「澄的死亡並非自殺、事件另有真兇」！原來琴子手上掌握詢問事件當時在場的妖狐從而得知、至今無人知曉的「某個重要事實」。事件的真凶究竟是誰！？

這裡是知名道地的鰻魚專賣店。因為強盜殺人失去妻子雪枝的梶尾隆也，正遭受他的好友十条寺良太郎的逼問。良太郎懷疑其實是隆也殺了雪枝，並為了不遭人懷疑才一直裝出憔悴的樣子。這時恰巧坐在店裡吃著特上鰻魚飯的琴子也被捲入這起與怪異有所牽扯、逐漸超乎尋常的事件……！？